Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 235,601 (bp)   Positions: 519
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.011
.001
.001
.02
.0
.026
.008
.001
.153
.001
.0
.056
.059
.002
.013
.013
.009
.004
.002
.0
.005
.149
.032
.038
.363
.358
.004
--
.401
.41
.01
.006
.782
.428
.408
.532
.01
.001
1.0
.0
.002
.414
.018
.01
.018
.019
.053
.013
.002
.01
.028
.0
.001
.003
.003
.005
.019
.0
.001
.435
.007
.053
.998
.98
.273
.171
.0
.001
.002
.008
.027
.02
.003
.0
.005
.0
.0
.0
.123
.413
.267
.003
.099
.025
.002
.0
.198
.013
.002
.0
.358
.572
.001
.003
.648
.0
.397
.58
.014
.006
.016
.0
.0
1.0
1.0
.011
--
--
.022
.033
.032
.077
.062
.136
.003
.012
.006
.001
.135
.008
.001
.001
.002
.156
.0
.377
.001
.001
.0
.022
.0
.005
.001
.004
.028
.014
.003
.009
.005
.003
.0
.005
.003
.001
.134
.389
.018
.034
.015
.005
.044
.038
.009
.425
.106
.001
.002
.003
.004
.015
.168
.569
.085
.132
.003
.001
.001
.988
.063
.007
.005
.001
.123
.628
.015
.999
.001
.055
.001
.132
.001
.007
.0
.008
.0
.013
.001
.028
.341
.757
.003
.013
.003
.001
.002
.003
.013
.0
.001
.001
.002
.035
.0
.001
.002
.0
.34
.013
.043
.179
.0
.93
.001
.052
.036
.006
.001
.011
.0
.001
.05
.02
.003
.005
.004
.006
.007
.001
.002
.007
.68
.012
.032
.0
.585
.009
.047
.064
.016
.0
.007
.095
.002
.001
.039
.001
.005
.0
.546
.002
.001
.013
.116
.0
.003
.001
.0
.033
.004
.0
.0
.003
.0
.0
.0
.001
.008
.001
.005
.012
.001
.0
.016
.033
.0
.0
.146
.082
.001
.456
.006
.0
.048
.0
.01
.007
.174
.0
.0
.129
.007
.023
.002
.011
.0
.0
.004
.005
.001
.0
.007
.0
.05
.0
.0
.003
--
.003
.002
.01
.016
--
--
--
--
--
.015
.001
.107
.0
.001
.126
.055
.05
.084
.01
.013
.134
.017
.001
.005
.001
.127
.007
.01
.082
.121
.527
.969
.251
.001
.003
.029
.0
.281
.001
.0
.001
.001
.142
.007
.004
.002
.001
.092
.098
.0
.047
.0
.202
.463
.0
.002
.002
.012
.003
.0
.002
.076
.0
.025
.001
.007
.919
.962
.649
.103
.237
.995
.001
.001
.002
--
--
.001
.001
.015
.02
.349
.0
.001
.001
.0
.0
.142
.0
.031
.0
.045
.001
.0
.0
.003
.001
.002
.0
.007
.001
.0
.0
.001
.006
.003
.0
.001
.007
.016
.0
.0
.0
.002
.0
.011
.005
.003
.071
.001
.013
.317
.036
.979
1.0
.034
.03
.008
.043
.092
.528
.088
.88
.0
.013
.197
.209
1.0
.28
.0
.016
.001
.012
.0
.0
.054
.001
.051
.004
.004
.019
.003
.0
.019
.998
.008
.0
.0
.0
.0
.005
.001
.0
.0
.004
.001
.196
.007
.006
.042
.024
.004
.004
.012
.012
.006
.008
.004
.002
.001
.001
.005
.0
.001
.779
.002
.001
.0
.001
.028
.003
.019
.003
.0
.0
.0
.002
.061
.063
--
--
--
.997
.067
.02
.0
.015
.015
.202
.002
.008
.001
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
Cachd1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
T
T
C
A
T
C
C
T
T
G
T
A
T
T
C
A
A
A
C
G
G
T
G
T
C
G
C
T
G
A
T
G
A
C
G
T
T
T
G
C
A
G
A
T
A
T
T
G
A
T
T
A
T
G
C
T
T
T
A
C
A
C
T
C
T
T
C
T
A
T
C
C
T
A
G
T
T
G
G
A
A
T
G
C
G
G
G
C
T
G
C
G
A
C
A
A
A
T
C
T
T
T
C
C
C
G
A
C
A
G
C
T
G
C
A
A
C
C
C
C
A
G
C
T
A
G
A
A
A
T
T
C
G
T
A
C
C
A
A
C
T
A
C
A
T
G
C
C
T
T
T
C
C
T
C
C
T
A
A
G
G
C
T
G
T
C
C
T
G
T
C
A
G
T
T
G
A
A
T
G
T
A
A
G
G
T
C
T
G
G
A
G
C
C
T
C
