Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 60,984 (bp)   Positions: 289
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.002
.053
.001
.271
.319
.127
.128
.01
.037
.001
.012
.091
.077
.021
.018
.016
.033
.048
.04
.36
.959
.924
.921
.812
.525
.291
.004
.004
.012
.031
.663
.001
.0
.0
.0
.005
.002
.001
.425
.492
.416
.659
.997
.995
.002
.004
.109
.005
.0
.004
.054
.001
.162
.102
.0
.0
.0
.0
.052
.002
.0
.006
.0
.0
.0
.0
.287
.039
.278
.003
.002
.012
.004
.787
.001
.0
.019
.0
.089
.928
.004
.027
.004
.431
.01
.001
.008
.03
.006
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.085
.005
.001
.006
.065
.0
.009
.002
.0
.074
.0
.002
.0
.0
.007
.001
.001
.0
.0
.012
.0
.0
.048
.001
.073
.048
.165
.038
.007
.0
.003
.006
.0
.148
.127
.008
.054
.103
.055
.001
.011
.322
.119
.485
.639
.633
.035
.018
.049
.491
.001
.003
.031
.004
.003
.158
.006
.027
.003
.001
.013
.003
.323
.539
.444
.955
.574
.115
.0
.001
.001
.002
.18
.0
.0
.01
.0
.0
.001
.003
.006
.0
.0
.0
.011
.0
.054
.918
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.134
.216
.006
.011
.016
.021
.025
.028
.177
.001
.0
.002
.004
.0
.0
.0
.001
.037
.002
.0
.0
.019
.022
.017
.0
.006
.001
.143
.0
.053
.001
.0
.273
--
--
--
--
--
.002
.0
.009
.318
.003
.002
.016
--
--
.026
.102
.07
.025
.0
.289
.348
.011
.004
.001
.001
.0
.001
.019
.0
.042
.002
.001
.002
.005
.003
.143
.006
.736
.057
.001
.004
.019
.002
.001
.001
.001
.001
.0
.033
.065
.0
.147
.036
.005
.001
.0
.01
.006
.015
.987
1.0
.951
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
Chsy1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
-
C
T
-
G
-
G
T
A
2
G
G
-
-
G
-
G
T
4
C
G
A
-
-
2
G
A
C
T
C
A
T
T
T
T
2
A
-
A
G
-
A
T
-
-
3
T
5
7
28
-
-
-
T
G
-
-
T
G
C
T
T
T
A
A
G
-
A
A
A
A
G
T
-
A
G
T
C
A
G
C
A
G
T
A
G
G
G
T
G
T
G
T
A
A
G
C
A
-
C
G
A
C
G
G
A
T
T
T
A
G
C
T
G
A
T
A
C
A
T
G
A
C
A
A
T
C
C
C
C
T
-
T
A
A
A
C
C
C
T
A
A
T
-
A
A
T
G
G
-
G
2
T
T
G
A
T
-
6
G
G
G
C
A
-
G
T
G
T
C
A
-
G
G
C
G
G
G
A
C
C
C
T
G
6
A
T
G
T
A
C
8
C
T
-
-
T
T
T
G
T
G
T
C
T
C
A
C
T
C
C
2
A
A
C
T
4
A
G
C
A
T
C
C
G
C
G
-
-
G
T
A
C
A
T
C
-
C
T
G
A
T
T
2
G
A
T
C
C
G
-
T
C
G
A
G
C
C
-
-
C
T
A
C
G
A
C
G
G
A
T
T
C
A
T
A
T
T
A
G
G
A
C
C
C
A
G
T
  127,012,177
  127,013,237
  127,013,455
  127,014,591
  127,014,604
  127,015,476
  127,015,480
  127,015,500
  127,015,505
  127,015,541
  127,015,552
  127,015,566
  127,015,578
  127,015,589
  127,015,592
  127,015,626
  127,015,638
  127,015,655
  127,015,659
  127,015,669
  127,015,694
  127,015,705
  127,015,707
  127,015,718
  127,015,725
  127,015,732
  127,015,760
  127,015,761
  127,015,767
  127,015,779
  127,015,845
  127,017,521
  127,017,762
  127,017,790
  127,017,792
  127,019,365
  127,019,706
  127,019,725
  127,019,883
  127,020,582
  127,020,586
  127,020,603
  127,020,629
  127,020,636
  127,020,701
  127,020,703
  127,020,721
  127,020,728
  127,020,737
  127,020,753
  127,020,793
  127,020,862
  127,020,954
  127,021,070
  127,021,266
  127,021,287
  127,021,316
  127,021,327
  127,021,414
  127,021,435
  127,021,437
  127,021,441
  127,021,449
  127,021,933
  127,021,969
  127,022,082
  127,022,738
  127,022,802
  127,022,817
  127,022,881
  127,022,887
  127,023,016
  127,023,059
  127,023,233
  127,023,391
  127,023,474
  127,024,108
  127,024,460
  127,025,088
  127,026,395
  127,026,490
  127,026,506
  127,026,668
  127,027,010
  127,027,029
  127,027,150
  127,027,301
  127,027,462
