Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 114,789 (bp)   Positions: 302
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.016
.002
.212
.005
.002
.001
.011
.011
.0
.001
.0
.0
.028
.0
.0
.0
.0
.001
.013
.0
.103
.002
.017
.01
.002
.399
.513
.067
.005
.0
.003
.024
.39
.992
.075
.122
.001
.002
.098
.011
.07
.056
.324
.046
.012
.01
.038
.062
.017
.018
.005
.015
.363
.246
.021
.04
.018
.009
.008
.001
.697
.0
.004
.002
.005
.022
.031
.023
.001
.085
.042
.028
.003
.01
.012
.016
.0
.0
.141
.027
.019
.003
.348
.005
.001
.005
.003
.0
.372
.004
.001
.071
.0
.103
.0
.014
.027
.001
.115
.0
.3
.007
.04
.003
.015
.022
.495
.468
.069
.905
.95
.824
.011
.026
.001
.003
.496
.303
.093
.009
.004
.001
.001
.005
.0
.001
.001
.001
.16
.11
.046
.001
.001
.006
.001
.013
.034
.056
.002
.017
--
--
.547
.015
.026
.002
.026
.003
.066
--
.854
.179
.001
.023
.002
.001
.0
.024
.003
.065
.008
--
.035
.001
.0
.099
.023
.0
.0
.001
.002
.014
.0
.005
.0
.5
--
.023
.079
.039
.012
.0
.006
.052
.046
.017
.006
.002
.006
.0
.022
.302
.007
.001
.172
.007
.001
.002
.0
.929
.0
.004
.0
.022
.033
.995
.697
.156
.003
.039
--
--
--
.004
.009
.0
.001
.009
.163
.076
.003
.038
.055
.001
.026
.002
.0
.123
.0
--
.416
.03
.003
.045
.391
--
.025
.0
.001
.001
.013
.012
.039
.001
.007
--
--
.023
--
.0
.055
.068
.044
.142
.016
.123
.045
.001
.015
.0
.006
.022
.029
.001
.016
.0
.0
.0
.001
.022
.044
.001
--
--
--
--
.387
.0
.0
.0
.001
.0
.001
.006
.012
.001
.003
.757
.047
--
--
.01
.047
.896
.014
.001
--
.0
.002
.216
.005
.465
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
Adgrd1
C
A
T
T
G
A
C
A
A
A
A
T
C
2
G
C
A
A
2
C
C
C
13
G
G
G
2
C
G
G
C
2
-
T
3
A
-
-
T
G
T
C
-
-
G
G
G
T
A
G
-
C
-
-
G
-
T
T
G
T
2
C
T
C
4
-
-
T
G
C
G
C
T
T
T
T
G
C
-
C
A
T
G
T
C
-
A
T
-
2
G
G
A
A
G
T
-
T
4
C
T
T
T
A
2
G
G
-
G
C
A
C
G
C
A
A
A
C
T
G
T
G
-
T
A
C
T
G
A
15
-
T
G
A
C
G
C
G
C
C
G
G
T
C
C
T
T
G
5
G
A
T
A
-
C
C
T
T
A
14
T
G
G
G
3
A
T
G
C
C
T
C
A
C
C
A
3
6
G
12
-
T
C
C
T
-
C
T
G
T
C
A
C
4
16
C
G
A
-
C
G
A
T
C
A
G
G
113
T
G
11
G
G
-
G
T
T
G
2
C
-
A
T
G
G
G
A
A
G
A
G
A
G
C
G
G
G
C
C
C
G
A
T
T
A
13
4
12
4
C
A
C
G
C
T
C
G
A
C
T
G
T
G
G
A
C
A
T
T
C
A
-
T
-
C
C
G
A
C
A
C
T
A
10
-
A
-
A
C
-
G
A
-
G
-
G
C
C
T
C
T
A
  31,134,900
  31,135,025
  31,135,187
  31,135,692
  31,136,029
  31,136,116
  31,136,569
  31,136,570
  31,137,076
  31,138,068
  31,138,183
  31,138,761
  31,139,034
  31,139,159
  31,139,507
  31,141,276
  31,141,323
  31,141,411
  31,141,583
  31,142,003
  31,142,111
  31,142,284
  31,142,293
  31,143,416
  31,143,811
  31,143,910
  31,143,943
  31,145,046
  31,145,098
  31,145,671
  31,146,170
  31,146,243
  31,146,271
  31,146,331
  31,146,360
  31,146,390
  31,146,422
  31,146,452
  31,146,578
  31,146,625
  31,146,673
  31,146,713
  31,146,728
  31,146,831
  31,146,838
  31,146,854
  31,146,884
  31,146,889
  31,146,907
  31,146,912
  31,146,936
  31,146,980
  31,147,012
  31,147,034
  31,147,095
  31,147,626
  31,148,398
  31,148,672
  31,149,600
  31,150,418
  31,150,448
  31,151,067
  31,151,200
  31,151,371
  31,151,931
  31,152,167
  31,152,172
  31,152,186
  31,152,220
  31,152,413
  31,153,043
  31,153,066
  31,153,350
  31,153,624
  31,153,691
  31,153,693
  31,154,216
  31,155,123
  31,155,175
  31,156,657
  31,157,084
  31,157,392
  31,158,042
  31,160,137
  31,160,918
  31,162,620
  31,163,430
  31,163,437
  31,164,011
  31,164,169
  31,167,227
