Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 239,490 (bp)   Positions: 472
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
1.0
.001
.0
.0
.645
.035
.101
.064
.0
.0
.002
.003
.028
--
.001
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.001
.001
.004
.003
.008
.02
.002
.472
.006
.001
.001
.002
.004
.002
--
--
.019
.001
.003
.002
.005
.0
.048
.363
.0
.008
.015
.007
.0
.0
.006
.0
.016
.0
.0
.34
.319
.058
.007
.001
--
--
.018
.015
.001
.821
.0
.0
.005
.0
.001
.008
.001
.0
.008
.011
.176
.0
.031
.0
.001
.001
.003
.037
.003
.016
.002
.001
.035
.005
.001
.0
.0
.001
.001
.0
.007
.035
.005
.015
.0
.003
.029
.003
.014
.0
.082
.027
.026
.002
.051
--
--
--
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.287
.005
.044
.006
.0
.023
.434
.952
.0
.001
.001
.001
.002
.099
.003
.06
.001
.005
.003
.001
.041
.024
.212
.0
.04
.001
.003
.003
.0
.002
.001
.0
.0
.01
.005
.323
.002
.005
.0
.0
.001
.0
.0
.026
.0
.072
.095
.001
.0
.001
.001
.0
.001
.026
.012
.009
.193
.045
.008
.002
.001
.0
.004
.003
.002
.004
.0
.001
.001
.0
.0
.002
.0
.0
.001
.0
.0
.004
.0
.0
.002
.001
.047
.046
.013
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.004
.012
.018
.004
.001
.001
.0
.02
.024
.016
.001
.007
.008
.026
.0
.01
.001
.002
.001
.0
.023
.0
.001
.0
.001
.049
.005
.023
.005
.056
.058
.004
.001
.003
.249
.633
.607
.853
.915
.624
.6
.55
.421
.347
.289
.376
.391
.408
.447
.392
.341
.225
.135
.003
.129
.164
.18
.192
.189
.002
.001
.006
.069
.193
.2
.19
.183
.133
.103
.072
.042
.084
.049
.035
.01
.028
.047
.047
.005
.01
.004
.027
.011
.003
.173
.213
.187
.023
.049
.053
.058
.016
.007
.004
.02
.028
.007
.004
.007
.007
.002
.166
.068
.003
.002
.004
.004
.034
.292
.988
.955
.26
.021
.003
.0
.0
.001
.021
.033
.012
.656
.306
.271
.859
.145
.008
.012
.001
.002
.002
.004
.001
.002
.038
.023
.024
.028
.036
.239
.21
.024
.024
.021
.024
.002
.003
.001
.14
.004
.007
.0
.031
.057
--
.988
.0
.002
.005
.002
.001
.001
.002
.009
.002
.012
.101
.001
.0
.018
.006
.024
.02
.019
.005
.002
.0
.0
.001
.0
.0
.005
.003
.0
.592
.014
.003
.015
.006
.02
.0
.998
.0
.0
.011
.372
.049
.049
.0
.002
.0
.0
.001
.029
.0
.004
.001
.0
.0
.921
.675
.715
.027
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
T
G
A
A
-
A
4
C
C
G
C
T
-
G
A
T
A
A
T
G
A
T
T
T
G
G
G
C
C
T
T
A
A
A
G
A
A
C
T
G
T
C
G
A
C
G
A
C
G
C
C
C
T
A
A
G
T
G
G
T
G
G
G
C
A
G
C
A
T
C
A
T
G
C
C
G
T
T
-
C
A
C
A
G
T
A
T
G
C
C
-
T
A
T
G
G
G
T
A
C
C
T
G
T
-
G
A
T
C
C
T
-
T
T
G
T
-
T
G
A
T
A
A
-
-
T
G
A
C
G
-
A
C
T
G
T
T
T
-
4
A
T
4
A
C
C
A
G
C
G
T
A
C
C
C
A
T
A
T
A
G
-
A
A
T
A
T
T
A
T
A
T
A
A
C
T
T
A
A
A
A
A
C
A
-
T
T
C
G
T
T
T
A
T
13
T
A
T
T
-
G
A
A
C
G
G
G
C
G
C
A
T
A
G
T
A
C
-
C
A
G
T
C
T
A
6
G
T
A
G
C
C
C
C
C
G
A
G
T
C
T
G
A
G
C
2
G
