Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 168,550 (bp)   Positions: 344
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.001
.001
.001
.005
.009
.0
.001
.04
.008
.002
.008
.002
.002
.007
.001
.001
.004
.002
.002
.008
.021
.024
.007
.006
.009
.006
.012
.009
.007
.049
.059
.039
.006
.008
.081
.051
.168
.192
.028
.017
.002
.001
.003
.014
.01
.012
.005
.001
.005
.006
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.002
.001
.002
.009
.517
--
.036
.004
.019
.051
.067
.002
.365
.117
.201
--
--
.136
.066
.044
.446
.0
.0
.126
.002
.0
.031
.204
.015
.519
.077
.097
.004
.091
.001
.0
.0
.003
.0
.02
.001
.041
.006
.001
.0
.001
.001
.0
.0
.0
.007
.004
.096
.004
.047
.039
.001
.034
.203
.018
.009
.009
.031
.02
.001
.02
.001
.0
.0
.174
.006
.049
.006
.003
.859
.001
.004
.024
.002
.08
.005
.145
--
--
.03
.007
.001
.0
.001
.001
.001
.023
.0
.0
.0
.0
.011
.998
.005
.133
.0
.036
.025
.107
.001
.0
.0
.001
.001
.0
.009
.0
.303
.001
.008
.041
.0
.049
.003
.067
.137
.038
.069
.021
.469
.018
.009
.027
.023
.0
.001
.001
.024
.0
.104
.003
.006
.001
.0
.001
.003
.001
.004
.063
.005
.001
.004
.293
.081
.018
.0
.0
.019
.089
.089
.003
.0
.0
.002
.0
.0
.117
.0
.001
.0
.163
.088
.001
.003
.001
.035
.353
.0
.001
.004
.003
.001
.0
.0
.154
.206
.0
.016
.0
.001
.0
.003
.003
.01
.371
.002
.004
.003
.029
.029
.0
.0
.001
.039
.295
.039
.088
.003
.001
.0
.014
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.097
.042
.257
.004
.0
.001
.0
.647
.0
.001
.0
.311
.001
.194
.675
.302
.0
.008
.005
.009
.028
.092
.001
.001
.001
.0
.001
.022
.004
.182
.226
.001
.0
.007
.003
.81
.581
.0
.133
.001
.001
.002
.006
.005
.028
.001
.003
.001
.073
.0
.004
.042
.005
.002
.0
.001
.001
.0
.0
.0
.0
.046
.0
.003
.0
.163
.0
.009
.001
.0
.0
.001
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
Atp10a
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
-
G
-
-
-
G
G
-
-
G
G
T
A
G
T
G
G
-
-
T
-
-
-
G
T
-
2
C
C
-
3
T
-
C
-
2
A
T
C
-
-
-
-
-
T
-
T
-
-
T
-
C
2
G
-
C
C
-
G
A
G
G
A
4
T
G
A
T
T
T
G
C
G
C
A
C
T
-
C
C
C
A
C
C
-
C
G
G
A
2
T
G
T
A
T
T
T
C
C
T
A
T
A
T
C
C
A
A
C
G
T
-
T
C
T
A
A
A
9
A
T
A
T
C
A
T
-
A
2
A
C
G
G
A
T
C
T
-
A
C
2
C
G
A
A
-
-
G
C
G
A
T
C
-
G
-
C
G
-
G
G
A
-
G
A
T
-
-
G
A
C
A
T
-
A
A
2
C
2
T
A
-
A
C
T
T
G
G
G
A
A
A
A
G
C
T
12
A
G
T
A
A
G
T
C
A
T
G
T
T
A
G
G
G
-
T
G
T
C
C
T
-
10
A
-
C
A
G
G
C
C
A
G
C
C
G
2
G
T
T
G
G
G
G
C
C
-
C
A
G
G
G
G
-
G
C
-
C
A
G
C
G
C
A
C
G
T
C
C
T
A
G
A
A
T
G
G
C
A
A
C
A
T
G
A
5
C
G
-
-
-
G
T
-
G
-
-
G
T
T
2
-
A
A
T
A
T
G
-
A
T
2
A
C
T
T
A
A
T
-
C
T
G
-
-
A
C
A
G
C
G
A
C
T
C
C
T
G
C
T
C
G
C
T
  115,973,630
  115,973,637
  115,973,641
  115,973,664
  115,973,696
  115,973,709
  115,973,717
  115,973,721
  115,974,178
  115,974,186
