Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 392,155 (bp)   Positions: 497
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.002
.031
.0
.011
.017
.014
.082
--
--
--
.003
.003
.003
.073
.017
.001
.003
.001
.039
.005
.002
--
--
.0
.015
.002
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.001
.002
.123
.0
.001
.005
.001
.031
.004
.0
.0
.003
.002
.006
.031
.018
.098
.0
.0
.004
.809
.835
.001
.025
--
--
--
--
--
--
.075
.495
.547
.0
.011
.003
.008
.476
.998
.003
.06
.02
.037
.0
.001
.1
.001
.004
.008
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
.101
.091
--
--
.004
.005
.145
.003
.031
.018
.045
.01
.001
.0
.012
.001
.001
.006
.044
.289
.05
.023
.0
.001
.0
.0
.127
.002
.001
.0
.003
--
.012
.0
.001
.387
.0
.031
.0
.0
.0
.898
.126
--
--
--
--
.055
.049
.039
.007
.002
.0
.748
.001
.002
.001
.244
.0
.002
.008
.002
--
.001
.031
.058
.0
.002
.034
.003
.031
.0
.003
.828
.001
.0
.008
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.008
.011
.009
.0
.004
.016
.001
.001
.009
.004
.005
.23
--
--
--
--
--
.049
.0
.009
.0
.008
.004
.001
.004
.011
.005
.042
.002
.001
.003
--
--
.002
.001
.001
.064
.001
.0
.0
.006
.0
.631
.0
.001
.005
.199
.016
.0
.0
.006
.0
.0
.003
.0
.008
.012
.001
.039
.0
.034
.143
.061
.001
.001
.013
.012
.005
.0
.0
.0
.997
.002
--
--
--
--
.001
.0
.0
.0
.0
.019
.019
.0
.0
.012
.0
.004
.275
.01
.001
.015
.0
.0
.0
.383
.938
.087
.238
.026
.001
.0
.001
.002
.011
--
--
.008
.062
.023
.06
.001
.003
.003
.0
.06
.096
.033
.14
.064
.002
.001
.002
.002
.012
.003
.01
.006
.002
.007
.007
.017
.047
.0
.003
.001
.209
.0
.0
.001
.001
.005
.001
.006
.003
.003
.001
.443
.002
.003
.009
.004
.055
.095
.003
.005
.645
.001
.0
.0
.0
.002
.01
.001
.0
.019
.003
.002
.077
.003
.003
.227
.228
.004
.364
.001
.067
.114
.007
.107
.007
.006
.012
.0
.0
.0
.017
.013
.021
.081
.0
.019
.0
.885
.128
.001
.001
1.0
.702
.008
.0
.0
.0
.001
.002
.0
.0
.003
.185
.022
.008
.014
.002
.041
.086
.008
.31
--
--
.003
.001
.001
.0
.994
.003
.003
.974
.727
.078
.007
.009
.027
.002
.0
.001
.001
.0
.002
.015
--
--
--
--
.002
.0
.0
.001
.0
.993
.734
1.0
.313
.002
.0
.0
.004
.0
.198
.0
.001
.006
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.002
.849
.007
.001
--
--
--
--
.002
.003
.07
.002
.003
.248
.032
.022
--
--
--
--
--
--
--
--
.025
.002
.001
.001
.002
--
--
--
--
--
--
--
.0
.995
.007
.976
.003
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
Cntn6
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
G
A
C
G
A
T
A
C
A
G
G
G
A
G
C
A
G
T
A
T
C
C
G
C
T
A
T
A
G
T
A
T
C
T
T
G
A
G
C
T
T
T
G
T
A
T
G
T
A
T
A
A
A
C
T
C
C
C
T
A
C
C
C
T
A
C
G
T
T
A
C
T
C
A
G
A
A
G
G
G
T
G
G
C
A
G
T
A
A
T
T
C
G
G
A
A
G
T
A
C
A
G
G
G
C
G
T
T
T
G
A
G
G
G
G
C
G
A
C
T
T
T
C
G
A
C
T
C
G
T
A
T
G
C
C
G
G
G
G
T
T
T
G
T
G
A
C
C
T
G
G
T
A
A
T
G
T
G
G
A
G
C
T
G
C
G
G
C
C
G
G
G
G
C
A
A
T
G
C
C
G
T
G
C
G
T
G
A
C
G
C
T
T
A
A
C
A
C
G
A
