Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 136,660 (bp)   Positions: 283
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.006
.029
.008
.002
.005
.013
.0
.001
.001
.048
.016
.015
.0
.0
.001
.009
.391
.421
--
--
.0
.026
.162
.001
.001
.064
.148
.157
.096
--
.929
.001
.006
.008
.041
.034
.093
.839
.019
.002
.033
.863
.675
.052
.578
.608
.064
.264
.101
.453
.003
.045
.09
.17
.98
.002
.0
.442
.025
.001
.301
.087
.0
--
.008
.143
--
--
.008
.558
.458
.0
.001
.001
.002
.006
.004
.047
.0
.046
.008
.011
.07
.683
.001
.004
--
--
.011
.007
.004
.001
.006
.004
.002
.042
.072
.099
--
.002
.004
.017
.429
.185
.146
.032
.275
.224
.01
.046
--
.026
.055
.303
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.391
.294
.072
.201
.011
.253
.71
.033
.011
--
.009
.019
.01
.036
.0
.176
.036
.002
.001
.013
.001
.126
.134
.141
.146
.245
.004
--
.029
.003
.002
.118
.016
.018
.107
.086
.014
.016
.248
.111
.237
.141
.003
.002
.672
.0
.0
.0
--
--
--
.128
.004
.049
.063
.078
.025
.027
.287
.055
.096
.033
.009
.002
.077
--
.757
.011
.366
.138
.005
.064
.017
.005
.293
.012
.02
.028
--
.002
.103
.001
.01
.013
.257
.052
--
.008
.102
.005
.012
.161
.07
.011
.001
.004
.0
.003
.027
.055
--
--
--
.001
.065
.376
--
.011
.0
.009
.004
--
.0
.003
.422
.026
.02
.002
.007
.047
.18
.149
.112
--
--
--
.009
.04
1.0
.0
.05
1.0
1.0
.001
.0
.001
.001
.002
.09
.0
.013
.021
.05
.007
.019
.937
.0
.005
.003
--
.001
.001
.001
.017
.0
.0
.043
1.0
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
Ash1l
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
A
G
G
C
G
4
A
A
T
A
A
G
C
A
T
-
C
G
G
C
T
-
-
2
A
T
T
T
T
T
G
T
G
G
T
A
10
G
A
G
G
C
-
3
T
T
A
G
T
G
-
C
-
T
A
C
A
-
C
C
A
G
A
C
A
G
T
T
T
G
T
G
G
-
T
A
T
T
T
C
C
A
C
A
A
G
T
C
T
A
C
A
A
A
-
A
A
T
G
T
A
A
C
T
A
-
G
A
A
A
G
-
C
C
A
T
G
T
C
G
T
A
G
A
T
T
C
G
G
T
3
T
35
T
G
T
T
G
G
G
T
G
G
-
T
A
A
A
A
G
A
T
A
G
A
T
T
T
T
3
T
2
G
-
T
C
A
C
A
G
A
G
G
C
A
T
C
4
T
G
C
A
A
T
G
G
-
C
G
-
C
T
G
2
G
G
A
G
G
G
T
T
109
A
A
C
G
G
C
A
C
T
C
G
T
T
T
T
2
G
C
T
-
C
-
2
-
A
A
A
A
A
-
G
-
T
G
C
A
C
C
2
C
G
-
-
-
C
C
C
G
G
A
C
G
G
A
C
G
G
G
4
C
C
C
A
C
G
C
C
A
C
C
A
A
-
T
G
G
A
G
A
  188,255,354
  188,255,521
  188,256,199
  188,257,015
  188,257,438
  188,258,183
  188,258,609
  188,258,672
  188,258,674
  188,259,136
  188,259,178
  188,260,338
  188,260,647
  188,261,053
  188,262,414
  188,262,565
  188,262,950
  188,262,954
  188,263,501
  188,263,735
  188,264,325
  188,264,569
  188,265,308
  188,266,086
  188,266,088
  188,266,264
  188,266,758
  188,266,849
  188,267,930
  188,268,003
  188,269,449
  188,269,691
  188,270,210
  188,270,294
  188,270,334
  188,270,803
  188,271,277
  188,271,672
  188,271,810
  188,272,636
  188,274,641
  188,274,805
  188,276,004
  188,276,594
  188,277,726
  188,278,045
  188,278,113
  188,279,909
  188,280,025
  188,280,311
  188,280,827
  188,280,839
  188,280,846
  188,280,873
  188,282,775
  188,286,672
  188,287,022
  188,287,492
  188,287,591
  188,288,005
  188,288,076
  188,288,459
  188,288,697
  188,289,406
  188,290,471
  188,291,131
  188,291,228
  188,292,809
  188,293,376
  188,293,678
  188,294,484
  188,295,604
  188,295,633
  188,295,692
  188,295,740
  188,295,765
  188,295,805
  188,296,161
  188,296,197
  188,296,994
  188,298,331
  188,300,181
  188,300,487
  188,300,637
  188,300,789
  188,301,320
