Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 109,274 (bp)   Positions: 255
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.142
.999
.0
.0
.001
.001
.016
.539
.128
--
.009
.006
.002
--
--
--
--
--
.071
.002
.0
.106
.016
.006
.028
.014
.02
.002
.012
.061
.007
.003
.031
.001
.285
.124
.08
.001
.016
.486
.499
--
--
--
.116
.002
.015
.218
.119
.017
.011
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.968
.006
.003
--
--
--
--
--
--
.01
.021
.912
.005
.011
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.008
.005
.013
.0
.002
.0
.001
.299
.021
.031
.049
.006
.002
.035
.012
.083
.109
.005
.031
.144
.01
.0
.001
.002
.0
.0
.242
.0
.003
.042
.0
.0
.001
.001
.996
.002
.0
.0
.0
.003
.0
1.0
.001
.001
.001
.0
.001
.013
.074
.016
.0
.002
.002
.025
.014
.005
.0
.005
.065
.0
.009
.001
.0
.002
.0
.0
.0
1.0
.017
1.0
.003
.0
.01
.0
.011
.005
.064
.003
.006
.154
.052
.007
.002
.019
.07
.007
.024
.001
.007
.061
.122
.01
.006
.005
.003
.012
.171
.231
.019
.075
.001
.159
.018
.029
.117
.3
.003
.0
.069
.001
.0
.0
.002
.0
.254
.004
.0
.021
.0
.001
.043
.006
.031
.645
.0
.0
.0
.0
1.0
.052
.022
.032
.0
.02
.065
.001
.0
.012
.0
.0
.0
.001
.002
.001
.0
.004
.006
.027
.003
.017
.0
.001
.021
.001
.0
.0
.0
.0
.003
.052
.008
.002
.021
.001
.097
1.0
.26
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
A
G
C
T
A
C
C
A
C
A
G
G
C
T
G
G
A
G
C
G
T
T
C
T
T
T
G
A
G
C
A
A
C
T
C
T
T
C
T
T
G
T
G
C
T
A
G
G
A
C
A
A
G
G
C
A
A
T
C
G
G
C
G
T
G
G
G
T
A
A
T
A
T
T
G
G
C
A
A
T
A
C
G
A
T
G
C
A
T
T
C
C
C
T
T
A
C
A
T
C
T
G
T
A
T
G
C
T
T
G
A
A
C
G
A
A
G
T
G
T
G
A
G
A
A
C
G
A
G
G
T
G
C
A
G
G
T
C
T
G
A
A
T
A
T
A
A
T
T
C
C
G
C
A
C
T
T
G
A
G
T
C
C
A
T
A
A
A
T
T
G
T
G
C
A
G
A
G
A
A
C
C
T
T
A
T
A
C
G
C
G
G
A
C
T
A
T
T
C
G
G
A
C
A
G
A
C
G
G
T
G
A
A
C
T
G
G
G
A
C
G
T
A
T
G
T
A
A
C
A
T
C
C
G
T
T
C
A
A
G
T
T
T
C
T
C
C
C
C
G
G
G
G
T
  8,578,326
  8,579,346
  8,579,644
  8,579,653
  8,579,832
  8,580,596
  8,581,581
  8,581,696
  8,581,723
  8,581,875
  8,582,056
  8,582,222
  8,582,274
  8,582,634
  8,582,724
  8,582,725
  8,582,726
  8,582,851
  8,583,040
  8,583,090
  8,583,188
  8,583,392
  8,583,474
  8,583,515
  8,583,529
  8,583,576
  8,583,627
  8,583,683
  8,584,044
  8,584,081
  8,584,475
  8,584,517
  8,584,777
  8,584,911
  8,585,279
  8,585,386
  8,585,455
  8,585,473
  8,585,555
  8,585,640
  8,585,641
  8,585,882
  8,586,177
  8,586,242
  8,587,051
  8,587,258
  8,587,426
  8,587,679
  8,587,732
  8,587,747
  8,587,748
  8,588,154
  8,588,196
  8,588,223
  8,588,330
  8,588,351
  8,588,352
  8,588,357
  8,588,446
  8,588,471
  8,588,551
  8,588,711
  8,588,860
  8,588,954
  8,589,255
  8,589,345
  8,589,400
  8,589,688
  8,589,843
  8,590,167
  8,590,237
  8,590,303
  8,590,389
