Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 398,531 (bp)   Positions: 571
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.001
.998
.0
.001
.005
--
.001
.001
.0
.261
.28
.002
.021
.368
.037
.001
.97
.0
.0
.008
.004
.008
.166
.027
.063
.006
.024
.081
.004
--
.059
.0
.003
.0
.7
.024
.002
.051
.086
.002
.0
.995
.989
.034
.009
.012
.03
.09
.007
.362
.162
.002
--
.0
.0
.455
.29
.177
.001
.003
.0
.496
.004
.037
.0
.0
.238
.0
.045
.003
.001
.0
.001
.002
.0
.0
.001
.0
1.0
.0
.0
.0
.0
.0
.01
.004
.037
.0
.0
.013
.005
.019
.0
.003
.0
.003
.272
.676
.003
.002
.0
.008
.001
.001
.031
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.15
.824
.001
.001
.0
.008
.001
.0
.001
.001
.012
.0
.237
.0
.97
.008
.026
.06
.094
.001
.12
.002
.0
.001
.044
.014
.025
.018
.053
.306
.01
.004
.007
.478
.167
.001
.034
--
.034
.819
.535
.001
.0
.02
.001
.0
.016
.98
.998
.001
.002
--
.009
1.0
1.0
.997
.955
.018
.0
.135
.0
.0
.0
.0
.002
.003
.0
.005
.0
.0
--
.008
.732
--
.028
.089
.104
.001
.217
.485
.001
.017
.002
.001
.001
.0
.0
.0
.041
.0
.005
.001
.0
.004
.0
.0
.006
.003
.001
.0
.001
.212
.005
.968
.134
.957
.001
.008
.002
.038
.011
.0
.0
.001
.008
.003
.008
.0
.006
.003
.018
.01
--
.014
.061
.036
.003
.004
.01
.035
.002
.003
.004
.196
.111
.205
.007
.004
.032
.002
.02
.005
.024
.004
.008
.002
.962
.001
.0
.002
.0
.005
.183
.0
.0
.995
.008
.028
.0
.002
.0
.066
.315
.971
.966
.96
.115
.002
--
--
--
--
.006
.0
.001
.001
.006
.002
.003
.035
.002
.0
.0
.012
.016
.002
.0
.0
.006
.068
.135
.001
.0
.077
.018
.001
.0
.001
.013
.003
.001
.008
.0
.002
.029
.01
.002
.002
.002
.075
.001
.0
.007
.0
.508
.001
.001
--
.008
.005
.003
.029
.006
.008
.001
.001
.0
.002
.038
.009
--
.024
.002
.001
.001
.003
.001
.263
--
.009
.007
.0
.0
.001
.001
.001
.002
.002
.0
.013
.105
.025
.019
--
--
--
.0
.007
.001
.015
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.001
.002
.008
.0
.0
.0
.0
.001
.002
--
--
.001
.329
.005
.049
.069
.018
.004
.0
.0
.001
.002
.0
.01
.009
.001
.042
.022
.004
.003
.002
.0
.007
.0
.001
.002
.001
.009
.187
.016
.356
.005
.001
.001
.0
.005
.126
1.0
1.0
.0
.012
.003
.004
.064
.175
.983
.017
.034
.022
.056
--
.0
.001
.022
.0
.0
.321
.001
.001
.029
.0
.005
.001
.0
.0
.01
.098
.0
.008
.001
.001
.008
.124
.03
.052
.005
.09
.388
.0
.001
.089
.002
.009
.003
.021
.006
.003
.015
.0
.034
.001
.01
.014
.0
.039
.296
.218
.0
.022
.023
.0
.0
.0
.234
.138
.054
--
--
.004
.0
.002
.007
.119
.015
.006
.0
.218
.683
.075
.019
.005
.078
--
--
.006
.005
.011
.001
.0
.054
.244
.034
.161
.096
.006
.0
.004
.0
.0
.309
.036
.019
.016
.199
.091
.132
.146
.675
.001
.003
.09
.088
.029
.001
.003
.001
.021
.018
.0
