Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 80,717 (bp)   Positions: 354
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.024
.052
.036
.002
.001
.0
.005
.024
.011
.004
.012
.008
.204
.007
.97
.005
.006
.765
.001
.059
.618
.035
.006
.447
--
--
--
--
--
.015
.0
.002
.007
.021
.01
.009
.052
.003
.002
.997
.001
.226
.161
.002
.001
.0
.008
.004
.004
.0
.0
.752
.585
.04
.333
.219
--
--
--
--
.19
.137
--
.007
.007
.012
.001
.948
.002
.002
.01
.008
.005
.001
.01
.003
.009
.014
.039
.032
.003
.003
.022
.002
.018
.16
.035
.037
.007
.197
.0
.026
.007
.04
.003
.027
.36
.006
.034
.021
.06
.051
.0
.125
.054
.074
.02
.018
.205
.182
.089
--
--
--
--
.017
.007
.001
.002
.122
.0
.0
.027
.0
.001
.0
.006
.106
.008
.001
.001
.0
.46
.05
.016
.001
.0
.016
.0
.0
.0
.002
.003
--
.128
.083
.464
.001
.003
.016
.001
.001
.082
.038
.001
.073
.018
.001
.025
.032
.011
.005
.012
.134
.013
.038
.041
.373
.0
.0
.081
.008
.013
.044
.6
.42
.021
.006
.009
.005
.048
.7
.023
.003
.057
.004
.022
--
.212
.061
.039
.004
.029
.276
.055
.055
.002
.809
.008
.062
.0
.013
.365
.041
.437
.041
.021
.001
.094
.001
.0
.007
.072
.082
.001
.019
.002
.002
.054
.057
.023
.018
.009
.027
.066
.089
.03
.015
.513
.418
.013
.01
.018
.353
.244
--
--
--
--
--
--
.471
.008
.003
.018
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.359
.559
.221
.206
.046
.032
--
.014
.003
.025
.025
.324
--
.008
.031
.001
.006
.003
.002
.006
.026
.0
.001
.001
.006
.004
.61
.006
.034
--
.005
.014
.004
.016
.012
.005
.808
.004
.008
.016
.184
--
--
--
--
--
--
.147
.024
.0
.002
.0
.006
.0
.062
.044
.003
.048
.107
.095
.092
.001
.0
--
--
--
--
.036
--
--
--
.005
.023
.029
.012
.087
.049
.15
.108
.077
.378
.003
.062
.232
.102
.032
.064
.01
.007
.003
.014
.025
.119
.003
.23
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
Bcat1
A
G
T
C
C
T
C
-
-
-
-
T
T
T
G
2
-
-
A
2
A
G
C
G
G
A
3
C
-
T
A
-
-
T
G
T
C
T
A
A
2
G
T
A
T
-
G
2
C
G
G
T
-
-
C
A
C
C
G
C
C
G
A
G
G
G
T
-
2
T
G
C
T
2
-
C
T
G
G
T
G
A
C
T
C
C
A
G
A
T
A
T
G
T
A
G
G
T
C
T
T
T
A
A
G
T
-
-
A
T
T
T
T
G
A
T
A
A
T
C
T
T
G
C
T
A
G
C
C
A
A
C
A
G
C
2
C
C
C
T
A
-
C
A
T
G
G
T
T
A
G
T
G
A
T
A
G
A
5
45
-
T
T
G
C
T
G
-
A
C
-
G
A
G
G
T
C
C
G
A
A
A
G
C
C
A
15
T
G
C
C
T
C
G
T
10
A
17
C
G
A
C
T
C
G
A
G
-
G
C
-
C
G
T
C
G
C
A
A
A
-
A
A
A
T
A
T
G
T
T
A
T
G
C
-
C
C
C
4
-
A
T
G
T
C
T
C
T
C
C
C
A
A
C
T
G
C
G
G
T
G
-
C
G
T
T
A
T
C
T
C
3
C
A
C
A
G
A
C
A
G
T
T
T
C
C
A
T
A
G
A
G
T
T
T
G
G
C
C
A
A
-
C
A
A
T
C
C
A
T
C
A
G
A
A
G
G
T
4
C
C
G
6
A
T
T
C
T
C
G
G
T
T
G
T
5
13
G
G
T
G
-
C
4
A
-
4
T
G
T
2
A
C
G
  179,261,510
  179,262,723
  179,262,736
  179,262,751
  179,262,766
  179,262,788
  179,262,841
  179,262,870
  179,262,882
  179,262,906
  179,262,957
  179,262,980
  179,263,785
  179,267,357
  179,267,890
  179,269,251
