Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 50,163 (bp)   Positions: 460
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.004
.063
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.003
.005
.007
.002
.003
.004
.095
.191
.233
.247
.408
.0
.0
.004
.0
.0
.0
.009
.003
.0
.0
.0
.0
.0
.002
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.006
.088
.012
.0
.669
.244
.161
.001
.0
.0
.0
.816
.138
.001
.001
.0
.008
.0
.001
.0
.048
.011
.001
.001
.005
.01
.0
.002
.052
.273
.892
.011
.035
.0
.002
.004
.0
.001
.0
.001
.002
.002
.001
.014
.004
.027
.051
.003
.002
.013
.0
.002
.001
.001
.003
.003
.007
.001
.0
.002
.011
.06
.013
.003
.002
.003
.004
.0
.0
.001
.044
.0
.001
.001
.0
.009
.003
.003
.038
.0
.004
.135
.154
.059
.023
.0
.002
.0
.004
.002
.0
.0
.0
.0
.0
.012
.001
.0
.011
.001
.008
.0
.0
.001
.001
.0
.002
.001
.0
.0
.021
.044
.015
.005
.004
.001
.004
.001
.005
.001
.058
.001
.014
.054
.087
.221
.021
.017
.012
.011
.001
.002
.077
.017
.0
.003
.0
.382
.03
.002
.026
.002
.002
.006
.001
.001
.171
.032
.041
.005
.01
.466
.062
.003
.002
.001
.0
.0
.001
.006
.001
.138
.032
.009
.961
.923
.031
.001
.094
.023
.019
.017
.135
.143
.007
.004
.061
.011
.019
.62
.005
.049
.072
.011
.031
.017
.0
.001
.001
.004
.001
.001
.016
.001
.005
.002
.003
.012
.001
.003
.014
.01
.011
.001
.001
.001
.0
.004
.014
.005
.001
.001
.145
.02
.01
.001
.003
.0
.001
.0
.016
.027
.038
.003
.0
.004
.0
.0
.0
.003
.001
.0
.001
.0
.011
.286
.814
.306
.085
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.063
.042
.001
.001
.0
.003
.001
.004
.001
.022
.0
.0
.0
.007
.002
.004
.003
.01
.061
.056
.048
.013
.015
.0
.001
.027
.003
.01
.042
.003
.001
.013
.002
.009
.0
.001
.0
.0
.001
.004
.011
.0
.0
.0
.006
.003
.001
.053
.069
.739
.828
.286
.365
.422
.407
.08
.085
.042
.094
.007
.002
.002
.003
.006
.001
.011
.009
.003
.09
.58
.69
.001
.036
.025
.0
.0
.0
.0
.007
.023
.0
.0
.0
.004
.002
.001
.011
.008
.003
.0
.0
.001
.004
.003
.007
.005
.0
.003
.049
.259
.028
.015
.005
.005
.005
.029
.014
.0
.001
.0
.0
.0
.001
.001
.002
.0
.001
.008
.0
.001
.027
.017
.108
.0
.0
.0
.004
.001
.048
.0
.048
.026
.004
.002
.001
.002
.008
.002
.001
.0
.0
.001
.001
.0
.0
.005
.001
.0
.002
.002
.018
.0
.001
.05
.007
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.005
.003
.0
.008
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC102555308
LOC102555308
LOC102555308
LOC102555308
LOC102555308
LOC102555308
LOC102555308
LOC102555308
LOC102555308
LOC102555308
LOC102555308
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
Capn2
T
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
C
T
T
G
G
G
G
T
G
T
C
T
C
C
A
C
T
C
-
C
T
C
C
C
C
C
T
C
G
C
C
C
G
G
G
A
T
G
G
A
T
G
G
C
A
G
T
G
C
G
A
C
A
A
C
C
C
-
G
T
G
T
T
G