.0
.0
.0
.0
.003
.0
.991
.005
.0
.18
.001
.003
.004
.002
.0
.002
.008
.008
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
Cep128
G
T
G
C
G
A
A
C
T
C
C
T
A
C
G
A
C
C
G
C
A
A
C
G
C
A
C
C
A
C
A
T
A
T
G
G
T
T
T
C
C
T
C
G
A
G
G
A
A
T
G
G
A
C
T
A
C
T
A
C
T
T
A
G
A
G
T
T
C
C
C
C
T
A
G
T
T
G
T
A
T
T
A
T
G
A
A
A
G
G
G
C
C
G
T
A
A
G
G
A
G
G
T
A
G
C
G
G
C
C
G
T
G
A
T
G
G
T
C
T
C
G
T
A
T
A
G
C
T
C
A
C
A
G
C
G
A
T
A
T
C
G
A
C
G
G
A
G
C
A
C
C
C
T
T
G
T
T
T
C
C
T
T
G
G
G
G
T
C
A
A
C
A
A
G
T
G
T
G
C
T
A
C
A
A
A
A
A
A
A
G
T
A
C
T
A
C
T
T
G
C
T
C
T
T
G
C
C
C
A
A
A
A
A
T
A
G
T
A
G
T
C
T
G
A
G
G
C
T
T
C
T
T
G
G
T
C
T
A
A
G
C
C
C
C
G
T
C
A
G
G
A
G
C
G
G
G
A
C
G
G
G
G
A
G
G
G
A
T
G
T
T
C
T
T
A
C
A
G
T
T
T
G
A
A
G
T
T
T
A
C
C
T
G
A
A
A
T
T
G
A
T
A
G
G
T
C
T
T
G
T
T
C
G
A
T
A
T
A
A
T
G
T
C
C
G
T
A
A
A
A
C
A
G
G
G
C
C
A
T
T
G
A
C
C
G
A
G
G
G
G
G
G
G
A
A
G
G
A
C
C
T
C
A
A
A
A
T
G
A
A
T
T
T
C
G
G
T
G
G
G
A
T
A
T
G
C
C
A
C
G
A
T
G
C
A
G
A
A
A
A
T
A
G
A
A
G
G
A
A
T
A
C
G
C
T
G
G
T
G
C
G
T
G
G
T
C
G
G
A
C
C
T
G
A
A
T
G
A
G
T
C
T
C
C
T
G
G
C
A
G
G
C
G
C
G
G
A
T
C
A
T
C
T
G
G
C
G
T
G
C
T
G
G
A
C
A
C
G
G
A
G
G
C
C
T
A
C
G
C
G
T
C
C
A
C
C
T
A
T
T
G
A
G
A
G
A
G
G
A
G
A
G
G
A
G
T
A
G
G
G
C
T
T
G
G
G
C
G
A
G
A
G
G
G
G
G
A
G
G
C
C
T
T
G
G
G
A
T
A
C
T
A
G
C
G
G
C
C
T
T
C
C
G
G
C
C
A
C
C
T
  114,760,931
  114,762,457
  114,762,891
  114,763,937
  114,764,423
  114,768,229
  114,769,234
  114,769,310
  114,771,688
  114,772,329
  114,772,973
  114,774,956
  114,775,325
  114,775,903
  114,777,822
  114,778,145
  114,778,639
  114,778,860
  114,778,875
  114,780,724
  114,780,935
  114,781,071
  114,783,830
  114,784,477
  114,784,938
  114,785,751
  114,786,033
  114,786,097
  114,786,315
  114,787,100
  114,787,327
  114,787,975
  114,788,127
  114,788,660
  114,788,992
  114,790,064
  114,791,848
  114,791,980
  114,793,708
  114,793,853
  114,796,253
  114,796,608
  114,796,661
  114,796,976
  114,798,720
  114,799,619
  114,800,421
  114,802,283
  114,802,290
  114,810,205
  114,810,276
  114,810,453
  114,811,185
  114,814,259
  114,815,354
  114,816,915
  114,818,832
  114,818,839
  114,819,450
  114,819,451
  114,819,819
  114,820,500
  114,821,075
  114,823,167
  114,825,216
  114,825,330
  114,825,942
  114,826,007
  114,826,162
  114,826,267
  114,826,567
  114,826,833
  114,826,940
  114,827,145
  114,827,207
  114,827,249
  114,827,312
  114,827,340
  114,828,511
  114,829,756
  114,830,047
  114,830,072
  114,830,112
  114,830,271
  114,830,803
  114,830,851
  114,830,889
  114,831,288
  114,831,705
  114,832,407
  114,832,449
  114,832,611
  114,833,004
  114,833,110
  114,833,113
  114,833,450