G
A
A
T
C
A
G
G
C
G
A
G
C
A
T
C
C
G
C
C
T
T
G
C
T
T
T
G
T
A
T
C
T
C
A
C
G
A
G
C
G
C
T
A
C
C
A
A
G
A
G
T
G
G
T
G
G
A
A
A
T
T
C
T
G
C
C
A
G
C
A
C
C
G
G
T
A
T
C
C
G
A
A
C
T
G
G
A
C
C
A
G
G
T
T
G
T
G
A
T
G
G
C
G
C
C
T
T
T
C
T
G
A
T
T
C
T
T
C
G
G
G
G
T
A
T
A
G
G
T
T
T
T
A
C
A
A
C
T
T
G
T
T
T
G
C
G
A
C
T
G
G
T
C
C
G
G
T
T
T
A
G
C
T
A
G
C
G
G
G
T
C
G
A
T
A
G
C
G
T
G
T
C
T
T
C
G
T
A
A
G
G
G
A
C
A
A
A
G
C
C
G
C
A
G
G
C
A
G
A
A
A
C
T
C
G
T
A
A
G
A
C
T
G
C
G
A
C
C
T
G
G
T
T
T
T
T
C
C
A
A
A
T
C
T
A
C
G
G
G
C
T
C
T
T
G
A
G
A
A
A
T
T
T
C
G
G
A
A
T
A
A
C
A
G
A
A
A
T
C
A
C
A
G
T
A
G
T
G
A
T
G
T
G
C
C
C
T
G
C
G
C
C
T
G
C
C
C
C
G
T
G
A
T
A
A
G
T
G
C
G
T
  119,604,924
  119,605,112
  119,605,133
  119,605,146
  119,605,625
  119,606,954
  119,606,969
  119,606,973
  119,607,004
  119,607,145
  119,607,147
  119,608,571
  119,608,757
  119,608,846
  119,609,014
  119,609,155
  119,609,587
  119,609,974
  119,610,098
  119,610,118
  119,610,271
  119,611,840
  119,614,387
  119,614,883
  119,615,155
  119,615,156
  119,615,201
  119,615,391
  119,615,894
  119,615,895
  119,616,236
  119,616,245
  119,616,279
  119,616,332
  119,616,378
  119,616,404
  119,616,467
  119,618,727
  119,619,896
  119,620,506
  119,620,739
  119,621,488
  119,621,931
  119,621,973
  119,622,031
  119,622,046
  119,623,263
  119,623,294
  119,623,346
  119,623,518
  119,623,665
  119,623,673
  119,623,734
  119,623,843
  119,624,704
  119,624,736
  119,625,425
  119,625,997
  119,626,203
  119,626,388
  119,626,638
  119,626,777
  119,626,841
  119,626,863
  119,626,933
  119,626,943
  119,627,220
  119,627,420
  119,627,468
  119,627,491
  119,627,539
  119,627,800
  119,627,853
  119,628,078
  119,628,111
  119,628,132
  119,628,281
  119,628,409
  119,628,646
  119,628,681
  119,628,790
  119,628,851
  119,629,057
  119,629,430
  119,629,502
  119,629,665
  119,629,966
  119,630,274
  119,630,388
  119,630,512
  119,630,601
  119,630,684
  119,630,738
  119,630,987
  119,631,690
  119,631,939
  119,632,339
  119,632,492
  119,632,587
  119,632,602
  119,632,634
  119,632,665
  119,632,939
  119,633,245
  119,633,263
  119,633,953
  119,635,216
  119,635,292
  119,635,503
  119,635,652
  119,635,773
  119,635,945
  119,635,951
  119,636,071
  119,636,175
  119,636,599
  119,636,635
  119,636,788
  119,636,986
  119,637,757
  119,638,597
  119,639,646
  119,639,784
  119,640,564
  119,640,871
  119,641,109
  119,642,352
  119,647,367
  119,649,693
  119,649,735
  119,649,745
  119,650,126
  119,654,034
  119,655,245
  119,655,275
  119,655,337
  119,655,423
  119,656,003
  119,657,462
  119,658,238
  119,658,884
  119,662,801
  119,664,477
  119,664,555
  119,666,542
  119,666,655
  119,666,734
  119,666,828
  119,667,314
  119,667,416
  119,667,934
  119,668,382
  119,668,647
  119,669,110
  119,669,137
  119,669,242
  119,669,298
  119,669,818
  119,669,988
  119,670,015
  119,671,015
  119,671,237
  119,671,313
  119,671,419
  119,671,758
  119,672,719
  119,672,825
  119,673,066