G
T
-
-
A
-
-
-
-
-
-
-
-
-
C
-
-
T
T
-
A
-
A
T
G
T
2
-
G
A
A
G
-
T
-
-
A
2
-
C
A
C
-
T
C
A
C
2
A
G
G
-
-
A
T
A
-
-
A
C
T
-
-
C
G
2
C
G
C
G
G
G
-
2
A
G
2
2
2
G
G
-
A
G
G
T
-
C
G
-
T
-
-
-
-
T
G
A
-
-
A
C
A
2
C
T
2
-
-
A
-
C
A
G
2
A
2
2
T
-
G
5
-
A
T
C
2
G
G
T
T
A
C
G
-
-
G
-
A
A
A
-
G
C
A
C
-
-
T
-
3
C
2
-
G
G
T
T
A
-
4
C
G
T
A
G
T
-
C
A
A
G
C
A
T
T
A
T
T
A
C
C
G
G
G
T
G
A
A
C
-
C
T
G
C
G
-
G
T
A
T
A
T
T
C
A
G
-
T
C
C
T
A
C
C
4
C
A
C
T
C
C
A
G
G
  105,353,898
  105,354,601
  105,356,065
  105,356,066
  105,356,854
  105,358,153
  105,359,539
  105,360,935
  105,361,245
  105,361,303
  105,361,452
  105,362,551
  105,362,588
  105,363,939
  105,364,608
  105,365,471
  105,365,751
  105,366,585
  105,367,455
  105,367,486
  105,367,489
  105,367,712
  105,367,715
  105,367,723
  105,367,725
  105,367,741
  105,367,744
  105,367,749
  105,367,767
  105,367,771
  105,367,786
  105,367,790
  105,367,795
  105,367,807
  105,368,087
  105,368,101
  105,368,107
  105,368,145
  105,368,153
  105,368,158
  105,368,166
  105,368,175
  105,368,242
  105,369,223
  105,369,226
  105,370,884
  105,371,245
  105,371,606
  105,372,016
  105,372,057
  105,372,059
  105,372,755
  105,376,120
  105,376,214
  105,379,310
  105,379,392
  105,379,439
  105,379,575
  105,381,194
  105,383,806
  105,388,042
  105,396,966
  105,403,253
  105,406,239
  105,407,078
  105,416,899
  105,417,804
  105,419,916
  105,421,903
  105,436,978
  105,437,463
  105,438,571
  105,438,960
  105,439,157
  105,439,160
  105,439,273
  105,439,482
  105,440,681
  105,441,474
  105,442,096
  105,444,856
  105,446,273
  105,447,265
  105,449,442
  105,449,970
  105,454,540
  105,456,024
  105,456,030
  105,457,829
  105,457,831
  105,460,453
  105,460,756
  105,462,428
  105,473,036
  105,473,037
  105,479,135
  105,479,137
  105,481,139
  105,483,796
  105,484,065
  105,485,205
  105,485,209
  105,485,365
  105,485,633
  105,486,673
  105,486,813
  105,487,012
  105,488,031
  105,490,153
  105,490,474
  105,491,475
  105,492,557
  105,492,783
  105,492,813
  105,494,901
  105,495,075
  105,495,532
  105,495,685
  105,496,976
  105,497,028
  105,497,487
  105,497,768
  105,498,492
  105,499,676
  105,499,917
  105,501,357
  105,501,503
  105,504,709
  105,505,537
  105,507,051
  105,507,474
  105,507,977
  105,509,254
  105,509,527
  105,510,112
  105,511,976
  105,512,154
  105,512,975
  105,513,312
  105,514,209
  105,515,724
  105,515,889
  105,515,910
  105,517,519
  105,518,529
  105,518,551
  105,521,028
  105,522,418
  105,522,469
  105,522,667
  105,522,857
  105,524,002
  105,524,170
  105,524,224
  105,525,763
  105,525,780
  105,526,507
  105,526,764
  105,527,384
  105,527,843