  115,974,189
  115,974,196
  115,974,197
  115,974,215
  115,974,224
  115,974,229
  115,974,235
  115,974,243
  115,974,244
  115,974,247
  115,974,270
  115,974,277
  115,974,284
  115,974,285
  115,974,296
  115,974,302
  115,974,310
  115,974,324
  115,974,340
  115,974,355
  115,974,359
  115,974,363
  115,974,380
  115,974,382
  115,974,404
  115,974,420
  115,974,425
  115,974,426
  115,974,438
  115,974,445
  115,974,448
  115,974,452
  115,974,458
  115,974,460
  115,974,464
  115,974,467
  115,974,475
  115,974,484
  115,974,485
  115,974,498
  115,974,501
  115,974,506
  115,974,508
  115,974,512
  115,974,515
  115,974,537
  115,974,539
  115,974,544
  115,976,110
  115,976,256
  115,977,429
  115,979,674
  115,981,822
  115,987,932
  115,988,151
  115,988,519
  115,992,049
  115,992,091
  115,994,273
  115,996,111
  115,996,475
  115,997,000
  115,997,209
  115,997,790
  115,997,851
  116,000,184
  116,000,350
  116,000,615
  116,000,995
  116,001,667
  116,002,055
  116,002,964
  116,003,554
  116,003,963
  116,005,096
  116,005,406
  116,005,746
  116,006,084
  116,006,491
  116,007,143
  116,007,256
  116,008,497
  116,008,730
  116,008,888
  116,009,788
  116,009,887
  116,009,941
  116,009,979
  116,010,011
  116,010,043
  116,010,141
  116,010,142
  116,010,191
  116,010,582
  116,010,684
  116,010,888
  116,010,983
  116,011,178
  116,011,520
  116,011,555
  116,011,595
  116,011,725
  116,011,982
  116,012,026
  116,012,170
  116,012,533
  116,012,605
  116,012,635
  116,012,638
  116,012,658
  116,012,713
  116,012,860
  116,012,872
  116,013,028
  116,013,093
  116,013,177
  116,013,976
  116,014,240
  116,014,800
  116,015,350
  116,015,363
  116,015,516
  116,016,014
  116,016,321
  116,016,390
  116,016,894
  116,017,015
  116,017,447
  116,018,332
  116,018,752
  116,018,789
  116,019,816
  116,020,082
  116,020,288
  116,021,034
  116,021,594
  116,021,752
  116,021,779
  116,022,959
  116,023,610
  116,024,357
  116,025,193
  116,025,525
  116,025,562
  116,025,951
  116,026,162
  116,026,402
  116,027,550
  116,027,797
  116,028,438
  116,028,476
  116,028,900
  116,029,040
  116,029,430
  116,029,629
  116,029,715
  116,029,719
  116,029,792
  116,029,880
  116,030,122
  116,030,529
  116,031,325
  116,031,391
  116,031,795
  116,032,496
  116,033,174
  116,033,334
  116,033,397
  116,033,420
  116,033,440
  116,033,590
  116,033,817
  116,033,911
  116,034,155
  116,034,250
  116,034,256
  116,034,853
  116,035,182
  116,035,440
  116,035,585
  116,035,680
  116,035,747
  116,036,097
  116,037,402
  116,037,488
  116,037,713
  116,038,267
  116,038,300
  116,038,384
  116,039,010
  116,040,136
  116,041,326