A
G
C
A
C
G
G
G
C
A
T
C
G
A
C
A
G
T
-
G
13
3
-
G
A
A
G
C
C
T
C
A
11
C
T
A
-
A
T
G
T
T
2
3
G
A
C
A
2
A
G
G
G
A
A
T
A
A
A
A
A
C
T
C
-
A
C
C
C
T
-
A
C
G
T
6
G
C
A
C
C
A
T
C
T
A
T
A
C
T
A
C
T
T
A
G
C
-
-
2
-
T
C
T
T
A
A
A
C
G
T
C
C
A
A
A
G
G
T
A
C
C
A
A
G
C
A
A
G
T
A
A
-
T
G
C
C
G
C
-
C
G
G
2
4
C
T
C
10
T
T
-
T
G
T
T
A
C
C
G
A
A
G
G
A
C
G
-
A
-
-
T
G
G
G
C
T
G
G
G
G
T
T
G
T
C
A
C
C
-
T
7
T
G
-
A
A
T
T
C
T
G
G
G
C
C
A
A
C
G
T
G
G
C
C
T
G
C
G
C
12
G
A
A
-
T
A
A
T
G
C
A
G
G
G
C
A
C
A
T
-
A
C
G
-
C
C
T
T
T
C
C
A
G
G
G
G
C
T
7
C
C
A
T
A
T
T
C
C
A
C
C
A
G
121
5
T
G
T
C
A
A
C
3
G
A
G
C
C
-
G
T
T
A
A
C
T
T
8
-
T
G
T
T
C
C
A
C
C
G
T
A
T
T
C
T
T
A
T
G
10
A
A
A
T
A
A
A
T
C
A
C
A
T
T
C
C
A
G
-
T
T
A
T
2
-
-
A
G
T
G
T
-
T
G
C
A
A
A
T
-
A
G
T
A
C
T
C
T
A
A
T
C
-
A
T
T
  100,881,976
  100,883,187
  100,883,211
  100,883,285
  100,883,289
  100,883,290
  100,883,293
  100,883,311
  100,883,321
  100,883,344
  100,883,357
  100,883,369
  100,883,370
  100,883,371
  100,883,385
  100,883,389
  100,883,396
  100,883,422
  100,883,430
  100,883,434
  100,883,443
  100,883,445
  100,883,446
  100,883,463
  100,883,468
  100,883,471
  100,883,472
  100,883,483
  100,884,846
  100,884,933
  100,884,959
  100,885,047
  100,885,083
  100,885,157
  100,885,158
  100,885,164
  100,885,167
  100,885,173
  100,885,188
  100,885,202
  100,885,203
  100,885,212
  100,885,220
  100,885,221
  100,885,223
  100,885,224
  100,885,225
  100,885,228
  100,885,237
  100,885,259
  100,886,419
  100,886,943
  100,887,352
  100,887,755
  100,887,866
  100,887,874
  100,888,459
  100,888,485
  100,888,812
  100,890,064
  100,890,409
  100,891,775
  100,892,166
  100,894,364
  100,894,953
  100,895,010
  100,895,163
  100,895,407
  100,895,428
  100,896,092
  100,896,101
  100,896,491
  100,896,757
  100,897,753
  100,897,815
  100,898,791
  100,898,820
  100,898,847
  100,898,855
  100,898,912
  100,899,073
  100,899,196
  100,899,299
  100,899,347
  100,899,434
  100,899,507
  100,899,781
  100,899,838
  100,899,842
  100,899,917
  100,900,055
  100,900,079
  100,900,157
  100,900,256
  100,900,310
  100,900,491
  100,900,514
  100,900,523
  100,900,578
  100,900,696
  100,900,737
  100,900,743
  100,901,210
  100,901,216
  100,901,362
  100,901,458
  100,901,508
  100,901,590
  100,901,591
  100,901,701
  100,901,825
  100,902,175
  100,902,177
  100,902,426
  100,902,711
  100,902,751
  100,903,090
  100,903,322
  100,903,486
  100,903,650
  100,903,730
  100,903,945
  100,904,238
  100,904,591
  100,905,026
  100,905,117
  100,905,194
  100,905,442
  100,905,522
  100,905,599
  100,905,699
  100,905,702
  100,905,714
  100,905,815
  100,905,908
  100,906,046
  100,906,116
  100,906,156
  100,906,184
