Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 511,072 (bp)   Positions: 312
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.002
--
--
.608
.059
.005
.086
.037
.042
.073
.094
.076
.091
.062
.037
.024
.022
.0
.001
.005
.003
.005
.0
.0
.001
.0
.0
.003
.002
.004
.004
.0
.011
.026
.032
.09
.083
.01
.0
.001
.004
.02
.002
.002
.001
.031
.004
.642
.613
.0
.231
.114
.877
.976
.998
1.0
1.0
.998
1.0
1.0
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.002
.001
.008
.037
.007
.004
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.001
.002
.003
.012
.0
.068
.001
.001
.0
.001
.0
.001
.111
.164
.18
.131
.958
.98
.988
.993
.996
.999
.991
.788
.999
.858
.048
.935
.929
.837
.499
.457
.562
.276
.061
.09
.31
.932
.441
.225
.003
.022
.055
.004
.0
.0
.033
.006
.001
.016
.012
.001
.001
.001
.003
.012
.004
.004
.393
.021
.032
.016
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.003
.0
.015
.002
.002
.01
.0
.0
--
--
--
--
.002
.002
.206
.192
.185
.108
.033
.021
.01
.001
.013
.042
.042
.04
.004
.021
.028
.018
.019
.07
.069
.043
--
--
--
.001
.001
.0
.0
.0
.001
.002
.202
.0
.001
.0
.0
.001
.255
.174
.003
.004
.001
.005
.001
.016
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.143
.862
.195
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.023
.032
.209
.005
.189
.139
.146
.154
.049
.0
.029
.001
.001
.0
.002
.017
.0
.141
.0
.004
.0
.982
.417
.588
.009
.003
.002
.0
.001
.0
1.0
.0
.001
.0
.003
.009
.048
.983
.001
.0
.001
.108
.182
.069
.046
.017
.05
.008
.234
.997
.952
.845
.994
.756
.215
.238
.038
.001
--
--
.04
.027
.003
.454
.487
.498
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
Aff2
T
-
T
-
-
C
T
2
T
A
A
3
-
3
C
3
-
C
-
2
A
T
T
3
T
C
G
-
G
T
2
G
A
G
C
G
-
-
A
G
C
-
C
C
C
-
C
-
A
-
T
C
-
T
T
A
G
-
-
A
-
C
C
C
C
-
-
-
-
-
-
-
2
T
C
T
C
-
-
-
-
-
-
G
-
G
T
G
G
G
-
-
G
-
T
A
G
G
-
-
-
-
A
T
C
-
-
-
G
T
-
-
T
T
C
T
-
-
-
G
-
-
C
A
G
G
-
T
-
-
G
2
-
G
G
C
-
G
A
T
-
-
-
-
-
G
T
-
-
-
2
-
-
-
-
-
-
-
-
T
-
T
G
-
-
A
T
G
G
A
T
G
G
C
C
T
G
T
C
G
A
G
A
G
C
C
C
G
2
T
G
A
2
A
A
A
T
G
A
T
C
A
2
-
G
T
G
C
T
C
A
C
C
T
G
G
-
C
G
A
T
C
C
C
T
C
C
G
C
A
G
C
G
2
T
2
A
A
T
T
T
8
G
C
G
T
G
-
-
C
-
C
A
A
T
A
T
C
A
C
G
T
A
-
G
C
C
A
A
T
T
-
T
-
T
T
A
T
A
C
-
A
C
T
4
T
A
-
-
A
T
G
C
A
86
-
G
T
A
C
A
T
G
T
G
T
-
2
2
T
T
T
  153,555,542
  153,562,959
  153,563,012
  153,571,323
  153,571,382
  153,577,755
  153,598,162
  153,598,433
  153,598,436
  153,598,446
  153,598,450
  153,598,460
  153,598,464
  153,598,471
  153,598,477
  153,598,479
  153,598,494
  153,598,534
  153,598,540
  153,598,546
  153,598,562
  153,598,581
  153,598,592
  153,598,607
  153,598,611
  153,598,612
  153,598,618
  153,598,647
  153,598,653
  153,598,670
  153,598,675
  153,598,681
  153,598,686
  153,598,694
  153,598,725
  153,598,769
  153,598,782
  153,598,799
  153,598,805
  153,598,807
  153,598,810
  153,598,843
  153,598,869
  153,598,870
  153,598,873
  153,598,879
  153,598,891
  153,598,921
  153,598,939
  153,598,975
  153,598,983
  153,599,000
  153,599,027
  153,599,043
  153,599,102
  153,599,158
  153,599,167
  153,599,239
  153,599,262
  153,599,275
  153,602,120
  153,602,136
  153,602,157
  153,602,187
  153,602,220
  153,629,219
  153,629,223
  153,629,225
  153,629,229
  153,629,232
  153,629,234
  153,629,238
  153,640,992
  153,644,852
  153,644,857
  153,644,858
  153,644,860
  153,644,870
  153,644,887
  153,644,892
  153,644,900
  153,644,913
  153,644,919
  153,644,920
  153,644,936
  153,644,949
  153,644,951
  153,644,972
  153,644,980
  153,644,987
  153,644,995
  153,645,000
  153,645,004
  153,645,017
  153,645,021
  153,645,022
  153,645,028
  153,645,033
  153,645,047
  153,645,050
  153,645,053
  153,645,055
