Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 230,020 (bp)   Positions: 308
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.167
.022
.004
.442
.0
.0
.563
.073
.035
.001
.011
.003
.116
.41
.005
.037
.001
.023
.992
.168
.0
.001
.0
.015
.027
.001
.408
.001
.129
.088
.0
.223
.0
.003
.001
.002
.074
.004
.856
.015
.002
.001
.002
.0
.0
.002
.007
.0
.012
.0
.0
.022
.018
.182
.103
.314
--
--
--
.034
.003
.831
.214
.358
.048
.012
.016
.009
.009
.119
.245
.007
.01
.001
.232
.069
.058
.014
.04
.023
.694
.064
.004
.064
.797
.31
.006
--
.046
.993
.68
1.0
1.0
.0
.007
.03
.006
.002
.047
.003
.005
.005
.009
.001
1.0
.401
.0
.998
.008
.763
.001
.823
.006
.02
.003
.027
.04
.006
.024
.029
.003
.998
.966
.294
.019
.001
.004
.382
.0
.372
.204
.007
.017
.007
.001
.0
.097
.045
.063
.0
.0
.003
.062
.01
.001
.122
.013
.004
.002
.002
.002
.0
.77
.694
.967
.003
.052
.002
.005
.002
.005
.0
.003
.027
.013
.011
.011
.206
.138
.904
.004
.0
.0
.0
.0
.001
.006
.98
.288
.965
1.0
.0
.036
.107
.338
.001
.013
.003
.035
.009
.011
.531
--
--
.786
.0
.025
.176
.168
--
.07
.007
.003
.001
.835
.969
.005
.002
.0
.997
1.0
1.0
.035
.094
.009
.003
.0
.0
.005
.115
.002
--
.001
.009
.774
.019
.014
.006
.276
.998
.288
--
.013
.001
1.0
.0
.986
.032
.008
.0
.0
.002
.41
.316
.0
.0
.003
.0
.027
.998
.973
.993
.035
.084
.002
.001
.015
.001
.15
.021
.001
.001
.064
.035
.011
.009
.001
.001
.009
.0
.001
.003
.068
.036
.0
.002
.004
.001
.0
.001
.001
.003
.072
.002
.001
.055
.175
.793
.001
.001
.001
.001
.002
.001
.0
.125
.005
.001
.0
.157
.073
.004
.012
.015
.002
.0
.978
1.0
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
Clybl
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC102555437
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
T
C
A
G
C
G
A
C
A
G
A
T
C
G
C
G
G
A
G
A
C
A
A
G
C
A
A
C
C
C
G
G
G
G
T
T
G
T
A
T
A
A
T
G
G
A
C
T
G
A
A
T
C
T
C
T
C
C
A
A
C
C
C
G
T
T
T
C
A
G
C
A
C
T
G
A
A
G
T
T
T
G
C
C
A
A
C
C
T
T
A
A
A
A
C
G
G
C
C
G
A
A
G
T
C
G
C
G
G
G
A
G
G
C
C
A
C
C
T
C
T
C
T
G
C
T
C
G
C
C
T
A
G
T
T
C
C
G
C
A
C
T
T
A
T
G
G
G
G
C
A
C
A
T
G
T
C
C
T
A
G
G
G
C
T
A
T
A
T
C
G
T
G
T
T
A
G
T
T
C
A
G
G
G
A
G
T
A
A
A
G
A
A
T
C
G
G
A
T
C
T
T
G
T
T
C
A
A
C
C
G
G
A
A
T
T
C
T
G
G
T
C
A
G
T
C
A
T
G
T
G
T
G
C
A
C
C
G
A
C
C
G
A
A
C
G
A
C
C
G
A
C
A
C
T
A
T
C
G
A
A
C
T
T
C
A
C
C
T
T
A
A
T
C
G
G
T
G
T
C
A
C
C
T
C
A
T
A
T
A
G
T
G
G
C
A
G
T
A
G
C
G
A
A
T
T
C
  108,608,252
  108,608,824
  108,610,233
  108,611,092
  108,626,005
  108,631,807
  108,642,891
  108,643,533
  108,643,960
  108,644,841
  108,644,990
  108,645,416
  108,645,668
  108,649,566
  108,649,665
  108,649,762
  108,649,910
  108,650,084
  108,650,407
  108,651,316
  108,651,504
  108,651,572
  108,652,059
  108,652,277
  108,655,838
  108,657,363
  108,657,724
  108,658,103
  108,658,577
  108,658,796
  108,660,057
  108,660,694
  108,660,739
  108,661,859
  108,662,210
  108,663,338
  108,663,387
  108,663,660
  108,664,193
  108,664,528
  108,664,698
  108,664,718
  108,664,964
  108,665,671
  108,665,672
  108,666,053
  108,666,266
  108,666,745
  108,667,032
  108,668,332
  108,668,889
  108,669,379
  108,671,487
  108,671,556
  108,671,576
  108,671,634
  108,671,918
  108,672,390
  108,672,692
  108,673,294
  108,673,302
  108,673,402
  108,673,475
  108,673,685
  108,674,535
  108,674,560
  108,675,396
  108,675,580
  108,675,939
  108,676,629
  108,676,656
  108,676,793
  108,677,499
  108,678,159
  108,678,258
  108,678,796
  108,678,810
  108,679,876
  108,679,925
  108,680,259
  108,680,324
  108,680,395
  108,684,033
  108,684,067
  108,685,025
  108,689,766
  108,689,901
  108,690,286
  108,691,173
  108,691,398
  108,692,102
  108,692,166
