Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 153,996 (bp)   Positions: 401
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.023
.071
.144
.014
.03
.055
.146
.0
.014
.536
--
.11
.224
.002
.025
.007
.08
.018
.078
.002
.042
.063
.04
.015
.003
.189
.015
.008
.065
.014
.03
.043
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.003
.45
.012
.777
.6
.106
.039
.315
.366
.123
.0
.002
.095
.074
.005
.118
.529
.075
.01
.005
.001
.009
.004
.005
.001
.046
.98
.99
.789
1.0
.999
1.0
.04
.004
.034
.539
.696
.014
.015
.005
.012
.291
.017
.023
.069
.001
.007
.02
.286
.008
.226
.031
.014
.008
.012
.011
.004
.838
.012
.045
.074
.004
.052
.03
.005
.007
.034
.263
.071
.3
.004
.055
.007
.606
.318
.305
.281
.212
.05
.147
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.077
.033
.101
.005
.018
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.029
.022
.023
.036
.007
.01
.021
.15
.015
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.014
.268
.467
.01
.027
.35
.082
.082
.219
.006
.007
.142
.204
.223
.11
.099
.014
.406
.041
.057
.022
.058
.711
.011
.951
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.166
.092
.034
.433
.128
.1
.009
--
--
--
--
--
--
--
.009
.02
.017
.006
.021
.426
.007
.016
.06
.032
.628
.015
.008
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.048
--
--
.019
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
1.0
.995
1.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.023
.015
.895
.766
.276
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC103690497
LOC103690497
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Hspa14-ps1
Hspa14-ps1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
Adgre1
T
A
G
G
T
A
T
A
G
C
G
G
G
G
T
A
C
T
G
C
G
T
G
T
T
C
C
A
A
G
A
G
C
C
A
G
A
T
A
G
A
A
G
T
G
G
T
C
T
T
T
A
T
T
C
A
G
G
A
A
T
A
G
A
C
C
C
A
C
G
T
G
C
C
C
T
A
G
C
T
A
G
T
C
C
A
C
C
T
T
G
A
C
A
C
T
T
G
T
A
A
A
G
G
C
G
A
T
T
T
A
T
C
T
A
A
C
T
C
T
C
C
T
A
T
A
C
C
T
A
A
C
T
T
T
G
C
C
C
G
A
T
C
T
C
G
G
T
T
C
G
T
C
G
C
G
G
G
T
T
T
T
G
T
T
C
T
T
C
T
T
G
T
G
A
C
C
C
G
G
T
C
G
A
G
A
T
T
T
A
G
A
C
G
A
C
G
A
T
C
T
C
C
T
C
T
C
G
G
C
C
C
C
G
T
G
C
C
A
T
T
C
A
T
G
A
A
T
C
C
A
C
T
C
C
C
C
T
T
A
T
G
A
G
G
A
G
A
G
G
A
C
T
C
C
G
G
C
T
C
A
G
A
G
C
C
C
C
T
A
A
G
A
T
A
A
C
G
G
C
C
A
T
T
A
T
G
G
T
C
C
T
C
T
T
A
C
G
C
A
C
A
A
C
C
A
A
A
A
A
G
G
T
T
T
A
T
G
T
C
T
A
C
C
A
C
T
A
A
T
G
T
G
G
G
G
T
C
T
T
G
T
C
T
C
T
T
A
G
T
C
A
C
A
G
T
G
G
T
A
T
C
G
C
T
T
A
A
A
T
G
C
A
G
C
A
A
C
C
C
A
T
G
C
G
T
A
G
G
G
T
G
C
G
G
T
G
G
C
A
A
  9,432,315
  9,433,677
  9,434,362
  9,434,414
  9,434,582
  9,435,119
  9,435,131
  9,439,267
  9,440,140
  9,440,294
  9,440,869
  9,441,464
  9,441,566
  9,441,646
  9,442,578
  9,442,781
  9,442,902
  9,445,173
  9,445,208
  9,445,249
  9,445,386
  9,445,509
