Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 398,531 (bp)   Positions: 425
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.06
.0
.172
.004
.222
.002
.974
.006
.037
.001
.032
.0
.008
.0
.001
.006
.004
.003
.0
.0
.7
.038
.051
.134
.009
.086
.002
.995
.989
.007
.009
.003
.022
.028
.035
.0
.014
.09
.007
.362
.187
.003
.041
.0
.0
.0
.001
.0
.511
.0
.0
.29
.177
.003
.001
.005
.004
.453
--
--
.15
.158
.66
.001
.0
.008
.001
.488
.002
.0
.0
.028
.237
.0
.001
.049
.825
.014
.026
.094
.004
.001
.12
.002
.025
.1
.018
.166
.004
.018
.007
.007
.962
.003
.0
.0
.0
--
.104
.84
.002
.001
.002
.485
.001
.001
.003
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.001
.0
.054
.0
.007
.0
.0
.002
.0
.006
.661
.001
.001
.002
.004
.006
.968
1.0
.001
.002
.022
.038
.011
.0
.001
.006
.001
.012
.005
.001
.0
.001
.0
.003
.009
.013
.011
.489
.006
.01
.007
--
.014
.006
.007
.018
.002
.01
.004
.002
--
.0
.039
.183
.0
.995
.008
.0
.002
--
--
.006
.002
.002
.003
.002
.002
.018
.001
.0
.001
.0
.013
.012
.004
.003
.09
.0
.001
.008
.0
.0
.046
.052
.001
.002
.067
.075
.002
.089
.001
.03
.001
.001
.0
.201
.0
.007
.006
.0
.013
.0
.002
.254
.003
.016
.0
.001
.095
.03
.001
.001
.0
.013
.321
.001
.001
.094
.003
.002
.13
.126
.002
.005
.029
.001
.004
.003
.011
.004
.008
.0
.001
.001
.003
.001
.002
.0
.023
.003
.014
.002
.038
.0
.015
.013
.069
.002
.05
--
.018
.01
.034
.042
.024
.0
.014
.0
.007
.0
.0
.001
.001
.001
.002
.002
.0
.001
.052
.003
.013
.004
.001
.0
.0
1.0
.017
.001
.009
.004
.002
.022
.002
.0
.007
.008
.004
.002
.006
.042
.001
.001
.017
.999
.0
.024
.002
.012
.118
.004
.064
.021
.002
.588
.006
.0
.001
.022
.0
.102
.0
.0
.0
.001
.001
.321
.913
.004
.0
.208
.0
.0
.098
.0
.014
.001
.002
.004
.0
.001
.0
.002
.0
.001
.018
.089
.003
.084
.002
.021
.006
.003
.0
.0
.022
.134
.059
.014
.005
.218
.002
.0
.0
.163
.001
.0
.004
.007
.049
.234
.008
.138
.054
1.0
.0
.002
.007
.119
.005
.007
.018
.001
.0
.0
.054
.244
.199
.091
.021
.132
.146
.675
.001
.116
.003
.088
.029
.001
.023
.003
.001
.021
.018
.0
.0
.0
.0
.0
.003
.0
.991
.005
.0
.18
.001
.003
.004
.002
.0
.002
.008
.008
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
A
G
T
A
C
C
C
G
G
A
A
G
A
G
A
A
A
C
T
T
G
T
T
T
T
T
C
T
C
T
A
G
G
C
A
T
C
A
A
T
G
G
A
C
T
C
A
C
A
G
G
C
T
T
A
G
A
A
G
A
C
T
G
G
T
A
T
C
C
G
G
C
A
C
G
G
C
G
C
A
A
T
A
T
G
T
C
T
A
G
A
T
C
A
A
T
C
T
T
G
G
T
T
T
T
G
T
T
T
C
G
C
C
A
A
A
A
T
T
A
A
G
T
C
G
A
T
T
G
C
G
A
T
T
C
T
T
G
G
A
C
C
T
A
G
T
G
C
C
G
C
C
A
G
G
C
A
G
C
A
C
G
A
A
C
A
T
T
T
T
C
A
T
G
A
T
T
T
T
T
C
G
A
T
T
A
C
T
T
A
T
A
A
T
A
A
G
C
T
G
A
A
A
A
G
G
A
A
A
T
A
T
A
A
C
C
C
C
A
T
C
A
G
T
A
G
C
A
G
C
A
G
G
A
A
G
A
T
C
T
T
C
T
T
A
G
T
T
A
T
A
G
A
A
G
A
T
C
C
T
G
A
G
C
G
T
G
G
G
T
G
A
C
C
T
C
A
A
A
A
A
G
G
A
G
G
G
A
T
T
A
A
G
G
A
C
T
G
T
T
G
A
G
C
C
C
C
A
T
A
A
C
T
G
G
A
C
A
T
G
G
C
G
C
A
C
C
A
G
A
A
A
T
A
T
A
T
C
T
G
G
G
T
A
G
A
C
G
A
A
A
C
G
G
A
G
G
T
T
G
A
C
G
G
T
G
A
A
A
G
C
T
T
T
A
T
G
G
A
G
A
A
A
G
T
T
C
T
G
A
G
G
G
C
C
T
C
T
G
G
A
G
T
A
C
T
A
G
C
G
G
C
C
T
T
C
C
G
G
C
C
A
C
C
T
  114,761,225
  114,762,891
  114,770,444
  114,770,988
  114,772,371
  114,774,211
  114,775,870
  114,777,600
  114,777,822
  114,778,145
  114,778,476
  114,778,875
  114,781,071
  114,784,874
  114,785,309
  114,785,751
  114,786,315
  114,787,881
  114,787,975
  114,788,660