  108,692,796
  108,694,027
  108,695,525
  108,696,076
  108,696,178
  108,696,269
  108,696,366
  108,696,468
  108,696,614
  108,697,666
  108,697,886
  108,697,903
  108,698,336
  108,698,640
  108,698,759
  108,700,062
  108,701,219
  108,701,567
  108,701,969
  108,702,129
  108,704,881
  108,705,637
  108,705,808
  108,707,066
  108,708,885
  108,710,011
  108,711,339
  108,712,348
  108,712,789
  108,713,835
  108,713,936
  108,714,145
  108,714,228
  108,714,360
  108,715,244
  108,715,259
  108,715,467
  108,716,092
  108,716,161
  108,716,318
  108,717,077
  108,717,078
  108,718,180
  108,718,386
  108,719,341
  108,719,381
  108,719,824
  108,720,762
  108,720,801
  108,720,984
  108,721,268
  108,722,501
  108,724,890
  108,726,612
  108,727,236
  108,729,171
  108,729,482
  108,729,483
  108,729,927
  108,731,011
  108,731,585
  108,731,639
  108,733,523
  108,733,802
  108,735,171
  108,738,397
  108,738,516
  108,738,523
  108,738,931
  108,738,939
  108,742,254
  108,742,517
  108,742,672
  108,742,743
  108,742,792
  108,742,912
  108,743,344
  108,743,706
  108,743,834
  108,743,847
  108,743,855
  108,743,866
  108,744,089
  108,745,249
  108,745,658
  108,746,414
  108,746,487
  108,746,661
  108,746,771
  108,746,956
  108,747,121
  108,747,687
  108,748,177
  108,748,851
  108,749,105
  108,749,293
  108,749,315
  108,749,547
  108,750,361
  108,751,057
  108,751,469
  108,751,521
  108,752,765
  108,753,093
  108,753,253
  108,753,322
  108,756,371
  108,756,806
  108,756,893
  108,757,602
  108,758,606
  108,758,997
  108,759,110
  108,759,393
  108,759,872
  108,760,018
  108,760,039
  108,760,228
  108,760,263
  108,761,683
  108,761,986
  108,762,023
  108,762,153
  108,762,220
  108,762,256
  108,762,761
  108,762,940
  108,764,092
  108,764,228
  108,764,564
  108,765,124
  108,765,778
  108,766,338
  108,767,054
  108,767,398
  108,768,002
  108,779,006
  108,784,319
  108,792,265
  108,797,635
  108,798,006
  108,801,643
  108,802,528
  108,803,473
  108,804,087
  108,804,937
  108,805,319
  108,806,991
  108,808,349
  108,809,851
  108,815,912
  108,818,414
  108,818,717
  108,820,721
  108,820,728
  108,820,803
  108,821,748
  108,821,826
  108,822,091
  108,822,113
  108,822,230
  108,822,557
  108,822,611
  108,822,816
  108,822,894
  108,823,559
  108,824,141
  108,824,929
  108,824,944
  108,825,078
  108,825,122
  108,825,464
  108,825,562
  108,825,643
  108,825,727
  108,825,766
  108,825,777
  108,825,799
  108,825,839
  108,825,865
  108,826,109
  108,826,414
  108,826,475
  108,826,646
  108,826,697
  108,827,700
  108,827,852
  108,828,350
  108,828,920
  108,828,921
  108,829,597
  108,829,838
  108,830,575
  108,830,805
  108,830,807
  108,831,179
  108,831,306
  108,831,309
  108,831,531
  108,831,550
  108,831,748
  108,831,749
  108,831,795
  108,832,614
  108,832,676
  108,832,998
  108,833,185
  108,833,653
  108,834,301
  108,834,486
  108,834,708
  108,835,688
  108,836,393
  108,836,461
  108,837,855
  108,838,002
T
C
T
G
A
T
A
G
T
T
C
G
C
G
A
T
A
A
G
C
C
T
G
T
T
T
C
T
T
G
T
A
T
A
A
A
C
A
C
G
C
G
G
C
A
A
G
T
C
C
G
G
C
G
C
T
A
T
A
G
G
T
T
T
A
C
C
G
A
G
A
T
G
T
C
A
G
G
T
G
C
C
C
A
T
G
G
T
T
C
C
C
G
G
G
G
A
A
G
T
A
G
G
A
A
T
A
T
C
A
T
G
A
A
G
G
G
T
G
G
T
A
T
C
A
T
G
T
A
A
T
C
T
T
G
C
A
G
A
G
C
T
G
C
G
G
A
T
C
C
T
G
T
G
C
T
G
G
G
G
G
C
A
C
G
C
C
A
G
C
G
A
C
T
C
C
G
A
C
A
T
G
A
A
A
C
A
C
G
T
G
A
G
G
C
T
A
T
G
C
T
G
A
A
C
C
T
C
T
T
T
C
A
G
G
C
C
T
C
C
A
C
T
G
A
G
T
G
C
T
C
A
C
A
G
G
T
T
A
T
T
T
A
C
G
G
C
T
A
T
C
G
T
G
T
C
G
C
T
T
T
T
T
C
C
A
G
G
T
C
G
T
C
A
G
A
A
C
A
C
C/A
A/G
G
T
C
T
C
G
G
C
C
A
C
A
A
T
G
C
C
C
A
T
T
C
C
C
C
T