Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 29,468 (bp)   Positions: 601
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.003
.006
.005
.022
.034
.034
.0
.0
.0
.054
.005
.004
.003
.009
.0
.001
.003
.0
.007
.001
.068
.0
.001
.003
.003
.012
.001
.041
.006
.266
.007
.036
.011
.02
.038
.13
.278
.031
.003
.006
.046
.0
.01
.007
.002
.003
.002
.191
.014
.004
.005
.063
.001
.0
.018
.002
.007
.012
.0
.002
.014
.0
.001
.0
.995
.004
.0
.0
.0
.002
.001
.004
.0
.001
.005
.01
.02
.015
.002
.032
.001
.002
.008
.01
.043
.108
.228
.794
.902
.85
.096
.045
.02
.009
.035
.035
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.014
.024
.028
.481
.45
.006
.017
.014
.003
.009
.009
.007
.005
.028
.033
.001
.001
.002
.001
.345
.396
.683
.691
.515
.506
.036
.039
.026
.028
.007
.058
.012
.003
.001
.003
.01
.02
.263
.242
.225
.236
.147
.136
.346
.055
.048
.039
.066
.015
.038
.037
.006
.285
.445
.43
.958
.257
.0
1.0
1.0
.042
.998
.0
.015
.0
.0
.052
.002
.0
.0
.0
.002
.007
.0
.001
.001
.001
.0
.0
.004
.005
.024
.001
.001
.0
.0
.002
.0
.0
.001
.002
.003
.0
.001
.008
.018
.003
.003
.001
.003
.0
.006
.008
.021
.001
.001
.024
.263
.026
.0
.012
.0
.034
.98
.009
.0
.001
.0
.006
.0
.001
.001
.0
.008
.055
.103
.024
.011
.0
.007
.095
.007
.103
.336
.254
.049
.02
.012
.117
.117
.0
.007
.0
.029
.855
.998
.0
.0
.0
.001
.002
.0
.018
.0
.001
.002
.0
.0
.017
.096
.002
.0
.0
.0
.0
.0
.011
.006
.036
.003
.001
.001
.0
.0
.0
.0
.003
.0
.02
.01
.054
.014
.035
.003
.018
.003
.029
.043
.001
.025
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.044
.009
.007
.032
.014
.005
.0
.005
.001
.0
.043
.975
.009
.202
1.0
.006
.002
.0
.0
.0
.007
.0
.113
.012
.0
.0
.351
.994
.979
.001
.012
.997
.888
.808
.747
.551
.942
.981
.867
.079
.044
.013
.001
.0
.002
.009
.002
.005
.001
.0
.002
.0
.002
.0
.0
.0
.001
.034
.013
.002
.0
.002
.001
.001
.005
.011
.003
.001
.001
.0
.009
.005
.007
.003
.005
.061
.052
.033
.04
.05
.079
.076
.048
.051
.016
.013
.022
.021
.001
.0
.01
.0
.001
.141
.048
.0
.0
.001
.001
.0
.0
.001
.013
.137
.0
.0
.068
.002
.001
.0
.0
.001
.0
.0
.002
.0
.0
.0
.001
.005
.001
.0
.001
.0
.003
.0
.001
.001
.002
.001
.002
.0
.021
.001
.0
.001
.0
.0
.001
.011
.003
.006
.002
--
--
--
--
.012
.003
.002
.003
.003
.003
.003
.011
.006
.336
.001
.006
.001
.001
.0
.002
.0
.134
.01
.001
.0
.0
.0
.001
.006
.498
.985
.005
1.0
.991
.017
.0
.0
.0
.008
.008
.0
.0
.004
.022
.021
.0
.002
.0
.002
.001
.006
.148
.282
.0
.0
.001
.001
.0
.0
.0
.0
.002
.0
.0
.002
.001
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.0
1.0
.104
.951
.001
.001
.001
.003
.166
.0
.001
.002
.038
.01
.0
.136
.021
.017
.193
.007
.022
.0
.003
.0
.0
.0
.002
.877
.02
.133
.003
.004
.025
.0
.0
.0
.0
.273
.06
.0
.0
.0
.001
.024
.001
.0
.007
--
--
.0
.001
.094
.0
.001
.008
.055
.05
.005
.006
.084
.008
.003
.105
.062
.222
.009
.116
