Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 158,969 (bp)   Positions: 442
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.113
.977
.68
.006
.003
.001
.001
.0
.065
.0
.003
.001
.002
.142
.015
.0
.053
.294
.001
.0
.0
.223
.0
.004
.141
.004
.001
.001
.002
.0
.972
.004
.003
.001
.023
.305
.02
.0
.013
.176
.001
.268
.169
.0
.001
.007
.018
.0
.002
.002
.232
.0
.017
.004
.003
.0
.217
.034
.031
.018
.002
.028
1.0
.527
.0
.002
.0
.0
.005
.009
.017
.668
.188
.162
.0
.101
.004
.148
.275
.0
.002
.0
.015
.945
.0
.009
.033
.002
.002
.005
.0
.0
.0
.02
.247
.001
.106
.0
.0
.0
.001
.001
.0
.001
.001
.001
.001
.002
.006
.997
.0
.001
.001
.028
.0
.0
.003
.309
.006
.001
.0
.0
.0
.004
.071
.129
.09
.033
.002
.0
.0
.004
.921
.005
.0
.362
.021
.003
.0
.049
.004
.001
.056
.002
.009
.014
.004
.023
.0
.0
.002
.0
.0
.094
.002
.0
.0
.017
.347
.05
.0
.002
.001
.0
.025
.0
.0
.894
.02
.0
.003
.001
.0
.001
.002
.011
.003
.0
.04
.883
.007
.108
.319
.744
.683
.99
--
--
--
--
--
.1
.001
.007
.505
.025
.029
.004
.007
.053
.056
.001
.062
.0
.001
.001
.0
.403
.002
.0
.002
.394
.009
.031
.0
.209
.0
.012
.001
.0
.0
.016
.002
.0
.029
.028
.0
.001
.001
.002
.036
.201
.013
.023
.175
.003
.001
.005
.001
.003
.002
--
--
--
.001
.001
.0
.991
.0
.524
.032
.0
.001
.0
.001
.002
.022
--
.005
.006
.978
.003
.016
.01
.01
.0
.0
.999
.012
.0
.002
.018
.007
.002
.016
.004
--
.18
.0
.001
.003
--
--
--
--
.001
.101
.005
.0
.353
.103
.012
.014
.001
.002
.033
.124
.001
.0
.071
.001
.001
.01
.577
.0
--
.005
.002
.004
.014
.0
.0
.0
.001
.0
.021
.002
.0
.0
.002
.028
.003
.0
1.0
.0
.0
.0
.0
.0
.064
.184
.0
.0
.001
.003
.0
.121
.0
.0
.0
.001
.992
.96
.008
.023
.012
.014
1.0
.153
.017
.0
.0
.001
.007
.002
.001
.019
.003
--
.054
.015
.058
.0
.0
.0
.0
.003
.97
.041
.002
.004
.001
.014
.002
.002
.0
.002
--
--
.004
.191
.307
.065
.022
.06
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.1
--
--
.146
.106
.001
.0
.072
.811
.036
.128
.004
.037
.013
.0
.003
.002
.0
.024
.0
.0
.0
.011
.002
.0
.002
.001
.0
.069
.004
.0
.117
.007
.0
.007
.0
.001
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.075
.063
.047
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
Ccdc141
A
-
A
-
T
G
C
-
G
T
C
T
T
5
T
C
A
A
T
A
T
T
-
T
-
T
T
T
C
T
G
-
A
A
T
T
G
-
A
G
A
A
G
-
A
T
G
C
G
G
C
G
-
G
A
A
-
G
G
C
C
G
T
A
T
-
C
C
A
A
T
G
T
2
T
G
G
T
G
C
A
-
C
A
C
A
T
C
24
T
-
A
A
C
T
C
A
G
C
T
C
C
T
T
-
G
-
G
G
G
G
A
C
C
-
T
A
G
C
G
G
G
A
A
G
T
G
C
G
A
32
T
