Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 75,316 (bp)   Positions: 310
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.071
.003
.005
.003
.0
.0
.968
1.0
1.0
.957
.0
.001
.0
.005
.021
.001
.0
.0
.001
.003
.13
.003
.0
.003
.013
.001
.01
.005
.0
.001
.0
.0
.0
.224
.003
.001
.0
.944
.912
.039
.012
.013
.007
.002
.225
.004
.238
.876
.0
.0
.006
--
--
--
--
--
--
.022
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.006
.451
.438
.0
.0
.019
.001
.005
--
--
.001
.008
.098
.699
.587
.002
.039
.004
.025
.026
.005
.002
.001
.012
.446
.477
.054
.052
.01
.0
.399
.001
.01
.007
.0
.0
.137
.001
.0
.195
.026
.134
.002
.001
.01
.001
.013
.001
.002
.001
.007
.003
.004
.011
.001
.002
.017
.0
.022
.0
.005
.0
.001
.168
.171
.005
.005
.097
.0
.0
.002
.002
.095
.005
.006
.005
.204
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.052
.034
.0
.082
.018
.0
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.02
--
.017
.018
.132
.197
.197
.124
.127
.001
.118
--
--
--
--
.048
.076
.063
.011
.203
.019
.001
.001
.002
.019
.005
.005
.177
.074
.02
.383
.001
.041
.0
.251
.0
.002
.0
.006
.013
.001
.057
.129
.545
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.012
.0
.045
.288
.457
.0
.003
.403
.007
.0
.056
.029
.0
.001
.004
.056
.012
.013
.001
.012
.06
.044
.0
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
Agtr1b
G
C
G
G
C
A
G
C
G
G
C
C
-
G
G
C
T
-
G
G
T
A
A
-
G
G
C
C
C
A
T
C
A
2
T
G
G
C
A
G
C
A
C
C
C
C
A
G
A
T
C
G
C
C
T
A
G
T
C
A
C
G
A
C
C
C
2
T
G
A
A
A
T
A
C
A
A
A
G
A
T
C
A
T
T
G
C
-
C
C
G
A
A
T
G
A
C
C
C
C
C
C
C
C
-
-
G
G
A
G
T
G
T
A
G
T
A
A
A
-
T
T
A
T
-
T
T
G
C
G
A
A
C
G
G
A
-
A
C
G
C
G
A
G
G
C
A
C
C
T
A
T
T
T
-
T
T
T
-
G
T
2
-
G
G
-
-
C
-
T
A
G
T
-
T
T
G
G
A
A
T
-
A
T
A
C
T
C
T
G
T
T
G
G
C
C
G
C
G
A
G
C
G
C
G
G
G
G
A
C
T
C
A
G
A
C
G
T
A
G
-
C
2
-
A
A
G
A
G
C
G
A
T
T
C
C
A
A
T
T
C
T
C
G
T
T
G
C
A
-
A
-
C
A
T
A
C
C
C
C
A
A
T
G
T
T
C
C
G
T
G
A
T
T
C
G
G
T
G
T
C
T
G
G
T
T
-
G
G
C
G
C
G
G
G
T
A
T
T
G
-
G
A
C
C
A
T
C
T
G
  105,149,348
  105,149,669
  105,149,740
  105,149,741
  105,149,821
  105,149,822
  105,150,055
  105,150,918
  105,150,931
  105,151,031
  105,151,042
  105,151,047
  105,151,103
  105,151,142
  105,151,197
  105,152,252
  105,152,356
  105,152,410
  105,152,814
  105,152,843
  105,152,903
  105,153,180
  105,153,709
  105,153,792
  105,155,038
  105,155,320
  105,155,400
  105,155,509
  105,155,716
  105,155,890
  105,156,119
  105,156,464
  105,156,465
  105,156,669
  105,156,748
  105,156,813
  105,156,835
  105,156,969
  105,156,970
  105,157,425
  105,157,443
  105,157,595
  105,157,824
  105,158,165
  105,158,279
  105,159,194
  105,159,213
  105,159,607
  105,159,619
  105,159,725
  105,160,040
  105,160,391
  105,160,618
  105,160,738
  105,160,789
  105,160,853
  105,161,074
  105,161,359
  105,161,421
  105,161,673
  105,161,727
  105,161,729
  105,161,778
  105,161,796
  105,161,812
  105,161,814
  105,161,816
  105,161,818
  105,161,829
  105,161,883
  105,161,959
  105,162,039
  105,162,044
  105,162,332
  105,162,369
  105,175,123
  105,175,146
  105,175,172
  105,175,253
  105,175,298
  105,175,460
  105,175,698
  105,175,699
  105,175,825
  105,175,883
  105,175,901
  105,176,602
  105,176,740
  105,179,337
  105,179,668
  105,179,756
  105,179,888
  105,179,902
  105,180,069
  105,180,070
  105,180,162
  105,181,012
  105,181,028
  105,181,052
  105,181,059
  105,181,076
  105,181,081
  105,181,082
  105,181,090
  105,181,138
  105,181,141
  105,181,472
  105,181,588
