Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 107,788 (bp)   Positions: 322
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
CDR 
.188
.994
.0
.998
.001
.001
.0
.103
.278
.962
.014
.024
.031
.004
.724
.361
.001
.001
--
.0
.004
.103
.041
.0
.413
.001
.012
.195
.0
.005
.014
.001
.006
.931
.018
.141
.004
.007
.002
.002
.001
.0
.225
--
.407
.126
.007
.032
.206
.001
.104
--
.02
.014
--
--
--
.001
.053
.733
.007
.004
.003
--
.007
.018
.008
.02
.002
.007
.435
.226
.0
.016
.339
.119
.024
.016
.0
.008
.459
.001
.001
.0
.027
.001
.994
.005
.202
.205
.005
.001
.81
.119
.0
.132
.001
.006
.906
.21
.001
.0
.0
.003
.827
.073
.0
.031
.002
.147
.149
.144
--
.416
.05
.011
.032
.065
.0
.001
.015
.012
.018
.005
.003
.003
.046
.018
.005
.001
.0
.636
.011
.001
.001
.0
.027
.032
.002
.019
.001
.01
.002
.007
.78
.016
.001
.001
.358
.815
.011
.011
.003
.0
.093
.008
--
--
.0
.002
.008
.018
.318
.004
.003
.001
.03
.412
--
.0
.337
.298
.005
.998
1.0
.135
.002
.0
.001
.0
.026
.001
.91
.097
.002
.0
.003
.017
.837
.004
.034
.044
.0
.052
.003
.0
.001
.996
.005
.001
.001
.001
.003
.006
.017
.143
.065
.402
.0
.004
.002
.025
.007
.0
.001
.011
.008
.0
.001
.06
.104
.141
.172
.473
.934
.045
.071
.093
.001
.007
.025
.003
.004
.003
.0
.012
.583
.0
.085
.016
.106
.002
.001
.0
.001
.001
.0
.0
.123
.0
.009
.001
1.0
.0
.001
.001
.031
.017
.059
.0
.7
.064
.431
.002
.0
.0
.668
.024
.216
.009
.884
1.0
.004
.011
.02
.196
.0
.0
.011
.002
.049
.951
.982
.962
.94
.715
.856
.859
.871
.881
.894
.943
.807
.977
.555
.081
.029
.02
.052
.06
.066
.226
--
.906
.017
.026
.012
1.0
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.001
1.0
.008
.176
.004
.19
1.0
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
Add3
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
A
T
T
G
G
T
T
C
A
A
C
A
T
G
C
T
T
T
3
A
G
A
A
G
T
T
T
G
A
C
3
T
G
T
T
G
2
2
G
T
A
C
A
A
T
C
A
A
4
C
A
A
A
C
C
A
G
T
A
A
T
A
C
T
T
A
A
A
A
C
G
G
G
T
T
A
A
T
G
T
T
T
C
A
T
A
G
T
A
G
G
T
T
T
A
2
T
A
C
G
T
C
G
C
C
C
A
4
T
C
C
2
15
T
A
G
G
A
G
G
C
A
A
A
T
C
7
A
T
T
T
A
T
A
T
A
C
C
A
T
G
T
2
T
T
T
G
G
T
C
A
T
G
A
A
T
C
T
T
C
C
T
T
T
T
A
A
G
T
12
8
A
C
C
T
A
A
A
C
T
2
T
C
T
G
A
A
A
C
T
C
G
C
12
G
G
C
C
C
C
C
C
C
C
A
G
4
G
G
T
G
A
C
C
A
A
G
T
G
G
G
G
C
T
A
C
G
C
T
3
T
A
G
C
T
2
C
A
G
A
A
A
T
A
C
A
A
T
A
C
G
T
C
G
C
T
G
5
T
44
22
A
G
11
44
11
C
C
A
C
T
C
T
G
G
C
A
G
G
G
A
A
A
C
A
T
G
G
C
G
T
T
C
C
G
2
G
G
C
C
2
C
140
C
G
22
A
C
C
C
C
G
G
G
T
C
A
G
G
A
G
  273,854,247
  273,854,699
  273,854,889
  273,854,904
  273,857,253
  273,857,255
  273,857,695
  273,859,699
  273,859,704
  273,860,626
  273,860,837
  273,860,960
  273,861,603
  273,861,938
  273,864,665
  273,865,084
  273,866,258
  273,866,260
  273,867,508
  273,868,553
  273,868,557
  273,868,820
  273,868,905
  273,870,294
  273,871,011
  273,871,091
  273,872,781
  273,872,838
  273,873,437
  273,875,452
  273,876,341
  273,876,960
  273,876,965
  273,878,719
  273,878,807
  273,880,021
  273,880,539
  273,880,759
  273,880,803
  273,881,077
  273,881,517
  273,881,806
  273,882,027
  273,882,241
  273,883,046
  273,883,395
  273,884,214
  273,885,273
  273,887,924
  273,889,341
  273,889,686
  273,890,449
  273,890,748
  273,891,992
  273,892,068
  273,893,763
  273,894,036
  273,894,324
  273,894,730
  273,894,820
  273,894,930
  273,895,200
  273,895,480
  273,895,822
  273,895,840
  273,895,844
  273,896,320
  273,896,971
  273,897,791
  273,897,947
  273,898,380
  273,898,402
  273,898,598
  273,898,782
  273,899,094
  273,899,095
  273,899,254
  273,899,280
  273,899,426
  273,901,746
  273,902,695
  273,902,755
  273,902,756
  273,903,477
  273,904,018
  273,905,036
  273,906,479
  273,906,733
  273,906,948
  273,906,949
  273,907,153
  273,907,180
  273,908,286
  273,908,962
  273,908,974
  273,910,350
  273,910,790
  273,910,804
  273,911,107
  273,911,389
