Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 362,691 (bp)   Positions: 319
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.997
.964
.998
.997
.584
.814
1.0
.216
.0
.001
.0
.003
.004
.0
.006
.004
.003
.015
.027
.033
.22
.23
.012
.012
.007
.004
.004
.002
.001
.005
.003
.002
.001
.0
.003
.003
.001
.16
.131
.023
.0
.008
.003
.002
.017
.002
.008
.02
.053
.004
.0
.0
.02
.015
.122
.078
.041
.012
.006
.002
.031
.105
.004
.0
.0
.006
.007
.001
.011
.003
.0
.0
.0
.0
.053
.0
.009
.008
.002
.0
.0
.017
.016
.001
.074
.009
.009
.037
.01
.001
.006
.873
1.0
1.0
.982
1.0
.631
.025
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
.992
.982
.948
.048
.0
.0
.0
.003
.005
.368
.341
.223
.004
.012
.037
.256
.0
.006
.001
.0
.002
.0
.0
.001
.01
.094
.052
.004
.006
.0
.0
.012
.017
.004
.684
.889
.858
.848
.593
.002
.007
.079
.086
.007
.027
.0
--
.033
.052
.01
.021
.223
.037
.001
.009
.052
.035
.073
.126
.05
.0
.003
.001
.005
.003
.08
.077
.014
.005
.02
.268
.105
.009
.003
.01
.009
.086
.991
.04
.002
.013
.016
--
.002
.318
.005
.016
.192
.05
.004
.316
.098
.04
.004
.001
.011
.173
.28
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.086
.102
.112
--
--
--
--
--
--
--
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
Col4a6
2
A
A
-
T
-
G
C
C
C
4
-
2
A
C
C
T
-
A
C
-
-
G
G
C
C
C
-
G
C
T
C
C
A
-
T
C
C
C
C
C
C
A
2
A
2
A
-
-
C
-
C
T
A
C
G
T
A
A
C
C
-
-
G
A
A
G
G
A
C
C
T
A
G
T
-
C
-
A
3
C
C
C
C
C
C
T
G
C
2
C
-
T
G
3
G
C
C
C
G
T
T
T
A
G
C
2
A
G
2
C
G
3
C
5
-
-
T
-
A
A
C
C
-
T
-
-
G
C
T
C
-
G
G
-
2
-
-
T
-
-
T
C
C
A
C
-
T
A
-
-
-
-
G
T
A
A
-
-
A
-
G
-
-
-
T
-
C
-
A
G
-
-
-
T
T
A
G
-
T
-
G
T
-
-
2
T
C
T
A
T
-
-
A
C
-
G
-
C
-
T
C
C
C
T
T
C
T
C
A
G
A
G
G
C
G
A
-
-
T
T
-
C
A
A
C
T
G
G
G
A
G
T
T
C
C
C
T
-
3
-
C
G
2
G
A
T
C
C
G
-
G
-
2
A
C
C
2
T
T
T
-
T
T
C
C
T
C
G
G
C
G
-
G
2
-
C
G
C
G
2
A
T
C
G
-
G
-
A
2
C
C
G
C
C
2
G
G
G
G
7
T
-
-
C
-
T
A
T
-
-
G
G
C
G
A
G
A
A
  112,405,857
  112,405,866
  112,405,869
  112,405,873
  112,405,892
  112,405,895
  112,405,906
  112,405,921
  112,405,937
  112,405,942
  112,405,952
  112,406,463
  112,406,469
  112,406,499
  112,406,523
  112,406,527
  112,406,532
  112,406,545
  112,406,566
  112,406,567
  112,406,585
  112,406,589
  112,406,646
  112,406,650
  112,406,656
  112,406,659
  112,406,661
  112,406,665
  112,406,674
  112,406,688
  112,406,689
  112,406,694
  112,406,701
  112,406,702
  112,406,705
  112,406,715
  112,406,727
  112,406,735
  112,406,749
  112,406,757
  112,406,766
  112,406,777
  112,406,784
  112,406,793
  112,406,807
  112,406,813
  112,406,820
  112,406,841
  112,406,846
  112,406,851
  112,406,854
  112,406,855
  112,406,874
  112,406,880
  112,406,885
  112,406,899
  112,406,901
  112,406,903
  112,406,909
  112,406,913
  112,406,928
  112,406,937
  112,407,240
  112,407,244
  112,407,248
  112,407,274
  112,407,283
  112,407,293
  112,407,296
  112,407,313
  112,407,317
  112,407,318
  112,407,321
  112,407,324
  112,407,339
  112,407,344
  112,407,367
  112,407,379
  112,407,382
  112,407,385
  112,407,401
  112,407,408
  112,407,416
  112,407,425
  112,407,437
  112,407,448
  112,407,503
  112,407,534
  112,407,540
  112,407,557
  112,407,575
  112,407,628
  112,407,646
  112,407,684
  112,407,711
  112,407,758
  112,407,777
  112,407,781
  112,407,794
  112,407,801
  112,407,842
  112,407,863
  112,407,871
  112,407,887
  112,407,901
  112,407,924
  112,407,929
  112,407,941
  112,407,944
  112,407,957
  112,407,963
  112,407,998
  112,408,006
  112,408,011
  112,408,013
  112,428,934
  112,428,935
  112,428,939
  112,428,951
  112,428,965