  114,833,568
  114,833,688
  114,833,752
  114,834,073
  114,834,326
  114,834,668
  114,834,912
  114,834,923
  114,835,145
  114,835,688
  114,835,777
  114,836,262
  114,836,310
  114,836,483
  114,836,602
  114,836,666
  114,836,733
  114,836,753
  114,837,973
  114,838,102
  114,838,191
  114,838,519
  114,839,172
  114,839,292
  114,839,648
  114,839,688
  114,839,691
  114,839,712
  114,839,795
  114,839,943
  114,840,096
  114,840,235
  114,841,095
  114,841,255
  114,842,023
  114,842,816
  114,843,757
  114,844,062
  114,844,611
  114,844,631
  114,844,680
  114,845,303
  114,845,534
  114,845,561
  114,845,753
  114,845,958
  114,846,186
  114,846,483
  114,846,499
  114,846,518
  114,846,536
  114,846,713
  114,847,563
  114,847,974
  114,848,134
  114,849,107
  114,849,314
  114,849,744
  114,850,069
  114,850,878
  114,852,728
  114,853,793
  114,855,985
  114,857,025
  114,857,063
  114,857,131
  114,857,587
  114,857,589
  114,857,657
  114,857,850
  114,857,892
  114,857,937
  114,857,940
  114,858,014
  114,862,031
  114,862,170
  114,862,340
  114,862,355
  114,862,360
  114,862,440
  114,862,507
  114,862,552
  114,862,736
  114,862,798
  114,862,841
  114,863,004
  114,863,265
  114,863,659
  114,863,695
  114,864,327
  114,864,890
  114,865,325
  114,866,841
  114,867,209
  114,869,581
  114,870,300
  114,872,568
  114,872,744
  114,872,939
  114,874,540
  114,874,584
  114,875,820
  114,876,065
  114,876,444
  114,879,039
  114,880,053
  114,881,539
  114,881,732
  114,881,747
  114,881,857
  114,882,015
  114,882,194
  114,882,226
  114,882,280
  114,882,347
  114,882,351
  114,882,388
  114,882,433
  114,882,520
  114,882,729
  114,882,989
  114,883,160
  114,883,395
  114,883,413
  114,883,435
  114,884,206
  114,884,574
  114,884,608
  114,884,709
  114,884,783
  114,884,978
  114,885,431
  114,885,541
  114,885,800
  114,885,866
  114,886,806
  114,887,911
  114,888,107
  114,888,576
  114,888,589
  114,888,813
  114,889,043
  114,889,080
  114,889,260
  114,889,523
  114,890,795
  114,891,444
  114,891,452
  114,891,813
  114,891,914
  114,892,016
  114,892,136
  114,892,316
  114,892,317
  114,892,345
  114,892,358
  114,892,374
  114,892,413
  114,893,084
  114,894,570
  114,894,835
  114,894,877
  114,896,366
  114,896,399
  114,896,453
  114,896,530
  114,896,535
  114,897,339
  114,900,187
  114,900,476
  114,900,501
  114,901,063
  114,901,079
  114,901,798
  114,902,001
  114,902,663
  114,902,691
  114,904,169
  114,904,517
  114,904,536
  114,904,565
  114,912,024
  114,912,049
  114,912,263
  114,912,463
  114,912,693
  114,912,730