  31,167,453
  31,167,873
  31,168,059
  31,168,481
  31,169,724
  31,170,180
  31,171,021
  31,171,068
  31,171,195
  31,171,434
  31,172,138
  31,172,277
  31,172,539
  31,172,955
  31,172,975
  31,173,273
  31,173,276
  31,174,032
  31,174,367
  31,174,385
  31,174,392
  31,174,600
  31,175,062
  31,175,415
  31,175,429
  31,175,736
  31,175,978
  31,176,051
  31,176,186
  31,176,862
  31,176,933
  31,176,948
  31,177,445
  31,177,471
  31,177,541
  31,177,912
  31,178,013
  31,178,261
  31,178,287
  31,178,383
  31,178,426
  31,178,451
  31,178,465
  31,178,648
  31,178,969
  31,179,096
  31,179,496
  31,179,599
  31,179,884
  31,180,067
  31,180,298
  31,180,483
  31,181,003
  31,181,061
  31,182,173
  31,182,246
  31,182,346
  31,183,181
  31,184,271
  31,185,150
  31,193,312
  31,193,628
  31,195,137
  31,197,897
  31,198,328
  31,199,535
  31,199,724
  31,200,954
  31,201,658
  31,201,999
  31,202,283
  31,202,450
  31,202,905
  31,203,101
  31,204,008
  31,204,231
  31,204,568
  31,204,768
  31,205,519
  31,205,578
  31,205,587
  31,207,449
  31,207,708
  31,208,254
  31,208,543
  31,209,196
  31,210,924
  31,211,454
  31,211,475
  31,211,540
  31,212,398
  31,212,517
  31,212,613
  31,212,900
  31,213,001
  31,213,660
  31,213,748
  31,214,152
  31,214,302
  31,214,647
  31,214,778
  31,215,342
  31,215,985
  31,216,281
  31,216,910
  31,218,295
  31,218,368
  31,218,390
  31,218,617
  31,218,849
  31,219,037
  31,219,665
  31,219,917
  31,220,156
  31,220,187
  31,220,226
  31,220,923
  31,221,196
  31,221,529
  31,221,667
  31,221,868
  31,222,000
  31,222,336
  31,222,626
  31,222,649
  31,222,829
  31,223,651
  31,224,283
  31,224,321
  31,224,849
  31,225,102
  31,225,121
  31,225,379
  31,225,411
  31,225,531
  31,225,921
  31,226,032
  31,226,109
  31,226,247
  31,226,594
  31,226,719
  31,226,793
  31,226,852
  31,227,385
  31,227,978
  31,228,139
  31,228,400
  31,228,705
  31,228,806
  31,228,931
  31,228,962
  31,229,422
  31,229,481
  31,229,752
  31,229,925
  31,229,970
  31,230,065
  31,230,265
  31,230,396
  31,230,618
  31,230,640
  31,230,813
  31,231,001
  31,231,063
  31,231,340
  31,231,350
  31,231,701
  31,232,044
  31,232,542
  31,232,694
  31,232,718
  31,232,719
  31,232,789
  31,233,092
  31,233,561
  31,233,629
  31,234,121
  31,234,395
  31,234,653
  31,234,666
  31,234,820
  31,234,983
  31,234,991
  31,234,998
  31,237,260
  31,237,289
  31,238,014
  31,238,185
  31,238,551
  31,238,653
  31,238,689
  31,238,710
  31,238,745
  31,238,846
  31,238,935
  31,238,940
  31,239,003
  31,239,651
  31,240,446
  31,240,452
  31,241,690
  31,241,985
  31,243,337
  31,243,482
  31,245,432
  31,246,018
  31,246,625
  31,246,960
  31,247,888
  31,248,037
  31,248,483
T
C
C
C
A
G
T
G
G
G
G
C
T
-
A
G
G
T
-
T
A
T
-
A
A
A
-
T
C
A
A
-
C
-
-
-
G
C
-
-
-
-
C
T
-
-
-
-
-
-
T
-
C
T
T
3
G
C
A
C
-
T
C
G
-
17
3
C
-
G
A
T
G
G
C
C
A
T
2
T
G
C
A
A
T
13
G
C
-/C
-
A
T
G
A/C
A
C
2
C
-
T
A
C
C
G
2/-
A
A
4
A
T
G
T
A
T
G
G
C
T
C
A
A
-
3
C
G
G
C
A
G
-
24
G
A
G
T
A
T
A
T
T
A
A
C
A
T
A
C
T
-
A
G
A
G
3
T
T
C
C
G
-
C
A
A
C
-
G
C
A
A
T
C
T
G
T
T
G
3/-
-
T
-
8
C
A
A
C
T
T
C
A
C
A
G
G
-
-
G
T
G
20
T
A
G
C
G
G
A
A
-
A
A
-
T
A
T
A
C
C
T
-
-
A/A
G
A
A
C
A
G
G
C
T
A
G
A
T
A
A
A
T
T
G
A
G
G
G
G
-
-
-
-
T
G
G
A
T
C
T
A
T
A
G
A
C
A
A
G
T
C
G
C
A
G
2
-
2
G
T
A
G
T
C
G
A
G
-
A
G
2
G
G
G
T
C
19
A
C
A
T
T
A
A
C
-