  100,906,187
  100,906,367
  100,906,393
  100,906,406
  100,906,556
  100,906,604
  100,906,626
  100,906,640
  100,906,670
  100,906,672
  100,906,771
  100,906,972
  100,906,987
  100,907,057
  100,907,059
  100,907,087
  100,907,229
  100,907,234
  100,907,377
  100,907,411
  100,907,481
  100,907,484
  100,907,493
  100,907,497
  100,907,537
  100,907,557
  100,907,572
  100,907,578
  100,907,636
  100,907,747
  100,908,028
  100,908,038
  100,908,056
  100,908,068
  100,908,071
  100,908,151
  100,908,306
  100,908,324
  100,908,372
  100,908,487
  100,908,629
  100,908,636
  100,908,930
  100,909,082
  100,909,279
  100,910,250
  100,910,312
  100,910,450
  100,910,469
  100,910,528
  100,910,573
  100,910,586
  100,910,588
  100,910,596
  100,910,664
  100,910,672
  100,910,720
  100,910,747
  100,910,756
  100,910,764
  100,910,818
  100,910,897
  100,910,904
  100,910,915
  100,910,950
  100,910,960
  100,910,961
  100,911,040
  100,911,053
  100,911,065
  100,911,067
  100,911,078
  100,911,128
  100,911,130
  100,911,207
  100,911,211
  100,911,272
  100,911,313
  100,911,341
  100,911,864
  100,911,865
  100,911,878
  100,911,950
  100,911,952
  100,911,994
  100,912,010
  100,912,075
  100,912,084
  100,912,089
  100,912,167
  100,912,211
  100,912,239
  100,912,243
  100,912,266
  100,912,284
  100,912,291
  100,912,401
  100,912,402
  100,912,496
  100,912,530
  100,912,533
  100,912,534
  100,912,580
  100,912,750
  100,912,919
  100,912,935
  100,912,948
  100,912,959
  100,913,016
  100,913,021
  100,913,067
  100,913,124
  100,913,125
  100,913,145
  100,913,146
  100,913,215
  100,913,249
  100,913,282
  100,913,422
  100,913,452
  100,913,537
  100,913,541
  100,913,829
  100,913,837
  100,913,869
  100,913,889
  100,913,982
  100,914,067
  100,914,070
  100,914,086
  100,914,206
  100,914,207
  100,914,289
  100,914,307
  100,914,332
  100,914,351
  100,914,440
  100,914,545
  100,914,584
  100,914,586
  100,914,608
  100,914,615
  100,914,638
  100,914,642
  100,914,660
  100,914,679
  100,914,691
  100,914,766
  100,914,772
  100,914,782
  100,914,783
  100,914,839
  100,914,851
  100,914,895
  100,914,926
  100,914,960
  100,914,983
  100,914,987
  100,915,012
  100,915,064
  100,915,074
  100,915,086
  100,915,111
  100,915,146
  100,915,171
  100,915,193
  100,915,213
  100,915,312
  100,915,347
  100,915,429
  100,915,449
  100,915,454
  100,915,496
  100,915,503
  100,915,505
  100,915,512
  100,915,641
  100,915,658
  100,915,664
  100,915,695
  100,915,715
  100,915,742
  100,915,766
  100,915,829
  100,915,836
  100,915,837
  100,915,855
  100,915,912
  100,915,915
  100,915,946
  100,915,950
  100,916,014
  100,916,028
  100,916,067
