Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 196,263 (bp)   Positions: 335
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.036
.285
.002
.0
.002
.004
.005
.0
.082
.034
.039
.025
.104
.007
.0
.006
.035
.969
.47
.0
.052
.036
.011
.013
.001
.005
.001
.007
.011
.027
.123
.04
.004
.0
--
.009
.001
.004
.006
.001
.015
.122
.01
--
--
.029
.005
.002
.033
.01
.004
.032
.0
.0
.0
.948
.002
.061
.003
.0
.0
.044
.043
.702
.002
.003
.224
.052
.0
.995
.997
.0
.077
.003
.007
.43
.01
.018
.003
.004
.01
.066
.006
.119
.133
.003
.001
.156
.0
.003
.004
.0
.0
.0
.003
.0
.0
.0
.008
.005
.001
.002
.01
.0
.0
.0
.002
.0
.002
.0
.056
.054
.001
.001
.025
.316
.11
.0
.0
.038
.01
.006
.016
.03
.029
.008
.013
.021
.008
.145
.008
.001
.019
.016
.124
.215
.142
.07
.071
.047
.016
.009
.016
.017
.015
.387
.623
.711
.737
.739
.458
.002
.002
.001
.002
.027
.199
.186
.203
.239
.346
.256
.545
.542
.241
.185
.153
.184
.009
.007
.02
.007
.141
.117
.131
.007
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
--
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.009
.001
.003
.006
.001
.001
.0
.0
.0
.009
.002
.002
.027
.002
.002
.754
.001
.0
.009
.022
.002
.0
.039
.0
.003
.003
.003
.036
.001
.997
.002
.011
.004
1.0
1.0
.467
.01
.012
.448
.549
.0
.001
.0
.002
.0
.002
.095
.001
.0
.003
.003
.002
.01
.011
.007
.001
.018
.014
.004
.01
.023
.0
.018
.0
.002
.005
.001
.003
.002
.997
.157
.002
.002
.0
.001
.002
.015
.005
.001
.007
.004
.007
.0
.021
.0
.007
.003
.001
.0
.002
.001
.003
.006
.001
.0
.036
.87
.0
.008
.0
.002
.019
.0
.723
.074
.016
.0
.008
.001
.001
.004
.003
.004
.0
.0
.0
.0
.11
.019
.0
.308
.05
.002
.839
.068
.005
.0
.001
.001
.0
.006
.0
.001
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
Add2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
-
G
T
C
T
T
C
G
T
C
C
G
2
T
C
-
T
-
C
-
T
C
T
T
T
G
C
C
G
A
G
G
3
C
C
T
T
-
C
G
T
T
17
-
G
3
C
C
T
G
G
G
G
T
18
T
A
T
T
C
A
-
T
A
C
-
G
T
T
G
T
C
C
C
C
C
T
C
C
G
T
-
G
G
A
A
-
G
20
A
A
G
T
A
T
T
A
C
-
G
C
A
G
T
A
T
G
-
-
-
-
C
G
G
T
C
-
-
4
-
G
T
C
C
A
G
G
C
A
C
-
T
C
-
2
3
C
-
2
G
A
-
G
G
A
-
3
A
C
G
C
A
G
C
-
-
A
C
-
G
C
-
-
-
-
-
G
-
-
-
T
C
C
A
T
G
C
C
C
G
A
C
T
T
G
T
G
C
C
C
G
T
G
T
A
G
C
A
G
-
G
G
G
G
C
G
C
T
-
-
-
-
-
-
T
C
T
T
G
T
A
G
A
C
A
G
A
G
G
-
A
C
A
T
G
T
C
C
C
C
T
-
A
G
G
T
C
C
-
2
-
-
-
G
G
G
G
T
-
3
A
G
A
C
T
C
T
A
2
G
T
A
G
T
T
T
A
G
A
G
C
T
G
G
T
A
A
A
G
A
-
C
-
A
C
G
G
G
A
A
A
G
A
G
C
G
-
T
T
A
A
G
-
C
C
T
-
C
C
-
-
G
C
T
-
G
T
C
A
T
T
2
-
T
  117,691,753
  117,692,237
  117,692,866
  117,694,295
  117,694,416
  117,694,518
  117,694,519
  117,694,528
  117,695,099
  117,696,233
  117,696,234
  117,696,275
  117,696,445
