Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 36,988 (bp)   Positions: 304
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.196
.0
.0
.0
.001
.0
.003
.005
.004
.001
.001
.002
.1
.04
.0
.0
.039
.046
.052
.057
.085
.048
.049
.005
.008
.008
.018
.01
.008
.003
.009
.021
.045
.001
.018
.004
.002
.184
.042
.003
.008
.0
.003
.001
.0
.002
.001
.01
.332
.01
.0
.01
.01
.001
.003
.002
.013
.024
.031
.004
.033
.043
.001
.007
.003
.001
.004
.0
.0
.0
.0
.005
.66
.0
.001
.001
.006
.0
.006
.035
.0
.995
.997
1.0
.997
.01
.029
.001
.001
.047
.001
.001
.018
.0
.005
.005
.012
.003
.071
.003
.0
.001
.003
.002
.121
.091
.002
.0
.001
.009
.03
.978
.971
.128
.12
.224
.195
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.006
.004
.013
.001
.003
.001
.004
.001
.002
.007
.011
.0
.003
.0
.021
.033
.055
.001
.002
.031
.017
.246
.595
.908
.891
.633
.622
.009
.046
.018
.003
.026
.002
.0
--
.015
.003
.001
.012
.024
.067
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.443
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.002
.0
.0
.001
.001
.672
.935
1.0
.999
.0
.007
.008
.008
.001
.001
.001
.0
.0
.005
.003
.002
.007
.051
.059
.001
.0
.0
.001
.034
.002
.003
.0
.001
.014
.003
.004
.003
.019
.138
.141
.008
.001
.007
.026
.003
.007
.007
.011
--
.154
.201
.213
.239
.023
.038
.015
.008
.008
.001
.001
.007
.004
.014
.044
.037
.002
.001
.097
.01
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
Chi3l3
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
C
A
C
C
A
-
C
C
G
C
C
G
T
A
A
G
T
G
A
A
C
G
A
T
G
T
G
T
C
T
T
C
A
G
C
T
C
T
A
A
A
T
C
A
T
A
T
-
T
T
C
A
A
T
T
C
G
-
C
T
G
C
G
T
C
G
G
T
-
G
A
A
T
G
T
T
T
A
C
T
G
A
G
T
C
G
G
C
2
T
T
T
A
C
G
A
A
A
G
T
A
A
G
T
T
A
T
C
A
A
C
T
G
C
A
A
-
C
A
A
G
G
-
-
A
G
A
G
A
G
C
A
A
G
C
-
C
A
G
T
C
C
A
A
C
C
A
T
G
G
-
A
A
G
T
G
A
-
-
A
A
3
C
C
T
A
A
A
T
T
A
A
T
49
-
-
G
A
-
-
A
A
A
-
T
C
T
A
G
-
-
-
-
G
T
-
A
G
2
2
-
G
G
A
-
C
A
-
C
T
G
A
-
C
C
A
G
T
T
T
G
G
T
A
G
G
G
C
A
G
A
T
G
C
A
T
-
T
C
T
A
G
T
A
T
G
T
G
C
C
C
T
A
G
A
G
C
T
G
A
A
T
C
G
C
T
A
G
T
G
-
4
2
-
T
C
G
A
T
T
A
G
G
T
A
T
G
10
C
A
A
T
T
G
A
A
A
T
G
C
C
C
A
  208,899,952
  208,899,988
  208,900,013
  208,900,104
  208,900,174
  208,900,227
  208,900,272
  208,900,405
  208,900,417
  208,900,457
  208,900,505
  208,900,594
  208,900,644
  208,900,654
  208,900,705
  208,900,727
  208,900,750
  208,900,751
  208,900,752
  208,900,791
  208,900,875
  208,901,001
  208,901,031
  208,901,067
  208,901,212
  208,901,284
  208,901,379
  208,901,446
  208,901,455
  208,901,549
  208,901,619
  208,901,769
  208,901,782
  208,901,824
  208,901,850
  208,901,910
  208,901,924
  208,902,049
  208,902,156
  208,902,255
  208,902,353
  208,902,440
  208,902,452
  208,902,454
  208,902,631
  208,902,934
  208,902,999
  208,903,124
  208,903,169
  208,903,205
  208,903,230
  208,903,393
  208,903,403
  208,903,517
  208,903,519
  208,903,538
  208,903,603
  208,903,636
  208,903,695
  208,903,761
  208,903,769
  208,903,845
  208,903,891
  208,903,913
  208,904,021
  208,904,112
  208,904,115
  208,904,128
  208,904,129
  208,904,165
  208,904,171
  208,904,205
  208,904,355
  208,904,397
  208,904,496
  208,904,503
  208,904,549
  208,904,772
  208,904,787
  208,904,807
  208,904,823
  208,904,919
  208,904,979
  208,904,984
  208,905,055
  208,905,133
  208,905,170
  208,905,183
  208,905,236
  208,905,283
  208,905,314
  208,905,343
  208,905,353
  208,905,511
  208,905,537
  208,905,615
  208,905,653
  208,905,717
  208,905,732
  208,905,798
  208,905,804
  208,905,838
  208,905,842
  208,905,843
  208,905,894
  208,905,897
  208,905,912
  208,905,923
  208,905,926
  208,906,126
  208,906,131
  208,906,208
  208,906,215
  208,906,235
  208,906,237
  208,906,248
  208,906,251
  208,906,282