  127,027,618
  127,027,811
  127,027,813
  127,028,606
  127,028,680
  127,028,780
  127,028,970
  127,029,228
  127,029,520
  127,030,137
  127,030,138
  127,031,559
  127,031,726
  127,031,975
  127,032,164
  127,032,221
  127,032,278
  127,032,488
  127,032,618
  127,032,899
  127,032,976
  127,033,105
  127,033,160
  127,033,163
  127,033,166
  127,033,404
  127,033,468
  127,033,788
  127,033,878
  127,034,583
  127,034,761
  127,035,093
  127,035,199
  127,035,230
  127,035,332
  127,035,394
  127,035,576
  127,035,627
  127,035,955
  127,036,064
  127,037,149
  127,037,153
  127,037,185
  127,037,376
  127,037,659
  127,037,780
  127,038,015
  127,038,293
  127,038,750
  127,038,791
  127,038,818
  127,038,919
  127,038,935
  127,038,998
  127,039,306
  127,039,326
  127,039,434
  127,040,253
  127,040,320
  127,040,451
  127,040,520
  127,040,550
  127,040,573
  127,040,863
  127,040,871
  127,040,892
  127,040,952
  127,041,010
  127,041,500
  127,041,770
  127,041,822
  127,041,838
  127,041,885
  127,041,891
  127,042,444
  127,043,259
  127,043,608
  127,043,893
  127,043,987
  127,044,187
  127,044,854
  127,044,951
  127,044,962
  127,045,009
  127,045,180
  127,045,337
  127,045,500
  127,045,915
  127,046,032
  127,046,305
  127,046,314
  127,046,707
  127,046,844
  127,046,912
  127,046,986
  127,047,914
  127,048,168
  127,048,211
  127,048,323
  127,048,326
  127,048,327
  127,048,345
  127,048,361
  127,048,438
  127,048,594
  127,048,800
  127,049,219
  127,049,432
  127,049,641
  127,049,840
  127,050,143
  127,050,467
  127,050,635
  127,051,114
  127,051,316
  127,051,400
  127,051,714
  127,051,879
  127,051,948
  127,052,318
  127,052,367
  127,052,506
  127,052,539
  127,052,598
  127,052,868
  127,053,503
  127,053,509
  127,053,523
  127,053,524
  127,053,550
  127,053,818
  127,053,892
  127,054,089
  127,054,431
  127,054,586
  127,054,608
  127,054,683
  127,054,874
  127,055,027
  127,055,145
  127,055,499
  127,055,532
  127,055,573
  127,055,614
  127,055,868
  127,056,092
  127,056,260
  127,056,597
  127,056,679
  127,056,860
  127,056,922
  127,056,989
  127,057,108
  127,057,177
  127,057,618
  127,057,630
  127,057,860
  127,058,386
  127,058,525
  127,058,540
  127,058,897
  127,059,449
  127,059,501
  127,059,550
  127,059,600
  127,059,724
  127,060,149
  127,060,176
  127,060,336
  127,060,452
  127,060,627
  127,060,685
  127,060,686
  127,060,989
  127,061,197
  127,061,625
  127,061,669
  127,061,821
  127,062,374
  127,062,409
  127,062,677
  127,062,739
  127,063,026
  127,063,090
  127,063,206
  127,063,953
  127,064,146
  127,064,246
  127,064,287
  127,064,398
  127,064,511
  127,064,799
  127,064,933
  127,065,374
  127,065,521
  127,066,484
  127,067,287
  127,068,116
  127,069,317
  127,070,076
  127,070,206
T
T
T
-
T
T
G
-
-
-
-
-
-
C
A
-
A
-
-
-
-
-
-
C
A
-
A
G
-
-
-
G
A
G
C
G
-
G
T
-
-
A
-
C
T
C
-
A
-
-
-
A
A
C
-
-
C
A
-
A
G
-
A
G
G
G
T
2
-
G
C
C
A
C
9
G
A
C
T
G
A
T
G
A
G
T
-
A
A
C
T
C
A
C
G
G
A
T
G
G
G
A
G
T
-
A
C
C
A
C
G
A
T
C
A
G
A
-
T
C
C
A
G
T
G
C
C
T
T
T
T
A
G
-
T
C
G
T
G
T
A
T
T
C
T
G
G
A
A
T
8
A
-
C
G
T
G
G
33
-
C
C
-
T
G
G
A
C
A
C
T
G
A
A
A
T
A
A
A
G
T
T
T
C
A
-
T
C
C
C
C
T
-
T
A
C
A
C
C
C
T
C
A
C
T
C
T
G
T
C
T
T
-
G
T
T
C
-
G
T
T
G
G
T
T
A
T
A
5
G
-
C
T
G
G
C
T
T
T
C
T
G
G
-
-
A
G
G
T
G
A
A
G
-
A
G
A
T
T
A
2
T
C
T
T
A
G
A
A
A
G
C
C
T
G
C
G
C
C
C
A
T
T
-
T
A
G
A
C