  119,673,264
  119,673,685
  119,673,760
  119,674,120
  119,674,193
  119,674,531
  119,674,561
  119,675,001
  119,675,806
  119,676,021
  119,676,294
  119,676,803
  119,677,177
  119,677,215
  119,677,339
  119,677,397
  119,677,474
  119,677,765
  119,677,834
  119,677,869
  119,677,904
  119,677,921
  119,678,495
  119,678,564
  119,678,991
  119,679,170
  119,679,294
  119,679,605
  119,679,772
  119,680,461
  119,680,463
  119,681,971
  119,682,363
  119,683,097
  119,684,149
  119,685,646
  119,685,654
  119,685,817
  119,685,920
  119,687,573
  119,688,656
  119,689,092
  119,691,596
  119,692,754
  119,692,916
  119,693,826
  119,695,186
  119,695,941
  119,696,202
  119,696,864
  119,697,013
  119,697,351
  119,698,956
  119,699,234
  119,701,311
  119,703,288
  119,703,764
  119,704,182
  119,704,615
  119,707,047
  119,707,759
  119,707,786
  119,708,499
  119,708,818
  119,709,078
  119,712,295
  119,713,261
  119,713,778
  119,714,868
  119,715,361
  119,715,706
  119,716,162
  119,716,194
  119,716,536
  119,718,160
  119,718,750
  119,719,913
  119,720,256
  119,720,556
  119,720,621
  119,722,904
  119,722,917
  119,724,109
  119,724,407
  119,724,419
  119,724,632
  119,724,817
  119,725,950
  119,726,904
  119,727,017
  119,727,605
  119,728,487
  119,729,616
  119,730,166
  119,730,354
  119,730,593
  119,733,128
  119,733,264
  119,733,300
  119,733,494
  119,733,532
  119,733,534
  119,734,014
  119,735,126
  119,738,082
  119,738,211
  119,738,307
  119,740,162
  119,740,526
  119,740,611
  119,740,668
  119,741,456
  119,741,953
  119,742,132
  119,743,379
  119,743,532
  119,743,640
  119,744,003
  119,744,271
  119,744,575
  119,745,251
  119,745,927
  119,746,467
  119,746,524
  119,747,015
  119,747,315
  119,747,339
  119,748,387
  119,748,531
  119,748,822
  119,748,861
  119,749,934
  119,750,094
  119,750,244
  119,750,478
  119,752,407
  119,753,099
  119,753,101
  119,754,016
  119,754,590
  119,754,913
  119,754,968
  119,754,973
  119,755,948
  119,755,967
  119,757,495
  119,757,549
  119,757,663
  119,760,184
  119,760,271
  119,765,202
  119,765,713
  119,766,006
  119,767,493
  119,767,749
  119,768,012
  119,768,014
  119,768,061
  119,768,506
  119,768,691
  119,768,927
  119,769,361
  119,769,365
  119,769,587
  119,769,780
  119,769,904
  119,770,252
  119,770,254
  119,770,255
  119,770,296
  119,770,485
  119,770,720
  119,772,172
  119,772,181
  119,772,226
  119,772,681
  119,772,781
  119,772,837
  119,773,002
  119,773,108
  119,773,145
  119,773,276
  119,773,468
  119,773,607
  119,773,679
  119,773,778
  119,774,279
  119,774,285
  119,777,097
  119,777,302
  119,778,575
  119,780,066
  119,780,657
  119,781,881
  119,784,116
  119,784,747
  119,784,826
  119,784,857
  119,785,036
  119,785,262
  119,787,666
  119,788,018
  119,788,204
  119,788,253
  119,788,692
  119,788,844
  119,788,860
  119,788,873
  119,789,627
  119,789,865
  119,789,928
  119,790,845
  119,791,150
  119,791,151
  119,791,484
