Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 100,767 (bp)   Positions: 314
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.003
.688
--
--
--
.355
.986
.997
.045
.006
.836
.091
.143
.009
.999
.961
.006
.043
.002
.0
.0
.179
--
--
.197
.006
.306
.28
.009
.0
.001
.001
.01
.003
.044
.076
.29
.047
.006
.004
.4
.129
.029
.002
.164
.015
.001
.001
.052
.0
.0
.004
.0
.0
.006
.047
.103
.023
.003
.003
.001
.039
.005
.065
.068
.0
.001
.98
.0
.025
.125
.011
.116
.003
.011
.012
.058
.005
.005
.006
.007
.018
.967
.941
.023
.016
.01
.001
.175
.002
.004
.001
.094
.005
.0
.0
.007
.033
.283
.655
.015
.014
.006
.0
.183
.011
.031
.447
.051
.023
--
--
.002
.003
.002
.004
.003
.004
.003
.003
.185
.015
.0
.0
.003
.0
.053
--
--
--
.166
.009
.009
.094
.025
.003
.126
.002
.083
.194
.199
.26
.006
.011
.004
.001
.034
.143
.045
.019
.01
.008
.002
.0
.012
.0
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.0
.002
.002
.015
.013
.014
.003
.003
.003
.0
.003
.004
--
--
.008
.01
.029
.075
.006
.001
.006
.0
.8
.001
.005
.001
.0
.0
.765
.0
.01
.286
.001
.0
.001
.001
.0
.017
.007
.04
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.218
.122
.015
.136
.06
.187
.091
.131
.002
.022
.0
.0
.001
.001
.007
.017
.028
.0
.011
.0
.001
.01
.079
.0
.001
.002
.026
.0
.0
.007
.003
.006
.002
.182
.0
.004
.003
.0
.022
.004
.0
.003
.003
.002
.002
.031
.01
.0
.003
.005
.0
.029
.223
.01
.004
.008
.034
.001
.367
.977
.001
.0
.0
.012
.604
.0
.0
.027
.001
.014
.003
.083
.0
.003
.0
.0
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
Alms1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
A
T
16
-
-
G
T
-
2
T
G
T
A
-
A
T
T
T
T
C
A
-
T
G
A
C
T
G
A
G
G
-
C
G
G
-
T
T
T
C
G
C
A
A
T
G
T
A
C
C
-
T
T
G
2
G
A
T
T
C
C
G
G
C
G
C
T
G
A
T
A
T
G
C
-
C
T
-
G
A
T
A
T
A
C
T
C
138
T
A
T
T
C
G
T
G
A
C
T
C
-
C
C
G
G
A
G
A
G
G
7
A
A
A
A
2
-
-
C
G
C
G
A
A
A
-
T
A
C
G
G
C
C
G
T
T
T
G
-
G
A
T
C
G
C
C
T
C
C
A
A
T
A
C
G
T
T
C
C
C
C
-
T
T
-
C
T
T
4
C
C
A
T
T
T
T
T
A
T
T
T
G
A
T
G
G
A
G
T
G
G
C
-
2
2
A
G
G
4
G
-
3
C
T
-
G
C
C
C
C
A
A
-
C
-
-
C
A
C
G
-
T
G
-
T
T
C
C
4
T
G
G
A
C
T
C
G
C
-
G
-
T
A
A
G
C
G
T
T
C
T
3
-
A
C
-
-
-
T
C
A
T
3
-
3
T
A
A
C
-
A
-
2
A
G
G
G
G
C
T
G
-
A
G
C
T
C
A
G
T
A
C
T
A
G
A
T
G
C
-
G
A
G
A
A
C
T
-
-
A
-
G
A
  117,371,757
  117,377,815
  117,378,278
  117,378,297
  117,379,087
  117,379,229
  117,379,910
  117,379,928
  117,382,587
  117,384,903
  117,385,164
  117,387,245
  117,388,018
  117,388,282
  117,390,305
  117,392,739
  117,393,085
  117,393,222
  117,393,770
  117,394,139
  117,394,410
  117,394,749
  117,395,091
  117,395,131
  117,395,251
  117,395,433
  117,395,717
  117,395,738
  117,396,569
  117,397,119
  117,397,210
  117,397,469
  117,397,561
  117,397,869
  117,398,071
  117,398,122
  117,398,197
  117,398,518
  117,398,977
  117,398,979
  117,400,304
  117,400,419
  117,400,580
  117,400,606
  117,401,124
  117,401,933
  117,403,135
  117,404,586
  117,406,198
  117,406,894
  117,407,136
  117,407,676
  117,407,771
  117,407,861
  117,407,914
  117,407,990
  117,407,997
  117,408,296
  117,408,654
  117,409,185
  117,409,268
  117,409,360
  117,409,785
  117,410,005
  117,410,010
  117,410,526
  117,410,845
  117,410,882
  117,413,485
  117,414,121
  117,414,196
  117,414,209
  117,414,517
  117,415,946
  117,415,970
  117,416,306
  117,417,208
  117,417,248
  117,417,261
  117,417,272
  117,417,825
  117,418,052
  117,418,204
  117,418,221
  117,418,387
  117,418,449
  117,419,910
  117,419,917
  117,420,172
  117,420,419
  117,420,728
  117,420,916
  117,421,019
  117,421,062
  117,421,960
  117,422,119
  117,422,251
  117,422,386
  117,422,718
  117,422,780
  117,424,385