  105,528,568
  105,529,095
  105,530,028
  105,535,584
  105,538,275
  105,538,411
  105,538,894
  105,539,669
  105,542,216
  105,543,289
  105,544,060
  105,544,308
  105,544,719
  105,544,752
  105,544,840
  105,545,018
  105,545,656
  105,545,847
  105,545,982
  105,546,304
  105,546,504
  105,546,524
  105,546,813
  105,547,162
  105,547,199
  105,547,345
  105,547,917
  105,548,220
  105,548,325
  105,548,440
  105,548,679
  105,548,783
  105,548,807
  105,548,837
  105,549,199
  105,549,243
  105,549,406
  105,549,537
  105,549,651
  105,550,161
  105,550,510
  105,550,864
  105,551,188
  105,551,270
  105,551,390
  105,551,443
  105,551,897
  105,551,977
  105,552,219
  105,552,322
  105,552,573
  105,552,864
  105,552,884
  105,552,900
  105,552,912
  105,552,985
  105,553,657
  105,553,723
  105,553,772
  105,554,228
  105,554,569
  105,554,719
  105,554,744
  105,554,767
  105,554,990
  105,555,196
  105,555,897
  105,556,012
  105,556,115
  105,556,332
  105,556,479
  105,557,017
  105,557,066
  105,557,167
  105,557,235
  105,557,279
  105,557,291
  105,557,394
  105,557,529
  105,557,534
  105,557,635
  105,557,776
  105,557,817
  105,557,926
  105,557,968
  105,558,210
  105,558,664
  105,559,648
  105,559,787
  105,559,805
  105,559,870
  105,559,902
  105,559,917
  105,559,938
  105,560,010
  105,560,029
  105,560,065
  105,560,068
  105,560,075
  105,560,180
  105,560,185
  105,560,200
  105,560,204
  105,560,899
  105,560,924
  105,560,940
  105,560,949
  105,560,997
  105,561,019
  105,561,045
  105,561,053
  105,561,082
  105,561,091
  105,561,108
  105,561,125
  105,561,128
  105,561,149
  105,561,154
  105,561,157
  105,561,163
  105,561,169
  105,561,177
  105,561,193
  105,561,200
  105,561,221
  105,561,243
  105,561,268
  105,561,276
  105,561,300
  105,561,314
  105,561,334
  105,561,346
  105,561,355
  105,561,361
  105,561,387
  105,561,396
  105,561,420
  105,561,438
  105,561,469
  105,561,496
  105,561,499
  105,561,507
  105,561,519
  105,561,525
  105,561,530
  105,561,565
  105,561,569
  105,561,573
  105,561,581
  105,561,596
  105,561,601
  105,561,613
  105,561,622
  105,561,635
  105,561,657
  105,561,667
  105,561,674
  105,561,690
  105,561,695
  105,561,709
  105,561,711
  105,561,716
  105,561,732
  105,561,754
  105,561,763
  105,561,779
  105,561,783
  105,561,799
  105,561,805
  105,561,810
  105,561,815
  105,561,831
  105,561,844
  105,561,848
  105,561,853
  105,561,863
  105,561,872
  105,561,875
  105,561,891
  105,561,901
  105,561,941
  105,561,951
  105,561,958
  105,561,967
  105,561,985
  105,561,992
  105,562,017
  105,562,060
  105,562,096
  105,562,102
  105,562,112
  105,562,123
  105,562,129