  179,269,273
  179,270,768
  179,272,303
  179,272,413
  179,272,483
  179,275,140
  179,275,488
  179,275,611
  179,276,117
  179,276,665
  179,276,683
  179,276,739
  179,276,742
  179,278,728
  179,282,780
  179,283,592
  179,283,596
  179,283,898
  179,284,045
  179,287,142
  179,287,749
  179,287,837
  179,287,843
  179,291,098
  179,291,195
  179,291,202
  179,291,208
  179,291,252
  179,291,278
  179,291,287
  179,291,291
  179,291,296
  179,291,312
  179,291,324
  179,291,328
  179,291,351
  179,291,361
  179,291,390
  179,291,560
  179,291,566
  179,291,758
  179,291,781
  179,291,820
  179,291,897
  179,292,061
  179,292,066
  179,292,361
  179,292,699
  179,292,723
  179,292,739
  179,292,774
  179,292,832
  179,292,939
  179,292,960
  179,293,046
  179,293,074
  179,293,165
  179,293,174
  179,293,177
  179,293,294
  179,293,417
  179,293,557
  179,293,775
  179,293,969
  179,294,103
  179,294,135
  179,294,183
  179,294,193
  179,294,393
  179,294,440
  179,294,672
  179,294,705
  179,294,864
  179,294,945
  179,295,022
  179,295,060
  179,295,121
  179,295,160
  179,295,250
  179,295,298
  179,295,482
  179,295,541
  179,295,574
  179,295,610
  179,295,656
  179,295,664
  179,295,843
  179,295,939
  179,296,053
  179,296,198
  179,296,277
  179,296,279
  179,296,346
  179,296,348
  179,296,360
  179,296,447
  179,296,459
  179,296,591
  179,296,630
  179,296,640
  179,296,723
  179,296,861
  179,296,967
  179,297,025
  179,297,061
  179,297,074
  179,297,167
  179,297,177
  179,297,183
  179,297,314
  179,297,399
  179,297,495
  179,297,547
  179,297,608
  179,297,674
  179,297,763
  179,298,239
  179,298,307
  179,298,461
  179,298,512
  179,298,522
  179,298,650
  179,299,074
  179,299,197
  179,299,496
  179,299,572
  179,299,918
  179,300,160
  179,300,334
  179,300,372
  179,300,453
  179,300,647
  179,300,752
  179,300,905
  179,301,113
  179,301,226
  179,301,436
  179,301,627
  179,301,697
  179,301,942
  179,301,950
  179,302,256
  179,302,494
  179,302,502
  179,302,631
  179,302,636
  179,302,650
  179,302,667
  179,302,678
  179,302,732
  179,302,733
  179,302,754
  179,302,850
  179,302,862
  179,302,882
  179,302,906
  179,302,907
  179,302,927
  179,302,963
  179,302,984
  179,303,392
  179,303,398
  179,303,411
  179,303,832
  179,304,093
  179,306,069
  179,306,342
  179,306,493
  179,307,185
  179,307,269
  179,307,485
  179,308,037
  179,308,090
  179,309,498
  179,309,504
  179,309,700
  179,310,078
  179,310,644
  179,310,692
  179,310,775
  179,310,850
  179,310,977
  179,311,178
  179,311,242
  179,311,251
  179,311,494
  179,312,135
  179,312,407
  179,313,123
  179,313,513
  179,313,550
  179,314,143
  179,314,177
  179,314,424
  179,314,548
  179,314,567