A
C
A
T
A
T
G
4
G
T
A
T
C
G
C
T
T
A
A
A
G
C
T
A
T
C
A
A
C
C
C
T
T
A
T
C
-
G
T
A
G
A
G
C
T
G
C
G
G
-
C
C
C
-
C
T
A
A
G
T
A
-
T
T
4
-
-
T
A
C
G
T
A
C
C
C
C
C
A
G
G
G
2
C
G
T
A
A
C
T
G
A
T
T
T
T
C
G
3
2
G
G
-
-
T
G
G
A
G
-
G
T
C
T
G
T
T
C
T
T
G
G
A
-
A
-
A
T
C
T
C
T
C
A
G
G
G
G
G
G
A
T
G
-
-
-
A
4
C
-
T
T
G
C
G
3
A
G
-
C
A
A
G
-
A
C
G
C
T
T
A
-
T
C
3
T
C
3
T
T
G
G
G
A
A
A
T
C
-
G
T
T
-
A
C
A
C
C
T
T
C
C
G
C
T
G
A
C
C
G
T
G
A
G
A
C
-
-
G
A
C
T
C
G
A
G
-
A
G
T
T
A
C
A
A
G
3
C
G
G
T
G
G
T
3
T
11
C
T
-
G
C
A
C
C
G
A
G
A
G
C
G
-
G
T
2
-
T
A
T
T
A
G
A
3
A
C
C
C
C
T
A
A
A
C
A
T
T
G
-
A
C
-
A
-
20
T
G
C
G
C
A
-
G
C
A
C
C
C
A
  63,865,773
  63,868,577
  63,869,023
  63,869,372
  63,871,301
  63,872,259
  63,872,858
  63,873,396
  63,873,607
  63,873,819
  63,873,977
  63,874,155
  63,874,213
  63,874,369
  63,874,684
  63,874,723
  63,874,972
  63,875,227
  63,875,447
  63,875,773
  63,875,812
  63,876,225
  63,876,298
  63,876,380
  63,876,445
  63,876,622
  63,877,349
  63,877,732
  63,878,031
  63,878,087
  63,878,622
  63,878,804
  63,878,849
  63,878,964
  63,879,150
  63,879,289
  63,879,763
  63,879,825
  63,879,951
  63,881,223
  63,881,254
  63,881,341
  63,881,523
  63,882,030
  63,882,237
  63,882,427
  63,882,480
  63,882,582
  63,882,586
  63,882,704
  63,883,538
  63,883,871
  63,883,919
  63,883,995
  63,884,051
  63,884,196
  63,884,219
  63,884,331
  63,884,333
  63,884,336
  63,884,373
  63,884,474
  63,884,640
  63,884,713
  63,884,969
  63,885,019
  63,885,066
  63,885,203
  63,885,482
  63,885,539
  63,885,828
  63,885,872
  63,885,914
  63,886,062
  63,886,419
  63,886,442
  63,886,650
  63,887,465
  63,887,610
  63,887,993
  63,888,218
  63,888,232
  63,888,527
  63,888,738
  63,888,820
  63,888,831
  63,888,981
  63,889,012
  63,889,860
  63,890,282
  63,890,301
  63,890,629
  63,890,883
  63,891,087
  63,891,317
  63,891,371
  63,891,660
  63,891,690
  63,891,691
  63,891,939
  63,892,174
  63,892,309
  63,892,559
  63,892,640
  63,893,302
  63,893,962
  63,894,385
  63,894,600
  63,895,158
  63,895,214
  63,895,498
  63,895,551
  63,895,695
  63,895,707
  63,895,959
  63,896,347
  63,896,389
  63,896,615
  63,896,639
  63,896,799
  63,896,831
  63,896,853
  63,896,901
  63,896,948
  63,896,991
  63,897,018
  63,897,051
  63,897,056
  63,897,584
  63,898,805
  63,899,058
  63,899,174
  63,899,530
  63,899,552
  63,900,318
  63,900,740
  63,901,909
  63,903,731
  63,903,903
