Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 390,746 (bp)   Positions: 325
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.989
1.0
.032
.0
.029
.002
.001
.001
.062
.003
.0
.0
.03
.003
.001
.0
.0
.297
.014
.001
.0
.0
.0
.188
.06
.0
.034
.0
.171
.177
.021
.022
.035
.037
.096
.0
.0
.002
.0
.001
.0
.0
.0
.002
.001
.001
.0
.001
.0
.0
.001
.0
.004
.001
.0
.002
.0
.0
.994
.001
.0
.002
.0
.0
.0
.012
.041
.001
.005
.001
.0
.0
.0
.002
.005
.0
.011
.003
.0
.005
.005
.022
.0
.014
.0
.001
.245
.019
.0
.0
.0
.0
.002
.0
.001
.003
.0
.0
.003
.0
.001
.0
.0
.0
.007
.024
.001
.168
.007
.001
.0
.0
.084
.019
.584
.001
.002
.001
.0
.0
.002
.0
.001
.074
.002
.014
.001
.0
.001
.023
.0
.0
.0
.002
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.595
.003
.1
.08
.016
.018
.001
.008
.007
.044
.739
.057
.037
.0
.105
.0
.049
.0
.0
.0
.005
.998
.001
.0
.001
.0
.495
.0
.002
.12
.0
.018
.002
.0
.0
.0
.583
.001
.0
.002
.0
.007
.007
.0
.0
.032
.036
.005
.001
.921
.005
.003
.001
.192
.0
.004
.0
.0
.019
.0
.009
.0
.361
.001
.0
.0
.002
.0
.005
1.0
.999
.011
.0
.004
.014
.087
.002
.161
.971
1.0
.0
.0
.0
.004
.001
.0
.008
.0
.05
.611
.0
.0
.026
.758
.766
.0
.004
.0
.999
.0
.904
.0
.0
.009
.001
.0
--
.001
.001
.003
.0
.001
.0
.0
.0
.001
.193
.0
.0
.011
.023
.0
.047
.003
.003
.001
.059
.001
.003
.006
.002
.0
.0
.004
.0
.002
.996
.023
.002
.001
.0
.001
.002
.001
.0
.0
1.0
.81
.004
.0
.0
.0
.078
.007
.0
.103
.0
.0
.04
.001
.0
.0
.001
.001
.0
.0
.0
.1
.001
.001
.001
.002
1.0
.001
.002
.059
.0
.007
.0
.359
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
Celf4
T
T
C
G
G
C
T
G
C
G
C
G
A
T
C
C
C
G
T
G
G
G
T
G
C
C
G
G
A
A
G
G
G
C
C
A
T
G
C
A
C
A
G
G
T
C
T
T
G
A
A
C
C
C
T
A
A
A
A
T
G
G
A
T
G
T
T
T
T
T
T
T
G
T
C
T
T
G
A
A
G
G
G
T
C
C
T
C
A
G
T
A
G
A
A
T
G
C
T
G
T
C
C
A
C
A
C
T
T
C
C
C
G
G
C
G
A
T
G
C
T
C
G
G
T
G
C
G
A
A
T
A
G
T
A
G
G
C
G
G
G
G
C
T
A
T
T
C
T
A
G
G
G
T
A
C
A
A
T
A
G
T
G
A
T
C
C
G
G
G
C
A
G
C
C
T
T
T
T
T
T
A
A
A
C
A
C
T
G
T
C
G
A
A
C
G
C
T
G
T
A
A
T
G
T
T
T
A
A
C
C
T
G
T
T
A
G
C
C
C
G
A
A
G
G
A
A
T
T
A
C
A
T
G
G
T
A
T
C
C
T
A
A
C
C
T
T
C
T
C
T
T
C
C
T
T
C
A
A
C
C
G
C
A
G
C
A
A
G
C
G
T
A
G
G
C
G
C
T
G
T
G
A
G
T
A
T
G
T
T
C
A
A
A
G
T
C
T
C
A
T
C
T
T
A
G
C
T
A
G
C
G
G
C
G
C
C
C
T
C
C
G
A
C
G
  17,690,697
  17,690,763
  17,691,584
  17,694,330
  17,694,683
  17,695,326
  17,695,370
  17,695,452
  17,695,679
  17,696,067
  17,696,309
  17,697,292
  17,697,616
  17,701,433
  17,701,492
  17,703,458
  17,703,667
  17,705,159
  17,705,821
  17,708,340
  17,708,375
  17,713,745
  17,714,475
  17,714,693
  17,715,277
  17,717,727
  17,718,162
  17,718,173
  17,718,205
  17,718,223
  17,718,247
  17,719,155
  17,719,228
  17,719,271
  17,719,283
  17,719,409
  17,719,672
  17,724,475
  17,726,511
  17,727,595
  17,728,899
  17,731,385
  17,732,390
  17,733,231
  17,733,569
  17,734,418
  17,734,884
  17,735,558
  17,737,249
  17,737,699
  17,737,700
  17,738,953
  17,738,985
  17,739,296
  17,740,470
  17,741,212
  17,741,524
  17,741,525
  17,742,068
  17,742,696
  17,757,619
  17,757,625
  17,758,513
  17,759,110
  17,759,852
  17,761,257
  17,761,596
  17,761,986
  17,761,987
  17,762,837
  17,763,563
  17,764,608
  17,765,042
  17,765,077
  17,766,366
  17,766,862
  17,767,058
  17,767,784
  17,768,321
  17,769,114
  17,769,304
  17,769,473
  17,769,874
  17,771,209
  17,772,092
  17,772,271
  17,772,681
  17,772,898
  17,773,049
  17,773,733
  17,773,805
  17,774,166
  17,774,445
  17,774,758
  17,774,835
  17,774,836
  17,775,332
  17,775,467
  17,776,247
  17,776,277
  17,776,552
  17,776,557
  17,776,577