  105,562,135
  105,562,159
  105,562,169
  105,562,186
  105,562,194
  105,562,212
  105,562,242
  105,562,251
  105,562,256
  105,562,268
  105,562,286
  105,562,293
  105,562,302
  105,562,316
  105,562,324
  105,562,332
  105,562,359
  105,562,368
  105,562,381
  105,562,397
  105,562,403
  105,562,421
  105,562,424
  105,562,432
  105,562,441
  105,562,454
  105,562,458
  105,563,282
  105,563,316
  105,563,321
  105,563,360
  105,563,367
  105,563,386
  105,563,404
  105,563,423
  105,563,454
  105,563,455
  105,563,462
  105,563,472
  105,563,500
  105,563,519
  105,563,532
  105,563,558
  105,563,563
  105,563,574
  105,563,582
  105,563,585
  105,563,600
  105,563,601
  105,563,603
  105,563,611
  105,563,616
  105,563,635
  105,563,651
  105,565,492
  105,566,971
  105,567,588
  105,569,401
  105,571,315
  105,572,698
  105,574,596
  105,575,328
  105,576,866
  105,577,011
  105,577,583
  105,577,644
  105,577,649
  105,577,650
  105,577,761
  105,577,908
  105,578,149
  105,578,227
  105,578,775
  105,579,562
  105,580,614
  105,581,489
  105,581,534
  105,581,584
  105,581,588
  105,581,590
  105,581,631
  105,581,649
  105,581,972
  105,582,086
  105,582,610
  105,582,792
  105,582,847
  105,582,911
  105,582,951
  105,583,002
  105,583,670
  105,583,711
  105,583,855
  105,583,895
  105,584,086
  105,584,095
  105,584,193
  105,584,337
  105,584,457
  105,584,577
  105,584,872
  105,585,150
  105,585,505
  105,587,665
  105,588,244
  105,588,345
  105,588,767
  105,588,769
  105,588,940
  105,589,501
  105,590,096
  105,590,467
  105,590,824
  105,590,940
  105,591,048
  105,592,310
  105,592,703
  105,592,704
  105,592,772
-
T
C
T
11
G
-
G
T
C
T
A
G
G/T
G
C
G
G
T/G
G/A
A/T
T/C
T/C
T/C
G/-
G/C
G/A
C/A
C/A
T/G
T/C
A/C
A/G
A/-
G/T
A/G
A/G
C/T
T/C
G/A
T/-
C/A
A
A/T
C/A
C
C
C/T
G/A
C/T
C/T
T
C
G
C
A
C
C
A
C
T
A
A
T
G
A
T
C
C
T
G
C
A
T
-
A
A
C
T
T
-
A
G
A
C
G
C
T
G
G
G
C
G
T/C
G/C
-
T
A
T
T
T
G
T
C
2
A
G
C
T
T
G
G
C
C
A
C
7
C
A
C
C
G
G
A
4
C
A
C
T
A
T
G
G
C
A
T/-
-
C
A
-
G
C
-
G
A
A
C
C
A
A
A
C
T
G
T
C
C
-
C
C
A
15
-
-
C
G
C
A
-
C
G
C
T
G
T
C
C
G
C
T
G
G
T
G
2
C
C
A
-
C
C
C
C
A
-
C
G
C
-
14
T
G
C
T
A
A
A
T
A
A
G
C
T
A
C
G
G
G
T
G
A
C
A
C
T
-
A
C
G
A
T
A
A
A
A
A
G
A
C
A
-
A
T
C
G
-
A
C
T/A
C
T
C
G
G
A
A
C
A
C
C
C
-
C
G
C
-
G
-
G
-
-
-
-
-
A
-
-
G
A
G
-
A
A
-
-
A
G
-
-
T
-
-
-
G
-
-
-
-
T
T
G
-
-
T
G
-
-
G
T
G
T
-
-
G
-
-
-
-
-
T
-
-
-
-
-
-
-
-
T
-
-
-
-
T
-
-
G
A
A
T
T
G
-
-
-
G
2
T
-
-
-
-
-
-
G
T
-
2
-
-
-
-
-
-
-
-
C
-
-
T
-
-
-
-
-
-
-
-
-
T
-
A
C
-
C
-
-
-
A
C
G
-
-
T
A
-
T
-
G
-
T
T
T
-
-
-
G
-
T
A
C
G
C
C
T
A
G
G
A
A
T
G
C
T
G
A
G
A
C/G
G/A
G/A
G/T
T/C
G/A
A/T
G
G
2
T
C
T
G
A
G
A
C
G
C
G
C
C
T
-
A
A
G
A
G
A
C
-
A
-
T
T
T
C
A
T
C
A
T