Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 104,346 (bp)   Positions: 325
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.016
.001
.086
.0
.0
.009
.0
.0
.0
.001
.0
.002
.002
.0
.001
.01
.009
.185
.085
.301
.002
.013
.002
.0
.0
.001
.0
.001
.004
.002
.0
.002
.002
.018
.062
.032
.0
.032
.0
--
.003
.001
.001
.003
.0
.029
.118
.001
.215
.007
.006
.0
.0
.222
.0
.028
.009
.0
.002
.0
.0
.002
.001
.001
.0
.0
.0
.135
.002
.0
.005
.0
.001
.006
.0
.003
.003
.023
.217
.005
.318
.006
.014
.03
.028
.0
.001
.006
.001
.016
.018
.022
.123
.002
.062
.001
.0
.0
.0
.0
.002
.0
.025
.003
.007
.013
.008
.002
.001
.0
.007
.092
.079
.039
.463
.206
.071
.002
.045
.0
.002
.0
.001
.02
.014
.021
.009
.003
.003
.066
.018
.004
.004
.0
.011
.005
.0
.503
.069
.11
.004
.538
.573
.025
.04
.001
.003
.003
.0
.0
.0
.004
.001
.0
.024
.734
.721
.001
.004
.0
.0
.02
.0
.0
.0
.002
.0
.009
.002
.077
.044
.559
.028
.038
.603
.03
.028
.014
.008
.003
.018
.043
.001
.003
.0
.0
.023
.012
.001
.006
.012
.002
.004
.002
.008
.005
.0
.009
.028
.002
.0
.005
.0
.002
.495
.159
.001
.001
.002
.0
.0
.036
.0
.0
.0
.0
.003
.002
.0
.008
.004
.001
.001
.0
.003
.001
.002
.0
.0
.0
.07
.0
.0
.002
.008
.0
.001
.0
.015
.371
--
.0
.985
.0
.016
.04
.001
.0
.005
.0
.012
.005
.0
.018
.0
.0
.0
.612
.0
.002
.372
.005
.002
.0
.0
.004
.007
.002
.115
.0
.0
.0
.002
.155
.003
.034
.027
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.003
.001
.012
.006
.006
.013
.003
.003
.0
.001
.05
.024
.0
.005
.004
.001
.007
.01
.0
.031
.365
.168
.027
.085
.001
.023
.069
.289
.145
.044
--
.068
.013
.136
--
--
.205
.003
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC103693167
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
Col6a5
T
A
G
G
C
C
C
A
C
A
T
G
C
A
A
T
A
G
A
A
A
A
T
C
G
C
T
A
A
G
A
T
A
T
A
G
G
T
C
G
A
T
T
G
T
C
C
G
G
C
C
C
G
C
C
T
G
T
G
G
G
A
C
A
C
G
G
T
G
G
C
G
T
A
C
T
C
A
T
C
C
T
C
G
G
C
A
A
G
A
G
A
T
C
A
A
A
C
C
A
T
G
T
T
G
G
G
T
A
C
G
A
T
T
G
C
A
A
C
T
A
A
T
G
G
C
A
G
A
C
G
G
C
A
G
A
T
T
A
A
C
T
T
A
T
G
C
A
C
G
G
G
A
T
G
G
G
A
C
A
C
G
G
C
A
T
A
A
G
G
C
A
G
T
C
G
A
C
A
G
A
C
A
C
G
C
C
T
G
G
G
A
C
T
C
A
G
T
C
G
C
G
C
A
T
G
T
C
A
C
A
C
T
G
T
T
T
G
G
T
A
G
A
C
G
T
C
G
A
G
A
A
G
G
T
T
G
T
T
G
C
A
G
C
G
G
A
G
A
G
C
G
G
T
C
A
C
T
A
C
T
C
G
T
G
G
A
G
A
T
G
T
A
A
T
C
G
A
T
T
C
T
A
T
T
A
A
A
T
A
C
A
T
C
T
T
C
G
T
A
C
T
T
G
C
C
T
G
T
T
C
T
A
T
A
C
A
T
C
G
C
T
G
C
G
  114,528,432
  114,528,724
  114,530,307
  114,530,710
  114,530,785
  114,530,951
  114,531,069
  114,531,323
  114,531,327
  114,531,339
  114,531,358
  114,531,420
  114,531,477
  114,531,478
  114,531,582
  114,531,752
  114,531,767
  114,531,935
  114,532,002
  114,532,129
  114,532,291
  114,532,373
  114,532,419
  114,532,535
  114,532,875
  114,532,985
  114,533,228
  114,534,768
  114,535,906
  114,536,082
  114,536,245
  114,537,385
  114,538,938
  114,539,007
  114,539,298
  114,539,502
  114,539,785
  114,539,867
  114,539,904
  114,540,189
  114,540,680
  114,541,201
  114,541,347
  114,543,792
  114,543,964
  114,544,215
  114,544,413
  114,544,457
  114,544,628
  114,545,075
  114,545,162
  114,546,841
  114,546,856
  114,547,046
  114,547,082
  114,547,094
  114,547,098
  114,547,176
  114,547,284
  114,547,733
  114,547,915
  114,548,123
  114,548,157
  114,548,191
  114,548,194
  114,553,467
  114,553,498
  114,553,638
  114,553,660
  114,553,675
  114,553,740
  114,554,340
  114,554,342
  114,554,359
  114,554,437
  114,554,504
  114,554,505
  114,554,813
  114,555,755
  114,555,848
  114,555,937
  114,555,983
  114,556,000
  114,556,028
  114,556,041
  114,556,079
  114,556,149
  114,556,229
  114,556,503
  114,556,555
  114,557,420
  114,557,421
  114,557,434
  114,557,486
  114,557,842
  114,558,139
  114,558,140
  114,558,975
  114,560,808
  114,561,311
  114,562,440
  114,562,983