  105,182,112
  105,182,607
  105,182,685
  105,182,756
  105,182,986
  105,183,087
  105,183,201
  105,183,219
  105,183,528
  105,183,552
  105,183,705
  105,183,898
  105,184,033
  105,184,163
  105,184,207
  105,184,300
  105,184,514
  105,184,761
  105,184,838
  105,184,904
  105,184,932
  105,184,944
  105,185,014
  105,185,070
  105,185,100
  105,185,106
  105,185,124
  105,185,133
  105,185,161
  105,185,175
  105,185,198
  105,185,206
  105,185,217
  105,185,436
  105,185,522
  105,185,719
  105,185,734
  105,185,907
  105,185,929
  105,186,090
  105,186,179
  105,186,338
  105,186,394
  105,186,463
  105,186,805
  105,186,863
  105,186,950
  105,187,195
  105,187,238
  105,187,303
  105,187,308
  105,187,317
  105,187,319
  105,187,338
  105,187,353
  105,187,359
  105,187,375
  105,187,384
  105,188,169
  105,188,284
  105,188,479
  105,188,529
  105,189,208
  105,189,405
  105,189,648
  105,189,748
  105,191,535
  105,192,008
  105,192,109
  105,192,473
  105,192,748
  105,193,021
  105,193,373
  105,193,568
  105,193,690
  105,193,937
  105,194,320
  105,194,468
  105,194,490
  105,195,041
  105,195,085
  105,195,276
  105,195,292
  105,195,402
  105,195,444
  105,195,468
  105,196,450
  105,196,473
  105,196,507
  105,196,587
  105,196,629
  105,196,811
  105,196,813
  105,196,861
  105,196,959
  105,197,030
  105,197,259
  105,197,346
  105,197,355
  105,197,366
  105,197,484
  105,198,119
  105,198,650
  105,198,795
  105,199,012
  105,199,137
  105,199,151
  105,199,174
  105,200,091
  105,200,220
  105,200,494
  105,201,176
  105,201,330
  105,201,332
  105,201,340
  105,201,427
  105,201,434
  105,201,436
  105,201,493
  105,201,879
  105,204,285
  105,204,424
  105,205,542
  105,206,419
  105,206,809
  105,206,819
  105,206,951
  105,207,912
  105,207,913
  105,208,002
  105,208,135
  105,208,151
  105,208,432
  105,208,592
  105,208,641
  105,208,671
  105,208,751
  105,208,878
  105,209,162
  105,209,686
  105,209,741
  105,209,782
  105,209,973
  105,210,002
  105,212,939
  105,213,057
  105,213,424
  105,213,577
  105,213,613
  105,213,766
  105,213,777
  105,213,924
  105,214,359
  105,214,360
  105,214,457
  105,214,548
  105,214,887
  105,214,897
  105,215,361
  105,215,515
  105,215,533
  105,215,922
  105,216,131
  105,216,180
  105,216,242
  105,216,270
  105,216,531
  105,216,538
  105,216,603
  105,216,993
  105,217,351
  105,217,429
  105,217,706
  105,217,765
  105,217,835
  105,217,896
  105,217,955
  105,218,260
  105,218,410
  105,218,892
  105,219,222
  105,219,353
  105,219,354
  105,219,657
  105,219,741
  105,220,554
  105,221,166
  105,221,492
  105,221,622
  105,221,654
  105,221,843
  105,222,007
  105,222,212
  105,222,298
  105,222,675
  105,222,825
  105,222,913
  105,223,139
  105,223,291
  105,223,292
  105,223,466
  105,223,665
A
T
T
T
T
G
A
T
A
A
T
T
T
A
A
T
C
4
A
A
C
G
T
12
A
A
T
G
T
G
A
A
G
-
C
T
A
A
G
A
T
T
-
T
T
T
-
A
G
C
T
T
T
T
C
T
A
A
A
G
C/A
G/C
A/G
C/A
C/T
-
-
A
G/A
A/T
G
T
A
G
-
G
T
G
T
G
C
T
G
G
C
T
T
G
T
T
T
G
G
C
C
G
T
T
T
G
A
A
T
A
A
A
A
A
T
A
C
A
C
G
A
A
G
G
G
14
C
C
T
A
3
C
C
A
T
A
G
G
T
-
-
-
3
-
A
-
-
A
C
T
A
A
G
G
T
C
G
C
C
G
A/A
A
A
-
A
A
-
-
T
-
-
A
A
T
2
C
-
A
A
A
A
A
A
A
G
T
A
A
G
G
-
G
C
T
C
T
G
C
T
C
C/T
C/T
G/T
T
C
A/T
G/T
A
A
T
A
A
A
A
C
A
A
A
G
A
T
A
A
G
-
A
-/8
C/T
-
T
T
G
A
C
C
A
A
G
A
G
T
T
G
G
C
C
A
A
T
A
C
C
A
-
-
2
G
A
A
C
A
G
T
A
T
A
G
G
G
-
C
A
T
-
A
C
A
G
-
G
T
T
A
C
A
C
T
G
-
A
C
C
A
T
A
A
T
A
A
A
A
C
T
G
C
A
4
A
-
T
T
-
G
A
C
T