  117,424,551
  117,424,600
  117,424,896
  117,425,655
  117,426,236
  117,426,608
  117,427,146
  117,427,473
  117,428,778
  117,429,143
  117,429,424
  117,429,518
  117,429,520
  117,429,522
  117,429,524
  117,429,664
  117,429,966
  117,429,970
  117,430,030
  117,430,166
  117,430,749
  117,430,945
  117,431,805
  117,431,987
  117,431,988
  117,432,061
  117,432,076
  117,432,161
  117,432,199
  117,432,355
  117,432,714
  117,433,388
  117,433,734
  117,433,792
  117,433,967
  117,434,328
  117,434,366
  117,434,377
  117,434,409
  117,434,422
  117,434,538
  117,434,808
  117,434,833
  117,434,845
  117,434,865
  117,434,875
  117,434,880
  117,434,903
  117,434,927
  117,435,016
  117,435,033
  117,435,212
  117,435,726
  117,436,021
  117,436,101
  117,436,342
  117,437,488
  117,437,537
  117,437,723
  117,437,863
  117,438,441
  117,438,560
  117,438,708
  117,438,750
  117,438,848
  117,439,024
  117,439,506
  117,439,536
  117,440,456
  117,440,489
  117,440,503
  117,440,506
  117,440,961
  117,440,974
  117,441,080
  117,441,302
  117,441,305
  117,441,357
  117,441,474
  117,441,475
  117,442,199
  117,442,206
  117,442,251
  117,442,508
  117,442,589
  117,443,254
  117,443,433
  117,443,937
  117,444,756
  117,444,774
  117,444,896
  117,444,904
  117,444,930
  117,444,963
  117,444,968
  117,445,033
  117,445,036
  117,445,324
  117,445,601
  117,445,785
  117,445,963
  117,445,992
  117,446,007
  117,446,246
  117,447,113
  117,447,462
  117,447,980
  117,448,120
  117,448,127
  117,448,414
  117,448,523
  117,448,579
  117,448,732
  117,448,766
  117,448,784
  117,448,785
  117,449,179
  117,449,357
  117,449,496
  117,450,321
  117,450,591
  117,450,715
  117,450,943
  117,450,952
  117,450,963
  117,450,966
  117,450,969
  117,450,985
  117,452,493
  117,452,500
  117,452,524
  117,452,564
  117,452,950
  117,453,297
  117,453,351
  117,453,476
  117,453,484
  117,453,553
  117,453,769
  117,454,014
  117,454,022
  117,454,083
  117,454,600
  117,454,639
  117,454,643
  117,454,774
  117,454,796
  117,454,809
  117,454,813
  117,454,818
  117,454,845
  117,455,176
  117,455,180
  117,455,235
  117,455,332
  117,455,681
  117,456,164
  117,456,166
  117,456,183
  117,456,456
  117,456,560
  117,457,213
  117,457,252
  117,457,267
  117,457,474
  117,457,571
  117,457,907
  117,457,936
  117,458,327
  117,458,420
  117,458,543
  117,458,665
  117,458,680
  117,458,859
  117,458,939
  117,458,977
  117,459,080
  117,459,368
  117,459,784
  117,460,239
  117,460,299
  117,460,518
  117,460,614
  117,460,713
  117,460,752
  117,460,886
  117,460,967
  117,461,401
  117,461,678
  117,462,474
  117,462,802
  117,462,866
  117,463,178
  117,463,276
  117,463,825
  117,464,571
  117,464,658
  117,465,385
  117,465,436
  117,465,500
  117,466,204
  117,467,119
  117,467,371
  117,467,500
  117,467,910
  117,467,971
  117,468,176
  117,469,390
  117,470,420
  117,470,923
  117,471,548
  117,471,952
  117,471,956
G
C
C
-
4
4
C
C
3
2/-
C
T
-
C
5
G
C
C
-
C
T
T
2
C
A
G
T
C
A
G
T
A
2
G
A
A
T
C
C
C
A
A
T
T
T
G
A
C
G
T
T
T
C
C
A
-
T
T
C
C
-
T
A
A
T
A
T
C
A
C
A
G
C
A
G
T
T
-
2
T
G
C
T
C
-
T
C
T
-
C
G
C
C
T
A
-
A
G
T
C
T
T
G
G
T
A
G
T
-
A
A
-
G
G
G
G
-
14
7
T
A
T
A
-
T
T
20
C
G
T
A
A
T
T
C
C
C
C
T
A
A
G
G
T
A
T
T
A
T
-
G
G
C
-
G
C
C
G
T
T
T
-
T
-
A
4
T
-
A
-
G
T
G
A
C
A
A
-
G
C
A
C
A
G
C
C
A
G
C
G
T
A
T
7
-
-
G
A
A
-
A
3
-
A
C
G
A
T
A
A
T
G
C
T
T
7
G
T
G
T
A
T
C
T
T
A
G
A
T
-
T/C
T
A
C
T
G
T
C
T
4
A
3
G
G
G
T
G
A
G
G
T
C
-
G
G
T
G
-/13
-/39
C
T
G
C
-
2
-
C
T
G
T
10
T
4
-
T
C
T
C
T
T
C
C
T
-
T
T
G
G
C
T
G
T
T
C
G
A
G
C
A
T
2
A
G
T
G
C
G
C
A
A
G
G
A
G