Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 180,469 (bp)   Positions: 539
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
0
0
.002
.01
.658
.004
.133
.028
.391
.026
.01
.002
.001
.006
0
.019
.003
0
.003
.022
.028
--
.001
.001
.104
.018
.028
.002
0
.002
.001
.001
.01
.014
.145
.192
.008
.704
.001
.605
.011
.008
.001
0
0
0
.023
.005
.266
.008
.001
.004
.002
0
.094
.001
.001
.051
.004
.001
.001
.002
0
.016
.007
.001
.003
.003
.003
.033
.008
.009
.065
--
.015
.047
.004
.01
.001
.003
.002
.001
.01
.862
.004
.026
.084
.001
.02
.031
.264
.057
.009
.329
.216
.005
.013
.252
.001
.101
.112
0
.002
.002
0
.004
.023
.072
.009
.006
.185
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.005
.008
.004
.093
.009
.001
.879
.861
0
0
.004
0
.053
.005
.141
.195
--
.027
.001
.083
0
0
.005
.002
.012
.003
.041
.001
.006
.015
.359
.003
0
0
.005
0
0
.004
0
0
.179
.01
.006
.017
.003
0
.002
.002
0
0
.003
0
.021
0
.371
.001
.001
.001
0
.001
.002
.015
.082
.001
.003
.219
.006
.002
0
0
.013
0
0
.002
.001
0
.262
.002
0
0
0
0
.003
.032
.019
.954
.518
.713
.091
.001
.001
.002
0
.001
0
.009
0
.121
.087
.686
.008
.055
.053
.043
.011
.004
.031
.025
.037
.014
.015
.012
.326
.971
.12
.039
.032
.008
.005
.011
.004
.031
.029
--
.126
.012
.028
.403
.016
.013
.191
.943
.002
.402
.002
.001
.952
0
.011
.007
.325
.256
.122
.016
.023
.021
.002
.018
.864
.057
.012
0
.672
.083
.998
.988
.997
.323
.97
.985
.39
.914
.914
1
1
.927
.891
.058
.212
.686
.645
.735
.145
.85
.999
.191
1
.928
.925
.932
.079
.996
.564
1
1
.863
.806
.714
0
0
0
.145
.098
0
.13
.232
.808
0
.001
.09
.814
.951
.638
.001
.33
.012
.002
0
0
.016
.01
.001
.005
0
0
.001
0
.001
.003
.021
.056
0
.007
.046
.311
.002
.007
.184
.002
.009
.029
.996
0
.476
.002
.003
0
.002
.006
.004
.001
.083
.089
.163
.055
.033
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.005
1
.002
0
.058
.001
.001
.001
0
.288
.008
0
0
0
.001
.003
.037
.007
.026
.015
.013
.013
.492
--
0
.086
0
.002
0
.012
0
.004
.015
.006
.001
0
0
0
.001
0
.001
.001
.015
.036
.014
.203
.366
--
--
--
.038
.005
.071
.005
.002
.006
--
--
0
.001
.011
.171
0
.026
0
0
0
.002
.004
0
.034
.003
0
.002
.001
.002
.001
0
.003
.069
.003
.011
.265
.05
.169
.017
.001
.014
.002
.021
.004
.041
.159
.003
.001
0
0
.002
.006
.002
.285
.261
0
.002
0
0
0
.177
0
0
.001
0
0
.006
0
.002
.086
.725
.019
.001
.005
.003
.002
.008
.015
.165
.012
.037
.021
.007
.013
.01
.003
.001
.006
.001
0
.002
.268
0
.021
.003
.001
.083
0
0
.182
.001
.011
.004
.012
0
.4
.003
0
.984
.341
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
G
C
A
G
T
G
G
A
C
T
A
C
C
T
C
G
C
C
C
T
G
C
C
A
A
T
A
G
G
T
G
G
A
A
C
C
C
C
G
G
C
A
C
G
G
C
G
T
C
C
A
A
C
G
T
G
A
A
T
G
A
C
C
G
C
A
A
G
A
T
G
T
C
C
C
G
T
C
G
T
T
G
C
G
A
C
G
G
T
G
A
G
C
T
A
G
C
G
G
C
G
G
G
C
T
G
G
T
C
C
T
G
T
A
G
T
T
T
G
T
G
T
T
A
A
T
A
A
T
C
G
G
T
T
A
A
C
A
A
T
T
C
T
T
G
C
T
T
G
T
T
T
T
T
C
T
G
C
T
C
G
C
G
A
T
A
T
C
A
T
T
G
T
A
A
A
A
G
G
T
C
G
C
T
A
G
C
C
A
A
C
G
G
T
G
T
C
G
C
G
