Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 533,049 (bp)   Positions: 407
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.083
.0
.027
.014
.01
.004
.013
.034
.043
.061
.022
.001
.004
.223
.549
.656
.531
.417
.026
.002
.0
.0
.021
.002
.002
.008
.0
.001
.001
.005
.005
.018
.013
.009
.013
.055
.057
.02
.002
.02
.008
.007
.009
.003
.0
.0
.003
.0
.0
.0
.004
.005
.026
.05
.163
.212
.02
.011
.023
.071
.007
.002
.001
.002
.001
.003
.0
.001
.005
.001
.001
.038
.01
.003
.017
.083
.007
.034
.001
.0
.019
.129
.137
.075
.007
.009
.009
.002
.008
.001
.013
.007
.002
.011
.006
.006
.0
.0
.0
.001
.001
.0
.0
.008
.166
.188
.267
.314
.306
.0
.0
.001
.001
.001
.002
.0
.001
.0
.001
.009
.008
.009
.003
.003
.001
.0
.078
.011
.003
.009
.035
.005
.0
.0
.269
.283
.005
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.01
.039
.0
.002
.0
.0
.0
.0
.006
.0
.001
.012
.001
.129
.027
.001
.003
.0
.065
.007
.004
.001
.0
.0
.007
.0
.003
.017
.002
.004
.001
.012
.007
.014
.002
.0
.0
.0
.001
.004
.003
.001
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.03
.0
.001
.004
.078
.009
.143
.219
.206
.0
.011
.171
.001
.155
.67
.025
.024
.005
.005
.001
.012
.016
.008
.131
.197
.0
.0
.001
.209
.018
.0
.001
.001
.0
.001
--
.811
.72
.662
.595
.408
.025
.225
.004
.001
.0
.004
.181
.045
.003
.002
.002
.0
.007
.004
.004
.003
.003
.081
.014
.001
.003
.081
.035
.006
.004
.001
.0
.001
.001
.05
.021
.087
.0
.0
.0
.0
.003
.0
.003
.002
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.448
.001
--
.07
.049
.027
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.001
.003
.007
.003
.003
.0
.04
.06
.058
.05
.032
.023
.001
.001
.011
.026
.059
.066
.029
--
--
.629
.01
.011
.024
.005
.011
.011
.003
.366
.106
.114
.138
.173
.004
.006
.006
.01
.081
.268
.379
.002
.17
.001
.0
.001
.0
.0
.001
.001
.001
.001
.001
.001
.001
.002
.048
.069
.008
.006
.003
.031
--
.152
.177
.177
--
.003
.019
.031
.042
.012
.007
.001
.031
.098
.0
.001
.001
.004
.014
.009
.001
.001
.01
.021
.001
.041
.045
.032
.063
.051
.035
.003
.004
.003
.001
.007
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
Atp8a2
-
C
5
A
4
2
C
-
2
2
A
A
G
2
A
T
C
2
-
-
T
A
G
-
3
-
-
A
A
G
T
T
2
A
G
T
C
C
5
5
-
C
G
-
3
2
A
-
G
G
C
A
-
-
-
-
C
G
T
T
A
T
-
G
C
2
-
C
-
A
C
C
T
G
-
A
A
-
A
C
-
C
G
-
-
-
G
-
T
T
G
C
-
-
-
4
T
A
2
G
A
-
-
-
A
T
C
G
7
C
C
-
A
-
-
C
G
-
-
-
A
C
-
A
-
-
-
C
-
C
A
A
C
-
G
-
-
-
C
C
C
-
-
C
-
-
-
C
C
A
-
A
-
-
-
C
T
-
-
C
C
A
-
T
-
-
-
C
G
A
-
-
-
-
-
A
2
-
A
G
A
-
C
T
G
-
C
-
G
C
C
3
A
T
A
-
3
G
-
A
-
C
G
C
A
2
C
5
-
A
G
2
C
T
G
G
2
3
-
-
G
G
-
C
-
A
-
2
-
G
A
-
2
G
-
-
-
-
-
A
-
-
C
T
-
T
-
-
G
G
T
-
2
C
T
-
-
-
-
-
T
C
-
A
-
-
-
-
G
-
-
A
A
C
C
G
A
G
T
A
C
C
C
C
2
7
G
C
-
A
-
G
-
-
G
T
17
5
G
3
G
G
G
G
-
3
2
10
2
G
G
T
C
T
2
G
G
G
4
G
-
-
4
G
3
G
2
A
A
6
A
G
G
C
G
C
C
C
A
-
C
C
A
-
-
G
-
-
-
-
-
2
G
C
G
-
C
A
A
2
-
-
T
T
C
-
C
C
C
A
T
-
C
G
-
T
G
G
-
G
-
-
G
G
G
-
A
T
C
-
-
A
T
-
G
-
T
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
  40,039,848
  40,040,065
  40,055,003
  40,055,011
  40,055,013
  40,055,021