C
G
G
G
A
G
A
T
A
A
C
G
C
C
A
G
T
T
G
C
G
T
T
T
G
A
G
G
T
A
A
C
G
A
A
T
C
C
A
T
A
A
C
A
T
C
T
C
A
A
T
T
T
T
T
T
A
G
A
G
A
T
G
C
G
C
C
T
T
G
G
C
A
T
G
C
C
A
T
A
G
T
G
T
C
A
A
A
T
C
A
T
A
T
G
G
G
G
C
A
G
T
G
T
C
C
C
C
A
G
A
G
C
C
T
A
T
A
A
T
A
G
C
A
A
G
C
G
A
T
C
T
C
G
T
T
T
C
A
C
A
A
C
T
A
A
A
G
C
C
T
A
A
G
A
C
A
T
T
A
G
A
C
T
A
A
T
C
C
G
C
T
T
T
G
C
C
C
G
G
G
G
G
G
T
G
C
C
G
T
T
C
C
C
T
G
C
C
T
A
C
A
T
T
G
T
A
G
T
A
T
T
C
G
G
T
G
C
A
T
T
C
A
C
A
T
A
G
A
G
A
C
T
T
G
C
C
T
G
C
C
G
G
A
C
T
G
C
T
C
G
G
G
A
T
A
G
G
C
A
T
A
A
T
G
C
A
T
G
C
A
A
T
A
C
A
C
C
T
C
C
C
C
C
A
A
T
A
T
A
G
A
T
C
T
C
  136,515,031
  136,516,484
  136,522,728
  136,523,616
  136,526,793
  136,529,869
  136,531,114
  136,537,372
  136,537,381
  136,538,821
  136,542,491
  136,542,493
  136,542,495
  136,542,633
  136,544,270
  136,544,276
  136,546,082
  136,547,869
  136,549,535
  136,550,086
  136,552,659
  136,557,423
  136,564,166
  136,569,505
  136,569,641
  136,569,659
  136,569,691
  136,569,774
  136,573,195
  136,573,196
  136,573,220
  136,573,236
  136,573,272
  136,573,531
  136,578,843
  136,585,198
  136,587,909
  136,587,922
  136,587,964
  136,588,002
  136,588,043
  136,588,084
  136,588,211
  136,588,370
  136,588,457
  136,589,160
  136,589,563
  136,590,001
  136,590,016
  136,590,466
  136,590,467
  136,592,089
  136,592,530
  136,592,538
  136,592,593
  136,593,159
  136,593,572
  136,593,582
  136,593,636
  136,593,690
  136,593,691
  136,593,868
  136,596,166
  136,596,169
  136,596,170
  136,598,208
  136,602,013
  136,602,037
  136,602,646
  136,603,417
  136,603,443
  136,604,720
  136,604,921
  136,605,042
  136,605,586
  136,606,365
  136,606,679
  136,606,791
  136,608,785
  136,609,671
  136,616,509
  136,617,767
  136,619,637
  136,619,789
  136,621,138
  136,621,791
  136,622,125
  136,622,316
  136,622,664
  136,622,736
  136,623,756
  136,624,703
  136,627,904
  136,627,908
  136,633,045
  136,633,761
  136,635,069
  136,636,940
  136,636,962
  136,638,112
  136,638,586
  136,639,463
  136,640,283
  136,640,674
  136,640,797
  136,641,030
  136,641,488
  136,641,681
  136,642,434
  136,642,518
  136,642,565
  136,643,852
  136,645,597
  136,646,328
  136,646,990
  136,646,992
  136,647,454
  136,647,808
  136,648,294
  136,648,589
  136,648,921
  136,649,651
  136,650,120
  136,650,393
  136,650,958
  136,651,513
  136,651,553
  136,651,924
  136,652,903
  136,653,215
  136,653,238
  136,653,704
  136,653,864
  136,656,897
  136,657,494
  136,657,554
  136,659,238
  136,659,764
  136,659,939
  136,660,428
  136,660,549
  136,662,311
  136,662,675
  136,662,954
  136,664,641
  136,665,547
  136,666,247
  136,668,486
  136,669,637
  136,670,192
  136,670,808
  136,673,341
  136,673,626
  136,677,175
  136,677,293
  136,680,556
  136,680,798
  136,680,828
  136,681,075
  136,681,343
  136,681,490
