Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 41,190 (bp)   Positions: 362
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.006
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.004
.0
.004
.0
.002
.001
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.209
.0
.0
.0
.0
.004
.002
.0
.0
.0
.0
.0
.018
.001
.004
.001
.002
.008
.001
.0
.0
.0
.001
.004
.002
.003
.023
.002
.0
.002
.004
.001
.002
.175
.178
.002
.002
.001
.007
.0
.002
.0
.0
.005
.039
.0
.0
.004
.088
.766
.019
.008
.005
.004
.01
.003
.003
.037
.149
.001
.007
.001
.081
.183
.009
.163
.016
.011
.007
.0
.001
.005
.002
.001
.0
.002
.002
.0
.0
.0
.0
.001
.006
.0
.0
.0
.001
.0
.007
.006
.063
.107
.122
.003
.253
.128
.014
.023
.07
.001
.0
.007
.042
.013
.001
.0
.0
.007
.005
.001
.0
.001
.015
.014
.0
.02
.017
.001
.004
.017
.001
.0
.002
.001
.005
.0
.002
.022
.014
.017
.001
.0
.001
.001
.052
.06
.0
.0
.0
.0
.085
.058
.011
.0
.0
.003
.0
.001
.0
.002
.0
.001
.004
.006
.0
.002
.001
.044
.097
.077
.001
.003
--
.001
--
--
--
.171
.0
.0
.072
.0
.002
.0
.007
.028
--
.001
.0
.0
.001
.002
.003
.002
.005
.009
.003
.002
.003
.025
.272
.0
.002
.008
.0
.0
.002
.001
.0
.0
.001
.0
.002
.003
.006
.0
.0
.002
.006
.001
.001
.003
.0
.056
.036
.0
.0
.0
.012
.001
.001
.0
.0
.0
.0
.003
.002
.0
.0
.817
.843
.47
.461
.099
.005
.004
.021
.0
.009
.414
.477
.004
.081
.072
.153
.147
.019
.162
.1
.3
.023
.005
.032
.12
.003
.078
.381
.01
.111
.064
.004
.15
.659
.011
.0
.005
.027
.001
.017
.0
.001
.002
.475
.025
.049
.001
.874
.999
.0
.0
.0
.0
.001
.002
.02
.042
.008
.001
.0
.003
.0
.927
.039
.002
.002
.026
.0
.064
.0
.02
.0
.283
.0
.0
.0
.0
.004
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.005
.004
.065
.013
.001
.003
.0
.0
.0
.0
.0
.002
.001
.004
.002
.0
.001
.014
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.002
.002
.001
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
Cd36
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
T
C
A
T
G
T
C
T
T
T
G
T
G
T
G
T
C
A
-
G
A
A
A
A
G
C
A
A
G
T
T
C
A
T
A
T
T
A
G
G
G
A
G
T
T
A
C
A
A
G
T
C
A
T
A
2
-
A
T
A
A
G
G
G
A
G
A
A
C
G
G
G
C
T
T
G
11
T
A
T
T
G
T
T
C
C
T
T
A
A
C
A
G
T
T
G
T
T
T
A
T
C
G
C
A
T
-
T
G
C
G
C
G
A
4
-
A
T
C
G
G
A
2
G
-
A
G
G
G
T
G
T
G
A
T
-
C
A
G
-
T
G
A
T
A
T
T
A
T
A
C
G
2
C
C
A
T
T
-
A
T
G
A
T
G
-
G
A
G
G
C
A
A
C
G
19
G
T
G
G
A
-
G
A
C
A
G
T
T
-
T
C
19
A
T
A
-
A
T
G
G
T
T
T
A
A
T
G
G
T
A
G
T
G
C
C
A
C
G
G
T
C
A
C
A
T
T
T
C
C
C
-
G
T
G
A
G
C
G
T
C
2
C
G
T
A
T
A
G
A
C
A
A
A
T
C
C
A
G
A
C
T
C
-
T
T
G
T
T
G
A
T
T
C
G
A
C
59
A
T
A
A
A
A
T
C
C
A
-
A
G
C
A
C
G
G
T
C
C
T
A
A
T
G
T
C
C
A
C
-
A
T
G
C
G
C
C
G
G
C
G
G
G
G
G
A
T
G
C
C
G
G
A
C
G
C
A
C
T
T
-
T
G
A
C
A
G
C
A
G
C
C
T
-
G
G
C
T
G
A
G
  14,151,229
  14,151,231
  14,151,665
  14,151,687
  14,151,691
  14,151,693
  14,151,694
  14,151,716
  14,151,734
  14,151,758
  14,151,763
  14,151,767
  14,151,770
  14,151,775
  14,151,777
  14,151,794
  14,151,797
  14,151,857
  14,151,914
  14,152,018
  14,152,046