.005
.011
.059
.01
.015
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
Acsm5
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
C
A
C
G
A
G
A
A
C
C
A
G
T
G
G
C
A
A
T
G
G
C
C
A
T
G
C
T
A
T
G
A
C
G
C
T
C
A
G
G
A
C
G
A
C
T
G
C
C
A
G
C
A
G
T
C
C
T
G
A
G
T
T
G
G
G
C
C
G
G
C
A
C
G
A
G
C
G
G
A
A
A
T
G
C
T
C
G
C
A
A
G
C
C
A
T
C
T
C
A
A
C
A
C
A
C
C
C
A
C
C
C
T
C
A
A
C
C
C
A
A
A
C
G
T
C
G
A
C
A
G
A
T
C
T
G
C
G
C
A
C
A
A
C
A
C
C
T
C
C
G
C
C
T
G
A
A
T
G
T
T
A
C
G
T
G
T
T
T
A
C
A
A
C
G
A
A
A
G
G
A
T
T
T
C
G
A
G
G
G
G
G
A
A
A
C
T
C
C
G
A
G
C
T
T
A
C
T
T
G
T
G
T
G
T
G
T
T
G
G
C
C
A
G
C
C
A
C
C
G
A
A
A
A
G
C
C
C
C
C
G
A
A
C
G
G
T
C
G
G
T
T
C
C
G
G
C
T
G
G
G
G
C
C
C
A
T
T
T
A
T
T
A
T
G
T
T
G
G
C
T
C
G
A
T
A
C
A
A
G
C
C
A
T
G
T
C
A
C
A
A
T
G
C
T
T
C
C
C
C
T
A
T
G
A
C
C
A
G
C
G
A
T
C
A
A
T
T
A
C
T
A
C
C
C
T
C
T
G
T
C
A
C
C
G
C
C
A
T
G
A
C
A
A
A
T
A
G
A
T
A
C
C
G
T
A
T
A
T
T
T
C
A
A
T
T
C
A
C
G
T
T
A
T
T
A
C
T
A
G
C
C
G
A
C
A
T
A
A
T
T
A
C
A
A
G
A
T
A
T
A
A
A
A
T
C
G
C
T
C
C
C
A
T
C
T
T
A
T
A
T
A
T
A
C
A
G
C
C
G
C
T
T
T
G
G
A
C
T
G
G
G
A
G
T
G
C
C
G
T
T
C
A
A
C
T
T
G
G
C
T
A
G
A
A
A
T
T
C
A
G
G
G
T
C
A
G
T
A
C
C
T
C
A
G
C
A
G
T
G
G
T
C
A
C
G
C
C
A
T
C
G
G
C
T
C
A
T
T
G
T
C
T
A
A
G
T
G
G
C
A
C
C
C
C
A
C
G
C
C
T
G
C
G
C
G
C
G
C
A
C
A
A
T
T
C
G
C
A
A
A
T
A
G
G
G
T
C
A
A
C
A
T
C
G
A
C
T
T
C
G
G
A
C
G
C
A
T
C
T
C
C
A
C
C
C
A
G
T
G
  189,240,989
  189,240,999
  189,241,175
  189,241,199
  189,241,223
  189,241,229
  189,241,553
  189,241,559
  189,241,595
  189,241,657
  189,241,679
  189,241,680
  189,241,695
  189,241,710
  189,241,756
  189,241,795
  189,241,837
  189,241,948
  189,241,958
  189,242,042
  189,242,043
  189,242,056
  189,242,188
  189,242,204
  189,242,251
  189,242,254
  189,242,265
  189,242,329
  189,242,461
  189,242,504
  189,242,531
  189,242,548
  189,242,645
  189,242,664
  189,242,682
  189,242,698
  189,242,759
  189,242,777
  189,242,883
  189,242,886
  189,242,897
  189,242,919
  189,242,996
  189,243,006
  189,243,034
  189,243,070
  189,243,074
  189,243,097
  189,243,150
  189,243,169
  189,243,170
  189,243,187
  189,243,210
  189,243,217
  189,243,314
  189,243,355
  189,243,402
  189,243,430
  189,243,490
  189,243,506
  189,243,541
  189,243,565
  189,243,576
  189,243,684
  189,243,914
  189,243,991
  189,244,146
  189,244,194
  189,244,196
  189,244,199
  189,244,203
  189,244,206
  189,244,215
  189,244,252
  189,244,259
  189,244,303
  189,244,309
  189,244,377
  189,244,384
  189,244,392
  189,244,489
  189,244,490
  189,244,532
  189,244,556
  189,244,562
  189,244,590
  189,244,627
  189,244,723
  189,244,736
  189,244,757
  189,244,837
  189,244,851
  189,244,911
  189,244,913
  189,244,924
  189,244,932
  189,244,958
  189,245,000
  189,245,042
  189,245,051
  189,245,052
  189,245,060
  189,245,084
  189,245,085
