Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 98,190 (bp)   Positions: 224
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
FHH/EurMcwi (MCW) 
.0
.003
.0
.001
.007
.003
.003
.002
.009
.069
.0
.0
.745
.031
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.318
.998
.0
.0
.018
.001
.0
.04
--
.004
.0
.0
.002
.005
.0
.008
.001
.997
.009
--
--
.402
.008
.004
.004
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.054
.555
.477
.028
.053
.007
--
.002
.0
.0
--
--
.028
--
--
.002
.0
.873
.689
.037
--
.036
.005
.112
.015
.284
.021
.017
.004
.008
.026
.148
.008
.041
.098
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.019
.017
--
.168
.009
.134
.006
.009
.025
.0
.003
--
.024
.011
.493
.025
.001
.001
.001
.0
.041
.01
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.008
.12
--
.002
.005
.002
.001
.0
.003
.002
.005
.001
.0
.0
.758
.78
.855
.71
.71
.569
.305
.328
.356
.121
.211
.135
.107
.091
.202
.112
.069
.106
.008
.015
.038
.095
.001
.0
.0
.1
.0
.0
.032
Ano5
Ano5
Ano5
Ano5
Ano5
Ano5
Ano5
Ano5
Ano5
Ano5
Ano5
Ano5
Ano5
Ano5
Ano5
Ano5
Ano5
Ano5
Ano5
Ano5
Ano5
Ano5
Ano5
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
G
A
G
T
G
C
C
C
G
A
A
T
T
G
T
A
A
C
G
A
A
C
A
A
T
A
C
G
T
C
C
A
C
C
A
C
A
G
T
T
A
A
C
C
C
C
G
C
G
T
C
G
T
A
T
G
T
T
A
T
T
G
C
G
G
C
G
A
G
T
C
C
G
T
T
A
C
G
C
C
C
C
C
A
G
C
G
G
G
A
T
C
C
T
C
C
A
A
T
G
T
A
T
G
G
T
C
A
C
A
C
T
T
A
G
G
C
G
G
G
A
T
G
G
C
G
C
G
G
T
C
T
G
C
T
A
A
G
A
G
A
G
C
G
T
C
G
C
C
G
A
T
G
C
G
T
C
G
G
C
C
A
C
A
T
C
T
C
G
A
G
T
A
G
G
A
C
A
A
T
A
T
A
T
A
T
A
G
G
G
A
G
A
A
G
T
C
G
G
A
A
A
T
T
G
T
G
A
A
C
A
G
G
T
A
A
A
C
G
T
T
G
T
  106,874,239
  106,874,260
  106,874,659
  106,875,037
  106,875,417
  106,875,606
  106,877,180
  106,878,281
  106,878,306
  106,878,321
  106,879,760
  106,880,281
  106,883,114
  106,883,292
  106,883,470
  106,883,557
  106,883,836
  106,884,084
  106,884,171
  106,884,357
  106,884,556
  106,886,869
  106,887,045
  106,887,792
  106,891,778
  106,891,795
  106,893,950
  106,894,873
  106,895,511
  106,896,156
  106,896,547
  106,897,448
  106,897,629
  106,897,819
  106,897,993
  106,900,297
  106,900,733
  106,900,747
  106,901,123
  106,901,540
  106,902,123
  106,902,406
  106,902,486
  106,902,620
  106,903,014
  106,903,129
  106,905,459
  106,905,598
  106,906,531
  106,907,032
  106,907,274
  106,907,281
  106,907,293
  106,908,496
  106,908,576
  106,908,592
  106,908,655
  106,908,772
  106,914,069
  106,914,571
  106,914,648
  106,914,775
  106,914,797
  106,915,012
  106,915,140
  106,915,146
  106,915,222
  106,915,336
  106,915,391
  106,917,702
  106,918,166
  106,918,222
  106,919,967
  106,921,088