C
C
T
A
G
C
A
G
C
G
A
G
G
C
C
C
T
A
C
A
A
A
C
G
G
T
A
G
C
T
C
C
C
A
A
A
T
A
G
C
G
C
C
C
T
A
A
G
G
C
C
G
G
T
C
T
C
A
C
A
T
T
A
A
C
G
C
T
G
G
T
G
T
C
T
G
G
T
G
T
T
T
A
C
C
C
T
T
G
T
G
T
C
T
C
G
T
G
G
T
G
T
G
A
T
A
T
A
A
A
C
T
T
A
G
C
C
A
G
A
T
G
G
C
T
T
A
A
A
G
T
C
G
T
A
G
A
C
T
A
T
G
T
A
A
T
T
T
C
T
T
T
A
C
C
C
C
G
T
C
C
T
A
A
G
A
T
G
T
G
A
G
C
C
A
A
A
G
A
C
G
T
A
C
G
C
A
G
T
C
A
C
A
T
A
C
G
C
T
G
C
C
G
C
G
C
C
A
G
T
C
A
A
T
A
C
A
C
T
C
C
G
C
T
G
A
A
G
C
C
A
T
G
G
C
G
G
A
C
C
G
A
C
G
C
A
T
A
A
A
A
T
A
T
T
G
G
A
C
G
C
C
G
T
G
C
A
C
T
A
C
C
C
T
G
G
T
A
G
T
T
C
T
C
T
C
A
G
A
C
G
T
G
C
C
A
T
C
G
G
A
T
T
C
T
G
G
C
A
C
G
C
T
A
T
A
T
A
G
A
T
G
G
T
T
A
A
C
G
G
C
A
C
T
A
C
C
G
  125,367,332
  125,367,496
  125,367,504
  125,367,803
  125,369,312
  125,369,611
  125,371,497
  125,372,471
  125,372,515
  125,372,843
  125,373,146
  125,373,261
  125,373,304
  125,373,800
  125,374,403
  125,374,886
  125,376,001
  125,376,160
  125,376,369
  125,376,563
  125,377,035
  125,377,437
  125,378,949
  125,378,955
  125,379,333
  125,379,667
  125,380,629
  125,380,790
  125,381,013
  125,381,573
  125,381,709
  125,381,721
  125,381,953
  125,382,146
  125,382,435
  125,384,407
  125,384,667
  125,384,986
  125,385,052
  125,388,685
  125,389,481
  125,390,099
  125,390,203
  125,390,368
  125,390,757
  125,390,800
  125,391,658
  125,391,860
  125,394,316
  125,395,286
  125,395,302
  125,395,425
  125,396,313
  125,396,324
  125,396,833
  125,397,092
  125,397,797
  125,397,913
  125,398,100
  125,398,212
  125,398,284
  125,398,327
  125,398,855
  125,399,232
  125,399,331
  125,399,518
  125,399,852
  125,400,190
  125,400,228
  125,400,777
  125,400,864
  125,400,912
  125,401,341
  125,401,719
  125,402,703
  125,402,833
  125,403,131
  125,403,927
  125,404,062
  125,404,089
  125,404,090
  125,404,145
  125,404,497
  125,404,581
  125,404,686
  125,404,751
  125,405,072
  125,405,208
  125,405,376
  125,405,504
  125,405,531
  125,405,619
  125,405,679
  125,405,886
  125,405,928
  125,406,392
  125,406,410
  125,406,922
  125,406,953
  125,407,040
  125,407,059
  125,407,401
  125,407,477
  125,407,757
  125,407,927
  125,407,962
  125,407,970
  125,408,054
  125,408,684
  125,408,854
  125,409,121
  125,409,318
  125,409,358
  125,409,508
  125,409,532
  125,409,538
  125,409,590
  125,409,640
  125,409,652
  125,409,676
  125,409,681
  125,409,726
  125,409,731
  125,409,736
  125,409,898
  125,409,899
  125,409,900
  125,411,074
  125,411,192
  125,411,597
  125,412,246
  125,412,348
  125,412,444
  125,412,731
  125,412,829
  125,412,890
  125,412,999
  125,413,064
  125,413,079
  125,413,212
  125,413,288
  125,416,739
  125,417,565
  125,417,724
  125,418,125
  125,418,342
  125,418,415
  125,418,943
  125,419,272
  125,420,592
  125,423,425
  125,423,761
  125,424,194
  125,424,424
  125,424,761
  125,424,990
  125,425,075
  125,425,659
  125,425,910
  125,426,165
  125,426,739