  189,245,100
  189,245,110
  189,245,124
  189,245,146
  189,245,205
  189,245,206
  189,245,253
  189,245,286
  189,245,324
  189,245,380
  189,245,408
  189,245,409
  189,245,502
  189,245,548
  189,245,580
  189,245,585
  189,245,644
  189,245,648
  189,245,659
  189,245,675
  189,245,696
  189,245,706
  189,245,715
  189,245,720
  189,245,722
  189,245,738
  189,245,917
  189,245,924
  189,245,971
  189,246,006
  189,246,032
  189,246,036
  189,246,085
  189,246,094
  189,246,106
  189,246,116
  189,246,125
  189,246,130
  189,246,141
  189,246,156
  189,246,240
  189,246,242
  189,246,298
  189,246,343
  189,246,356
  189,246,388
  189,246,398
  189,246,404
  189,246,424
  189,246,431
  189,246,465
  189,246,469
  189,246,480
  189,246,501
  189,246,512
  189,246,515
  189,246,616
  189,246,674
  189,246,714
  189,246,745
  189,246,765
  189,246,806
  189,246,831
  189,246,840
  189,246,907
  189,246,934
  189,246,943
  189,246,944
  189,247,025
  189,247,066
  189,247,083
  189,247,150
  189,247,161
  189,247,176
  189,247,282
  189,247,321
  189,247,361
  189,247,364
  189,247,366
  189,247,406
  189,247,416
  189,247,428
  189,247,430
  189,247,452
  189,247,454
  189,247,462
  189,247,471
  189,247,485
  189,247,517
  189,247,571
  189,247,603
  189,247,612
  189,247,631
  189,247,667
  189,247,683
  189,247,688
  189,247,711
  189,247,714
  189,247,717
  189,247,727
  189,247,762
  189,247,774
  189,247,948
  189,247,965
  189,247,974
  189,247,990
  189,247,997
  189,248,006
  189,248,037
  189,248,057
  189,248,058
  189,248,120
  189,248,121
  189,248,139
  189,248,219
  189,248,220
  189,248,238
  189,248,262
  189,248,263
  189,248,281
  189,248,305
  189,248,310
  189,248,327
  189,248,343
  189,248,364
  189,248,410
  189,248,439
  189,248,460
  189,248,523
  189,248,526
  189,248,533
  189,248,543
  189,248,604
  189,248,607
  189,248,610
  189,248,635
  189,248,653
  189,248,656
  189,248,672
  189,248,675
  189,248,682
  189,248,696
  189,248,708
  189,248,734
  189,248,753
  189,248,811
  189,248,890
  189,248,897
  189,248,961
  189,248,985
  189,248,986
  189,249,029
  189,249,135
  189,249,186
  189,249,210
  189,249,379
  189,249,628
  189,249,650
  189,249,653
  189,249,723
  189,249,828
  189,249,842
  189,249,843
  189,249,929
  189,249,939
  189,250,018
  189,250,071
  189,250,072
  189,250,084
  189,250,085
  189,250,122
  189,250,136
  189,250,146
  189,250,153
  189,250,156
  189,250,162
  189,250,165
  189,250,176
  189,250,204
  189,250,219
  189,250,317
  189,250,327
  189,250,387
  189,250,389
  189,250,421
  189,250,432
  189,250,457
  189,250,603
  189,250,605
  189,250,608
  189,250,614
  189,250,644
  189,250,681
  189,250,696
  189,250,707
  189,250,710
  189,250,719
  189,250,779
  189,250,817
  189,250,840
