Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 109,274 (bp)   Positions: 332
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.999
.001
.001
.016
.539
.128
--
.009
.006
.002
--
--
--
--
--
.071
.002
.0
.106
.016
.006
.028
.014
.02
.002
.012
.061
.0
.006
.007
.003
.031
.162
.001
.285
.124
.08
.001
.016
.486
.499
--
--
--
--
--
--
.004
.335
.001
.931
.116
.002
.015
.022
.003
.218
.119
.017
.011
.048
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.968
.006
.002
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
.01
.021
.912
.005
.373
.011
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.0
.001
.0
.0
.0
.278
.018
.011
.316
.007
.008
.005
.001
.0
.003
.003
.0
.004
.006
.008
.0
.001
.0
.001
.0
.013
.01
.0
.001
.0
.023
.001
.004
.0
.0
.001
.017
.008
.031
.004
.001
.006
.002
.012
.031
.01
.009
.0
.019
.002
.0
.89
1.0
.001
.006
.001
.001
.0
.081
.013
.029
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.065
.0
.009
.0
.0
.0
.003
.003
.0
.01
.0
.732
.068
.208
--
.003
.011
.01
.006
.052
.002
.019
.306
.07
.007
.001
.058
.007
.01
.005
.003
.012
.171
.645
.139
.004
.002
.008
.052
.082
.363
.4
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.014
.411
.231
.004
.04
.006
.075
.01
--
.001
.003
.0
.022
.069
.147
.001
.0
.002
.008
.014
.884
.029
.0
.002
.001
.088
.351
.041
.645
.007
.0
.0
.0
.0
1.0
.052
.032
.0
.065
.004
.104
.001
.001
.0
.012
.0
.016
.031
.001
.005
--
--
.014
.0
.0
.001
.756
.0
.001
.0
.0
.006
.0
.003
.003
.001
.001
.0
.002
.0
.004
.017
.028
.002
.001
.021
.058
.001
.0
.0
.003
.001
.052
.008
.006
.002
1.0
.035
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
A
A
C
C
C
A
C
A
G
G
C
T
G
G
A
G
C
G
T
T
C
T
T
T
G
A
G
-
G
C
A
A
G
C
T
C
T
T
C
T
T
G
T
-
T
-
G
T
G
G
T
C
T
A
A
G
G
G
A
C
A
T
C
A
A
G
G
C
A
A
T
C
G
G
C
G
T
G
C
G
G
T
A
G
A
A
T
A
T
T
G
G
C
C
A
A
T
A
C
G
G
T
A
T
G
-
C
G
-
T
G
-
A
-
T
-
T
A
T
-
G
C
C
G
G
C
C
2
-
-
T
G
-
-
C
A
2
-
G
-
T
T
T
C
-
-
G
A
A
T
G
T
G
C
T
C
C
G
A
-
G
-
A
C
4
G
T
T
T
C
A
T
2
A
A
G
A
2
-
G
T
G
-
A
4
T
G
-
G
G
T
C
T
A
A
T
C
G
A
T
T
A
G
-
C
A
A
-
T
G
T
A
T
T
T
G
T
G
A
A
G
A
C
C
T
G
-
-
T
T
C
C
-
T
-
2
A
T
G
C
C
G
T
G
-
T
C
G
C
T
-
C
A
A
C
-
T
2
A
T
C
6
2
A
A
A
G
-
-
T
A
T
-
G
A
A
8
T
G
G
A
G
G
G
G
T
A
T
G
-
6
3
27
A
C
G
T
A
A
C
C
A
T
T
-
T
2
G
A
G
T
G
C
G
T
T
A
A
A
G
G
C
T
T
-
C
C
G
-
G
C
  8,579,177
  8,579,346
  8,580,596
  8,580,681
  8,581,581
  8,581,696
  8,581,723
  8,581,875
  8,582,056
  8,582,222
  8,582,274
  8,582,634
  8,582,724
  8,582,725
  8,582,726
  8,582,851
  8,583,040
  8,583,090
  8,583,188
  8,583,392
  8,583,474
  8,583,515
  8,583,529
  8,583,576
  8,583,627
  8,583,683
  8,584,044
  8,584,081
  8,584,191
  8,584,199
  8,584,475
  8,584,517
  8,584,777
  8,584,815
  8,584,911
  8,585,279
  8,585,386
  8,585,455
  8,585,473
  8,585,555
  8,585,640
  8,585,641
  8,585,882
  8,585,922
  8,586,027
  8,586,177
  8,586,219
  8,586,242
  8,586,698
  8,586,782
  8,586,791
  8,586,853
  8,587,051
  8,587,258
  8,587,426
  8,587,603
  8,587,633
  8,587,679
  8,587,732
  8,587,747
  8,587,748
  8,587,809
  8,587,942
  8,587,970
  8,588,154
  8,588,196
  8,588,223
  8,588,330
  8,588,351
  8,588,352
  8,588,357
  8,588,446
  8,588,471
  8,588,551
  8,588,711
  8,588,860
  8,588,954
  8,589,255
  8,589,345
  8,589,383
  8,589,400
  8,589,688
  8,589,843
  8,589,951
  8,589,955
  8,590,167
  8,590,237
  8,590,303
  8,590,389
  8,590,961
  8,590,979
  8,591,170
  8,591,791
  8,591,896
  8,591,917
  8,592,156
  8,592,211
  8,592,247
  8,592,268