  125,426,838
  125,426,895
  125,426,897
  125,426,945
  125,427,071
  125,427,211
  125,427,379
  125,427,524
  125,427,703
  125,428,583
  125,428,647
  125,428,830
  125,429,340
  125,429,352
  125,429,366
  125,429,548
  125,429,643
  125,429,714
  125,430,784
  125,430,885
  125,430,926
  125,430,947
  125,431,153
  125,431,249
  125,431,299
  125,431,307
  125,431,337
  125,431,442
  125,431,535
  125,431,856
  125,431,863
  125,432,511
  125,432,544
  125,432,647
  125,432,786
  125,432,877
  125,433,017
  125,433,106
  125,433,227
  125,433,522
  125,433,730
  125,433,939
  125,434,429
  125,434,965
  125,435,184
  125,436,476
  125,436,610
  125,437,382
  125,437,518
  125,437,641
  125,437,667
  125,437,695
  125,437,702
  125,437,754
  125,437,758
  125,437,760
  125,437,839
  125,438,098
  125,438,318
  125,438,444
  125,438,665
  125,439,004
  125,439,777
  125,439,932
  125,440,142
  125,440,221
  125,440,724
  125,440,932
  125,441,111
  125,441,174
  125,441,497
  125,441,692
  125,441,854
  125,441,867
  125,442,073
  125,442,150
  125,442,336
  125,442,808
  125,443,158
  125,443,254
  125,444,003
  125,444,018
  125,444,019
  125,444,070
  125,444,324
  125,444,398
  125,444,613
  125,445,225
  125,445,510
  125,446,061
  125,446,163
  125,446,183
  125,446,735
  125,446,740
  125,447,048
  125,447,245
  125,447,290
  125,447,394
  125,447,417
  125,447,584
  125,447,882
  125,448,142
  125,448,216
  125,448,296
  125,448,486
  125,449,353
  125,449,958
  125,450,033
  125,450,077
  125,450,078
  125,450,560
  125,451,588
  125,452,214
  125,452,650
  125,453,660
  125,454,494
  125,455,180
  125,455,605
  125,458,424
  125,458,435
  125,458,684
  125,459,501
  125,459,633
  125,459,637
  125,459,643
  125,459,657
  125,459,739
  125,460,472
  125,460,492
  125,460,506
  125,460,509
  125,460,606
  125,460,640
  125,460,700
  125,460,740
  125,460,752
  125,460,822
  125,460,857
  125,460,897
  125,460,930
  125,460,947
  125,460,968
  125,461,057
  125,461,075
  125,461,097
  125,461,108
  125,461,130
  125,461,168
  125,461,171
  125,461,188
  125,461,192
  125,461,198
  125,465,230
  125,465,234
  125,465,297
  125,465,598
  125,465,628
  125,465,915
  125,466,025
  125,466,231
  125,466,370
  125,466,540
  125,466,821
  125,466,904
  125,466,991
  125,466,993
  125,467,008
  125,467,225
  125,467,873
  125,468,255
  125,468,560
  125,468,627
  125,469,511
  125,470,592
  125,470,635
  125,470,830
  125,470,862
  125,471,244
  125,471,478
  125,471,497
  125,471,770
  125,472,024
  125,472,130
  125,472,267
  125,472,819
  125,473,750
  125,474,165
  125,474,523
  125,476,267
  125,476,584
  125,477,763
  125,478,022
  125,478,430
  125,480,586
  125,480,748
  125,481,454
  125,482,826
  125,483,256
  125,484,670
  125,485,271
  125,485,515
  125,485,549
  125,485,678
  125,485,681
  125,485,743
  125,486,119
  125,486,121
  125,486,152
  125,486,329
