Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 128,514 (bp)   Positions: 394
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.041
.125
.078
.015
.818
.025
.001
.001
.636
.794
.195
.941
.09
.002
.231
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.009
.001
.03
.0
.0
.0
.02
.004
.003
.961
.091
.867
.025
.0
.0
.002
.002
.002
.996
.983
.0
.001
.0
.028
.018
.001
.005
.001
.0
.0
.005
--
--
--
--
--
--
.001
--
--
--
--
--
--
.002
.02
.302
.001
.922
.96
.015
.003
.0
.414
.0
.001
.033
.263
.129
.001
.0
.003
.056
.0
.001
.0
.903
.001
.007
.013
.117
.003
.0
.0
.004
.001
.001
.026
.021
.028
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.014
.007
.007
.035
.037
.001
.142
.025
.002
.002
.0
.001
.018
.008
.003
.008
.002
.002
.003
.001
.001
.001
.001
.006
.001
.004
.034
.038
.541
.89
.738
.017
.06
.029
.007
.001
.027
.027
.003
.006
.009
.298
.21
.034
.002
.002
.004
.001
.004
.006
.019
.016
.0
.0
.0
.001
.001
.001
.007
.002
.001
.001
.0
.018
.047
.128
.105
.001
.001
.001
.035
.017
.0
.002
.004
.016
.003
.005
.003
.001
.033
.119
.13
.041
.238
.026
.028
.008
.005
.002
.009
.016
.007
.007
.072
.038
.036
.054
.062
.015
.01
.004
.052
.029
.011
.016
.022
.1
.062
.061
.056
.062
.012
.013
.013
.009
.009
.014
.008
.001
.429
.071
.0
.0
.0
.002
.001
.004
.711
.003
.018
.001
.001
.012
.0
.001
.0
.047
.001
.102
.2
.054
.0
.008
.001
.169
.092
.0
.0
.001
.0
.003
.0
.0
.004
.003
.007
.0
.001
.0
.0
.038
.007
.001
.002
.001
.002
.014
.003
.004
.0
.001
.0
.162
.008
.001
.023
.002
.003
.032
.294
.022
.0
.0
.0
.0
.999
.0
.0
.0
.001
.0
.001
.021
.14
.0
.429
1.0
.966
.0
.0
.046
.031
.023
.014
.121
.125
.148
.164
.0
.006
.052
.006
.017
.018
.018
.018
.004
.014
.631
1.0
.037
.0
.0
.005
.0
.035
.001
.055
.014
.0
.001
.039
.065
.068
.073
.001
.042
.0
.595
.003
.02
.961
--
--
--
--
.0
.0
.347
.021
.019
.0
.008
--
.113
.001
.029
.017
.002
.0
.001
.001
.005
.003
.005
.006
.015
.947
.0
.002
.068
.171
.628
.002
.997
.026
.0
.001
--
.0
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
Col8a1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
-
-
T
A
C
-
A
A
-
C
-
C
G
T
C
C
C
2
A
A
G
A
T
A
3
G
C
8
C
T
C
A
C
4
A
-
C
A
-
A
C
-
A
A
T
G
C
T
C
C
C
G
A
T
T
T
G
8
4
44
C
C
T
T
3
C
C
C
C
G
C
G
C
G
G
G
G
-
G
A
T
G
C
G
G
2
C
A
A
T
2
-
G
C
4
-
A
G
C
G
T
G
C
C
C
T
A
-
-
-
-
A
2
A
-
-
A
C
C
G
C
-
-
G
C
-
-
G
G
T
A
G
C
G
A
A
T
C
A
G
C
A
3
-
-
-
G
-
A
2
-
T
T
A
T
-
A
G
-
3
C
-
2
G
-
-
-
A
A
C
G
2
2
A
T
G
G
2
-
T
C
G
-
T
-
G
-
-
-
-
C
-
C
-
C
T
-
C
C
C
A
-
2
G
C
-
T
C
C
-
G
C
A
C
2
G
G
C
-
G
C
G
C
G
2
G
C
G
T
C
G
C
2
T
A
G
-
A
C
-
T
T
A
A
G
G
C
C
C
A
T
C
9
A
A
G
A
C
G
-
C
G
-
A
A
-
-
-
-
-
-
3
G
-
-
2
G
G
T
A
-
-
-
C
-
C
A
T
C
-
C
-
T
G
-
G
G
A
4
T
4
4
A
A
T
-
2
-
G
-
T
C
-
-
-
-
-
G
T
G
-
-
A
C
T
G
G
T
A
A
G
A
-
C
3
G
G
A
A
C
G
A
A
G
C
-
A
A
-
T
A
A
-
G
G
T
A
A
G
-
T
C
G
A
C
A
C
A
C
T
A
T
G
8
-
A
A
-
C
2
G
T
5
-
-
A
T
-
G
G
A
-
C
A
  44,878,981
  44,878,998
  44,879,003
  44,879,016
  44,879,022
  44,879,037
