Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 47,515 (bp)   Positions: 310
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.003
.001
.02
.0
.0
.0
.002
.005
.008
.046
.132
.007
.007
.041
.005
.006
.016
.002
.005
.003
.04
.014
.004
.005
.005
.003
.003
.002
.236
.261
.237
.002
.081
.11
.031
.025
.008
.004
.011
.003
.024
.033
.058
.058
.001
.001
.032
.039
.03
.054
.036
.042
.045
.038
.033
.011
.001
.006
.005
.02
.021
.078
.01
.012
.009
.011
.01
.002
.004
.004
.012
.008
.004
.004
.023
.008
.008
.001
.017
.001
.261
.002
.002
.0
.005
.022
.597
.21
.035
.073
.119
.038
.012
.002
.0
.0
.002
.004
.006
.021
.01
.004
.002
.005
.004
.001
.0
.001
.007
.0
.067
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.013
.008
.006
.003
.003
.001
.008
.001
.005
.008
.004
.014
.019
.001
.001
.015
.018
.999
.999
.703
.996
.98
.983
.93
1.0
.983
.019
.104
.98
1.0
.996
.004
.001
.011
.0
.001
.0
.0
.0
.008
.0
.002
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.001
.0
.023
.0
.001
.001
.001
.001
.019
.001
.0
.0
.001
.0
.014
.0
.009
.0
.0
.909
.153
.329
.085
.091
.53
.047
.018
.091
--
.0
.025
.009
.055
.022
.01
.001
.001
.002
.004
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.006
.015
.002
.002
.0
.0
.007
.001
.003
.002
.001
.093
.202
.0
.005
.0
.077
.128
.111
.032
.003
.006
.031
.042
.042
.025
.02
.002
.006
.01
.074
.028
.054
.058
.024
.027
.35
.476
.009
.001
.0
.995
1.0
1.0
1.0
.979
.997
1.0
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.024
.002
.001
.005
.001
.001
.949
.014
.001
.065
.015
.009
.0
.011
.01
.002
.02
.019
.012
.006
.003
.012
.035
.031
.006
.001
.002
.027
.006
.006
.004
.002
.0
.003
.033
.008
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
Aldh1l1
C
C
-
-
C
C
A
T
C
-
T
G
-
G
G
C
C
A
2
C
C
C
C
-
C
G
C
A
2
2
C
2
C
3
C
G
-
C
3
A
2
-
A
C
2
-
C
A
-
C
G
C
C
-
C
-
-
2
C
C
-
A
G
T
A
G
G
2
G
C
G
G
C
C
C
C
G
A
-
-
G
A
A
T
G
C
A
-
T
-
T
A
-
T
-
-
2
-
A
-
A
C
-
C
2
-
2
-
-
G
-
-
-
-
-
G
G
-
T
-
A
2
-
-
-
-
2
-
G
G
-
C
C
-
-
A
-
G
C
C
C
-
G
T
A
T
T
-
T
-
-
2
T
G
C
-
-
-
-
G
-
-
C
A
A
-
-
-
2
2
-
C
G
G
-
-
-
-
-
-
G
G
C
-
A
G
-
C
-
-
A
-
-
A
-
C
-
G
A
C
C
2
A
3
3
A
G
2
G
G
2
-
C
3
3
G
G
G
2
3
G
G
2
4
C
-
7
T
G
4
C
5
-
-
A
-
C
T
G
T
T
G
-
G
-
-
A
-
-
T
T
C
A
C
T
C
G
A
C
G
T
A
A
G
A
T
A
-
G
T
-
A
A
G
T
T
T
G
G
G
G
A
A
C
T
G
G
T
T
G
-
-
-
G
A
-
A
C
A
G
A
-
-
C
G
T
A
G
-
G
  123,519,094
  123,522,421
  123,523,366
  123,523,378
  123,523,724
  123,524,165
  123,525,195
  123,526,229
  123,527,235
  123,528,074
  123,531,249
  123,531,266
  123,531,279
  123,531,291
  123,531,307
  123,531,310
  123,531,315
  123,531,355
  123,531,361
  123,531,365
  123,531,391
  123,531,402
  123,531,418
  123,531,424
  123,531,442
  123,531,451
  123,531,457
  123,531,460
  123,531,475
  123,531,488
  123,531,497
  123,531,511
  123,531,536
  123,531,542
  123,531,555
  123,531,559
  123,531,567
  123,531,574
  123,531,581
  123,531,591
  123,531,611
  123,531,621
  123,531,634
  123,531,638
  123,531,659
  123,531,666
  123,531,676
  123,531,694
  123,531,721
  123,531,727
  123,531,771
  123,531,774
  123,531,789
  123,531,793
  123,531,795
  123,531,800
  123,531,819
  123,531,838
  123,531,846
  123,531,854
  123,531,871
  123,531,901
  123,531,929
  123,531,945
  123,531,953
  123,532,858
  123,532,878
  123,532,902
  123,532,919
  123,532,923
  123,532,939
  123,532,944
  123,532,971
  123,532,979
  123,532,997
  123,533,023
  123,533,067
  123,533,072
  123,534,989
  123,535,706
  123,535,726
  123,536,248
  123,536,899
  123,537,389
  123,537,532
  123,537,727
  123,538,217
  123,539,797
  123,539,846
  123,539,883
  123,539,944
  123,539,946
  123,540,028
  123,540,085
  123,540,102
  123,540,116
  123,540,125