  136,681,532
  136,683,320
  136,685,917
  136,686,106
  136,686,744
  136,686,928
  136,687,999
  136,688,520
  136,688,743
  136,689,108
  136,689,237
  136,689,640
  136,689,676
  136,690,438
  136,691,674
  136,691,872
  136,691,913
  136,691,964
  136,692,014
  136,692,124
  136,692,463
  136,692,741
  136,692,742
  136,693,341
  136,693,762
  136,693,775
  136,693,875
  136,693,921
  136,694,178
  136,694,279
  136,694,334
  136,694,353
  136,694,441
  136,694,505
  136,695,581
  136,696,234
  136,696,342
  136,697,878
  136,698,157
  136,698,371
  136,698,390
  136,698,807
  136,699,075
  136,699,456
  136,699,688
  136,699,860
  136,707,166
  136,707,292
  136,707,376
  136,707,524
  136,707,726
  136,707,751
  136,708,766
  136,709,428
  136,710,178
  136,710,211
  136,711,022
  136,711,419
  136,712,172
  136,712,565
  136,712,834
  136,714,054
  136,714,492
  136,714,608
  136,714,959
  136,715,923
  136,716,136
  136,716,868
  136,717,148
  136,717,280
  136,717,374
  136,717,733
  136,718,302
  136,718,615
  136,719,680
  136,721,068
  136,721,232
  136,721,241
  136,721,317
  136,721,380
  136,721,720
  136,721,771
  136,722,480
  136,722,508
  136,722,509
  136,722,633
  136,722,634
  136,722,676
  136,722,879
  136,723,143
  136,723,215
  136,723,547
  136,724,554
  136,724,941
  136,724,968
  136,725,625
  136,726,310
  136,726,645
  136,726,781
  136,726,801
  136,727,058
  136,727,219
  136,727,406
  136,727,753
  136,727,852
  136,728,353
  136,728,380
  136,728,535
  136,728,539
  136,738,696
  136,740,196
  136,740,351
  136,740,525
  136,740,807
  136,740,883
  136,741,026
  136,741,520
  136,741,705
  136,741,991
  136,742,293
  136,742,933
  136,746,774
  136,746,917
  136,747,167
  136,747,733
  136,748,070
  136,748,215
  136,748,503
  136,748,842
  136,749,501
  136,749,771
  136,750,031
  136,750,368
  136,750,369
  136,750,541
  136,750,611
  136,750,769
  136,750,794
  136,751,003
  136,751,090
  136,751,107
  136,751,128
  136,751,280
  136,751,314
  136,751,343
  136,751,347
  136,751,368
  136,751,423
  136,751,436
  136,754,831
  136,754,919
  136,754,965
  136,755,157
  136,755,291
  136,755,522
  136,755,617
  136,756,358
  136,757,067
  136,757,292
  136,757,474
  136,757,657
  136,758,950
  136,758,985
  136,759,007
  136,759,392
  136,759,660
  136,759,759
  136,759,815
  136,759,874
  136,760,036
  136,760,223
  136,761,465
  136,762,097
  136,762,267
  136,762,295
  136,762,649
  136,762,666
  136,762,952
  136,763,105
  136,763,930
  136,763,967
  136,764,047
  136,764,337
  136,764,679
  136,764,773
  136,764,867
  136,767,018
  136,767,872
  136,767,903
  136,768,035
  136,768,317
  136,768,620
  136,769,397
  136,769,400
  136,769,544
  136,771,787
  136,785,977
  136,786,828
  136,788,025
  136,788,097
  136,788,880
  136,789,339
  136,789,851
  136,790,626