  114,914,951
  114,916,107
  114,917,222
  114,917,600
  114,917,761
  114,917,865
  114,918,475
  114,919,383
  114,919,432
  114,919,923
  114,920,040
  114,920,104
  114,920,438
  114,920,444
  114,920,518
  114,920,592
  114,920,793
  114,920,947
  114,921,232
  114,921,587
  114,921,617
  114,921,748
  114,921,757
  114,921,872
  114,921,967
  114,922,073
  114,922,464
  114,922,811
  114,922,975
  114,924,180
  114,925,141
  114,925,150
  114,925,180
  114,925,345
  114,927,271
  114,927,896
  114,927,908
  114,929,153
  114,929,285
  114,930,322
  114,930,378
  114,930,381
  114,937,634
  114,938,003
  114,938,097
  114,939,028
  114,940,292
  114,941,504
  114,941,756
  114,943,194
  114,944,609
  114,945,850
  114,946,895
  114,947,413
  114,947,426
  114,947,702
  114,948,278
  114,949,370
  114,950,026
  114,951,454
  114,951,478
  114,952,157
  114,953,008
  114,953,011
  114,953,470
  114,957,329
  114,964,548
  114,965,357
  114,965,656
  114,965,796
  114,965,831
  114,966,495
  114,968,147
  114,968,859
  114,969,275
  114,969,385
  114,969,425
  114,969,427
  114,969,428
  114,969,438
  114,969,473
  114,969,500
  114,969,528
  114,969,539
  114,980,106
  114,980,640
  114,980,777
  114,985,887
  114,994,205
  114,994,206
  114,994,213
  114,994,748
  114,994,900
  114,995,312
  114,996,463
  114,997,592
  114,998,012
  114,998,082
  114,998,109
  114,998,110
  114,998,138
  114,998,175
  114,998,313
  114,998,748
  114,998,753
  114,999,391
  115,000,042
  115,000,835
  115,001,211
  115,001,740
  115,002,569
  115,002,729
  115,003,552
  115,003,816
  115,003,982
  115,006,242
  115,006,610
  115,006,773
  115,007,688
  115,007,934
  115,007,980
  115,008,153
  115,009,335
  115,010,024
  115,010,509
  115,010,758
  115,011,059
  115,011,598
  115,012,797
  115,013,440
  115,013,741
  115,013,834
  115,013,934
  115,014,214
  115,014,303
  115,014,355
  115,014,360
  115,014,918
  115,015,010
  115,015,169
  115,015,679
  115,016,227
  115,016,656
  115,016,813
  115,019,873
  115,020,550
  115,022,077
  115,023,659
  115,024,195
  115,024,245
  115,043,403
  115,045,754
  115,047,106
  115,047,719
  115,049,494
  115,053,218
  115,054,227
  115,059,579
  115,060,150
  115,060,475
  115,061,414
  115,062,294
  115,065,858
  115,066,810
  115,066,834
  115,066,848
  115,069,391
  115,070,667
  115,072,778
  115,073,980
  115,076,320
  115,076,490
  115,076,974
  115,076,977
  115,077,189
  115,077,840
  115,078,069
  115,078,952
  115,079,057
  115,079,256
  115,079,340
  115,080,072
  115,082,917
  115,084,223
  115,084,481
  115,084,951
  115,085,466