  100,916,082
  100,916,090
  100,916,111
  100,916,192
  100,916,201
  100,916,298
  100,916,313
  100,916,354
  100,916,402
  100,916,406
  100,916,560
  100,916,587
  100,916,651
  100,916,673
  100,916,683
  100,916,686
  100,916,718
  100,916,729
  100,916,762
  100,916,872
  100,916,887
  100,916,918
  100,916,919
  100,917,100
  100,917,136
  100,917,289
  100,917,314
  100,917,315
  100,917,346
  100,917,385
  100,917,442
  100,917,541
  100,917,553
  100,917,577
  100,917,599
  100,917,775
  100,917,803
  100,917,851
  100,917,949
  100,918,090
  100,918,227
  100,918,447
  100,918,492
  100,918,543
  100,918,550
  100,918,565
  100,918,641
  100,918,825
  100,918,841
  100,918,891
  100,918,991
  100,919,011
  100,919,260
  100,919,298
  100,919,341
  100,919,393
  100,919,394
  100,919,533
  100,919,974
  100,920,063
  100,920,074
  100,920,089
  100,920,093
  100,920,104
  100,920,107
  100,920,110
  100,920,115
  100,920,188
  100,920,327
  100,920,553
  100,920,618
  100,920,667
  100,920,697
  100,920,705
  100,920,741
  100,920,744
  100,920,764
  100,920,773
  100,920,780
  100,920,830
  100,920,834
  100,920,884
  100,920,895
  100,920,922
  100,920,938
  100,920,987
  100,921,008
  100,921,114
  100,921,156
  100,921,173
  100,921,218
  100,921,317
  100,921,322
  100,921,331
  100,921,334
  100,921,338
  100,921,342
  100,921,353
  100,921,370
  100,921,371
  100,921,372
  100,921,374
  100,921,391
  100,921,400
  100,921,418
  100,921,454
  100,921,462
  100,921,468
  100,921,469
  100,921,477
  100,921,487
  100,921,547
  100,921,642
  100,921,885
  100,922,433
  100,922,643
  100,922,645
  100,922,655
  100,922,657
  100,922,685
  100,923,035
  100,923,149
  100,923,833
  100,924,429
  100,925,475
  100,926,128
  100,927,658
C
-
T
A
A
T
A
A
A
A
A
A
C
A
A
A
A
A
A
G
C
C
A
A
C
C
C
C
C
A
G
G
A
T
A
A
-
C
A
A
G
G
A
A
A
A
T
A
T
T
T
A
A
A
G
G
A
T
G
G
A
C
T
G
A
C
A
T
A
-
G
G
G
A
T
T
2
A
C
A
G
-
T
G
A
G
G
T
A
A
A
G
-
-
T
A
G
G
G
A
C
77
-
-
-
7
A
-
T
T
G
A
C
T
G
-
T
C
C
C
G
G
A
C
C
-
-
T
G
T
C
-
C
A
T
A
G
C
C
T
C
G
G
T
G
C
T
2
G
T
T
T
C
T
G
T
A
C
-
A
T
G
T
T
G
C
T
A
G
C
G
A
C
G
G
A
C
G
A
T
3
2
-
2
C
T
C
C
C
C
C
T
A
C
T
T
G
G
T
C
A
C
T
T
T
T
G
A
A
G
G
A
G
C
-
4
-
C
T
G
A
T
G
T
A
A
-
-
T
C
-
-
C
C
21
C
A
C
G
C
T
G
A
G
G
A
A
G
T
A
3
G
T
2
-
A
C
A
T
G
T
A
A
A
C
C
C
C
A
C
T
-
A
G
-
C
A
6
G
G
C
A
-
C
A
A
C
T
T
G
G
G
A
A
A
A
G
T
C
A
G
A
A
-
A
C
G
15
C
G
C
G
A
T
G
C
T
A
T
G
T
G
A
4
C
G
T
C
T
T
G
C
C
-
T
G
A
T
A
C
T
-
-
T
T
C
C
G
A
C
T
A
G
T
T
G
A
121/-
-
C
T
C
G
-
T
T
-
A
C
A
T
T
2
A
C
C
G
G
T
C
C
-
C
C
-
C
-
T
T
G
T
A
A
G
T
C
C
T
C
C
G
C
C
-
G
G
G
C
G
G
T
C
G
T
T
T
C
C
-
T
G
C
4
A
A
T
G
-
2
A
T
C
C
A
A
C/A
C
C
T
G
G
G
C
4
C
A
C
G
T
C
T
C
G
C
C
A
2
C
A
C