  44,879,044
  44,879,061
  44,879,076
  44,879,088
  44,879,103
  44,879,149
  44,879,624
  44,879,959
  44,880,046
  44,880,072
  44,880,175
  44,880,276
  44,880,281
  44,880,284
  44,880,287
  44,880,527
  44,880,702
  44,880,960
  44,881,213
  44,881,218
  44,881,220
  44,881,224
  44,881,802
  44,883,037
  44,883,537
  44,883,695
  44,883,781
  44,884,267
  44,884,943
  44,885,186
  44,886,307
  44,886,376
  44,887,126
  44,887,609
  44,887,724
  44,887,756
  44,888,622
  44,888,698
  44,889,566
  44,889,762
  44,889,775
  44,889,983
  44,890,395
  44,890,412
  44,890,414
  44,891,968
  44,892,231
  44,892,234
  44,892,240
  44,892,252
  44,892,253
  44,892,290
  44,892,336
  44,892,342
  44,892,391
  44,892,397
  44,892,407
  44,892,413
  44,892,423
  44,892,560
  44,892,649
  44,892,789
  44,892,832
  44,894,858
  44,895,453
  44,896,553
  44,897,971
  44,898,000
  44,898,341
  44,899,164
  44,900,070
  44,900,635
  44,900,738
  44,900,889
  44,901,080
  44,901,104
  44,901,201
  44,901,223
  44,901,299
  44,901,435
  44,901,509
  44,901,550
  44,901,851
  44,902,535
  44,902,594
  44,903,156
  44,903,883
  44,904,407
  44,905,763
  44,906,816
  44,907,143
  44,907,675
  44,908,001
  44,908,577
  44,908,620
  44,908,900
  44,909,176
  44,909,194
  44,909,346
  44,909,391
  44,909,393
  44,909,398
  44,909,405
  44,909,413
  44,909,435
  44,909,453
  44,909,459
  44,909,485
  44,909,490
  44,909,495
  44,909,526
  44,909,531
  44,909,544
  44,909,579
  44,909,595
  44,909,602
  44,909,852
  44,909,855
  44,909,860
  44,909,871
  44,909,877
  44,909,883
  44,909,889
  44,909,893
  44,909,894
  44,909,898
  44,909,918
  44,909,924
  44,909,931
  44,909,943
  44,909,962
  44,909,973
  44,909,991
  44,910,010
  44,910,011
  44,910,022
  44,910,033
  44,910,055
  44,910,070
  44,910,077
  44,910,083
  44,910,085
  44,910,093
  44,910,100
  44,910,107
  44,910,118
  44,910,120
  44,910,126
  44,910,151
  44,910,162
  44,910,170
  44,910,175
  44,910,178
  44,910,180
  44,910,190
  44,910,192
  44,910,209
  44,910,224
  44,910,226
  44,910,231
  44,910,255
  44,910,257
  44,910,266
  44,910,270
  44,910,276
  44,910,284
  44,910,299
  44,910,316
  44,910,319
  44,910,323
  44,910,328
  44,910,330
  44,910,334
  44,910,343
  44,910,361
  44,910,363
  44,910,372
  44,910,379
  44,910,389
  44,910,397
  44,910,408
  44,910,419
  44,910,422
  44,910,430
  44,910,437
  44,910,441
  44,910,448
  44,910,452
  44,910,455
  44,910,463
  44,910,475
  44,910,498
  44,910,502
  44,910,504
  44,910,512
  44,910,516
  44,910,518
  44,910,522
  44,910,527
  44,910,532
  44,910,547
  44,910,987
  44,910,992
  44,910,998
  44,911,007
  44,911,017
  44,911,024
  44,911,026
  44,911,033
  44,911,040
  44,911,053
  44,911,056
  44,911,063
  44,911,083
  44,911,104
  44,911,112
  44,911,114
  44,911,124
  44,911,130
  44,911,138
  44,911,147
  44,911,158
  44,911,171
  44,911,173