  116,042,058
  116,042,061
  116,042,430
  116,042,959
  116,042,986
  116,043,262
  116,043,275
  116,043,363
  116,043,383
  116,043,391
  116,043,504
  116,044,163
  116,044,203
  116,044,243
  116,044,288
  116,044,335
  116,044,577
  116,044,691
  116,045,320
  116,046,058
  116,046,719
  116,047,473
  116,048,039
  116,048,043
  116,049,162
  116,049,949
  116,051,508
  116,052,381
  116,052,384
  116,052,783
  116,053,328
  116,053,851
  116,054,686
  116,055,729
  116,056,473
  116,057,315
  116,057,903
  116,058,388
  116,059,373
  116,059,447
  116,059,470
  116,059,701
  116,059,760
  116,063,954
  116,064,298
  116,064,514
  116,065,754
  116,067,324
  116,068,771
  116,068,815
  116,069,720
  116,069,781
  116,070,248
  116,071,044
  116,071,499
  116,071,838
  116,071,881
  116,072,836
  116,073,229
  116,073,483
  116,073,614
  116,073,859
  116,074,269
  116,074,299
  116,074,507
  116,074,523
  116,075,153
  116,075,711
  116,075,977
  116,076,169
  116,076,809
  116,076,885
  116,077,275
  116,078,756
  116,080,187
  116,080,582
  116,080,742
  116,093,511
  116,094,435
  116,095,205
  116,095,407
  116,096,476
  116,098,132
  116,099,108
  116,099,165
  116,099,361
  116,099,440
  116,099,459
  116,099,533
  116,099,593
  116,099,600
  116,099,644
  116,099,649
  116,099,664
  116,099,679
  116,099,684
  116,099,689
  116,099,700
  116,099,715
  116,100,722
  116,101,829
  116,102,075
  116,105,049
  116,106,072
  116,106,625
  116,109,427
  116,109,923
  116,116,729
  116,117,079
  116,117,883
  116,118,407
  116,118,551
  116,119,377
  116,119,380
  116,120,041
  116,121,366
  116,121,437
  116,121,485
  116,121,930
  116,122,556
  116,122,985
  116,123,971
  116,124,287
  116,124,745
  116,128,538
  116,128,705
  116,130,112
  116,130,134
  116,130,400
  116,130,528
  116,130,701
  116,131,133
  116,131,315
  116,131,938
  116,134,140
  116,134,147
  116,136,526
  116,138,702
  116,139,447
  116,141,681
  116,141,768
  116,141,804
A
-
5
C
A
-
A
C
G
-
-
A
C
T
A
-
A
C
A
-
C
C
A
A
-
C
-
-
A
2
-
G
3
A
2
-
-
C
A
2
A
C
T
A
A
5
C
A
2
-
4
T
-
C
C
-
-
A
A
G
A
C
-
-
C
A
G
C
C
C
A
-
C
T
G
G
C
2
A
T
T
G
G
T
18
G
A
T
G
-
-
T
C
G
C
C
C
G
T
C
G
A
-
A
G
T
G
T
T
A
C
6
C
T
C
G
G
-
-
C
C
G
A
T
G
C
2
G
-
-
T
T
A
G
C
T
-
4
C
T
-
T
T
C
G
A
T
C
G
A
G
G
T
T
C
A
A
C
-/T
T
A
T
C
A
G
C
4
T
A
-
T
G
C
T
T
G
-
G
-
A
G
C
G
T
-
C
A
A
A
T
G
G
-
A
-
C
-
G
A
C
G
G
A
C
T
G
C
A
C
C
G
A
A
A
G
G
A
A
G
T
G
T
-
T
A
A
C
C
C
G
T
C
A
G
G
A
-
T
C
C
C
A
A
A
A
T
11
T
T
A
T
T
T
2
A
T
T
T
G
A
G
T
T
-
C/T
G/T
C
T
A
C
G
C
G
T
A
T
T
-
C
G
G
G
C
T
T
-
-
-
T
A
A
-
-
T
-
T
C
-
-
-
-
-/10
T
T
A
C
C
A
2
C
C
-
G
A
G
G
G
G
C
T
G
C
A
116
T
G
T
C
C
T
A
C
T
G
T
G
G
A
T
C
T
A
T
C