  115,085,625
  115,087,915
  115,089,871
  115,090,059
  115,090,943
  115,092,025
  115,094,241
  115,094,973
  115,094,975
  115,094,979
  115,094,981
  115,095,248
  115,095,651
  115,097,112
  115,098,089
  115,098,291
  115,098,778
  115,099,630
  115,099,765
  115,100,836
  115,101,392
  115,101,892
  115,103,717
  115,103,777
  115,104,258
  115,104,486
  115,106,066
  115,109,421
  115,110,154
  115,110,161
  115,113,335
  115,115,870
  115,116,952
  115,117,930
  115,118,227
  115,118,286
  115,119,356
  115,119,385
  115,120,577
  115,121,679
  115,122,014
  115,124,645
  115,124,905
  115,125,035
  115,128,052
  115,128,224
  115,134,105
  115,134,124
  115,137,115
  115,139,485
  115,140,076
  115,140,324
  115,140,823
  115,141,681
  115,142,882
  115,142,907
  115,143,046
  115,143,427
  115,143,563
  115,144,691
  115,145,233
  115,146,632
  115,146,840
  115,146,927
  115,146,993
  115,147,024
  115,147,158
  115,147,858
  115,147,885
  115,148,644
  115,148,738
  115,149,267
  115,149,743
  115,149,955
  115,150,299
  115,150,305
  115,150,531
  115,151,337
  115,151,467
  115,151,751
  115,152,328
  115,153,188
  115,154,411
  115,154,512
  115,154,552
  115,154,707
  115,155,130
  115,155,434
  115,155,438
  115,155,580
  115,155,781
  115,155,923
  115,156,069
  115,156,124
  115,156,202
  115,156,257
  115,156,346
  115,156,364
  115,156,571
  115,156,696
  115,156,698
T
C
C
T
A
A/G
T
T
G
G
T
C
G
T
A
G
G
T
C
T
G
G
A
T
A
G
A
T
G
C/G
T
C
T
C
A
T
C
C
C
G
T
C
T
A
G
A
A
T
C
C
A
A
A/C
T
C
G
T
A
G
A
A
C
G
A
C
A
G
C
T
A
T
C/T
C
G
A
C
C
A
A
G
C
G
G
C
T
G
G
G
A
A
A
A
C/T
A
C
G
G
A
A
T
A
A
C
G
A
A
T
G/T
G
T
A
G
A
C
G
A
C
A
T
C
C/T
A
C
G
T/C
G
A
G
C
T
G
T
T
T
G
G/A
G
C
G
A
T
A
C
T
G/T
G/A
G
A
T
G
T
T
T
A
C
C
C
C
C
A
T
G
A
C
A
A
A
C
A
G
T
A
C
C
T
T/G
C
A
A
T
C
G
T
G
G
C
G
T
A/G
G
A
C
G
A
C
G
T
C
C
G/T
T
T/C
T
C
A
A
T
T
T
G
G
G
G
G
C
T
A
C
G
A
G
T
C
A
G
A
A
G
A
C
T
C
C
G/A
C
G
T
C
G
G
G/C
T
G
T
T
C
C
T
G
A
A
G
C
T
C
A
A
C
A
C
C
T
C
G
A
A
A
G
G
T
A
C
A
C
C
T
T
G
A
C
G
C
C
G
A/C
A
C
C
A
G
T
A
A
A
G
G
G
C
C
A
G
C
T
A
A
G
A
G
C
C
G
A
G
A
G
A
G
C
G
T
C
A
C
C/A
T
A
G
G
C
C
G
T
T
A
A
A
T
G
G
G
G
A
G
T
C/T
A
G
A
A
A
A
T
A
A
T
G
A
A
C
A
A
C
A
G
G
G
T
T/C
A
G
G
C
A
A
T
A
C
C
A
A
A
G
C
A/G
C
A
T
T
G
T
A
G
G
C
T
C
A
T
G
G
G
T/C
G
A
G
G
A
A
G
G
C
G
T
A
T
C
T
C
A
A
T
A
A
A
A
G
A
T
A
G
T
T
C
A
C
T
C
A
C
A
C
T
A
A
C/T
C
A
A
G
G
A
A
G
G/A
G
T
A
G
C
A
G
C
G
C
G/A
A
A
A
C
A
T
C
A
A
G
G
G
A
C
A
C
A
A
C/T
T
C
G
T
A
T
A
C
T
T
G
T
T
C
G
A
C
C
T
A
G
A
G
A
A
G
A
T
A
C
G
T
G
G
A
G/A
A
A
C
C
A
A
A
C/A
C
G
C
G
A
A
A
A
A
G
A
A
T
T
C
A
T
A
A
G
C
G
T
C
G
A
T
A
A
A
T
C
C
A
T
A
T
T
A
T
T
C/A
C