  153,645,057
  153,645,059
  153,645,070
  153,645,078
  153,645,089
  153,645,109
  153,645,119
  153,645,138
  153,645,145
  153,645,149
  153,645,152
  153,645,153
  153,645,159
  153,645,166
  153,645,171
  153,645,173
  153,645,179
  153,645,194
  153,645,208
  153,645,211
  153,645,218
  153,645,222
  153,645,233
  153,645,246
  153,645,265
  153,645,267
  153,645,278
  153,645,281
  153,645,289
  153,645,296
  153,645,300
  153,645,305
  153,645,309
  153,645,311
  153,645,315
  153,645,335
  153,645,339
  153,645,341
  153,645,352
  153,645,364
  153,645,377
  153,645,381
  153,645,383
  153,645,395
  153,645,396
  153,645,399
  153,645,408
  153,645,424
  153,645,427
  153,645,432
  153,645,437
  153,645,447
  153,645,451
  153,645,476
  153,645,481
  153,645,486
  153,646,264
  153,646,275
  153,646,279
  153,646,283
  153,646,291
  153,646,293
  153,646,323
  153,646,325
  153,646,326
  153,646,336
  153,646,347
  153,646,376
  153,646,402
  153,646,423
  153,646,430
  153,646,445
  153,646,448
  153,646,450
  153,646,461
  153,646,486
  153,646,497
  153,646,501
  153,646,502
  153,646,535
  153,646,539
  153,646,544
  153,677,531
  153,677,536
  153,678,001
  153,692,285
  153,703,961
  153,706,697
  153,706,706
  153,706,709
  153,706,997
  153,722,944
  153,722,993
  153,729,685
  153,730,942
  153,730,959
  153,730,961
  153,731,007
  153,755,259
  153,755,261
  153,759,135
  153,772,148
  153,772,165
  153,789,876
  153,790,026
  153,790,031
  153,801,653
  153,801,767
  153,801,949
  153,801,960
  153,801,965
  153,801,989
  153,801,993
  153,802,038
  153,802,088
  153,802,159
  153,802,194
  153,802,220
  153,802,280
  153,802,478
  153,802,530
  153,802,531
  153,802,534
  153,802,537
  153,802,546
  153,802,549
  153,802,558
  153,802,580
  153,802,581
  153,802,586
  153,802,783
  153,834,180
  153,836,513
  153,837,303
  153,881,029
  153,881,286
  153,881,335
  153,881,400
  153,881,401
  153,881,405
  153,881,414
  153,881,660
  153,881,676
  153,881,797
  153,881,883
  153,881,905
  153,882,015
  153,882,045
  153,882,060
  153,882,134
  153,882,135
  153,882,210
  153,882,213
  153,882,232
  153,882,298
  153,882,316
  153,882,320
  153,883,046
  153,883,071
  153,883,072
  153,883,092
  153,883,107
  153,883,121
  153,883,148
  153,883,189
  153,894,280
  153,894,298
  153,894,304
  153,894,417
  153,894,578
  153,894,579
  153,895,736
  153,895,741
  153,897,488
  153,897,585
  153,898,303
  153,898,367
  153,898,413
  153,898,427
  153,898,459
  153,898,461
  153,900,261
  153,900,898
  153,915,983
  153,915,984
  153,915,994
  153,916,007
  153,916,018
  153,916,019
  153,916,043
  153,918,603
  153,920,145
  153,920,224
  153,931,860
  153,931,874
  153,931,911
  153,931,930
  153,931,941
  153,931,973
  153,931,993
  153,932,023
  153,932,035
  153,955,095
  153,955,164
  153,991,345
  153,992,229
  154,004,789
  154,010,332
  154,010,335
  154,010,336
G
31
A
T
3
G
G
-
-
-
-
-
T
-
-
-
T
-
T
-
-
-
A
-
G
A
-
2
T/AC
-
-
T
-
-
-
-
A
T
-
A
A
T
-
A
-
A
-
T
-
C
-
-
C
-
-
-
-
A
T
-
T
T
T
-
T
4
26
23
21
23
8
42
2/-
C
-
A
-
A
A
T
C
G
A
T
C
A
G
-
A
-
C
C
-
2
A
G
A
-
A
A
A
C
-
A
A
2
A
A
-
-
A
2
A
C
A
A
T
A
C
C
A
A
-
T
-
-
A
-
C
A
-
-
T
-
-
A
2
-
C
A
2
A
A
A
A
T
A
G
A
C
-
C
C
C
C
A
A
A
C
C
2
-
A
A
2
C
A
-
-
-
C
-
-
-
-
-
-
C
-
A
G
A
-
A
C/G
C/T
C/T
C
2/-
-
-
-
-
-
-
G
T/A
G/C
A/G
T/A
T
T
2/-
T
T
-
-
-
T/A
C/A
A/G
C/T
C/T
T/C
G/C
G/T
T/T
C/T
G/T
A/C
T/G
C/T
C/T
C/A
T/C
C/T
C/T
G/T
C/T
A/G
G/C
C/G
G/T
2/-
G
2/-
A/C
A/G
C
T/-
T/C
8/-
G/A
C/A
G/A
C
C
A
G
T
C
T
G
T
G
G
C
A
G
T
A
C
G
2
A
T
T
C
T
-
C
A
C
-/A
T/A
C
G
-
G
T
3
G
-
C
-
C
T
C
T
-
G
-
-
G
-
G
C
G
G
G
C
C
A
G
T
T/A
7
2/-
2/-
T/-
T/C
T/C