  14,152,077
  14,152,083
  14,152,090
  14,152,101
  14,152,102
  14,152,126
  14,152,171
  14,152,189
  14,152,256
  14,152,310
  14,152,332
  14,152,345
  14,152,356
  14,152,364
  14,152,373
  14,152,382
  14,152,404
  14,152,481
  14,152,506
  14,152,527
  14,152,534
  14,152,647
  14,152,658
  14,152,665
  14,152,688
  14,153,100
  14,153,128
  14,153,159
  14,153,161
  14,153,165
  14,153,171
  14,153,195
  14,153,196
  14,153,210
  14,153,211
  14,153,216
  14,153,221
  14,153,223
  14,153,258
  14,153,298
  14,153,299
  14,153,313
  14,153,317
  14,153,329
  14,153,351
  14,153,372
  14,153,378
  14,153,388
  14,153,414
  14,153,435
  14,153,453
  14,153,478
  14,153,495
  14,153,515
  14,153,536
  14,153,601
  14,153,634
  14,153,654
  14,153,709
  14,153,712
  14,153,722
  14,153,740
  14,153,747
  14,153,783
  14,153,816
  14,153,818
  14,153,825
  14,153,836
  14,153,839
  14,153,856
  14,153,863
  14,153,910
  14,153,921
  14,153,928
  14,153,942
  14,153,962
  14,153,963
  14,153,976
  14,153,989
  14,153,994
  14,154,005
  14,154,019
  14,154,020
  14,154,021
  14,154,034
  14,154,096
  14,154,105
  14,154,130
  14,154,151
  14,154,173
  14,154,175
  14,154,223
  14,154,261
  14,154,268
  14,154,324
  14,154,350
  14,154,354
  14,154,378
  14,154,399
  14,154,403
  14,154,417
  14,154,459
  14,154,487
  14,154,491
  14,154,496
  14,154,540
  14,154,554
  14,154,556
  14,154,558
  14,154,567
  14,154,574
  14,154,608
  14,154,635
  14,154,650
  14,154,652
  14,154,662
  14,154,682
  14,154,694
  14,154,715
  14,154,726
  14,154,749
  14,154,761
  14,154,764
  14,154,795
  14,154,836
  14,154,889
  14,154,891
  14,154,894
  14,154,920
  14,154,943
  14,154,947
  14,155,217
  14,156,088
  14,156,593
  14,157,597
  14,158,691
  14,158,911
  14,158,935
  14,159,309
  14,159,312
  14,159,560
  14,159,786
  14,159,800
  14,159,820
  14,159,937
  14,160,010
  14,160,159
  14,160,187
  14,160,316
  14,160,352
  14,160,355
  14,160,406
  14,160,415
  14,160,434
  14,160,480
  14,160,493
  14,160,513
  14,160,527
  14,160,948
  14,161,032
  14,161,225
  14,161,869
  14,162,454
  14,164,709
  14,164,713
  14,165,310
  14,165,363
  14,165,393
  14,165,404
  14,165,446
  14,166,011
  14,168,403
  14,168,639
  14,168,714
  14,168,822
  14,168,981
  14,169,013
  14,169,056
  14,169,071
  14,169,072
  14,169,075
  14,169,082
  14,169,099
  14,169,101
  14,169,105
  14,169,113
  14,169,144
  14,169,203
  14,169,225
  14,169,277
  14,169,355
  14,169,455
  14,169,474
  14,169,475
  14,169,520
  14,170,006
  14,170,077
  14,170,126
  14,170,200
  14,170,208
  14,170,320
  14,170,436
  14,170,792
  14,171,234
  14,171,266
  14,171,269
  14,171,305
  14,171,367
  14,171,493
  14,171,506
  14,171,511
  14,171,545
  14,171,673
  14,171,713
  14,171,743
  14,171,744
  14,171,753
  14,171,907
  14,172,137
  14,172,141
  14,172,191
  14,172,206
  14,172,239
  14,172,276
  14,172,316
