Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 84,884 (bp)   Positions: 313
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.005
.0
.001
.003
.0
.0
.932
.002
.008
.0
.701
.011
.004
.009
.131
1.0
.0
.0
.003
.102
.996
.003
.041
.008
.007
.0
.018
.007
.001
.001
.082
.005
.014
.008
.006
.045
.001
.0
.0
.009
.003
.06
.036
.001
.071
.675
.001
.001
.022
.003
.053
.064
--
.019
.002
.08
.0
.022
.06
.0
.002
.016
.001
.0
.0
.0
.008
.004
.0
--
--
--
--
--
--
--
.002
.002
.021
.004
.004
.0
.0
.298
.59
.091
.674
.0
.008
.004
.0
.001
.003
.003
.003
.003
.187
.0
.003
.001
.062
.033
.048
.002
.0
.092
.04
--
.039
.015
.006
.086
.028
.131
.004
.001
.075
.124
.001
.025
.002
.001
.635
.027
.016
.079
.003
.038
.004
.001
.038
.07
.002
.002
.001
.003
.091
.001
.01
.986
.783
.318
--
.784
.02
.039
.087
.002
.014
1.0
.006
.022
.002
.006
.138
.369
.013
.0
--
--
--
--
.001
.0
.004
.164
.055
.329
.064
.015
.001
.025
.355
.047
.016
.009
.029
.173
.939
.998
.007
.018
.424
.229
.194
.012
.033
--
--
--
--
--
--
.058
.018
.161
.01
.005
.002
.01
.527
.183
.076
.017
.001
.001
.04
.001
.012
.002
.002
.223
.046
.024
.84
.0
.007
.003
.25
.001
.021
.02
.082
.072
.02
.156
.06
.131
.131
.185
.028
.026
.035
.019
.019
.028
.076
.258
.308
.164
.133
.032
.017
.02
.022
.01
.009
.256
.511
.054
.171
.01
.059
.015
.0
.489
.04
.0
.007
.051
.179
.981
.354
.189
.182
.266
.285
.559
.021
.081
.03
--
--
.224
.013
.001
.009
.157
.041
.048
.002
.019
.014
.214
.985
.005
.01
.001
.163
.006
.845
.055
--
--
.619
.005
.001
.003
.001
.046
.398
.005
.005
.023
.131
.095
.119
.335
.991
.003
.0
.0
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
Apaf1
T
A
T
T
C
A
T
A
G
T
T
C
G
A
A
A
A
C
C
G
A
G
T
A
A
C
C
A
G
A
C
C
T
G
C
T
G
T
G
A
C
T
C
G
G
C
G
C
G
T
G
A
A
G
G
G
G
T
T
G
A
A
A
C
T
C
G
A
T
G
G
G
A
T
T
T
G
C
T
A
C
G
T
T
A
G
G
A
T
G
A
T
A
G
T
G
C
C
G
G
A
T
C
A
G
C
G
T
G
A
G
A
T
A
G
G
G
G
A
C
T
A
A
T
C
G
C
G
A
T
T
C
G
G
C
T
G
G
C
G
G
C
A
A
A
A
C
A
T
A
C
G
C
A
T
A
T
A
A
A
A
C
C
T
G
G
C
G
C
C
T
G
A
C
A
A
T
C
A
C
G
A
A
C
G
A
A
T
T
A
A
C
T
T
C
A
G
C
C
G
C
C
C
T
T
T
G
A
C
T
A
A
A
A
T
C
T
C
C
C
T
G
C
G
A
G
G
T
C
G
T
G
C
T
C
A
T
T
A
C
A
A
C
C
A
C
T
G
A
C
C
A
G
G
G
G
T
A
G
G
T
A
T
T
C
C
A
C
T
T
A
T
G
G
A
G
A
G
C
T
T
T
G
A
C
C
G
T
T
A
C
T
A
G
C
C
T
C
C
A
C
T
G
C
T
A
A
A
A
C
T
A
T
  31,699,321
  31,699,709
  31,700,500
  31,700,995
  31,701,170
  31,702,809
  31,703,439
  31,703,657
  31,703,799
  31,703,847
  31,704,709
  31,705,315
  31,705,439
  31,705,597
  31,705,890
  31,706,801
  31,707,753
  31,707,868
  31,708,024
  31,708,145
  31,708,520
  31,712,552
  31,712,595
  31,714,521
  31,714,805
  31,715,586
  31,715,850
  31,716,184
  31,716,220
  31,716,398
  31,717,703
  31,718,130
  31,718,288
  31,718,293
  31,718,297
  31,718,316
  31,718,426
  31,719,447
  31,719,896
  31,721,203
  31,722,297
  31,722,330
  31,722,336
  31,722,377
  31,722,542
  31,722,588
  31,722,825
  31,722,896
  31,723,160
  31,723,178
  31,723,185
  31,723,187
  31,723,238
  31,723,865
  31,724,053
  31,724,184
  31,724,459
  31,725,694
  31,725,752
  31,725,838
  31,726,063
  31,726,119
  31,726,139
  31,726,377
  31,726,569
  31,726,576
  31,726,611
  31,726,631
  31,726,679
  31,726,948
  31,726,949
  31,726,963
  31,727,635
  31,727,659
  31,727,704
  31,727,905
  31,727,993
  31,728,854
  31,728,980
  31,729,106
  31,729,483
  31,729,548
  31,729,821
  31,730,191
  31,730,286
  31,730,342
  31,730,458
  31,730,787
  31,730,790
  31,730,864
  31,730,875
  31,731,112
  31,731,220
  31,731,241
  31,731,263
  31,731,970
