Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 109,274 (bp)   Positions: 295
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.03
.189
.007
.004
.006
.001
.999
.001
.539
.128
--
.009
.006
.002
--
--
--
--
.071
.002
.106
.016
.028
.014
.02
.012
.061
.0
.007
.003
.162
.001
.285
.124
.08
.001
.015
.029
.486
.499
--
--
--
--
--
--
--
.004
.116
.002
.015
.022
.003
.218
.119
.017
.011
.048
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.018
.968
.006
.002
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.01
.543
.912
.058
.005
.011
.008
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.0
.001
.0
.0
.0
.278
.018
.011
.316
.007
.008
.005
.001
.0
.003
.0
.004
.006
.008
.0
.001
.0
.001
.002
.013
.0
.001
.282
.008
.021
.012
.01
.009
.019
.001
.0
.0
.001
.0
.003
.0
.001
.001
.996
.002
.0
.0
.134
.0
.006
.002
.002
.002
.515
1.0
.0
.013
.005
.002
.0
.003
.005
.2
.07
.01
.005
.003
.171
.139
.004
.002
.008
.052
.082
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.014
.231
.052
.05
.002
.001
.0
.007
.254
.004
.001
.029
.0
.021
.0
.001
.088
.351
.999
.645
.007
.0
.0
.0
.0
1.0
.715
.032
.0
.004
.014
.001
.0
.012
.0
.001
.0
.004
.001
--
.0
.023
.0
.001
.006
.0
.0
.002
.0
.464
.017
.032
.001
.021
.001
.0
.003
.001
.052
.008
.001
.097
1.0
.011
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
Chat
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
2
C
C
T
T
A
T
C
A
G
A
G
G
T
G
G
A
G
C
T
T
T
T
T
A
G
-
C
A
G
C
T
C
T
T
T
A
T
T
G
G
T
-
T
-
G
T
C
T
A
A
G
G
G
A
C
A
T
C
A
A
G
G
C
A
A
T
C
G
G
C
T
G
C
G
G
T
A
A
A
A
T
A
-
T
C
G
A
G
C
C
A
C
A
T
A
G
A
A
C
G
A
T
A
A
C
A
T
T
T
2
T
T
C
G
-
G
A
C
C
G
T
C
T
C
T
-
C
G
-
G
A
A
T
G
-
A
-
T
-
T
A
T
-
C
G
G
C
C
2
-
-
T
G
-
-
C
A
2
-
G
T
T
T
C
-
-
G
A
C
T
A
-
C
-
T
T
C
A
2
-
-
A
-
-
-
T
5
T
G
A
G
A
-
A
C
G
C
A
T
A
C
A
-
G
T
T
G
C
G
G
A
C
T
-
-
T
T
C
C
-
2
A
T
G
C
C
G
T
C
T
T
A
C
7
G
G
G
A
A
A
A
A
G
A
-
T
T
T
-
G
A
A
8
T
20
G
A
G
G
T
A
T
G
C
C
4
C
C
T
4
A
A
-
T
T
G
G
-
T
A
A
A
G
T
T
-
C
C
17
G
G
G
T
  8,577,584
  8,577,633
  8,577,638
  8,577,643
  8,577,648
  8,578,634
  8,579,346
  8,579,832
  8,581,696
  8,581,723
  8,581,887
  8,582,056
  8,582,222
  8,582,274
  8,582,724
  8,582,725
  8,582,726
  8,582,851
  8,583,040
  8,583,090
  8,583,392
  8,583,474
  8,583,529
  8,583,576
  8,583,627
  8,584,044
  8,584,081
  8,584,191
  8,584,475
  8,584,517
  8,584,815
  8,584,911
  8,585,279
  8,585,386
  8,585,455
  8,585,473
  8,585,554
  8,585,606
  8,585,640
  8,585,641
  8,585,882
  8,585,884
  8,585,922
  8,586,027
  8,586,177
  8,586,219
  8,586,242
  8,586,698
  8,587,051
  8,587,258
  8,587,426
  8,587,603
  8,587,633
  8,587,679
  8,587,732
  8,587,747
  8,587,748
  8,587,809
  8,587,942
  8,587,970
  8,588,154
  8,588,196
  8,588,223
  8,588,330
  8,588,351
  8,588,352
  8,588,357
  8,588,446
  8,588,471
  8,588,551
  8,588,954
  8,589,197
  8,589,255
  8,589,345
  8,589,383
  8,589,400
  8,589,688
  8,589,843
  8,589,951
  8,589,971
  8,590,167
  8,590,237
  8,590,303
  8,590,389
  8,590,395
  8,590,961
  8,591,025
  8,591,170
  8,591,738
  8,591,791