  40,055,024
  40,055,027
  40,055,029
  40,055,045
  40,055,062
  40,055,072
  40,055,074
  40,055,080
  40,055,099
  40,055,105
  40,055,116
  40,055,122
  40,055,141
  40,055,150
  40,055,159
  40,055,160
  40,055,181
  40,055,202
  40,055,209
  40,055,216
  40,055,221
  40,055,235
  40,055,238
  40,055,244
  40,055,245
  40,055,249
  40,055,293
  40,055,299
  40,055,303
  40,055,310
  40,055,318
  40,055,322
  40,055,325
  40,055,334
  40,059,441
  40,059,456
  40,059,457
  40,059,473
  40,059,478
  40,059,489
  40,059,491
  40,059,500
  40,059,506
  40,059,519
  40,059,537
  40,059,540
  40,059,561
  40,059,563
  40,059,567
  40,059,571
  40,059,588
  40,059,593
  40,059,650
  40,059,665
  40,059,679
  40,059,686
  40,059,775
  40,059,782
  40,059,786
  40,059,791
  40,059,804
  40,059,808
  40,059,811
  40,059,821
  40,059,830
  40,059,844
  40,059,849
  40,059,868
  40,059,872
  40,059,878
  40,059,899
  40,059,904
  40,059,957
  40,059,958
  40,059,965
  40,059,976
  40,059,981
  40,059,987
  40,060,004
  40,060,018
  40,060,033
  40,063,561
  40,063,569
  40,063,573
  40,063,584
  40,063,591
  40,063,600
  40,063,614
  40,063,617
  40,063,622
  40,063,630
  40,063,634
  40,063,637
  40,063,641
  40,063,649
  40,063,654
  40,063,672
  40,063,684
  40,063,710
  40,063,712
  40,063,715
  40,063,723
  40,063,728
  40,068,054
  40,068,058
  40,068,100
  40,070,682
  40,073,465
  40,073,466
  40,073,473
  40,073,493
  40,073,504
  40,073,520
  40,073,568
  40,073,586
  40,073,606
  40,073,610
  40,073,612
  40,073,618
  40,073,651
  40,073,681
  40,073,709
  40,073,744
  40,073,752
  40,073,766
  40,073,800
  40,073,842
  40,073,854
  40,073,884
  40,073,887
  40,073,915
  40,073,921
  40,073,935
  40,073,937
  40,073,939
  40,073,945
  40,073,950
  40,073,952
  40,073,955
  40,073,961
  40,073,967
  40,073,972
  40,073,984
  40,073,986
  40,074,007
  40,074,015
  40,074,020
  40,074,024
  40,074,026
  40,074,035
  40,074,042
  40,074,054
  40,074,077
  40,074,085
  40,074,089
  40,074,093
  40,074,101
  40,074,105
  40,074,108
  40,074,110
  40,074,131
  40,074,136
  40,074,144
  40,074,156
  40,074,166
  40,074,181
  40,074,195
  40,074,201
  40,074,219
  40,074,224
  40,074,226
  40,074,272
  40,074,285
  40,074,290
  40,074,291
  40,074,299
  40,074,302
  40,074,308
  40,074,312
  40,074,327
  40,074,334
  40,074,337
  40,074,351
  40,074,357
  40,074,377
  40,074,381
  40,074,394
  40,074,413
  40,074,438
  40,074,451
  40,074,461
  40,074,476
  40,074,483
  40,074,495
  40,074,510
  40,074,511
  40,074,520
  40,074,524
  40,074,535
  40,074,560
  40,074,567
  40,074,584
  40,074,592
  40,074,594
  40,074,618
  40,074,621
  40,074,636
  40,074,644
  40,074,646
  40,074,650
  40,074,675
  40,074,679
  40,074,728
  40,109,705
  40,109,713
  40,109,757
  40,109,795
  40,109,834
  40,109,877
  40,109,879
  40,109,884
  40,109,886
  40,110,132
  40,110,289
  40,110,298
  40,110,304
  40,110,306
  40,110,309
  40,114,732
  40,115,979
  40,116,002
  40,116,031
  40,116,053