  114,788,992
  114,791,506
  114,791,980
  114,792,018
  114,793,574
  114,793,708
  114,793,853
  114,796,608
  114,796,661
  114,797,236
  114,798,720
  114,800,449
  114,800,970
  114,801,491
  114,801,492
  114,801,544
  114,801,583
  114,802,283
  114,802,290
  114,810,205
  114,812,188
  114,812,685
  114,813,300
  114,814,259
  114,815,354
  114,815,739
  114,816,396
  114,816,803
  114,817,564
  114,818,043
  114,818,289
  114,818,832
  114,818,839
  114,819,430
  114,819,450
  114,819,515
  114,821,075
  114,825,869
  114,835,617
  114,836,753
  114,839,172
  114,839,173
  114,839,471
  114,839,688
  114,839,691
  114,839,712
  114,839,795
  114,841,454
  114,841,744
  114,841,808
  114,841,970
  114,842,016
  114,842,023
  114,842,516
  114,842,611
  114,843,140
  114,843,718
  114,844,546
  114,844,611
  114,844,680
  114,845,267
  114,845,303
  114,845,534
  114,845,561
  114,846,499
  114,847,296
  114,847,504
  114,847,907
  114,847,974
  114,848,209
  114,852,707
  114,862,041
  114,862,322
  114,863,659
  114,863,695
  114,865,266
  114,868,464
  114,870,300
  114,872,939
  114,874,191
  114,874,539
  114,874,541
  114,874,542
  114,875,820
  114,876,065
  114,876,382
  114,881,667
  114,881,732
  114,881,747
  114,881,800
  114,881,857
  114,882,054
  114,882,194
  114,882,280
  114,882,347
  114,882,424
  114,882,433
  114,882,442
  114,882,450
  114,882,473
  114,882,485
  114,882,495
  114,882,520
  114,882,702
  114,882,989
  114,883,395
  114,883,535
  114,883,537
  114,883,792
  114,884,206
  114,884,340
  114,884,709
  114,885,127
  114,885,168
  114,885,431
  114,885,541
  114,885,800
  114,885,840
  114,885,984
  114,886,010
  114,886,161
  114,886,436
  114,886,806
  114,886,994
  114,887,291
  114,887,377
  114,887,516
  114,887,583
  114,887,829
  114,887,960
  114,888,366
  114,888,813
  114,889,260
  114,889,338
  114,890,663
  114,890,795
  114,892,788
  114,893,084
  114,893,691
  114,894,877
  114,896,437
  114,896,530
  114,897,339
  114,897,986
  114,899,605
  114,901,170
  114,902,001
  114,902,663
  114,904,169
  114,904,517
  114,904,565
  114,912,024
  114,917,600
  114,918,459
  114,920,104
  114,920,442
  114,920,592
  114,922,956
  114,924,008
  114,924,132
  114,924,180
  114,925,141
  114,925,150
  114,925,180
  114,925,238
  114,925,345
  114,925,763
  114,925,892
  114,927,271
  114,927,433
  114,927,489
  114,927,896
  114,928,204
  114,929,153
  114,929,669
  114,936,924
  114,937,511
  114,937,623
  114,938,003
  114,938,061
  114,938,097
  114,938,528
  114,938,651
  114,939,028
  114,939,586
  114,939,939
  114,940,006
  114,940,292
  114,941,009
  114,941,386
  114,941,504
  114,941,570
  114,941,573
  114,941,709
  114,941,756
  114,941,990
  114,943,614
  114,944,121
  114,944,192
  114,944,425
  114,944,903
  114,944,907
  114,944,929
  114,944,941
  114,945,015
  114,945,024
  114,945,059
  114,945,080
  114,945,146
  114,945,225
  114,945,560
  114,946,193
  114,946,216
  114,946,269
  114,946,272
  114,946,288
  114,947,554
  114,948,278
  114,948,336
  114,949,028
  114,949,176
  114,949,186
  114,949,234
  114,949,275
  114,949,665
  114,949,779
  114,949,836
  114,950,122
  114,951,454
  114,951,511
  114,951,696
  114,951,714
  114,951,878