  136,791,742
  136,796,611
  136,796,890
  136,797,291
  136,798,644
  136,800,453
  136,800,971
  136,801,541
  136,801,807
  136,806,487
  136,807,551
  136,808,956
  136,810,386
  136,812,841
  136,814,549
  136,814,608
  136,815,264
  136,816,017
  136,817,601
  136,817,711
  136,818,370
  136,818,393
  136,818,417
  136,818,543
  136,820,433
  136,820,671
  136,822,010
  136,822,476
  136,822,551
  136,822,800
  136,822,973
  136,823,015
  136,823,731
  136,824,421
  136,824,744
  136,824,788
  136,825,445
  136,825,566
  136,825,705
  136,827,850
  136,828,127
  136,830,113
  136,830,330
  136,832,688
  136,832,717
  136,833,198
  136,836,183
  136,836,426
  136,836,468
  136,837,881
  136,839,725
  136,840,187
  136,840,542
  136,840,945
  136,843,715
  136,844,030
  136,845,626
  136,846,149
  136,847,190
  136,847,764
  136,849,429
  136,849,519
  136,849,744
  136,851,141
  136,851,293
  136,851,745
  136,851,786
  136,852,048
  136,853,054
  136,853,529
  136,854,082
  136,854,516
  136,855,345
  136,855,535
  136,856,184
  136,856,729
  136,857,755
  136,857,818
  136,857,915
  136,858,375
  136,859,013
  136,859,042
  136,859,176
  136,859,294
  136,859,295
  136,859,623
  136,859,700
  136,860,146
  136,860,261
  136,860,371
  136,860,506
  136,860,514
  136,861,011
  136,861,325
  136,861,682
  136,862,322
  136,862,508
  136,865,119
  136,865,211
  136,865,391
  136,865,948
  136,865,975
  136,866,243
  136,866,282
  136,866,820
  136,866,891
  136,867,182
  136,867,911
  136,868,100
  136,868,355
  136,868,356
  136,868,398
  136,868,500
  136,868,829
  136,869,665
  136,875,010
  136,877,777
  136,878,359
  136,888,509
  136,890,244
  136,894,239
  136,894,240
  136,894,296
  136,894,330
  136,894,528
  136,894,681
  136,894,821
  136,897,307
  136,898,659
  136,900,388
  136,902,150
  136,904,010
A
A
T
G
T
T
A
C
A
G
A
A
A
T
C
G
G
T
A
T
G
A
A
T
G
C
T
C
G
T
G
G
C
G
A
A
C
T
A
T
G
C
G
T
C
T
G
T
A
T
A
C
C
C
T
G
A
A
T
C
T
A
A
T
A
G
T
T
C
G
G
G
A
T
G
A
G
G
A
T
A
C
C
C
G
G
A
G
C
C
G
C
A
T
A
G
C
T
A
G
T
G
A
A
A
A
A
A
A
A
A
G
A
A
T
T
A
A
T
A
C
A
G
A
A
G
T
C
G
A
C
T
C
C
A
T
A
A
T
C
C
C
C
T
G
A
T
G
T
C
A
A
C
G
G
C
A
G
T
A
G
A
T
C
A
T
A
T
G
T
A
A
A
C
T
C
G
C
A
T
T
T
C
A
T
T
A
T
G
T
C
T
C
C
G
T
T
C
T
A
C
T
A
T
C
T
A
G
A
T
G
A
C
A
A
C
A
A
C
A
G
A
C
C
A
C
T
A
A
C
T
G
G
T
G
G
C
T
A
G
A
G
G
A
C
A
T
A
T
G
C
G
C
G
A
C
C
G
T
C
A
G
G
A
T
A
G
A
G
C
T
C
G
C
C
A
T
T
T
C
G
A
C
A
C
T
G
C
C
G
A
T
A
T
C
A
A
A
A
T
G
A
A
C
C
T
A
A
A
G
T
G
T
T
G
A
G
G
C
G
C
G
A
T
G
T
A
A
A
T
C
A
G
T
A
C
A
A
T
G
T
C
T
T
A
C
C
G
A
T
A
C
G
G
A
G
T
G
C
A
T
C
C
T
G
G
G
C
T
T
C
G
A
G
G
A
T
G
T
A
A
A
A
C
T
C
A
T
G
A
C
C
T
T
T
C
A
G
T
C
G
T
T
C
C
T
C
G
A
C
G
C
G
T
T
T
G
A
T
C
C
C
T
T
T
G
A
G
T
C
A
G
T
G
A
T
T
G
C
A
T
T
A
A
G
T
G
T
T
G
T
A
C
A
T
A
G
A
A
T
G
C
G
C
C
A
T
G
C
A
T
T
G
G
C
T
G
T
T
G
T
T
A
G
G
G
G
C
G
G
C
T
T
C
G
C
T