  123,540,171
  123,540,203
  123,540,227
  123,540,248
  123,540,249
  123,540,257
  123,540,299
  123,540,334
  123,540,383
  123,540,395
  123,540,463
  123,540,479
  123,540,506
  123,540,514
  123,541,379
  123,541,391
  123,541,406
  123,541,410
  123,541,431
  123,541,436
  123,541,465
  123,541,474
  123,541,501
  123,541,527
  123,541,535
  123,541,581
  123,541,595
  123,541,673
  123,541,680
  123,541,694
  123,541,698
  123,541,711
  123,541,731
  123,541,739
  123,541,745
  123,541,748
  123,541,778
  123,541,814
  123,541,824
  123,541,827
  123,541,880
  123,541,881
  123,541,899
  123,541,911
  123,541,924
  123,541,928
  123,541,935
  123,541,958
  123,541,966
  123,541,973
  123,541,980
  123,541,988
  123,541,995
  123,542,003
  123,542,011
  123,542,017
  123,542,020
  123,542,041
  123,542,088
  123,542,100
  123,542,108
  123,542,111
  123,542,151
  123,542,185
  123,542,190
  123,542,198
  123,542,199
  123,542,202
  123,542,205
  123,542,211
  123,542,226
  123,542,272
  123,542,281
  123,542,322
  123,542,334
  123,542,347
  123,542,365
  123,542,420
  123,542,426
  123,542,442
  123,542,493
  123,542,512
  123,542,530
  123,542,536
  123,542,594
  123,542,644
  123,542,684
  123,542,687
  123,542,727
  123,542,757
  123,543,996
  123,545,201
  123,545,212
  123,545,235
  123,545,283
  123,545,311
  123,545,345
  123,545,362
  123,545,469
  123,545,558
  123,547,506
  123,549,482
  123,549,486
  123,549,489
  123,549,491
  123,549,497
  123,549,500
  123,549,507
  123,549,516
  123,549,520
  123,549,527
  123,549,533
  123,549,541
  123,549,543
  123,549,548
  123,549,552
  123,549,554
  123,549,560
  123,549,566
  123,549,570
  123,549,575
  123,549,587
  123,549,598
  123,549,655
  123,549,666
  123,549,679
  123,549,689
  123,549,695
  123,549,701
  123,549,705
  123,549,715
  123,549,719
  123,549,722
  123,549,729
  123,549,731
  123,553,462
  123,553,470
  123,553,487
  123,553,490
  123,553,497
  123,553,504
  123,553,509
  123,553,513
  123,553,527
  123,553,534
  123,553,539
  123,553,542
  123,553,548
  123,553,577
  123,553,581
  123,553,588
  123,553,603
  123,553,607
  123,553,624
  123,553,709
  123,554,730
  123,554,801
  123,555,004
  123,555,155
  123,555,166
  123,555,167
  123,555,179
  123,555,182
  123,555,185
  123,555,188
  123,555,568
  123,555,634
  123,555,770
  123,555,919
  123,555,975
  123,556,071
  123,556,075
  123,556,084
  123,556,096
  123,556,159
  123,556,478
  123,556,490
  123,556,556
  123,556,647
  123,556,654
  123,556,686
  123,556,774
  123,556,858
  123,557,430
  123,557,855
  123,557,996
  123,558,300
  123,559,237
  123,559,241
  123,559,412
  123,559,457
  123,559,459
  123,559,497
  123,559,513
  123,559,617
  123,559,649
  123,559,654
  123,559,668
  123,559,703
  123,559,708
  123,559,746
  123,559,752
  123,559,755
  123,559,756
  123,559,760
  123,559,782
  123,559,800
  123,559,805
  123,559,814
  123,559,816
  123,559,826
  123,559,840
  123,559,848
T
T
C
2
T
T
G
-
T
A
-
-
C
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
C
-
-
-
-
-
-
A
-
-
-
-
-
A
-
-
-
-
C
-
-
-
G
-
-
T
-
-
-
-
2
-
A
A
-
-
-
A
-
-
G
-
-
-
-
-
-
-
-
A/A
-
-
-
-
-
C
2
-
G
C
G
A
T
G
2
-
T
-
-
G
-
C
C
2/-
C
-
C
C
A
C
-
-
T
-
C
C
-
T
G
G
G
2
-
-
A
A
2
-
-
A
T
2
T
-
T
-
-
G
-
-
G
3
C
2
A
G
-
-
T
-
-
-
-
-
G
-
G
C
-
-
-
-
A
T
G
G
-
G
G
A
C
-
G
G
T
-
-
G
T
-
-
A
A
C
2
G
C
-
-
-
G
G
-
A
T
10
3
-
T
2
-
G
T
2
A
-
-
T
-
-
-
-
-
-
-
C
C
-
A
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
2
-
-
-
-
-
-
G
C
-
G
-
-
-
-
-
-
A
A
T
T
-
T
T
-
-
-
G
A
C
C/A
G/T
A/G
C/G
G/T
T/G
A/G
T
A
G
C
G
T
A
C
G
G
G
T
C
G
G
A
A
A
A
C
G
T
-
-
-
C
A
-
A
G
G
C
G
A
-
-
C
A
T
A
C
-
-
-
G
-
2
-