  273,911,798
  273,911,936
  273,912,123
  273,912,128
  273,912,396
  273,912,398
  273,912,493
  273,912,977
  273,913,207
  273,913,752
  273,913,778
  273,913,780
  273,914,059
  273,915,160
  273,915,258
  273,916,205
  273,916,733
  273,916,801
  273,917,398
  273,917,413
  273,917,507
  273,917,555
  273,917,585
  273,917,743
  273,918,335
  273,919,251
  273,920,013
  273,920,073
  273,920,158
  273,920,383
  273,920,400
  273,921,245
  273,921,323
  273,921,354
  273,921,389
  273,922,047
  273,922,181
  273,922,209
  273,922,665
  273,923,003
  273,923,023
  273,923,026
  273,923,063
  273,923,095
  273,923,292
  273,923,555
  273,923,586
  273,923,591
  273,923,740
  273,923,781
  273,924,112
  273,925,073
  273,925,436
  273,925,533
  273,925,755
  273,926,078
  273,926,247
  273,926,432
  273,926,885
  273,927,090
  273,927,433
  273,928,315
  273,928,445
  273,928,547
  273,928,833
  273,928,839
  273,929,750
  273,929,947
  273,930,184
  273,930,461
  273,930,615
  273,930,619
  273,930,796
  273,930,986
  273,931,068
  273,931,179
  273,931,187
  273,931,229
  273,931,335
  273,931,445
  273,931,490
  273,931,889
  273,932,294
  273,932,321
  273,932,459
  273,932,551
  273,932,647
  273,932,721
  273,932,984
  273,933,475
  273,933,513
  273,933,545
  273,933,685
  273,933,874
  273,933,885
  273,934,018
  273,934,049
  273,934,663
  273,934,791
  273,934,794
  273,934,796
  273,934,798
  273,934,800
  273,934,802
  273,934,804
  273,935,158
  273,935,211
  273,935,381
  273,935,434
  273,935,440
  273,935,553
  273,935,725
  273,935,830
  273,935,834
  273,936,154
  273,936,188
  273,936,987
  273,937,200
  273,938,418
  273,939,391
  273,939,397
  273,939,403
  273,939,409
  273,939,569
  273,939,989
  273,940,842
  273,941,090
  273,941,384
  273,941,471
  273,941,615
  273,942,164
  273,942,222
  273,942,369
  273,942,890
  273,943,037
  273,943,066
  273,943,207
  273,943,441
  273,943,936
  273,943,972
  273,944,076
  273,944,129
  273,944,142
  273,944,696
  273,944,885
  273,945,157
  273,945,530
  273,945,791
  273,945,948
  273,946,534
  273,946,607
  273,946,730
  273,947,101
  273,947,347
  273,947,393
  273,947,400
  273,947,533
  273,947,563
  273,947,572
  273,947,639
  273,949,156
  273,949,165
  273,949,199
  273,949,221
  273,949,223
  273,949,230
  273,949,244
  273,949,411
  273,950,486
  273,950,506
  273,950,693
  273,950,934
  273,951,332
  273,951,464
  273,952,614
  273,952,919
  273,953,244
  273,953,799
  273,954,442
  273,954,458
  273,955,006
  273,955,078
  273,955,081
  273,955,135
  273,955,340
  273,955,399
  273,955,449
  273,955,450
  273,955,453
  273,955,455
  273,955,457
  273,955,580
  273,955,634
  273,955,685
  273,956,320
  273,956,396
  273,956,520
  273,956,608
  273,956,622
  273,956,628
  273,956,629
  273,956,648
  273,956,737
  273,956,768
  273,956,968
  273,957,046
  273,957,198
  273,957,409
  273,957,533
  273,957,849
  273,958,036
  273,958,039
  273,958,468
  273,958,547
  273,958,548
  273,958,986
  273,959,102
  273,959,749
  273,959,779
  273,959,832
  273,960,490
  273,961,637
C
2
-
C
9
A
C
C
T
C
G
T
G
C
A
T
-
A
C
-
-
A
T
G
A
C
A
C
A
G
T
-
G
A
G
C
T
2/-
-
3
C
T
T
T
G
-
T
G
9
-
T
G
5
G
T
T
G
A
C
G
T
C
G
3
3
C
G
G
G
G
T
2
A
7
A
C
T
G
C
C
G
G
C
A
C
G
G
A
G
T
T
T
C
C
G
G
-
C
T
T
C
C
T
A
-
T
T
G
-
C
2
A
-
-
C
T
A
11
G
A
C
T
G
C
G
C
G
-
G
A
2
-
G
C
-
C
4
2
T
G
2
A
G
-
C
A
C
-
C
A
G
G
7
A
T
G
G
T
C
C
G
T
G
G
A
-
G
G
T
C
12/-
-
G
G
T
C
5
G
G
G
C
-
C
T
C
A
7
G
G
A
C
A
T
-
-
C
A
T
A
2
A
A
A
A
A
G
A
-
A
A
A
A
G
T
T
G
G
A
C
T
G/T
G/T
G/T
T
C
G
T
C
2
G
-
C
T
A
T
C
-
T
G
A
C
G
G
G
G
T
G
G
C
G
T
A
C
T
A
T
C
A
-
C
44/-
22/-
A/G
G/A
11/-
44/-
11/-
2
T
G
T
C
G
C
T
C
A
G
C
A
A
G
G
G
2
15
T/C
G/T
G/A
C/A
G/A
G
C
T
G
A
-
T
A
A
G
-
C/T
140/-
-
T
-
C
T
G
4
T
A
A
A
C
T
C
A
C
T
A