  188,301,774
  188,301,999
  188,303,406
  188,303,657
  188,303,662
  188,303,749
  188,306,920
  188,307,169
  188,309,116
  188,310,313
  188,310,683
  188,311,052
  188,311,159
  188,311,484
  188,312,014
  188,313,294
  188,313,450
  188,313,816
  188,313,912
  188,314,149
  188,314,363
  188,314,920
  188,315,027
  188,315,236
  188,315,570
  188,315,904
  188,315,937
  188,316,803
  188,316,997
  188,318,736
  188,318,829
  188,319,136
  188,319,327
  188,319,875
  188,320,049
  188,320,476
  188,320,836
  188,320,987
  188,321,407
  188,322,577
  188,323,080
  188,323,511
  188,323,635
  188,323,855
  188,324,161
  188,324,335
  188,324,520
  188,324,524
  188,324,595
  188,324,666
  188,325,630
  188,325,663
  188,325,952
  188,327,084
  188,327,343
  188,327,478
  188,327,860
  188,327,899
  188,329,532
  188,329,752
  188,331,073
  188,331,076
  188,331,079
  188,331,082
  188,331,219
  188,331,939
  188,332,094
  188,332,478
  188,333,011
  188,333,089
  188,333,278
  188,333,468
  188,333,469
  188,333,489
  188,333,498
  188,333,761
  188,334,681
  188,334,726
  188,335,710
  188,338,411
  188,338,533
  188,338,648
  188,338,784
  188,339,325
  188,339,959
  188,340,373
  188,340,374
  188,341,499
  188,341,664
  188,341,853
  188,343,411
  188,343,872
  188,344,682
  188,345,349
  188,345,699
  188,345,908
  188,345,909
  188,346,146
  188,346,339
  188,346,389
  188,346,604
  188,347,400
  188,348,785
  188,349,356
  188,350,209
  188,350,293
  188,350,532
  188,350,556
  188,350,808
  188,351,000
  188,351,095
  188,351,470
  188,351,527
  188,351,602
  188,352,317
  188,352,715
  188,353,202
  188,353,424
  188,354,262
  188,354,935
  188,355,067
  188,355,107
  188,355,421
  188,355,506
  188,357,256
  188,358,473
  188,359,452
  188,359,612
  188,359,672
  188,359,775
  188,359,984
  188,359,990
  188,360,371
  188,360,552
  188,360,965
  188,361,630
  188,362,018
  188,362,082
  188,362,113
  188,363,155
  188,363,168
  188,363,256
  188,363,363
  188,363,905
  188,364,071
  188,364,322
  188,364,728
  188,365,125
  188,365,422
  188,365,487
  188,368,015
  188,368,389
  188,368,742
  188,368,974
  188,369,059
  188,369,588
  188,370,735
  188,372,314
  188,372,396
  188,372,469
  188,372,488
  188,372,511
  188,373,264
  188,373,266
  188,373,271
  188,373,849
  188,374,343
  188,374,461
  188,375,748
  188,375,908
  188,376,248
  188,376,428
  188,376,544
  188,377,000
  188,377,567
  188,377,903
  188,378,404
  188,379,079
  188,379,189
  188,379,367
  188,379,624
  188,381,124
  188,381,388
  188,381,950
  188,382,798
  188,383,180
  188,383,423
  188,384,568
  188,384,583
  188,385,611
  188,385,728
  188,386,260
  188,387,344
  188,387,646
  188,388,086
  188,388,165
  188,388,449
T
G
A
A
A
A
-
T
T
-
G
G
C
G
G
C
5
T
A
A
G
C
2
2
-
G
C
C
A
-
C
A
C
A
A
C
-
-
C
G
A
A
T
2
-
G
C
G
A
C
A
2
T
G
C
T
T
T
T
A
T
-
A
T
A
G
A
G
C
C
-
C
C
A
8
C
G
C/CA
C
A
T
T
G
T
T
G
A
A
G
-
G
T
G
G
C
T
C
G
A
A
-
C
G
T
A
G
2
A
T
T
G
A
5
T
G
G
A
A
-
G
C
G
G
C
G
C
G
T
A
A
-
-
C
35/-
C
T
C
C
A
A
C
A
A
C
4
C
G
G
G
A/G
A
G
A
G
A
G
A
C
C
G
-
A
-
A
2
-
A
T
T
T
A
G
T
A
T
G
C
T
-
-
A
T
G
T
C
T
A
5
A
A
G
T
T/-
T
-
A
A
G
A
A
T
G
A
-
G
G
T
A
A
T
G
-
A
T
A
C
-
C
A
-
A
T
C
36
A
2
-
A
G
G
G
-
G
T
A
A
C
A
T
G
T
T
-
A
A
2
3
2
A
A
A
A
A
G
T
A
A
G
A
A
T
A
-
T
A
T
G
G
A
T
T
G
T
T
G
T
A
-
A
A
C
A
-