  112,428,970
  112,428,974
  112,428,984
  112,429,003
  112,429,012
  112,429,018
  112,429,024
  112,429,034
  112,429,036
  112,429,048
  112,429,049
  112,429,085
  112,429,101
  112,429,105
  112,429,120
  112,429,125
  112,429,128
  112,429,133
  112,429,154
  112,429,157
  112,429,167
  112,429,176
  112,429,177
  112,429,196
  112,429,197
  112,429,209
  112,429,213
  112,430,606
  112,430,612
  112,442,136
  112,442,407
  112,467,682
  112,491,452
  112,523,516
  112,523,528
  112,523,534
  112,523,538
  112,523,568
  112,523,594
  112,523,600
  112,523,616
  112,523,684
  112,523,690
  112,523,694
  112,523,703
  112,523,733
  112,536,859
  112,536,868
  112,536,875
  112,536,880
  112,536,910
  112,537,296
  112,537,297
  112,537,314
  112,537,323
  112,537,333
  112,537,344
  112,537,360
  112,537,369
  112,537,373
  112,537,401
  112,537,421
  112,537,433
  112,545,852
  112,547,878
  112,548,838
  112,548,841
  112,548,842
  112,557,409
  112,561,316
  112,561,324
  112,561,358
  112,561,361
  112,561,370
  112,561,388
  112,561,426
  112,561,563
  112,561,569
  112,561,581
  112,561,587
  112,561,594
  112,561,602
  112,561,607
  112,561,618
  112,571,613
  112,571,918
  112,572,028
  112,572,366
  112,572,391
  112,572,549
  112,579,370
  112,579,376
  112,579,388
  112,579,397
  112,579,400
  112,582,633
  112,582,658
  112,582,662
  112,582,710
  112,582,720
  112,582,725
  112,582,728
  112,586,547
  112,586,551
  112,586,552
  112,593,328
  112,593,334
  112,593,395
  112,593,401
  112,593,404
  112,603,072
  112,603,075
  112,620,696
  112,620,700
  112,632,319
  112,632,325
  112,632,328
  112,661,638
  112,713,231
  112,713,239
  112,713,243
  112,713,270
  112,713,273
  112,713,651
  112,713,670
  112,713,675
  112,713,681
  112,713,691
  112,713,703
  112,713,711
  112,713,715
  112,717,103
  112,718,011
  112,719,834
  112,738,324
  112,738,403
  112,738,404
  112,738,421
  112,738,603
  112,738,739
  112,738,873
  112,739,183
  112,739,214
  112,739,298
  112,739,647
  112,739,973
  112,740,555
  112,740,742
  112,741,117
  112,742,498
  112,742,506
  112,746,699
  112,747,739
  112,747,749
  112,747,777
  112,747,783
  112,747,792
  112,747,802
  112,747,808
  112,747,829
  112,747,845
  112,747,866
  112,747,888
  112,747,903
  112,747,906
  112,747,913
  112,747,932
  112,747,952
  112,747,956
  112,747,967
  112,747,972
  112,747,979
  112,747,982
  112,747,988
  112,747,991
  112,747,994
  112,747,998
  112,748,001
  112,748,013
  112,748,018
  112,751,494
  112,751,520
  112,751,536
  112,751,541
  112,751,549
  112,751,557
  112,751,564
  112,751,576
  112,751,589
  112,751,593
  112,751,608
  112,761,403
  112,761,404
  112,761,428
  112,761,729
  112,761,837
  112,763,737
  112,763,746
  112,763,974
-
-
G
2
-
C
-
-
-
T
-
A
-
-
T
-
-
T
T
A
G
G
-
-
-
-
T
G
-
T
C
-
A
C
C
G
-
-
-
-
-
G
-
-
-
-
-
T
T
-
2
-
-
G
-
-
A
-
-
-
-
T
A
-
-
-
-
-
-
T
T
C
-
-
-
A
-
A
-
-
T
-
G
-
-
-
-
-
T
-
-
C
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
T
-
-
G
-
-
A
-
-
G/T
-
G
G
-
2
-
-
T
A
T
-
G
T
C
T
C
T
G
-
-
T
-
G
T
G
T
T
C
T
G
C
T
G
-
G
G
8
C
22
T
-
-
G
G
T
-
2
-
T
G
G
G
A
-
T
C
T
A
A
A
-
-
-
-
A
-
T
-
-
8
A
-
A
A
A
-
-
A
T
-
-
G
-
T
-
T
-
-
-
-
T/C
T/C
C/T
T/G
C/T
A/G
A
T
A
C
A
-
-
A
C
-
-
G
G
T
T
C/T
T/C
G/A
G/A
G/T
A/C
G/T
-
C
G
-
-
T/A
T
-
2
-
T
-
-
C
-
-
-
-
3
-
C
2/-
A/T
-
A
-
T/C
T/G
T/C
-/3
T/C
T/C
C/T
C/T
T/C
C/A
G/C
G/A
C/G
-
C
-
-
A
-
-
-
-
-
-
-
-
-
A
-
A
-
-
A
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
C
C
T
C
C
-
-
C
T
G/A
G/A
C/A
C
-
G/A
A/-
A/-