  44,911,177
  44,911,181
  44,911,186
  44,911,389
  44,911,807
  44,914,181
  44,915,147
  44,916,014
  44,917,577
  44,920,075
  44,920,120
  44,922,125
  44,922,451
  44,923,190
  44,923,220
  44,923,232
  44,923,245
  44,924,284
  44,925,307
  44,925,604
  44,927,840
  44,928,731
  44,930,437
  44,930,460
  44,930,477
  44,930,493
  44,930,513
  44,930,521
  44,930,530
  44,930,538
  44,930,547
  44,930,554
  44,930,560
  44,930,572
  44,930,594
  44,930,621
  44,930,635
  44,930,641
  44,930,666
  44,930,691
  44,930,713
  44,930,725
  44,930,797
  44,930,821
  44,930,841
  44,930,848
  44,930,851
  44,930,862
  44,930,866
  44,930,884
  44,930,888
  44,930,907
  44,930,919
  44,930,936
  44,930,946
  44,931,034
  44,931,339
  44,932,530
  44,932,703
  44,933,452
  44,933,467
  44,933,475
  44,933,811
  44,934,785
  44,934,921
  44,935,518
  44,935,546
  44,935,812
  44,935,885
  44,937,282
  44,937,561
  44,937,569
  44,937,659
  44,937,673
  44,939,169
  44,939,172
  44,939,206
  44,939,214
  44,939,287
  44,939,348
  44,939,385
  44,939,436
  44,939,540
  44,939,589
  44,939,651
  44,939,678
  44,939,708
  44,939,716
  44,939,738
  44,939,739
  44,939,746
  44,939,755
  44,942,670
  44,942,702
  44,942,743
  44,942,800
  44,942,802
  44,943,055
  44,943,137
  44,943,259
  44,943,471
  44,944,189
  44,944,340
  44,945,438
  44,945,921
  44,946,604
  44,949,557
  44,950,199
  44,950,347
  44,950,632
  44,951,014
  44,951,206
  44,951,211
  44,951,822
  44,953,054
  44,953,325
  44,953,334
  44,953,336
  44,953,340
  44,957,576
  44,958,198
  44,958,771
  44,959,604
  44,962,490
  44,965,295
  44,965,962
  44,966,266
  44,966,278
  44,966,281
  44,966,287
  44,966,994
  44,972,388
  44,979,690
  44,979,973
  44,979,974
  44,979,999
  44,980,412
  44,981,052
  44,981,338
  44,981,854
  44,982,703
  44,983,881
  44,984,380
  44,985,401
  44,985,416
  44,985,419
  44,985,421
  44,985,424
  44,987,134
  44,988,017
  44,988,879
  44,989,588
  44,993,819
  44,993,825
  44,994,195
  44,995,338
  44,995,464
  44,996,280
  44,997,654
  44,998,289
  44,999,220
  44,999,930
  45,002,430
  45,002,751
G
C
-
-
G
G
C
-
A
-
T
-
-
C
T
A
T
-
C
G
T
G
A
G
-
A
T/3
-
T
C
T
G
T
-
G
A
T
T
A
T
A
G
C
G
G
T
T
C
T
A
T
T
T
C
A
C
A
-
-
-
T
T
C
C
-
T
T
T
T
A
G
A
T
A
A
A
T
A
T
G
G
A
T
A
A
-
T
C
G
C
-
C
A
T
-
A
G
C
T
A
C
A
T
G
T
-
-
C
G
2
C
-
-
C
G
A
-
-
G
-
-
C
2
-
-
T
2
-
-
C
T
-
T
T
-
-
C
T
G
T
A
-
-
A
T
A
T
T
-
-
T
-
-
G
-
T
-
T
C
-
A
C
-
T
C
G
T
-
-
-
-
-
-
T
G
-
C
-
G
-
A
C
A
-
A
-
G
T
T
G
-
G
-
A
-
-
A
-
-
-
-
G
-
-
T
2
A
A
-
A
T
-
C
A
-
-
-
-
A
-
-
C
T
C
-
-
-
-
C
T
-
-
-
C
-
C
T
-
T
G
-
-
G
G
C
A
T
T
A
G
G
G
-
T
-
-
-
-
A
T
-
-
G
-
-
A
A
A
A
A
A
-
T
T
C
-
T
-
-
-
T
C
C
-
C
T
T
C
T
A
-
A
G
A
2
C
T
T
-
C
-
-
G
G
-
C
-
T
-
T
-
-
G
A
A
G
A
-
G
T
G
3
-
A
-
-
-
C
C
C
A
G
2
T
-
A
A
G
G
A
A
T
C
A
T
G
G
G
G
C
-
C
A
T
T
C
-
T
-
G
-
T
A
C
A
T
A
T
T
C
G
C
-
-
5
-
G
G
T
-
A
-
-
4/C
T
G
C
A
-
A
G
2
T
G