  9,445,522
  9,445,527
  9,445,531
  9,445,923
  9,446,175
  9,446,187
  9,446,311
  9,446,908
  9,447,706
  9,447,743
  9,447,754
  9,447,784
  9,448,414
  9,448,430
  9,448,606
  9,448,633
  9,448,908
  9,449,307
  9,449,445
  9,449,706
  9,449,775
  9,450,173
  9,453,600
  9,453,978
  9,454,477
  9,454,964
  9,458,890
  9,463,126
  9,463,131
  9,465,786
  9,466,158
  9,466,396
  9,467,299
  9,470,446
  9,471,980
  9,473,089
  9,473,250
  9,473,296
  9,473,322
  9,473,356
  9,473,361
  9,473,572
  9,473,617
  9,473,683
  9,473,736
  9,473,739
  9,473,853
  9,473,871
  9,473,905
  9,474,035
  9,474,145
  9,474,384
  9,474,457
  9,474,496
  9,474,529
  9,474,717
  9,474,799
  9,474,880
  9,474,882
  9,475,014
  9,475,186
  9,475,336
  9,475,394
  9,475,483
  9,475,514
  9,475,605
  9,475,971
  9,476,169
  9,476,340
  9,476,761
  9,476,846
  9,477,042
  9,477,108
  9,477,123
  9,477,139
  9,477,195
  9,477,447
  9,477,487
  9,477,555
  9,477,750
  9,478,030
  9,478,050
  9,478,261
  9,478,440
  9,478,526
  9,478,765
  9,478,804
  9,478,807
  9,478,938
  9,478,940
  9,479,003
  9,479,068
  9,479,198
  9,479,233
  9,479,331
  9,479,397
  9,479,460
  9,479,471
  9,479,577
  9,479,634
  9,479,683
  9,479,871
  9,480,094
  9,480,258
  9,480,362
  9,480,376
  9,480,423
  9,480,473
  9,480,590
  9,480,607
  9,480,611
  9,480,623
  9,480,887
  9,480,999
  9,481,039
  9,481,100
  9,481,174
  9,481,412
  9,481,654
  9,481,806
  9,481,904
  9,482,126
  9,482,177
  9,482,307
  9,482,461
  9,482,546
  9,482,767
  9,482,830
  9,482,975
  9,483,020
  9,483,279
  9,483,280
  9,483,762
  9,483,767
  9,484,058
  9,484,130
  9,484,131
  9,484,172
  9,484,316
  9,484,339
  9,484,380
  9,484,499
  9,484,533
  9,484,544
  9,484,763
  9,484,810
  9,484,817
  9,485,017
  9,485,148
  9,485,372
  9,485,474
  9,485,920
  9,485,958
  9,486,039
  9,486,357
  9,486,430
  9,486,569
  9,486,603
  9,486,724
  9,486,755
  9,486,956
  9,487,267
  9,491,329
  9,491,677
  9,492,354
  9,492,481
  9,492,514
  9,492,539
  9,492,749
  9,492,811
  9,492,913
  9,493,212
  9,493,287
  9,493,623
  9,493,691
  9,493,782
  9,494,014
  9,494,129
  9,495,002
  9,495,021
  9,495,039
  9,495,069
  9,495,085
  9,495,252
  9,495,308
  9,495,506
  9,495,564
  9,495,655
  9,495,657
  9,495,723
  9,495,796
  9,495,810
  9,495,837
  9,495,905
  9,495,938
  9,495,945
  9,495,999
  9,496,002
  9,496,081
  9,496,230
  9,496,406
  9,496,827
  9,496,957
  9,497,001
  9,497,166
  9,497,185
  9,497,226
  9,497,234
  9,497,312
  9,497,474
  9,497,496
  9,497,536
  9,497,703
  9,497,740
  9,498,053
  9,498,059
  9,498,065
  9,498,073
  9,498,133
  9,498,372
  9,498,442
  9,498,578
  9,498,690
  9,499,034
  9,499,166
  9,499,185
  9,499,202