  117,697,134
  117,697,188
  117,698,122
  117,698,406
  117,698,745
  117,698,785
  117,700,105
  117,700,982
  117,702,514
  117,704,265
  117,704,689
  117,705,355
  117,705,498
  117,705,982
  117,706,109
  117,706,123
  117,706,546
  117,707,516
  117,707,580
  117,708,104
  117,708,566
  117,709,351
  117,709,772
  117,710,009
  117,710,125
  117,710,759
  117,710,923
  117,711,125
  117,711,794
  117,712,014
  117,712,741
  117,712,811
  117,713,999
  117,714,939
  117,718,777
  117,721,310
  117,721,388
  117,722,145
  117,722,188
  117,722,626
  117,722,850
  117,722,877
  117,723,061
  117,723,717
  117,725,006
  117,727,019
  117,728,233
  117,728,324
  117,730,148
  117,730,778
  117,730,902
  117,732,222
  117,732,903
  117,733,898
  117,734,094
  117,734,526
  117,734,709
  117,734,710
  117,734,969
  117,735,595
  117,735,673
  117,735,876
  117,736,697
  117,736,857
  117,736,940
  117,737,260
  117,737,765
  117,737,883
  117,738,587
  117,738,737
  117,738,777
  117,738,779
  117,738,818
  117,738,820
  117,739,527
  117,739,693
  117,739,952
  117,740,746
  117,741,295
  117,741,400
  117,742,578
  117,742,999
  117,743,276
  117,743,714
  117,744,154
  117,744,365
  117,744,487
  117,744,619
  117,744,736
  117,744,879
  117,745,283
  117,745,398
  117,745,471
  117,745,484
  117,745,590
  117,745,595
  117,745,608
  117,745,656
  117,745,677
  117,745,683
  117,745,696
  117,745,721
  117,745,735
  117,745,745
  117,745,819
  117,745,820
  117,745,850
  117,745,882
  117,745,883
  117,745,909
  117,745,951
  117,745,952
  117,745,963
  117,745,965
  117,745,974
  117,745,978
  117,745,990
  117,746,012
  117,746,020
  117,746,026
  117,746,028
  117,746,180
  117,746,200
  117,746,214
  117,746,221
  117,746,228
  117,746,232
  117,746,237
  117,746,246
  117,746,249
  117,746,251
  117,746,266
  117,746,295
  117,746,315
  117,746,323
  117,746,329
  117,746,336
  117,746,406
  117,746,507
  117,746,508
  117,746,513
  117,746,515
  117,746,522
  117,746,565
  117,746,570
  117,746,579
  117,746,581
  117,746,672
  117,746,682
  117,746,722
  117,746,725
  117,746,757
  117,746,784
  117,746,792
  117,746,801
  117,746,840
  117,746,843
  117,746,852
  117,746,917
  117,746,947
  117,746,978
  117,746,982
  117,746,999
  117,747,002
  117,841,897
  117,841,898
  117,841,995
  117,841,999
  117,842,044
  117,842,084
  117,842,087
  117,842,106
  117,842,117
  117,842,148
  117,842,190
  117,842,201
  117,842,208
  117,842,209
  117,842,212
  117,842,425
  117,842,477
  117,842,481
  117,842,483
  117,842,503
  117,842,546
  117,842,547
  117,842,552