  114,563,426
  114,563,596
  114,563,849
  114,564,477
  114,564,684
  114,565,070
  114,565,167
  114,565,574
  114,566,094
  114,566,222
  114,566,689
  114,566,721
  114,566,776
  114,566,845
  114,566,968
  114,567,130
  114,567,285
  114,567,499
  114,567,503
  114,567,541
  114,567,656
  114,567,784
  114,567,882
  114,567,953
  114,568,018
  114,568,043
  114,568,047
  114,568,086
  114,568,092
  114,568,103
  114,568,113
  114,568,323
  114,568,348
  114,568,361
  114,568,364
  114,568,385
  114,568,410
  114,568,412
  114,568,419
  114,568,427
  114,568,441
  114,568,561
  114,568,591
  114,568,604
  114,568,754
  114,568,814
  114,568,834
  114,568,868
  114,568,982
  114,569,012
  114,569,214
  114,569,230
  114,569,359
  114,569,380
  114,569,381
  114,569,527
  114,569,528
  114,569,532
  114,569,599
  114,569,615
  114,569,664
  114,569,720
  114,569,721
  114,569,729
  114,569,736
  114,569,949
  114,570,000
  114,570,094
  114,570,140
  114,570,175
  114,570,338
  114,570,358
  114,570,428
  114,570,490
  114,570,518
  114,570,531
  114,570,570
  114,570,590
  114,570,599
  114,570,619
  114,570,655
  114,570,843
  114,570,888
  114,571,060
  114,571,071
  114,571,080
  114,571,222
  114,571,296
  114,571,299
  114,571,389
  114,571,452
  114,571,461
  114,571,491
  114,571,502
  114,571,576
  114,571,603
  114,571,731
  114,571,784
  114,572,004
  114,572,350
  114,572,453
  114,572,478
  114,572,493
  114,572,500
  114,572,578
  114,572,586
  114,572,637
  114,572,644
  114,572,680
  114,572,688
  114,572,721
  114,572,777
  114,572,779
  114,572,795
  114,572,835
  114,572,836
  114,572,865
  114,573,108
  114,573,139
  114,573,180
  114,573,211
  114,573,270
  114,573,464
  114,573,484
  114,573,568
  114,573,734
  114,573,738
  114,574,020
  114,574,102
  114,574,294
  114,574,495
  114,574,504
  114,574,606
  114,575,071
  114,575,346
  114,575,457
  114,576,286
  114,576,326
  114,577,380
  114,578,754
  114,582,504
  114,583,332
  114,584,056
  114,586,895
  114,587,294
  114,589,862
  114,592,384
  114,593,805
  114,594,878
  114,596,161
  114,596,461
  114,599,331
  114,599,514
  114,599,659
  114,599,788
  114,600,762
  114,600,957
  114,601,352
  114,601,643
  114,601,699
  114,602,090
  114,602,422
  114,602,424
  114,602,589
  114,602,842
  114,602,926
  114,603,005
  114,604,233
  114,604,252
  114,604,632
  114,605,197
  114,606,596
  114,606,982
  114,609,026
  114,618,369
  114,618,409
  114,618,642
  114,618,686
  114,618,688
  114,619,003
  114,619,069
  114,619,457
  114,619,462
  114,619,539
  114,619,561
  114,619,638
  114,619,788
  114,620,042
  114,620,142
  114,620,458
  114,620,593
  114,621,141
  114,621,452
  114,622,996
  114,623,104
  114,624,636
  114,624,825
  114,624,849
  114,625,106
  114,625,174
  114,625,243
  114,625,420
  114,626,425
  114,626,758
  114,626,771
  114,627,049
  114,627,301
  114,627,672
  114,628,006
  114,628,233
  114,628,311
  114,628,398
  114,628,767
  114,629,147
  114,629,578
  114,630,004
  114,630,524
  114,630,677
  114,630,718
  114,630,764
  114,631,089
  114,631,479
  114,631,625
G
G
A
A
T
T
T
G
G
G
A
A
T
G
G
C
G
A
G
C
C
T
C
T
T
T
A
T
C
A
G
A
G
G
G
A
A
C
G
A
G
C
A
A
A
T
T
C
C
T
T
A
A
A
T
A
T
G
A
A
T
G
T
T
T
A
A
C
A
C
G
T
A
G
T
C
T
G
C
G
T
A
T
A
A
G
G
G
A
G
A
G
C
A
G
G
G
T
T
G
C
A
G
C
A
A
T
A
G
T
A
G
C
C
A
T
G
G
T
C
T
C
C
A
A
T
G
A
G
T
A
T
T
G
A
G
C
C
G
T
T
G
A
G
C
C
A
G
T
A
A
A
G
C
A
A
A
G
T
T
T
A
T
T
G
C
G
G
A
A
T
G
A
C
T
A
G
T
G
A
G
T
T
A
A
T
T
C
A
A
T
G
G
G
T
T
A
C
T
C
T
A
A
G
A
A
C
T
G
G
G
T
A
C
C
C
C
A
A
C
G
A
G
T
C
C
T
A
G
A
G
G
C
A
A
G
A
C
A
A
T
G
A
G
A
A
A/C
A
G
A
T
A
A
C
T
G
T
G
G
T
A
T
A
G
T
T
C
A
G
C
A
G
G
C
G
T
C
G
C
C
A
G
T
C
C
G
G
G
A
G
T
T
C
T
C
C
A
A
G
G
T
C
C
T
T
T
A
C
C
C
T
C
G
C
T
A
G
C
T
A
T
C
A
T
A