Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 104,346 (bp)   Positions: 289
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.44
.0
.009
.0
.0
.001
.0
.002
.002
.0
.001
.009
.185
.301
.002
.013
.023
.0
.0
.001
.0
.0
.001
.268
.002
.009
.001
.003
.029
.001
.026
.215
.0
.0
.222
.0
.028
.009
.0
.0
.0
.002
.001
.001
.0
.68
.104
.99
.165
.03
.0
.0
.135
.002
.0
.005
.0
.001
.006
.0
.003
.003
.217
.005
.318
.006
.014
.03
.028
.0
.001
.006
.001
.016
.202
.018
.022
.123
.002
.062
.001
.0
.0
.02
.0
.003
.0
.002
.0
.025
.003
.013
.008
.002
.001
.007
.092
.463
.206
.071
.002
.045
.0
.0
.002
.0
.001
.02
.014
.021
.008
.009
.003
.003
.066
.018
.004
.004
.011
.503
.004
.025
.04
.001
.003
.003
.0
.0
.0
.004
.001
.0
.024
.734
.721
.001
.004
.0
.0
.02
.0
.0
.0
.002
.0
.009
.002
.077
.044
.559
.028
.038
.603
.03
.028
.014
.008
.003
.018
.043
.001
.003
.0
.0
.023
.012
.001
.006
.012
.002
.004
.002
.004
.008
.005
.0
.009
.0
.028
.002
.0
.0
.002
.495
.159
.002
.0
.0
.036
.0
.0
.0
.0
.003
.002
.0
.004
.001
.001
.0
.003
.001
.0
.0
.0
.07
.0
.0
.002
.005
.0
.0
.001
.0
.015
.371
.357
--
.216
.133
.0
.002
.0
.016
.002
.008
.0
.017
.023
.193
.209
.0
.004
.0
.007
.008
.015
.156
.05
.005
.33
.0
.0
.059
.0
.0
.001
.001
.0
.0
.004
.0
.002
.005
.036
.001
.018
.0
.0
.002
.0
.0
.0
.0
.0
.026
.062
.003
.009
.019
.0
.002
.008
.097
--
--
--
.001
.0
.006
.004
.065
--
.044
.032
--
.013
.003
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC103693167
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
G
G
C
A
C
A
T
G
C
A
A
A
G
A
A
A
G
C
G
C
T
G
T
C
A
C
T
G
C
G
T
G
C
G
C
C
T
G
T
G
G
A
C
A
C
A
T
G
T
C
G
G
T
G
G
C
G
T
A
C
T
C
T
C
C
T
C
G
G
C
A
A
G
A
A
G
A
T
C
A
A
A
C
A
C
T
A
T
G
T
T
G
G
T
A
G
A
G
C
A
A
C
G
T
A
A
T
G
G
C
A
A
G
A
C
G
G
C
G
T
C
A
T
G
C
A
C
G
G
G
A
T
G
G
G
A
C
A
C
G
G
C
A
T
A
A
G
G
C
A
G
T
C
G
A
C
A
G
A
C
A
C
G
C
C
T
G
G
G
A
C
T
G
C
A
G
T
G
C
G
C
C
A
T
G
A
C
A
C
T
G
T
T
T
G
G
A
G
A
C
G
T
G
A
G
A
A
G
G
T
T
T
G
T
T
G
G
C
A
T
A
C
C
G
G
A
C
G
G
G
T
G
T
G
G
T
A
A
G
A
A
A
G
A
A
A
G
A
A
T
A
G
A
G
T
A
T
C
A
G
G
C
T
G
T
A
G
T
A
A
C
C
G
G
T
T
T
A
G
A
G
C
A
C
C
C
C
C
G
  114,529,965
  114,530,710
  114,530,951
  114,531,323
  114,531,327
  114,531,339
  114,531,358
  114,531,420
  114,531,477
  114,531,478
  114,531,582
  114,531,767
  114,531,935
  114,532,129
  114,532,291
  114,532,373
  114,532,376
  114,532,535
  114,532,875
  114,532,985
  114,533,228
  114,533,253
  114,535,135
  114,536,907
  114,538,938
  114,538,944
  114,541,201
  114,543,792
  114,544,215
  114,544,457
  114,544,484
  114,544,628
  114,546,841
  114,546,856
  114,547,046
  114,547,082
  114,547,094
  114,547,098
  114,547,176
  114,547,733
  114,547,915
  114,548,123
  114,548,157
  114,548,191
  114,548,194
  114,548,655
  114,548,696
  114,548,838
  114,548,862
  114,549,072
  114,553,467
  114,553,498
  114,553,638
  114,553,660
  114,553,675
  114,553,740
  114,554,340
  114,554,342
  114,554,359
  114,554,437
  114,554,504
  114,554,505
  114,555,755
  114,555,848
  114,555,937
  114,555,983
  114,556,000
  114,556,028
  114,556,041
  114,556,079
  114,556,149
  114,556,229
  114,556,503
  114,556,555
  114,557,115
  114,557,420
  114,557,421
  114,557,434
  114,557,486
  114,557,842
  114,558,139
  114,558,140
  114,558,975
  114,560,286
  114,560,808
  114,561,280
  114,561,311
  114,562,440
  114,562,983
  114,563,426
  114,563,596