  114,952,534
  114,953,008
  114,953,011
  114,953,172
  114,954,611
  114,955,965
  114,956,210
  114,956,221
  114,956,542
  114,957,329
  114,959,132
  114,959,302
  114,959,574
  114,960,921
  114,964,548
  114,964,741
  114,964,761
  114,965,902
  114,969,385
  114,969,425
  114,969,427
  114,969,428
  114,969,438
  114,969,473
  114,969,500
  114,969,528
  114,969,539
  114,970,787
  114,974,582
  114,974,607
  114,974,679
  114,993,289
  114,993,306
  114,994,633
  114,995,268
  114,996,066
  114,996,408
  115,008,153
  115,010,758
  115,012,235
  115,012,558
  115,012,797
  115,013,149
  115,013,934
  115,014,214
  115,015,197
  115,015,207
  115,016,389
  115,017,518
  115,017,591
  115,019,503
  115,020,923
  115,037,797
  115,038,210
  115,039,279
  115,041,299
  115,041,455
  115,045,754
  115,047,340
  115,047,719
  115,049,494
  115,050,033
  115,061,856
  115,064,794
  115,065,059
  115,065,858
  115,066,810
  115,066,834
  115,066,848
  115,067,732
  115,069,059
  115,069,391
  115,069,654
  115,070,157
  115,070,412
  115,070,667
  115,071,033
  115,072,982
  115,073,764
  115,074,596
  115,077,189
  115,077,840
  115,078,952
  115,079,057
  115,079,218
  115,079,340
  115,079,458
  115,079,542
  115,079,840
  115,082,315
  115,082,328
  115,082,332
  115,087,519
  115,089,567
  115,090,584
  115,090,943
  115,092,044
  115,093,460
  115,094,423
  115,094,975
  115,094,979
  115,094,981
  115,095,187
  115,095,651
  115,097,244
  115,097,430
  115,097,440
  115,098,778
  115,100,669
  115,101,392
  115,101,714
  115,101,892
  115,102,185
  115,103,172
  115,103,427
  115,104,258
  115,104,712
  115,107,763
  115,108,431
  115,109,421
  115,109,473
  115,110,154
  115,110,161
  115,117,773
  115,117,930
  115,118,227
  115,118,286
  115,119,356
  115,128,052
  115,137,924
  115,140,468
  115,140,657
  115,140,823
  115,141,364
  115,141,681
  115,142,882
  115,147,858
  115,147,885
  115,148,639
  115,148,644
  115,148,738
  115,149,267
  115,149,743
  115,149,853
  115,149,955
  115,150,305
  115,150,531
  115,151,337
  115,151,455
  115,151,467
  115,151,751
  115,152,328
  115,153,188
  115,154,411
  115,154,512
  115,154,552
  115,154,707
  115,155,130
  115,155,434
  115,155,438
  115,155,580
  115,155,781
  115,155,923
  115,156,069
  115,156,124
  115,156,202
  115,156,257
  115,156,346
  115,156,364
  115,156,571
  115,156,696
  115,156,698
C
C
C
G
T
T
A
C
A
G
T
C
G
A
T
G
G
T
C
C
A
C
C
G
A
C
G
C
T
C
G
T
A
A
G
G
G
T
C
C
T
A
T
T
C
T
C
T
C
A
A
T
A
C
G
A
G
T
A
C
T
C
C
A
C
G
C
T
T
A
A
A
G
T
A
A
T
A
G
G
G
C
G
A
T
C
T
C
G
A
G
G
T
G
G
A
T
C
C
A
A
C
A
C
C
A
A
C
A
G
A
T
T
G
G
G
G
C
C
C
G
A
C
T
A
G
C
C
T
T
A
G
C
C
G
A
C
A
A
T
G
T
C
G
A
C
A
A
G
A
T
T
G
C
A
T
G
C
A
C
T
T
G
G
T
G
A
C
C
C
T
G
G
A
G
G
C
G
A
G
G
A
G
A
A
G
G
C
C
G
G
G
G
C
G
T
A
T
G
A
G
G
C
C
A
A
C
C
G
C
G
C
G
C
T
T
G
A
C
G
G
G
A
C
T
A
T
C
T
G
G
A
A
T
T
T
G
G
T
C
C
T
C
G
G
A
G
G
G
C
G
C
G
G
A
G
C
T
A
G
A
G
A
G
A
G
T
A
A
A
C
C
A
A
C
A
G
G
G
T
C
T
A
T
A
A
A
C
A
A
G
G
A
A
G
T
C
T
C
C
A
G
T
A
T
T
A
G
C
G
C
T
C
A
A
G
T
C
C
A
A
G
A
T
G
T
T
G
A
C
C
G
C
G
C
G
C
G
C
C
A
A
C
T
A
G
T
A
G
G
C
T
A
A
C
A
A
T/G
A
C
G
T
A
A
C
A
G
G
G
A
T
C
C
G
G
A
C
A
G
A
G
G
G
A
C
C
T
C
A
G
A
A
A
T
T
C
G
A
A
A
G
A
C
G
T
C
G
A
T
A
A
A
T
C
C
A
T
A
T
T
A
T
T
A
C