  14,172,399
  14,172,410
  14,172,432
  14,172,434
  14,172,443
  14,172,444
  14,172,452
  14,172,481
  14,172,484
  14,178,114
  14,178,317
  14,178,412
  14,178,592
  14,178,598
  14,178,886
  14,179,447
  14,179,691
  14,179,881
  14,179,888
  14,179,902
  14,179,934
  14,180,032
  14,180,162
  14,180,375
  14,180,379
  14,180,450
  14,180,505
  14,180,725
  14,181,108
  14,181,380
  14,181,969
  14,182,020
  14,182,041
  14,182,339
  14,182,696
  14,182,802
  14,182,904
  14,183,471
  14,183,500
  14,183,590
  14,183,599
  14,183,779
  14,183,815
  14,183,840
  14,183,841
  14,184,044
  14,184,141
  14,184,142
  14,184,151
  14,184,215
  14,184,246
  14,184,395
  14,184,402
  14,184,409
  14,184,410
  14,184,412
  14,184,438
  14,184,623
  14,184,784
  14,184,793
  14,185,265
  14,185,437
  14,185,489
  14,185,500
  14,185,763
  14,185,901
  14,185,925
  14,185,943
  14,186,009
  14,186,056
  14,186,204
  14,186,255
  14,186,291
  14,186,295
  14,186,325
  14,187,859
  14,187,870
  14,187,877
  14,187,879
  14,187,902
  14,187,914
  14,187,925
  14,187,933
  14,187,946
  14,187,961
  14,187,979
  14,188,018
  14,188,224
  14,188,245
  14,188,287
  14,188,294
  14,188,297
  14,188,310
  14,188,350
  14,188,352
  14,188,407
  14,188,424
  14,188,429
  14,188,434
  14,188,444
  14,188,491
  14,188,565
  14,188,575
  14,188,594
  14,188,600
  14,188,603
  14,188,623
  14,188,781
  14,188,789
  14,188,794
  14,189,054
  14,189,365
  14,189,520
  14,189,603
  14,190,185
  14,190,322
G/A
T/A
C/T
A/T
T/C
G/A
T/A
C/A
T/A
T/C
T/A
G/T
T/C
G/T
T/C
G/A
T/G
C/T
A/T
-/A
G/C
A/T
A/G
A/G
A/T
G/A
C/A
A/G
A/T
G/A
T/G
T/G
C/T
A/T
T/G
A/G
T/C
T/G
A/G
G/C
G/A
G/T
A/G
G/A
T/C
T/C
A/G
C/T
A/T
A/T
G/A
T/-
C/T
A/T
T/C
A/C
2/-
-/3
A/G
T/A
A/G
A/T
G/A
G/C
G/A
A/C
G/A
A/C
A/G
C/A
G/A
G/A
G/A
C/A
T/A
T/C
G/A
11/-
T/G
A/G
T/C
T/A
G/-
T/A
T/G
C/A
C/T
T/A
T/A
A/G
A/G
C/A
A/G
G/A
T/G
T/A
G/A
T/C
T/A
T/C
A/T
T/C
C/G
G/A
C/A
A/G
T/C
-/A
T/C
G/T
C/T
G/A
C/T
G/T
A/T
4/-
-/2
A/T
T/G
C/T
G/C
G/A
A/G
2/-
G/A
-/2
A/T
G/C
G/T
G/A
T/A
G/A
T/-
G/A
A/G
T/C
-/A
C/T
A/T
G/C
-/A
T/G
G/A
A/C
T/A
A/G
T/C
T/C
A/G
T/C
A/G
C/T
G/A
2/-
C/T
C/T
A/G
C
T/G
-/T
A/G
T/C
G/T
A/-
T/C
G/C
-/T
G/A
A/G
G/C
G/T
C/G
A/T
A/T
C/A
G/A
19/-
G/C
T/G
G/C
G/T
A/G
-/T
G/A
A/C
C/G
A/C
G/A
T/G
T/C
-/3
T/G
C/A
19/-
A/G
T/C
A/G
-/2
A/G
T/C
G/A
G/A
T/C
T/-
T/-
A/C
A/G
T/A
G/C
G/C
T/C
A/T
G/A
T/C
G/A
C/-
C/A
A/-
C/T
G/C
G/C
T/C
C/A
A/G
C/-
A/G
T/A
T/A
T/A
C/G
C/A
C/G
-/A
G/A
T/A
G/A
A/G
G/A
C/T
G/C
A
T
2/-
G
C
G
T
A
C
T
T
G
-
C
G
T/C
C/T
C/T
A/G
G/A
A/T
C/A
T/C
C/A
-/4
T/A
T/C
G/T
T/C
T/A
G/-
A/G
T/G
T/C
C/A
G/A
A/-
C/A
59/-
A/G
T/G
A/G
A/C
A/G
A/G
T/C
C/T
C/G
A/G
-/T
A/T
G/A
C/A
A/G
C/T
G/A
G/A
T/G
C/A
C/T
T/C
A/G
A/G
T/C
G/A
T/G
C/T
C/G
A/G
C/G
-/14
A/G
T/C
G/A
C/T
G/A
C/G
C/T
G/A
G/A
C/T
G/A
G/C
G/C
G/C
G/C
A/T
T/A
G/A
C/G
C/G
G/A
G/A
A/T
C/A
G/T
C/A
A/T
C/T
T/A
T/C
-/3
T/C
G/T
A/T
C/A
A/T
G/A
C/T
A/G
G/T
C/G
C/A
T/A
-/A
G/A
G/A
C/T
T/C
G/A
A/C
G/T