  63,905,118
  63,905,546
  63,906,917
  63,907,269
  63,907,278
  63,907,399
  63,907,450
  63,907,463
  63,907,491
  63,907,662
  63,907,683
  63,907,712
  63,907,782
  63,907,856
  63,908,036
  63,908,080
  63,908,234
  63,908,372
  63,909,025
  63,909,041
  63,911,119
  63,911,607
  63,911,890
  63,912,207
  63,912,322
  63,912,384
  63,912,482
  63,912,517
  63,912,875
  63,913,281
  63,913,295
  63,913,345
  63,913,555
  63,913,872
  63,914,186
  63,914,246
  63,914,283
  63,914,578
  63,915,213
  63,915,299
  63,916,014
  63,916,062
  63,916,113
  63,916,321
  63,916,548
  63,916,970
  63,917,367
  63,917,663
  63,917,697
  63,917,698
  63,917,703
  63,917,762
  63,917,942
  63,918,107
  63,918,130
  63,918,161
  63,918,704
  63,918,933
  63,919,047
  63,919,080
  63,919,379
  63,919,388
  63,919,597
  63,919,768
  63,919,893
  63,919,919
  63,920,055
  63,920,177
  63,920,231
  63,920,447
  63,920,448
  63,920,496
  63,920,532
  63,920,624
  63,920,634
  63,920,756
  63,920,927
  63,921,197
  63,921,328
  63,922,057
  63,922,073
  63,922,405
  63,923,141
  63,923,392
  63,924,022
  63,924,899
  63,925,844
  63,926,828
  63,929,463
  63,929,530
  63,929,547
  63,929,975
  63,929,986
  63,932,832
  63,933,803
  63,933,886
  63,933,915
  63,934,951
  63,935,333
  63,936,208
  63,939,658
  63,939,890
  63,941,131
  63,941,541
  63,941,543
  63,942,341
  63,942,628
  63,942,975
  63,943,410
  63,944,020
  63,945,055
  63,945,611
  63,946,215
  63,946,217
  63,946,236
  63,946,273
  63,946,304
  63,947,944
  63,947,988
  63,948,537
  63,948,855
  63,948,886
  63,949,301
  63,949,488
  63,949,641
  63,949,756
  63,950,570
  63,950,670
  63,952,067
  63,952,401
  63,952,801
  63,953,006
  63,953,059
  63,953,850
  63,953,911
  63,954,066
  63,954,541
  63,955,066
  63,955,231
  63,955,960
  63,956,477
  63,958,486
  63,958,767
  63,958,772
  63,958,776
  63,958,898
  63,959,787
  63,961,308
  63,961,991
  63,965,430
  63,965,983
  63,966,771
  63,967,920
  63,968,050
  63,968,159
  63,968,770
  63,968,866
  63,969,037
  63,969,344
  63,969,420
  63,969,451
  63,969,511
  63,969,512
  63,969,684
  63,970,404
  63,970,559
  63,970,765
  63,970,878
  63,970,894
  63,970,903
  63,970,913
  63,971,081
  63,971,193
  63,971,683
  63,971,820
  63,972,041
  63,973,139
  63,974,193
  63,974,467
  63,974,894
  63,975,122
  63,975,242
  63,975,277
  63,975,505
  63,975,603
  63,975,836