  125,486,418
  125,487,240
  125,487,259
  125,487,691
  125,487,806
  125,488,390
  125,488,407
  125,488,554
  125,488,660
  125,488,888
  125,489,142
  125,490,685
  125,491,387
  125,491,716
  125,493,169
  125,494,136
  125,494,219
  125,495,546
  125,495,550
  125,495,554
  125,495,560
  125,496,209
  125,496,417
  125,496,506
  125,496,514
  125,496,523
  125,496,575
  125,497,055
  125,497,095
  125,497,108
  125,497,249
  125,497,372
  125,497,551
  125,498,110
  125,498,671
  125,499,466
  125,499,986
  125,500,019
  125,500,194
  125,500,628
  125,500,996
  125,501,376
  125,501,530
  125,501,798
  125,502,409
  125,502,556
  125,503,224
  125,503,225
  125,503,732
  125,503,857
  125,504,009
  125,504,400
  125,506,216
  125,506,629
  125,506,651
  125,506,813
  125,506,954
  125,507,475
  125,507,493
  125,507,878
  125,507,948
  125,507,964
  125,508,092
  125,508,120
  125,508,204
  125,508,230
  125,508,258
  125,508,265
  125,508,439
  125,508,450
  125,508,990
  125,509,508
  125,509,724
  125,509,920
  125,510,393
  125,511,134
  125,511,251
  125,511,262
  125,511,467
  125,511,527
  125,511,926
  125,513,103
  125,513,409
  125,514,509
  125,514,877
  125,515,405
  125,515,412
  125,515,469
  125,515,475
  125,515,539
  125,515,726
  125,516,025
  125,516,362
  125,516,523
  125,516,658
  125,517,552
  125,518,470
  125,518,581
  125,519,430
  125,519,900
  125,520,233
  125,520,443
  125,520,555
  125,521,079
  125,521,252
  125,521,663
  125,521,829
  125,521,900
  125,522,356
  125,522,462
  125,522,528
  125,522,542
  125,522,811
  125,522,885
  125,523,575
  125,523,772
  125,523,836
  125,523,837
  125,524,167
  125,524,285
  125,524,372
  125,524,401
  125,524,648
  125,525,546
  125,525,629
  125,525,680
  125,525,791
  125,525,940
  125,526,083
  125,526,095
  125,526,411
  125,526,563
  125,526,603
  125,526,613
  125,526,623
  125,526,643
  125,526,707
  125,526,808
  125,526,951
  125,527,142
  125,527,224
  125,527,260
  125,527,421
  125,527,540
  125,527,682
  125,528,007
  125,528,153
  125,528,981
  125,529,202
  125,530,055
  125,530,604
  125,530,727
  125,530,938
  125,530,947
  125,531,137
  125,531,174
  125,531,498
  125,531,633
  125,532,713
  125,532,995
  125,533,024
  125,533,168
  125,533,264
  125,533,699
  125,533,736
  125,533,893
  125,534,008
  125,538,418
  125,547,676
A
A
T
G
A
C
A
A
C
T
C
G
T
T
C
T
T
T
T
G
A
A
G
G
T
T
A
T
A
A
C
A
A
G
G
T
T
T
T
A
A
T
G
A
A
C
A
A
C/T
T
T
C
G
A
T
C
T
T
G
C
A
G
T
T
T
T
G
G
A
T
C
T
C
T
T
A
A
C
T
C
C
G
C
T
A
G
T
T
A
C
T
G
A
T
A
G
T/G
T
A
T
T
A
C
A
T
C
A
T
C
T
T
A/T
T/G
A/T
G/A
A/G
A/T
A/T
A/T
A/G
G/T
A/G
G/T
A/T
G
G
G
G
G
C
T
A
A
G
C
G
T/A
T
G
C
C
A/T
T
C
C
A
T
C
C
A
C
C
C
C
C
G
C
A
T
C
T
A
A
A
G
C
G
C
A
G
C
C
A
C
G
G
G
G
C
A
G
T
A
T
C
G
A
T
G
T
C
T
A
A
C
A
C
T
A
T
A
T
T
C
T
A
T
T
A
T
A
G
A
A
T
T
T
C
G
T
G
G
C
T
T
T
A
G
T
T
C
T
G
T
G
G
G
A
T
A
T
A
T
A
T
C
G
G/A
A
C
T
T
A
A
A
T
C
T
C
A
G
C
C
G
G
T
A