  9,499,241
  9,499,302
  9,499,454
  9,499,738
  9,501,563
  9,502,559
  9,502,597
  9,502,877
  9,503,138
  9,503,172
  9,503,191
  9,504,124
  9,504,310
  9,504,357
  9,504,460
  9,504,791
  9,504,921
  9,504,998
  9,505,278
  9,505,370
  9,505,409
  9,505,430
  9,505,565
  9,505,638
  9,505,740
  9,505,896
  9,505,974
  9,506,011
  9,506,076
  9,506,315
  9,506,478
  9,506,561
  9,506,595
  9,507,072
  9,507,312
  9,507,332
  9,507,381
  9,507,473
  9,507,611
  9,507,706
  9,507,821
  9,508,400
  9,508,595
  9,508,835
  9,509,236
  9,509,299
  9,509,341
  9,510,367
  9,510,483
  9,510,640
  9,511,192
  9,511,272
  9,511,563
  9,511,610
  9,511,695
  9,511,872
  9,511,933
  9,511,950
  9,512,177
  9,512,184
  9,512,818
  9,512,845
  9,513,390
  9,513,471
  9,513,584
  9,513,611
  9,513,644
  9,513,838
  9,514,082
  9,514,143
  9,514,470
  9,515,938
  9,516,209
  9,516,397
  9,516,661
  9,517,727
  9,518,336
  9,519,097
  9,519,677
  9,519,712
  9,520,537
  9,520,652
  9,520,657
  9,521,278
  9,525,494
  9,525,557
  9,526,641
  9,526,766
  9,527,798
  9,528,100
  9,528,597
  9,529,374
  9,529,431
  9,529,482
  9,529,742
  9,529,836
  9,530,292
  9,530,838
  9,530,884
  9,531,353
  9,531,530
  9,531,567
  9,531,872
  9,531,996
  9,532,053
  9,532,196
  9,535,821
  9,536,843
  9,536,955
  9,537,379
  9,537,425
  9,537,514
  9,538,948
  9,539,296
  9,539,313
  9,539,314
  9,540,192
  9,540,364
  9,540,905
  9,541,036
  9,541,672
  9,542,206
  9,542,263
  9,542,325
  9,542,641
  9,544,372
  9,545,284
  9,545,430
  9,545,561
  9,545,646
  9,555,163
  9,555,344
  9,555,688
  9,556,602
  9,557,149
  9,557,224
  9,570,528
  9,570,662
  9,570,689
  9,570,698
  9,570,723
  9,570,834
  9,570,861
  9,570,905
  9,570,907
  9,570,999
  9,571,007
  9,571,103
  9,571,728
  9,571,794
  9,571,862
  9,572,310
C
G
A
C
C
G
C
C
A
A
A
A
A
A
C
C
T
C
C
T
A
C
A
C
C
G
T
G
G
A
A/G
T
T
T
G
T
G
C
G
C
G
C
A
G
A
G/A
C
A
C
T/G
T/G
C
C
T/A
A
G
A
T
G
T
G
G
A
G
T
A
T
G
A
A
G
A
A
T
A
G
T
A
T
G
G
A
C
G
T
G
G
C/G
C
C
A
T
C/G
G
C/T
C
C
A
C
C
G
G
T
A
G
A
T
C
G
C
G
A
T
C
G
G
T
G
T
G
T
T
C
C
C
G
G
T
C
G
C
T
C
C
C
A
T
A
G
T
G
C
A
C
G
A
A
C
C
A
A
G
T
A
T
A
A
A
C
G
G
T/C
A
C
T/C
C/T
C
C
G
G
T/A
T
T/C
A
T
C/T
A
T
T
C
T/C
C/T
C
C
A
G
C
A
C
G
A
T
T
A
G
T
A
T
A
T
C
T
T
C
T
C
C/A
A
A
A
A
T
T
A
C
A
T
T
G
C
T/C
T
C
C
A
T
G
C
T
G
G
T
C
T
T
T
T
C
G
G
G
A
G
A
T
G
A
G
C
T
G
T
C
C/G
C/G
A
T
T
C
G
G
A
C
A
T
C/T
C/T
T
C
G
G
A
C
C
T
G
T
A
A
T
T
T
C
C
T
C
A
C
C
C/T
T
C
T
T/C
T/C
G
A
T
C/T
G
C/T
A/G
G
T
T
G
G
G
G
A/G
A
A
G
C
G
C
C
T
C
T
G
G
T
T
C
A
A
G
C
C
C
C
A
A
A
G/A
T/C
C/A
T/C
C
A
C
G
C
T
C
G
G
C
C
T
T
A
T
G/A
C
T
A
T/C
G
C
G
G/A
C/A
G
G
G
G
A/T
C
T
T
G
A
C/T
G
A/T
C/T
G
A
T
T/C
A
A
T
G
G
G/A
G/A
G/C
T/C
G/C
C/G
G/A
G/A
T/C
G/A
A
C/A
A/G
C