  179,314,755
  179,315,095
  179,315,812
  179,315,868
  179,316,094
  179,316,190
  179,316,434
  179,316,436
  179,316,443
  179,316,450
  179,316,456
  179,316,459
  179,316,464
  179,316,472
  179,316,477
  179,316,486
  179,316,521
  179,316,535
  179,316,565
  179,316,566
  179,316,571
  179,316,604
  179,316,608
  179,317,277
  179,317,416
  179,317,420
  179,317,621
  179,317,671
  179,317,736
  179,318,483
  179,319,388
  179,319,430
  179,319,452
  179,319,692
  179,319,696
  179,320,111
  179,320,140
  179,320,142
  179,320,278
  179,320,341
  179,320,459
  179,320,804
  179,321,583
  179,322,258
  179,322,436
  179,323,157
  179,323,695
  179,323,806
  179,323,831
  179,323,838
  179,324,848
  179,326,216
  179,327,328
  179,327,859
  179,327,950
  179,328,185
  179,328,400
  179,328,481
  179,329,637
  179,329,713
  179,329,726
  179,329,749
  179,329,890
  179,329,894
  179,329,913
  179,330,006
  179,330,021
  179,330,092
  179,330,115
  179,330,171
  179,330,283
  179,330,486
  179,330,763
  179,330,922
  179,331,074
  179,331,171
  179,331,512
  179,331,553
  179,331,558
  179,331,657
  179,331,695
  179,331,721
  179,332,011
  179,332,124
  179,332,324
  179,332,389
  179,332,455
  179,332,513
  179,332,536
  179,332,550
  179,332,566
  179,332,587
  179,332,607
  179,332,706
  179,332,721
  179,332,931
  179,332,950
  179,333,067
  179,333,086
  179,333,176
  179,333,250
  179,333,253
  179,333,274
  179,333,352
  179,333,362
  179,334,142
  179,334,702
  179,334,888
  179,335,121
  179,335,581
  179,335,775
  179,335,825
  179,335,865
  179,336,372
  179,336,538
  179,336,643
  179,336,886
  179,337,020
  179,337,073
  179,337,438
  179,337,479
  179,337,495
  179,337,512
  179,337,629
  179,337,635
  179,337,696
  179,337,832
  179,338,210
  179,338,250
  179,338,497
  179,338,511
  179,338,644
  179,338,709
  179,338,735
  179,338,752
  179,338,784
  179,339,036
  179,339,366
  179,339,558
  179,339,668
  179,339,708
  179,339,991
T
-
-
-
-
-
-
G
G
T
G
C
C
C
A
-
2
4
G
-
G
A
A
-
-
T
-
-
T
C
G
3
G
C
C
C
T
A
T
G
-
T
-
-
-
A
-
-
-
-
-
-
G
3
T
G
A
T
A
T
T
A
C
A
T
A
C
4
-
C
C
T
A
-
2
A
C
A
A
C
A
G
T
C
T
T
G
A
G
A
G
A
A
C
G
A
C
C
T
G
C
G
G
T
C
C
7
114
C
A
A
-
-
A
G
C
G
G
G
A
G
C
T
T
G
C
T
T
-
C
G
T
C
A
A
-
T
T
G
C
T
G
T
C
A
A
C
C
C
-
A
C
A
G
C
G
A
G
-
-
A
-
-
-
-
G
T
G
-
-
G
A
G
-
-
-
T
T
A
G
T
-
A
A
G
C
-
C
A
T
T
C
G
A
C
-
G
-
T
A
G
T
C
T
T
G
A
3
A
T
3
T
A
C
T
A
T
G
A/-
A/G
-/13
A/G
A/G
A/G
T/C
A/C
T/C
G/A
T/C
T/C
A/T
T/G
G/-
C/A
-/A
T
T
T
-
T
G
C
A
A
T
C
G
C
T
T
T
G
T
T
C
A
T
A
G/T
C
A
5
T
C
C
G
G
C
T
C
T
-
A
G
A
G
T
G
T
G
A
C
C
C
T
T
G
G
G
A
C
A
G
C
C
-
A
T
T
T
G
T
G
G
A/G
A
T
T
-
C
T
G
A
G
G
A
A
-
-
T
T
C
-
T
G
C
-
G
T
A
A
C
C
A
C
-
-
A
A
-
A
4
T
-
G
G
-
C
-
C
-
T
G
T