  8,591,917
  8,592,078
  8,592,156
  8,592,195
  8,592,211
  8,592,247
  8,592,268
  8,592,281
  8,592,358
  8,592,435
  8,592,442
  8,592,495
  8,592,736
  8,592,791
  8,592,793
  8,592,903
  8,593,081
  8,593,126
  8,593,694
  8,593,828
  8,593,842
  8,593,844
  8,594,018
  8,594,252
  8,594,288
  8,594,407
  8,594,486
  8,594,556
  8,594,825
  8,594,980
  8,595,171
  8,595,260
  8,595,370
  8,595,398
  8,595,456
  8,595,459
  8,595,555
  8,595,969
  8,596,069
  8,596,608
  8,596,668
  8,596,680
  8,596,783
  8,596,786
  8,596,798
  8,596,815
  8,596,831
  8,596,853
  8,596,861
  8,596,873
  8,596,885
  8,596,893
  8,596,896
  8,596,899
  8,596,914
  8,596,919
  8,630,826
  8,630,833
  8,630,872
  8,630,886
  8,630,893
  8,630,907
  8,630,921
  8,630,964
  8,630,974
  8,631,018
  8,631,067
  8,631,068
  8,631,076
  8,631,086
  8,631,101
  8,631,131
  8,631,152
  8,631,167
  8,631,183
  8,631,185
  8,631,191
  8,631,199
  8,631,204
  8,631,209
  8,631,224
  8,631,300
  8,633,314
  8,633,317
  8,633,672
  8,634,040
  8,634,140
  8,635,759
  8,636,425
  8,636,427
  8,636,824
  8,637,819
  8,637,820
  8,637,821
  8,637,824
  8,637,825
  8,637,827
  8,638,073
  8,638,233
  8,638,533
  8,638,668
  8,639,050
  8,639,121
  8,639,579
  8,639,987
  8,640,238
  8,640,883
  8,640,897
  8,640,986
  8,640,987
  8,641,024
  8,641,063
  8,642,454
  8,642,889
  8,643,417
  8,644,287
  8,644,499
  8,646,702
  8,646,765
  8,647,262
  8,649,647
  8,650,832
  8,651,101
  8,651,103
  8,651,248
  8,651,362
  8,651,411
  8,651,413
  8,651,415
  8,651,419
  8,651,420
  8,652,148
  8,652,150
  8,652,155
  8,652,156
  8,652,161
  8,652,164
  8,652,168
  8,652,212
  8,652,214
  8,652,550
  8,652,829
  8,653,843
  8,653,878
  8,657,448
  8,658,021
  8,658,210
  8,658,525
  8,658,541
  8,658,722
  8,660,576
  8,661,184
  8,661,284
  8,662,069
  8,662,253
  8,662,262
  8,663,836
  8,663,982
  8,664,760
  8,665,092
  8,665,185
  8,665,410
  8,665,493
  8,665,929
  8,667,914
  8,669,135
  8,669,267
  8,670,539
  8,671,031
  8,671,608
  8,671,788
  8,672,030
  8,672,253
  8,672,649
  8,672,871
  8,672,883
  8,673,123
  8,673,593
  8,673,788
  8,673,952
  8,674,601
  8,675,176
  8,675,424
  8,675,454
  8,675,714
  8,676,117
  8,676,398
  8,676,969
  8,677,204
  8,677,784
  8,678,371
  8,678,588
  8,679,002
  8,679,102
  8,679,420
  8,680,141
  8,680,369
  8,680,706
  8,680,977
  8,681,029
  8,681,377
  8,682,995
  8,683,604
  8,685,666
  8,685,762
A
-
T
-
C
C
T
C
T
G
T
G
A
A
C
A
C
G
A
T
C
C
C
G
G
G
A
17
T
T
-
T
C
T
C
A
C
G
A
G
A
A
C
A
C
2
A
C
T
A
T
C
A
A
A
G
T
-
C
T
G
G
A
T
T
G
G
C
G
C
A
T
C
A
-
C
A
G
T
G
G
G
A
G
T
C
T
A
G
C
T
T
G
T
G
C
T
A
G
G
A
A
G
C
C
G
T
G
C
C
-
-
C
C
T
A
G
A
G
T
A
A
G
A
G
T
C
A
T
A
A
-
-
-
-
-
A
-
T
G
T
-
T
A
T
T
-
-
-
-
-
T
C
-
-
G
G
G
G
-
C
-
-
-
-
-
C
A
-
-
T
G
-
A
A
23
C
C
G
-
-
G
6
C
A
4
46
A
-
G
A
T
T
G
T
T
T
A
T
C
C
G
T
G
10
A
G
C
A
T
A
A
C
A
A
2
3
A
-
A
T
2
-
T
A
C
G
G
C
C
T
C
A
G
T
-
A
A
C
C
G
G
G
G
T
G
4
A
G
C
T
A
G
G
-
C
-
A
G
A
A
C
C
G
C
T
T
-
A
T
C
-
G
G
A
C
A
A
C
5
C
C
T
G
A
C
C
C
T
T
-
A
C
C
C