  17,777,623
  17,778,303
  17,779,434
  17,779,486
  17,779,729
  17,779,971
  17,781,709
  17,785,667
  17,785,887
  17,786,158
  17,786,931
  17,786,978
  17,787,183
  17,787,257
  17,787,466
  17,788,225
  17,788,440
  17,792,887
  17,793,510
  17,794,073
  17,794,920
  17,796,807
  17,797,393
  17,801,271
  17,801,370
  17,801,414
  17,801,500
  17,801,894
  17,801,895
  17,802,323
  17,802,345
  17,802,473
  17,802,556
  17,802,980
  17,803,638
  17,803,996
  17,804,024
  17,804,125
  17,804,138
  17,804,858
  17,805,185
  17,805,437
  17,805,642
  17,806,184
  17,806,390
  17,806,435
  17,806,444
  17,806,872
  17,806,876
  17,807,828
  17,808,124
  17,810,012
  17,810,678
  17,811,351
  17,812,869
  17,813,918
  17,814,135
  17,817,221
  17,817,421
  17,817,739
  17,817,830
  17,820,963
  17,825,105
  17,826,814
  17,828,232
  17,828,463
  17,829,910
  17,830,321
  17,832,694
  17,832,924
  17,833,366
  17,833,583
  17,833,592
  17,834,027
  17,834,597
  17,834,914
  17,835,949
  17,837,412
  17,837,641
  17,837,998
  17,838,118
  17,839,302
  17,840,733
  17,841,040
  17,841,066
  17,841,648
  17,841,689
  17,842,487
  17,842,692
  17,843,009
  17,846,547
  17,853,371
  17,855,125
  17,863,622
  17,864,532
  17,864,682
  17,866,132
  17,866,923
  17,867,057
  17,867,185
  17,868,750
  17,868,795
  17,869,237
  17,869,272
  17,869,885
  17,870,004
  17,870,973
  17,872,877
  17,873,005
  17,873,181
  17,873,391
  17,873,422
  17,873,776
  17,873,835
  17,874,684
  17,895,521
  17,902,905
  17,903,194
  17,975,575
  17,986,093
  17,986,163
  17,986,397
  17,988,989
  17,990,391
  17,991,755
  17,993,130
  17,993,160
  17,993,457
  17,993,550
  17,994,419
  17,998,585
  17,998,916
  18,000,064
  18,001,520
  18,002,124
  18,002,125
  18,004,098
  18,005,308
  18,008,162
  18,009,492
  18,012,795
  18,013,814
  18,014,437
  18,014,486
  18,014,575
  18,015,067
  18,015,914
  18,016,155
  18,017,081
  18,017,263
  18,017,884
  18,018,564
  18,018,628
  18,019,369
  18,019,435
  18,019,440
  18,019,787
  18,019,984
  18,020,325
  18,020,347
  18,020,535
  18,020,537
  18,021,073
  18,021,215
  18,021,485
  18,021,868
  18,021,916
  18,022,029
  18,022,299
  18,024,374
  18,025,501
  18,025,851
  18,025,929
  18,026,250
  18,027,666
  18,029,365
  18,031,733
  18,032,424
  18,035,408
  18,035,820
  18,037,673
  18,038,464
  18,038,477
  18,039,371
  18,040,776
  18,043,995
  18,046,728
  18,049,134
  18,049,528
  18,049,709
  18,050,816
  18,050,953
  18,052,096
  18,054,840
  18,055,201
  18,055,277
  18,055,581
  18,056,590
  18,056,687
  18,057,409
  18,058,392
  18,058,491
  18,058,752
  18,058,777
  18,059,523
  18,060,524
  18,060,761
  18,061,737
  18,062,376
  18,062,406
  18,065,900
  18,066,627
  18,070,153
  18,070,476
  18,071,053
  18,073,134
  18,073,267
  18,075,146
  18,077,062
  18,077,077
  18,078,480
  18,079,035
G
G
T
A
A
G
C
A
T
A
T
A
G
C
A
G
T
G/A
C
A
T
A
C
T
T
T
C
A
G
C
A
A
A
C/A
T
G
C
C
T
G
A
G
T
A
C
A
C
C
C
T
C
G
A
T
C
G
C
C
G
C
A
A
G
C
A
C
C
A
T/C
C
C
C
A
C
T
C
C
A
G
T
T
A
T
C
T
T
C
T
G
A
G
G
C
T
G
C
A
T
C
A
C
T
G
C
A
G
G
A
C
T
T
T
G/A
A
T
C
C
C
A
T
C
G
A
T
C
A
G
A
G
G
A
G
A
C
T
T
A
G
A
A
A
A
T
C
G
C
C
T
C
G
A
A
G/A
C
C
T
G
G
C
G
G/C
C
A
G
C
T
A
A
A
A
T
G
C
A
T
C
C
C
C
C
C
G
G
G
G
T
A
C
T
G
T
C
G
G
A
A
A
C
A
G
C
C
C
A
G
C
C
G
T
G
T
C
A
C
C
G
A
T
A
T
A
A/G
G
A
A
C
T
G
C
G
T
C
C
C
A
A
G
C
T
G
T/C
G
G
T
C/G
C
C
T
C
T
A
C
T
T
C
C
T
G
T
G
T
T
A
T
T
A
G
G
A
T
C
C
G
A
A
T
A
T
C
A
A
A
G
A
A
G
C
T
C
C
T
C
T
C
T
C
T
A
T
G
C
A
C
G
T
A
T
C
G
C
G
A
T
A
A
G
T
C/A
C
C/T
T
A
C
T
A