  106,921,271
  106,921,579
  106,923,365
  106,923,495
  106,924,896
  106,926,252
  106,929,316
  106,929,327
  106,929,397
  106,929,534
  106,929,723
  106,929,909
  106,930,155
  106,930,193
  106,931,766
  106,931,823
  106,932,066
  106,932,349
  106,932,566
  106,932,620
  106,932,647
  106,932,718
  106,932,870
  106,933,111
  106,933,585
  106,933,592
  106,933,678
  106,933,702
  106,933,812
  106,933,835
  106,933,842
  106,933,848
  106,933,889
  106,933,899
  106,933,928
  106,934,006
  106,934,015
  106,934,135
  106,934,156
  106,934,411
  106,934,638
  106,934,851
  106,935,116
  106,935,324
  106,935,435
  106,935,655
  106,935,781
  106,935,785
  106,935,986
  106,936,155
  106,936,162
  106,937,063
  106,937,223
  106,937,265
  106,937,290
  106,937,364
  106,937,628
  106,937,695
  106,938,045
  106,938,150
  106,938,607
  106,938,790
  106,938,997
  106,939,020
  106,939,041
  106,939,147
  106,939,291
  106,939,292
  106,939,388
  106,939,460
  106,940,173
  106,941,903
  106,941,938
  106,942,118
  106,942,815
  106,942,969
  106,942,981
  106,943,256
  106,943,392
  106,943,451
  106,943,502
  106,943,642
  106,943,650
  106,943,669
  106,943,747
  106,943,785
  106,943,814
  106,943,818
  106,943,898
  106,944,117
  106,944,323
  106,944,561
  106,944,595
  106,944,675
  106,944,730
  106,944,749
  106,944,755
  106,944,776
  106,944,779
  106,944,868
  106,944,918
  106,944,967
  106,944,983
  106,944,999
  106,945,148
  106,945,153
  106,945,507
  106,945,838
  106,945,875
  106,946,228
  106,948,170
  106,948,866
  106,949,862
  106,950,096
  106,950,392
  106,951,349
  106,951,367
  106,951,540
  106,952,362
  106,952,784
  106,952,826
  106,953,783
  106,953,785
  106,953,837
  106,953,921
  106,953,936
  106,954,040
  106,954,413
  106,954,621
  106,954,637
  106,954,770
  106,955,160
  106,955,167
  106,955,189
  106,955,198
  106,955,216
  106,955,312
  106,955,322
  106,955,336
  106,955,689
  106,956,172
  106,956,445
  106,957,366
  106,960,582
  106,960,796
  106,960,821
  106,962,060
  106,966,062
  106,970,317
  106,970,484
A
A
C
A
G
A
T
T
T
C
G
G
G
C
C
C
G
T
G
A
G
G
T
G
A/G
T/C
G
T
A
C
A
T
G
T
T
G
T
C
C
C
C
T
C
T
T
T
T
A
T
A
C
T
A
G
G
G
A
C
T/C
G
C
C
A
T
G/C
G/C
T
C
G
A
C
T
T
T
C
C
G
A
A
T
T
T
T
G
G
A
T
A
A
A
T
G
T
G
G
A
T
G
A/G
A
G/A
T/C
A/C
T/C
G/T
G/A
T/G
T
A/G
C/T
A/G
T
G
G
G
A
T
G
A
A
C
G
A
A
T
T
A
A
C
A
C
T
C
A
T
G
T
G
A
G
G/A
A/C
G/A
C/G
C
T/G
C/T
G/A
T
T
C
T
T/C
G/A
C/T
G/A
T/C
C/A
C
G/A
C/T
C/G
A/T
C/A
C
T/C
C/T
T/C
C/T
G/A
A/G
G/A
T/C
A/G
G/A
G/A
A/G
C/T
G
G
A
C
C
G
A
T
C
G
A
A
A
G
A
G
T
A
C
T
A
A
G
G
C
A
C
A
C
A
T
C
C/T
G
A
A
C
T
T
G
T
C
C
C
T
G