  114,564,477
  114,564,684
  114,565,070
  114,565,167
  114,566,094
  114,566,222
  114,566,776
  114,566,845
  114,566,968
  114,567,130
  114,567,285
  114,567,329
  114,567,499
  114,567,503
  114,567,541
  114,567,656
  114,567,784
  114,567,882
  114,567,953
  114,567,974
  114,568,018
  114,568,043
  114,568,047
  114,568,086
  114,568,092
  114,568,103
  114,568,113
  114,568,348
  114,568,385
  114,568,419
  114,568,561
  114,568,591
  114,568,604
  114,568,754
  114,568,814
  114,568,834
  114,568,868
  114,568,982
  114,569,012
  114,569,214
  114,569,230
  114,569,359
  114,569,380
  114,569,381
  114,569,527
  114,569,528
  114,569,532
  114,569,599
  114,569,615
  114,569,664
  114,569,720
  114,569,721
  114,569,729
  114,569,736
  114,569,949
  114,570,000
  114,570,094
  114,570,140
  114,570,175
  114,570,338
  114,570,358
  114,570,428
  114,570,490
  114,570,518
  114,570,531
  114,570,570
  114,570,590
  114,570,599
  114,570,619
  114,570,655
  114,570,843
  114,570,888
  114,571,060
  114,571,071
  114,571,080
  114,571,222
  114,571,296
  114,571,299
  114,571,389
  114,571,452
  114,571,461
  114,571,464
  114,571,491
  114,571,502
  114,571,576
  114,571,603
  114,571,657
  114,571,731
  114,571,784
  114,572,004
  114,572,453
  114,572,478
  114,572,493
  114,572,500
  114,572,637
  114,572,644
  114,572,680
  114,572,688
  114,572,721
  114,572,777
  114,572,779
  114,572,795
  114,572,835
  114,572,836
  114,572,865
  114,573,139
  114,573,180
  114,573,211
  114,573,270
  114,573,464
  114,573,484
  114,573,734
  114,573,738
  114,574,020
  114,574,102
  114,574,294
  114,574,495
  114,574,504
  114,574,605
  114,574,690
  114,575,071
  114,575,346
  114,575,457
  114,576,286
  114,576,326
  114,576,330
  114,577,380
  114,577,823
  114,577,875
  114,578,754
  114,583,212
  114,583,332
  114,584,056
  114,584,266
  114,585,563
  114,585,864
  114,588,685
  114,588,879
  114,589,157
  114,589,171
  114,589,862
  114,590,030
  114,590,632
  114,591,424
  114,591,540
  114,591,557
  114,591,649
  114,592,272
  114,592,384
  114,592,522
  114,592,699
  114,592,770
  114,592,793
  114,592,952
  114,593,083
  114,593,127
  114,593,223
  114,593,251
  114,593,761
  114,594,988
  114,595,150
  114,596,046
  114,596,161
  114,597,038
  114,597,376
  114,599,331
  114,599,514
  114,599,659
  114,602,090
  114,602,424
  114,602,952
  114,604,233
  114,604,252
  114,605,783
  114,606,573
  114,606,864
  114,606,982
  114,607,507
  114,608,702
  114,610,065
  114,613,020
  114,615,407
  114,617,476
  114,618,642
  114,619,457
  114,619,462
  114,619,539
  114,619,852
  114,620,042
  114,623,381
  114,623,572
  114,626,165
  114,629,147
  114,629,171
  114,629,397
  114,630,524
  114,631,479
  114,631,625
A
A
T
G
G
G
A
A
T
G
G
G
A
C
C
T
A
T
T
T
A
T
C
T
G
T
C
A
T
C
C
C
A
A
A
T
A
T
G
A
T
G
T
T
T
G
C
A
C
A
A
A
C
A
C
G
T
A
G
T
C
T
C
G
T
A
T
A
A
G
G
G
A
G
G
A
G
C
A
G
G
G
T
G
T
A
G
C
A
G
C
A
T
A
G
A
G
A
T
G
G
T
A
C
T
C
C
A
A
T
G
G
A
G
T
A
T
T
A
C
T
G
C
C
A
G
T
A
A
A
G
C
A
A
A
G
T
T
T
A
T
T
G
C
G
G
A
A
T
G
A
C
T
A
G
T
G
A
G
T
T
A
A
T
T
C
A
A
T
G
G
G
T
T
T
A
C
A
T
C
T
A
G
A
A
G
G
G
T
A
C
C
C
C
A
A
G
A
G
T
C
C
A
G
A
G
G
C
A
A
C
G
A
C
A
A
T
T
G
A
G
T
G
A
A
C
T
A
C
C
G
A
C
C
A
C
G
G
A
G
G
G
T
G
C
C
A
G
G
C
C
A
G
A
C
G
C
T
G
A
T
T
C
A
C
G
A
G
C
G
T
T
A
A
C
C
C
G
A
G
A
G
G
A
T
A
T
T
A