  117,842,676
  117,845,248
  117,845,647
  117,845,653
  117,845,657
  117,845,660
  117,845,667
  117,845,671
  117,845,672
  117,845,681
  117,845,687
  117,845,708
  117,845,711
  117,845,717
  117,845,722
  117,845,747
  117,845,750
  117,846,011
  117,846,274
  117,846,378
  117,846,920
  117,847,135
  117,847,348
  117,847,499
  117,847,575
  117,847,620
  117,847,672
  117,849,112
  117,851,125
  117,851,148
  117,851,234
  117,851,701
  117,852,378
  117,853,711
  117,853,882
  117,854,114
  117,854,115
  117,854,157
  117,854,460
  117,854,814
  117,855,311
  117,855,836
  117,857,401
  117,857,411
  117,857,834
  117,858,230
  117,858,280
  117,858,684
  117,858,728
  117,858,961
  117,858,963
  117,858,976
  117,858,980
  117,858,986
  117,859,584
  117,859,586
  117,859,588
  117,859,590
  117,859,687
  117,859,701
  117,859,718
  117,859,730
  117,859,910
  117,860,099
  117,860,221
  117,860,257
  117,861,254
  117,861,388
  117,861,401
  117,861,689
  117,862,211
  117,862,391
  117,862,795
  117,862,842
  117,863,064
  117,863,464
  117,863,503
  117,863,551
  117,863,848
  117,864,219
  117,864,367
  117,864,504
  117,864,659
  117,865,685
  117,866,847
  117,867,219
  117,867,512
  117,868,288
  117,868,371
  117,868,375
  117,868,379
  117,869,388
  117,869,505
  117,869,739
  117,869,878
  117,870,928
  117,870,974
  117,871,525
  117,876,300
  117,876,870
  117,877,258
  117,877,298
  117,877,305
  117,877,784
  117,877,989
  117,878,326
  117,878,628
  117,878,712
  117,879,001
  117,879,058
  117,879,376
  117,879,549
  117,880,356
  117,880,395
  117,880,500
  117,880,619
  117,880,857
  117,880,990
  117,881,091
  117,881,101
  117,881,108
  117,881,722
  117,882,487
  117,883,308
  117,883,958
  117,884,100
  117,884,211
  117,884,218
  117,885,523
  117,885,770
  117,886,238
  117,886,342
  117,886,488
  117,886,574
  117,886,578
A
5
C
C
T
G
G
T
A
A
A
T
A
-
C
T
2
C
A
T
2
C
T
C
C
C
A
T
A
A
G
A
A
-
C/T
A
C
C
55
T
A
C
C
-
2
A
-
T
T
G
A
-
A
A
G
-
C
-
C
G
G
G
T
C
G
T
2
A
C
C
A
C
T
T
T
A
T
C
T
T
A
G
4
C
C
G
G
2
A
-
G
G
A
C
G
C
C
G
T
A
A
T
G
C
C
G
A
-
G
10
47
A
-
-
-
-
-
G
G
-
A
T
-
-
A
-
-
-
-
-
-
C
-
T
A
-
-
A
A
-
A
G
3
-
-
-
T
-
-
T
-
A
C
-
-
2
G
T
G
2
-
-
C
G
2
G/C
A
-
A
2
C
C
-
A
-
C
T
A
T
C/T
G/C
A/G
C/T
T/C
C
G/A
T/C
G/A
C/T
C/T
C/G
G/T
T/G
G/A
T/C
G/T
G/A
T
G
A
C
G/A
-
-
C
-
C
A
C
C
C
C
C
2
T
C
-
C
C
A
C
G
A
G
T
G
A
G
A
A
3
G
T
G
-
A
C
T
T
T
T
A
6
G
A
A
C
T
T
A
-
2
2
2
C
C
C
-
-
C
-
-
A
G
T
A
A
C
C
-
A
C
-
T
C
C
C
G
A
G
A
T
-
A
A
C
G
T
-
-
-
T
T
2
G
T
A
C
A
G
G
G
A
G
A
T
A
2
C
C
G
G
A
2
T
A
C
5
C/T
C/T
-/4
12
A
T
C
8
A
C
T
C
C
C
-
C
C