  119,791,603
  119,792,113
  119,793,464
  119,794,912
  119,794,923
  119,795,189
  119,796,002
  119,796,847
  119,797,070
  119,797,137
  119,797,901
  119,798,469
  119,798,570
  119,799,280
  119,799,996
  119,800,255
  119,800,700
  119,800,768
  119,800,778
  119,800,784
  119,801,590
  119,801,728
  119,802,147
  119,802,192
  119,802,352
  119,803,139
  119,803,191
  119,803,350
  119,804,101
  119,804,733
  119,804,859
  119,805,252
  119,805,528
  119,806,218
  119,806,272
  119,807,184
  119,807,522
  119,807,653
  119,807,891
  119,808,075
  119,809,427
  119,809,488
  119,809,720
  119,810,030
  119,810,120
  119,810,200
  119,810,266
  119,810,351
  119,810,378
  119,810,767
  119,810,771
  119,810,996
  119,811,077
  119,811,506
  119,811,543
  119,811,665
  119,811,798
  119,811,936
  119,811,957
  119,813,762
  119,815,645
  119,817,332
  119,817,486
  119,817,522
  119,817,745
  119,818,060
  119,818,385
  119,818,593
  119,818,624
  119,818,651
  119,818,706
  119,818,741
  119,818,781
  119,818,790
  119,818,900
  119,818,956
  119,818,986
  119,819,003
  119,819,063
  119,819,517
  119,819,648
  119,819,658
  119,819,703
  119,819,719
  119,819,781
  119,819,795
  119,819,800
  119,819,803
  119,819,889
  119,819,955
  119,820,089
  119,820,137
  119,820,148
  119,820,218
  119,820,344
  119,820,359
  119,820,360
  119,820,377
  119,820,378
  119,820,387
  119,820,448
  119,820,489
  119,820,528
  119,820,702
  119,820,778
  119,820,843
  119,820,882
  119,820,902
  119,821,017
  119,821,191
  119,821,194
  119,821,346
  119,821,347
  119,821,440
  119,821,505
  119,821,544
  119,821,661
  119,821,974
  119,822,045
  119,822,259
  119,822,475
  119,822,633
  119,822,925
  119,824,135
  119,824,151
  119,824,229
  119,825,162
  119,825,560
  119,825,587
  119,825,722
  119,827,929
  119,829,185
  119,829,216
  119,829,545
  119,830,298
  119,831,362
G
C
G
T
G
T/C
T
C/T
C
C
A
C
T
C
A
T
G
C
C
A
T
A
G
T
C
T
A
T
C
A
A/G
T/C
G/T
A/G
C/G
G/C
C
C
C
A
T
G
C
G
C
C
C
C
T
T
C
C
G
C
A
T
C
G
C
G
T
G
C/T
T/G
A
C
C
T
T/C
G
A
T
T
G
G
A
G
C
T
T
C
G
A
C
T
A
C
A
T
C
C
T
A
T
T
T
G
G
G
T
C
G
C
T
G
T
T
G
G
G
A
C/T
T/C
T
G
T
G
G
T
A
A
T
A
T
C
G
A
G
C
C
G
C
T
A
C
G
A
T
G
C
T
C
A/T
T
G
A
A
T
G
G
C
C
T
A
C
T
T
C
G
G
C
A
A
A
C
C
T
T
A
A
C
C/T
G
A
C
C
A
C
C
A
A
C
C
G
A
A
C
T
A
A
A
G
A
T
T
C
T
C
G
G
C
A
G
A
A
T
A
G
T
T
G
A
T
T
A
T
T
A
C
C
T
A
G
C
A
A
T
G
G
C
T
C
G
A
C
A
T
C
T
C
G
T
T
C
G
A
C
A
C
A
T
C
A
A
G
G
G
G
A
T
C
T
T
T
C
A
T
G
A
A
A
T
C
G
C
T
T
G/A
T
G
T
C
C
T
C
T
T
G
A
A
C
A
A
G
A
T
C
A
A
A
A
T
T
C
C
C
A
C
G/T
G
C
A
T
T/C
T/G
T
A
A
A
A
C
G
T/G
G
T
A
G
G
G
C
G
T
G
G
T
G
C
C
C
C
C
A
T
A
G
A
G
A
A
C
T
T
A
A
T/C
T/C
C
G
A
T
C
G
A
T
C
A
A
C
T
C
C
G
G
T
T
A
G
A
G
T
C
C
T
A
A
T
A/G
G/A
C
A
G
T
G
C
G
A
A
A
A
T
G
A
A
A
G
A
G
C
T
T
T/C
T
A
C
G
G
A
G
G
A
A
A
A
G
T
T
C
C
A
G
C
C
G
G
T
T
G
G
G
C
T
C
G
G
A
T
A
A
A
T
C
C
A
G
A
G
G
G
C
C
C
T
C
A
G
G
G
G
G
T
G
A
G
C
G
G
T
G
T
G
A
C
T
A
G
A
C
C
A
C
A
T
T
T
C
A
A
T
A
T
A
A
A
T
T
T
G/T
T/C
A
G
C
G
G
A
C
A
T
T
C