  8,593,255
  8,593,501
  8,594,227
  8,594,252
  8,594,825
  8,595,370
  8,595,852
  8,595,961
  8,596,182
  8,596,608
  8,596,668
  8,596,798
  8,596,815
  8,596,831
  8,596,853
  8,596,861
  8,596,873
  8,596,885
  8,596,893
  8,596,896
  8,596,899
  8,596,914
  8,596,917
  8,596,921
  8,596,927
  8,630,826
  8,630,833
  8,630,872
  8,630,886
  8,630,893
  8,630,907
  8,630,921
  8,630,964
  8,630,974
  8,631,018
  8,631,067
  8,631,068
  8,631,076
  8,631,086
  8,631,101
  8,631,131
  8,631,143
  8,631,152
  8,631,167
  8,631,183
  8,631,185
  8,631,191
  8,631,199
  8,631,204
  8,631,209
  8,631,276
  8,631,300
  8,631,303
  8,631,305
  8,631,801
  8,632,128
  8,632,621
  8,632,660
  8,632,675
  8,632,826
  8,633,314
  8,633,317
  8,633,571
  8,634,040
  8,634,228
  8,634,433
  8,634,738
  8,635,563
  8,635,705
  8,635,759
  8,636,126
  8,636,425
  8,636,427
  8,636,466
  8,636,824
  8,637,768
  8,640,238
  8,641,053
  8,641,063
  8,641,160
  8,641,167
  8,641,353
  8,641,563
  8,641,594
  8,642,562
  8,642,889
  8,643,093
  8,643,333
  8,643,341
  8,643,352
  8,643,573
  8,644,089
  8,644,499
  8,644,500
  8,645,088
  8,645,253
  8,645,296
  8,645,358
  8,645,628
  8,645,935
  8,646,264
  8,646,702
  8,646,831
  8,646,964
  8,646,986
  8,647,332
  8,647,485
  8,647,567
  8,647,950
  8,647,967
  8,648,557
  8,649,074
  8,649,154
  8,649,185
  8,649,313
  8,649,436
  8,649,550
  8,649,647
  8,649,781
  8,649,797
  8,650,236
  8,650,295
  8,650,832
  8,651,101
  8,651,103
  8,651,180
  8,651,248
  8,651,313
  8,651,362
  8,651,411
  8,651,413
  8,651,415
  8,651,419
  8,651,420
  8,651,924
  8,651,937
  8,652,148
  8,652,150
  8,652,155
  8,652,156
  8,652,161
  8,652,164
  8,652,168
  8,652,212
  8,652,214
  8,652,620
  8,652,791
  8,652,829
  8,653,179
  8,653,488
  8,653,799
  8,654,145
  8,654,457
  8,654,730
  8,655,495
  8,656,503
  8,656,810
  8,657,191
  8,657,192
  8,657,194
  8,657,232
  8,657,337
  8,657,448
  8,658,443
  8,658,454
  8,661,103
  8,661,184
  8,661,284
  8,661,508
  8,662,218
  8,663,836
  8,663,982
  8,664,643
  8,665,092
  8,665,185
  8,665,410
  8,665,493
  8,665,929
  8,667,914
  8,669,135
  8,669,872
  8,670,539
  8,671,031
  8,671,439
  8,671,608
  8,671,679
  8,671,920
  8,672,030
  8,672,253
  8,672,649
  8,672,871
  8,673,575
  8,673,729
  8,673,755
  8,673,759
  8,673,919
  8,673,952
  8,674,283
  8,674,601
  8,675,424
  8,675,454
  8,675,689
  8,675,722
  8,675,787
  8,676,056
  8,676,117
  8,676,165
  8,676,514
  8,676,696
  8,676,698
  8,676,700
  8,676,756
  8,677,055
  8,677,499
  8,677,522
  8,677,856
  8,678,371
  8,678,442
  8,678,658
  8,679,002
  8,679,102
  8,679,341
  8,679,420
  8,679,520
  8,680,141
  8,680,369
  8,680,706
  8,680,977
  8,681,029
  8,681,047
  8,682,439
  8,683,604
  8,684,398
T
T
G
T
T
T
G
T
G
A
A
T
C
A
C
G
A
T
A
C
C
T
C
G
G
A
G
A
17
A
T
T
T
-
T
C
T
C
A
T
A
G
A
C
A
C
2
A
C
A
A
C
T
A
T
C
A
A
A
G
T
-
C
T
G
G
A
T
T
G
G
C
G
C
T
T
A
C
A
-
C
A
G
T
A
G
G
A
G
C
A
A
C
-
T
G
G
C
T
A
A
A
C
G
G
T
T
T
A
A
-
-
A
-
T
G
T
-
T
A
T
-
T
A
-
-
-
-
-
T
C
-
-
G
G
G
G
-
C
-
C
-
-
-
-
C
A
-
-
G
G
A
C
A
T
C
T
T
A
-
A
C
23
G
T
-
A
C
C
C
G
-
A
-
G
T
A
G
-
2
T
C
A
-/3
G
-
C
A
2
A
A
G
T
G
G
G
C
T
A
G
C
C
G
A
A
A
G
G
6
C
A
C
G
C
C
G
A
C
A
T
G
A
C
A
T
A
A
2
3
A
-
A
T
A
C
2
-
T
A
C
G
G
C
C
A
A
C
A
A
T
C
A
A
G
G
A
2
C
-
G
C
T
-
-
G
G
G
A
-/G
4
A
G
C
T
A
G
G
-
C
A
A
G
A
A
A
A
C
C
G
C
4
-
-
-
-
T
C
C
G
G
T
T
C
G
C
G
G
-
T
T
A
C
-
G
A
C
C
G
T
G
A
A
T
C
C
C
T
T
A
2
C
T