  40,116,055
  40,116,064
  40,116,140
  40,116,156
  40,116,157
  40,116,163
  40,116,215
  40,116,219
  40,116,234
  40,116,266
  40,116,305
  40,116,349
  40,116,375
  40,116,383
  40,116,412
  40,116,413
  40,116,434
  40,116,438
  40,116,440
  40,116,450
  40,120,187
  40,120,357
  40,120,374
  40,120,491
  40,152,292
  40,192,333
  40,192,338
  40,192,415
  40,192,423
  40,192,498
  40,192,586
  40,192,715
  40,192,727
  40,230,932
  40,230,933
  40,230,941
  40,245,483
  40,245,642
  40,245,743
  40,245,935
  40,245,945
  40,245,946
  40,246,639
  40,246,675
  40,246,680
  40,258,642
  40,263,810
  40,263,818
  40,263,873
  40,264,062
  40,264,090
  40,264,174
  40,264,176
  40,268,765
  40,268,810
  40,328,577
  40,336,140
  40,336,271
  40,353,688
  40,353,695
  40,353,697
  40,353,702
  40,353,706
  40,353,709
  40,353,712
  40,353,716
  40,353,719
  40,353,726
  40,353,729
  40,353,753
  40,353,766
  40,353,768
  40,353,778
  40,353,788
  40,353,789
  40,353,793
  40,353,842
  40,353,850
  40,353,860
  40,353,864
  40,353,869
  40,353,872
  40,353,880
  40,353,884
  40,353,906
  40,353,909
  40,353,915
  40,353,917
  40,361,829
  40,369,654
  40,369,673
  40,414,386
  40,414,424
  40,414,427
  40,414,526
  40,414,549
  40,414,577
  40,414,603
  40,414,611
  40,416,325
  40,416,397
  40,416,399
  40,416,408
  40,416,494
  40,418,204
  40,418,207
  40,418,208
  40,418,210
  40,418,213
  40,418,219
  40,418,225
  40,418,241
  40,421,706
  40,424,699
  40,424,705
  40,424,713
  40,424,760
  40,424,764
  40,424,765
  40,424,771
  40,424,781
  40,424,786
  40,424,790
  40,424,792
  40,424,796
  40,424,815
  40,439,040
  40,439,062
  40,439,075
  40,439,133
  40,439,162
  40,439,172
  40,451,007
  40,451,272
  40,451,281
  40,451,316
  40,451,668
  40,451,723
  40,451,798
  40,451,850
  40,451,858
  40,451,863
  40,451,886
  40,451,889
  40,451,900
  40,451,919
  40,451,925
  40,451,932
  40,451,937
  40,451,938
  40,451,953
  40,451,993
  40,452,005
  40,452,022
  40,452,038
  40,452,048
  40,452,099
  40,452,125
  40,452,140
  40,452,278
  40,452,308
  40,452,315
  40,452,321
  40,452,329
  40,452,350
  40,452,382
  40,452,483
  40,452,506
4
-
-
-
-
-
-
G
-
-
-
G
A
-
T
-
-
-
G
A
C
T
-
2
-
2
A
-
-
T
G
-
-
G
-
-
-
-
-
-
G
G
C
C
-
-
G
C
-
-
-
-
A
G
G
C
G
C
-
-
-
A
T
A
A
-
2
-
G
C
-
-
-
C
G
-
-
C
C
A
T
-
-
A
G
A
-
T
-
-
-
T
2
T
G
-
C
C
-
-
-
C
A
C
-
A
T
-
-
-
-
A
T
T
T
-
T
G
C
T
G
-
T
C
G
T
T
-
G
-
-
G
G
T
-
T
G
A
T
G
G
C
3
-
A
2
G
-
T
C
T
T
C
T
G
-
C
G
T
-
-
-
G
G
T
T
C
-
T
G
2
2
T
C
C
T
-
T
-
A
G
G
-
-
-
A
-
C
-
-
-
-
-
-
-
T
-
T
2
-
T
G
-
-
-
-
-
-
C
T
-
-
-
A
-
-
-
-
4
A
-
-
G
-
T
C
2
-
T
-
-
3
-
T
2
A
T
G
C
-
C
T
A
C
A
-
G
A
A
-
-
C
-
T
C
C
C
C
C
4
-
-
A
G
C
C
C
2
-
G
G
-
G
A
A
G/T
A/C
G/C
T/G
A/G
C/A
A
A
A
2/-
-
C
G
C
-
C
-
A
A
G/A
-
-
-
C
-
-
-
A/C
-
2
-
-
-
-
T
-
-
T
C
-
-
C
-
-
C
A
C
-
-
-
-
-
G
A/T
6/-
-
-
-
-
T
-
A
-
-
G
-
-
-
C
3
C
2
2
A
3
A
2/-
-
-
-
T
A
G
G
-
G
C
-
A
T
C
-
-
-
-
-
6
-
-
C
G
-
-
C
-
T
T
-
-
-
A
G
C
G
C
T
-
-
C
-
T
-
A
C
C
T
C
C
T
A
C
A