  208,906,295
  208,906,310
  208,906,325
  208,906,380
  208,906,425
  208,906,434
  208,906,435
  208,906,445
  208,906,446
  208,906,456
  208,906,458
  208,906,472
  208,906,473
  208,906,477
  208,906,583
  208,906,836
  208,906,875
  208,906,883
  208,906,956
  208,906,960
  208,906,961
  208,907,004
  208,907,016
  208,907,040
  208,907,079
  208,907,112
  208,907,130
  208,907,235
  208,907,261
  208,907,435
  208,907,470
  208,907,497
  208,907,568
  208,907,576
  208,907,693
  208,907,719
  208,907,726
  208,907,783
  208,907,785
  208,907,800
  208,907,802
  208,907,820
  208,907,866
  208,907,920
  208,908,199
  208,908,223
  208,908,357
  208,908,541
  208,910,311
  208,912,949
  208,912,955
  208,912,974
  208,912,993
  208,913,001
  208,913,012
  208,913,066
  208,920,267
  208,923,411
  208,923,416
  208,923,418
  208,923,419
  208,923,425
  208,923,437
  208,924,373
  208,924,441
  208,924,465
  208,924,480
  208,924,500
  208,924,501
  208,924,518
  208,924,526
  208,924,535
  208,924,551
  208,924,584
  208,924,899
  208,924,915
  208,924,955
  208,924,965
  208,924,986
  208,925,026
  208,925,040
  208,925,053
  208,925,058
  208,925,065
  208,925,195
  208,925,198
  208,925,225
  208,925,230
  208,925,251
  208,925,267
  208,925,274
  208,925,282
  208,929,400
  208,931,637
  208,931,644
  208,931,658
  208,931,702
  208,931,704
  208,931,719
  208,931,769
  208,931,771
  208,931,778
  208,932,173
  208,932,191
  208,932,201
  208,932,209
  208,932,215
  208,932,217
  208,932,268
  208,932,290
  208,932,320
  208,932,335
  208,932,342
  208,932,401
  208,932,407
  208,932,414
  208,934,175
  208,934,194
  208,934,241
  208,934,250
  208,934,260
  208,934,264
  208,934,329
  208,935,536
  208,935,539
  208,935,552
  208,935,689
  208,935,692
  208,935,693
  208,935,697
  208,935,711
  208,935,713
  208,935,732
  208,935,735
  208,935,746
  208,935,757
  208,935,761
  208,935,770
  208,935,782
  208,935,803
  208,935,806
  208,935,860
  208,935,882
  208,935,887
  208,935,892
  208,935,927
  208,935,942
  208,935,944
  208,936,000
  208,936,001
  208,936,014
  208,936,032
  208,936,033
  208,936,046
  208,936,056
  208,936,065
  208,936,068
  208,936,077
  208,936,083
  208,936,090
  208,936,097
  208,936,105
  208,936,107
  208,936,110
  208,936,310
  208,936,317
  208,936,358
  208,936,368
  208,936,376
  208,936,381
  208,936,440
  208,936,474
  208,936,538
  208,936,543
  208,936,544
  208,936,568
  208,936,569
  208,936,589
  208,936,605
  208,936,609
  208,936,643
  208,936,646
  208,936,758
  208,936,778
  208,936,806
  208,936,846
T/G
C/T
A/C
C/A
C/G
A/T
-/38
C/T
C/A
G/C
C/T
C/T
G/A
T/C
A/G
A/G
G/A
T/C
G/A
A/C
A/G
C/A
G/A
A/G
T/G
G/T
T/G
G/A
T/C
C/T
T/A
T/C
C/T
A/T
G/T
C/T
T/C
C/T
T/C
A/G
A/T
A/C
T/C
C/T
A/G
T/A
A/T
T/A
-/4
T/C
T/-
C/T
A/G
A/G
T/C
T/G
C/A
G/T
-/3
C/T
T/C
G/A
C/T
G/A
T/C
C/G
G/A
G/A
T/C
-/T
G/A
A/G
A/G
T/C
G/-
T/C
T/C
T/A
A/G
C/A
T/G
G/C
A/G
G/A
T/A
C/T
G/A
G/A
C/G
2/-
T/C
T/C
T/C
A/G
C/-
G/C
A/G
A/G
A/G
G/C
T/C
A/G
A/T
G/A
T/A
T/A
A/C
T/G
C/T
A/T
A/C
C/G
T/C
G/A
C/A
A/G
A/G
-/4
C/A
A/G
A/T
G/A
G/T
-/A
-/T
A/G
G/A
A/-
G/-
A/C
G/A
C/A
A/G
A/G
G/A
C/T
-/A
C/-
A/G
G/A
T/C
C/-
C/T
A/C
A/T
C/T
C/T
A/G
T/G
G/A
G/A
-/G
A/G
A/G
G/-
T/A
G/A
A/G
-/A
-/A
A/T
A/T
3/-
C/T
C/A
T/-
G
A/T
A/T
T/C
T/C
A/C
A/G
T/A
-
C
2
T
T
T
T
-
-
-
C
-
A
-
-
A
A
A
T
G
-
-
C
-
-
-
-
A
-
-
-
A
-
-
G
-
-
-
-
T
-
A
-
A
-
-
T/C
G/T
G/A
T/C
A/G
G/A
G/A
G/A
C/T
A/C
G/A
A/G
T/C
G/T
C/A
A/T
T/C
G/C
T/C
C/T
T/A
A/C
G/A
T/C
A/T
T/C
G/A
T/C
G/A
C/T
C/T
C/A
T/G
A/C
G/A
A/G
G/A
C/-
T/-
G/A
A/G
A/G
T/C
C/A
G/C
C/A
T/G
A/G
G/A
T/G
G/A
T/T
4/-
2/-
-/2
T/A
C/T
G/A
A/C
T/C
T/C
A/T
G/A
G/A
T/C
A/G
T/A
G/C
10/-
C/G
A/G
A/C
T/C
T/C
G/A
A/G
A/T
A/-
T/G
G/A
C/T
C/A
C/T
A/C