  8,590,961
  8,590,979
  8,591,170
  8,591,791
  8,591,917
  8,592,156
  8,592,211
  8,592,247
  8,592,268
  8,593,255
  8,593,501
  8,594,825
  8,595,370
  8,595,852
  8,631,068
  8,631,076
  8,631,300
  8,631,305
  8,631,711
  8,632,128
  8,632,660
  8,633,835
  8,634,140
  8,634,228
  8,634,657
  8,635,669
  8,635,705
  8,635,750
  8,635,759
  8,635,948
  8,636,012
  8,636,104
  8,636,126
  8,636,273
  8,636,425
  8,636,466
  8,636,487
  8,636,506
  8,636,683
  8,636,684
  8,636,715
  8,636,843
  8,636,864
  8,636,904
  8,637,123
  8,638,073
  8,638,098
  8,638,533
  8,638,668
  8,639,050
  8,639,121
  8,639,579
  8,640,238
  8,640,694
  8,640,830
  8,641,063
  8,641,353
  8,641,552
  8,641,563
  8,641,594
  8,642,199
  8,642,889
  8,642,907
  8,643,255
  8,643,333
  8,643,421
  8,643,722
  8,643,900
  8,643,985
  8,644,298
  8,644,499
  8,644,823
  8,645,088
  8,645,253
  8,645,296
  8,645,330
  8,645,358
  8,645,461
  8,645,628
  8,645,935
  8,646,296
  8,646,390
  8,646,577
  8,646,618
  8,646,702
  8,646,923
  8,646,964
  8,646,986
  8,648,557
  8,648,659
  8,648,781
  8,649,094
  8,649,154
  8,649,181
  8,649,185
  8,649,237
  8,649,313
  8,649,436
  8,649,647
  8,649,781
  8,649,851
  8,650,079
  8,650,295
  8,650,572
  8,650,761
  8,650,832
  8,651,017
  8,651,101
  8,651,103
  8,651,180
  8,651,248
  8,652,829
  8,653,794
  8,654,145
  8,655,495
  8,655,569
  8,655,670
  8,655,686
  8,655,782
  8,656,422
  8,656,503
  8,656,810
  8,657,192
  8,657,232
  8,657,337
  8,657,388
  8,657,448
  8,658,210
  8,658,541
  8,658,722
  8,660,975
  8,662,069
  8,662,253
  8,662,262
  8,663,247
  8,664,206
  8,664,681
  8,665,092
  8,665,410
  8,665,493
  8,665,929
  8,666,282
  8,669,135
  8,669,872
  8,670,143
  8,670,539
  8,671,031
  8,671,258
  8,671,439
  8,672,030
  8,672,253
  8,672,649
  8,672,871
  8,674,601
  8,675,424
  8,675,454
  8,675,635
  8,675,787
  8,676,117
  8,677,377
  8,677,549
  8,677,684
  8,677,698
  8,678,371
  8,678,831
  8,679,002
  8,679,102
  8,679,420
  8,680,141
  8,680,145
  8,680,311
  8,680,312
  8,680,369
  8,680,977
  8,681,029
  8,681,480
  8,682,551
  8,682,955
  8,682,995
  8,683,604
  8,685,372
  8,685,762
T
T
C
T
C
G
T
T
G
T
G
A
A
T
C
A
C
G
A
T
A
C
C
T
C
G
G
A
G
A
T
T
T
T
C
T
C
A
T
A
G
A
C
A
T
A
T
A
A
G
T
G
G
A
T
T
G
G
C
G
C
T
T
A
C
A
C
A
G
G
G
A
G
C
A
A
C
T
G
G
C
T
A
A
G
G
T
G
G
G
C
T
T
T
A
C
G
A
C
C
T
C
T
G
C
C
A
G
A
C
A
T
T
T
C
C
G
A
A
A
G
A
T
T
G
T
A
T
G
T
A
C
A
T
G
A
A
C
T
C
T
T
G
G
T
G
G
G
G
C
A
T
A
T
C
A
C
C
A
G
A
C
G
T
G
C
G
G
G
C
C
A
C
A
T
G
A
G
A
G
C
A
T
A
C
C
C
G
G
A
T
T
C
G
A
C
G
C
C
T
A
C
C
T
G
T
G
T
T
A
C
A
G
G
T
C
A
T
A
G
T
A
C
C
G
C
C
G
G
T
C
C
A
T
A
C
C
T
T
G
A
C
A
A
A
C
T
T
T
T
A
A
C
A
C