  31,732,008
  31,732,125
  31,732,147
  31,732,152
  31,732,227
  31,732,281
  31,732,343
  31,732,406
  31,732,414
  31,732,428
  31,732,445
  31,732,507
  31,732,531
  31,732,539
  31,732,764
  31,732,940
  31,732,976
  31,733,035
  31,733,352
  31,733,355
  31,733,516
  31,733,531
  31,733,682
  31,733,709
  31,733,780
  31,733,784
  31,733,852
  31,733,915
  31,733,984
  31,734,024
  31,734,676
  31,735,448
  31,735,813
  31,736,291
  31,736,451
  31,736,646
  31,737,013
  31,737,685
  31,738,172
  31,738,311
  31,738,461
  31,738,537
  31,739,313
  31,739,790
  31,739,906
  31,743,840
  31,745,921
  31,747,097
  31,747,944
  31,748,947
  31,749,330
  31,749,460
  31,750,075
  31,750,344
  31,750,539
  31,750,602
  31,750,731
  31,750,779
  31,751,117
  31,751,338
  31,751,588
  31,751,858
  31,752,399
  31,752,403
  31,752,470
  31,752,847
  31,753,196
  31,753,290
  31,753,422
  31,754,110
  31,754,116
  31,754,392
  31,754,837
  31,754,905
  31,754,988
  31,756,206
  31,756,524
  31,756,623
  31,756,673
  31,756,760
  31,756,947
  31,757,130
  31,757,167
  31,757,224
  31,757,493
  31,758,109
  31,758,446
  31,758,463
  31,758,468
  31,758,676
  31,758,714
  31,758,943
  31,758,961
  31,759,193
  31,759,226
  31,759,388
  31,759,418
  31,759,596
  31,760,196
  31,760,506
  31,760,653
  31,760,725
  31,760,734
  31,760,848
  31,760,934
  31,761,081
  31,761,375
  31,761,492
  31,761,544
  31,761,765
  31,761,975
  31,762,025
  31,762,437
  31,762,587
  31,763,062
  31,763,284
  31,763,454
  31,763,502
  31,763,691
  31,763,778
  31,763,859
  31,763,898
  31,763,912
  31,763,929
  31,765,199
  31,765,256
  31,765,711
  31,766,317
  31,766,365
  31,766,482
  31,766,511
  31,766,543
  31,766,545
  31,766,611
  31,766,620
  31,766,645
  31,766,651
  31,766,668
  31,766,685
  31,766,716
  31,766,720
  31,766,749
  31,766,777
  31,766,785
  31,766,786
  31,766,822
  31,766,833
  31,766,834
  31,766,846
  31,766,850
  31,766,859
  31,766,970
  31,767,246
  31,767,394
  31,767,826
  31,768,248
  31,768,266
  31,768,307
  31,768,545
  31,768,638
  31,768,670
  31,769,961
  31,770,293
  31,770,316
  31,770,477
  31,770,565
  31,770,629
  31,770,733
  31,770,752
  31,770,823
  31,770,864
  31,771,312
  31,771,372
  31,771,599
  31,771,651
  31,771,717
  31,771,746
  31,771,840
  31,771,943
  31,772,084
  31,772,111
  31,772,376
  31,773,061
  31,773,399
  31,773,925
  31,774,168
  31,774,170
  31,774,184
  31,774,218
  31,774,558
  31,774,602
  31,774,629
  31,774,887
  31,775,020
  31,775,110
  31,775,130
  31,775,202
  31,775,248
  31,775,514
  31,775,891
  31,775,903
  31,775,933
  31,775,938
  31,775,998
  31,777,316
  31,778,278
  31,778,601
  31,778,825
  31,779,422
  31,779,448
  31,779,452
  31,780,779
  31,781,259
  31,782,786
  31,783,534
  31,783,892
  31,784,079
C
G
A
C
T
G
A
C
A
G
C
C/T
A
G
G
G
G
T
A
A
G
T
C
G
A/G
T
T
A/G
G/A
A/G
A
G
C
A
T
C
A
A
T
T
A
C
G
A
A
T
A
G
A
G
C
T
G
A
A
A
T
C
C
T
G
G
T
T
A
T
A
G
C
G/A
G/T
G/A
A/T
T/A
T/G
A
T
T
C
G
T
G/C
C
C
G
A
A
C
C
A
T
C
G
A
C
G/A
T
T
A
A
G
C
A
T
A
G
T
C
A
G
T
A/G
C
G
G/A
G/A
G/A
G/C
G
A
A
G
C
G
A
T
A
A
C
C
A
T
C
C
A
C
A
A
T
A
T
T
G
A/T
G
G
T
G
C
G
T
A
T
G
C
G
A
G
A/G
A/G
G
C/T
T
C
A
A
G
A
T
A
C
A
G
T
C
G
C
T
G
T
A
G
G
T
A
G
G
C
A
C
T
A
C
C
T
G
A
T
T
A
T
T
G
C
C
C
A
T
G
A
G
C
T
G
C
T
G
T
T
T
C
C
T
A
G
A
T
C
A
T
C
T
T
C
T
T
C
C
G
T
G
G
A
G
G
T
C
T
T
G
T
G
A
A
C
G/A
A
G
A
A
C
G
A
C
T
T
G
T
C
C
G
C
A
T
G
A
G
T
T
A
G
C
T
G
T
T
A
C
C
T
T
C
G
G/A
G
T
C
T
T
T
T
C
A
T
C
C
C
G
G
T
C
T
C