  63,975,897
  63,975,964
  63,976,151
  63,976,374
  63,977,574
  63,978,364
  63,978,463
  63,978,562
  63,978,974
  63,979,409
  63,979,428
  63,979,471
  63,979,494
  63,979,773
  63,980,756
  63,981,653
  63,982,521
  63,982,558
  63,982,811
  63,982,831
  63,982,872
  63,982,899
  63,983,895
  63,984,054
  63,984,078
  63,984,085
  63,984,086
  63,985,883
  63,985,998
  63,986,369
  63,987,037
  63,987,525
  63,987,831
  63,988,394
  63,989,151
  63,989,313
  63,990,313
  63,990,505
  63,990,792
  63,990,824
  63,991,162
  63,991,169
  63,991,183
  63,991,303
  63,991,477
  63,991,597
  63,991,661
  63,991,990
  63,992,114
  63,992,126
  63,992,151
  63,992,250
  63,992,841
  63,992,912
  63,993,209
  63,993,319
  63,993,330
  63,993,367
  63,994,293
  63,994,691
  63,995,152
  63,995,154
  63,995,159
  63,995,170
  63,995,173
  63,995,418
  63,995,466
  63,995,482
  63,995,653
  63,996,637
  63,996,784
  63,997,242
  63,997,338
  63,997,511
  63,997,517
  63,997,547
  63,997,569
  63,998,302
  63,998,337
  63,998,433
  63,998,738
  63,999,370
  63,999,666
  64,000,088
  64,000,245
  64,000,288
  64,000,346
  64,000,433
  64,000,574
  64,000,582
  64,001,495
  64,001,988
  64,002,162
  64,002,235
  64,003,688
  64,004,844
  64,005,880
  64,005,897
  64,006,066
  64,007,709
  64,008,325
  64,008,754
  64,009,429
  64,010,848
  64,013,410
  64,014,068
  64,015,738
  64,018,606
  64,018,923
  64,019,298
  64,020,009
  64,020,045
  64,022,434
  64,023,201
  64,023,205
  64,023,209
  64,023,714
G
A
G
G
C
A
T
A
A
C
T
C
A
-
-
T
T
-
A
C
C
C
T
A
A
A
C
A
A
C
A
A
G
G
C
A
A
2
G
A
T
G
G/A
G
G
C
A
T
A
A
T
T
A
A
C
T
2
A
A
T
T
C
C
G
C
-/2
T
T
G
G
C
A
C
-
G
A
T
G
A
G
G
12
T
C
T
G
C
T
-
A
C
G
G
A
G
T
G
A
T
C
T
T
C
C
T
A
A
A
A
A
-
G
T
T
T
C
G
A
T
A
A
A
C
C
A
A
T
T
A
G
-
C
G
T
G
C
G
G
T
-
A
C
G
A
T
A
T
C
C
C
G
G
A
T
C
G
A
T
-
G
T
G
A
C
C
T
C
T
2
A
C
G
C
G
A
G
C
T
T
A
A
A
T
T
A
T
G
C
G
T
T
C
C
2
C
C
-
7
G
C
G
T
A
C
C
T
A
T
A
A
T
A
A
A
-
T
A
C
G
G
G
A
A
G
C
G
A
C
T
A
-
-
A
A
3
A
G
A
A
G
A
7
C
G
A
C
A
A
C
T
-
G
A
T
G
3
G
2
G
C
G
G
T
A
T
C
A
A
A
A
A
-
C
C
A
2
4
G
G
-
T
C
A
A
A
T
A
-
T
A
11
A
G
G
A
3
G
T
A
-
C
A
G
A
C
A
-
C
T
-
C
C
T
-
T
G
G
C
C
T
A
A
C
C
A
G
T
T
T
G
C
C
T
T
T
-
A
A
G
A
T
A
C
C
G
A
G
T
T
T
T
G
T
C
T
T
G
A
G
T
A
C
C
G
A
C
C
A
-
T
A
A
A
A
A
A
-
C
-
T
A
T
A
T
C
C/A
C/T
G/T
A/T
G/A
A/C
G/A
C/T
A
2
A
C
-
C
C
G
C
C
G
A
G
-
G
T
T
T
T
C
T
G
G
T
G
C
C
A
T
T
T
T
G
2
-
C
A
A
T
-
G
C
A
T
G
A
A
A
T