  189,250,850
  189,250,862
  189,250,868
  189,250,875
  189,250,942
  189,250,948
  189,250,968
  189,250,972
  189,250,989
  189,251,098
  189,251,103
  189,251,205
  189,251,218
  189,251,308
  189,251,335
  189,251,356
  189,251,429
  189,251,484
  189,251,541
  189,251,579
  189,251,602
  189,251,626
  189,251,659
  189,251,715
  189,251,784
  189,251,850
  189,251,870
  189,251,872
  189,251,875
  189,251,895
  189,251,944
  189,251,974
  189,251,996
  189,252,001
  189,252,066
  189,252,099
  189,252,102
  189,252,109
  189,252,118
  189,252,121
  189,252,184
  189,252,203
  189,252,235
  189,252,236
  189,252,256
  189,252,264
  189,252,270
  189,252,283
  189,252,293
  189,252,294
  189,252,434
  189,252,522
  189,252,550
  189,252,551
  189,252,560
  189,252,584
  189,252,612
  189,252,615
  189,252,631
  189,252,634
  189,252,642
  189,252,657
  189,252,663
  189,252,684
  189,252,772
  189,252,782
  189,252,801
  189,252,859
  189,252,893
  189,252,894
  189,252,899
  189,252,901
  189,252,941
  189,253,011
  189,253,013
  189,253,025
  189,253,027
  189,253,097
  189,253,201
  189,253,209
  189,253,234
  189,253,258
  189,253,281
  189,253,301
  189,253,323
  189,253,331
  189,253,344
  189,253,345
  189,253,349
  189,253,380
  189,253,395
  189,253,397
  189,253,417
  189,253,445
  189,253,446
  189,253,490
  189,253,503
  189,253,514
  189,253,624
  189,253,653
  189,253,680
  189,253,686
  189,253,733
  189,253,755
  189,253,761
  189,253,773
  189,253,812
  189,253,834
  189,253,843
  189,253,867
  189,253,911
  189,253,932
  189,253,968
  189,253,988
  189,254,008
  189,254,108
  189,254,111
  189,254,139
  189,254,144
  189,254,146
  189,254,179
  189,254,183
  189,254,213
  189,254,229
  189,254,241
  189,254,366
  189,254,411
  189,254,421
  189,254,474
  189,254,492
  189,254,494
  189,254,536
  189,254,537
  189,254,547
  189,254,569
  189,254,648
  189,254,682
  189,254,726
  189,254,789
  189,254,791
  189,254,794
  189,254,832
  189,254,856
  189,254,914
  189,254,964
  189,254,968
  189,255,008
  189,255,058
  189,255,069
  189,255,112
  189,255,115
  189,255,162
  189,255,179
  189,255,187
  189,255,197
  189,255,209
  189,258,733
  189,258,764
  189,258,784
  189,258,786
  189,258,815
  189,258,817
  189,258,820
  189,258,829
  189,258,832
  189,258,857
  189,258,889
  189,258,905
  189,258,908
  189,258,911
  189,258,914
  189,258,923
  189,258,925
  189,258,970
  189,258,971
  189,258,985
  189,258,998
  189,259,023
  189,259,030
  189,259,031
  189,259,033
  189,259,049
  189,259,076
  189,259,086
  189,259,107
  189,259,149
  189,259,213
  189,259,223
  189,259,236
  189,259,240
  189,259,273
  189,259,307
  189,259,316
  189,259,317
  189,259,324
  189,259,452
  189,259,456
  189,259,504
  189,259,506
  189,259,541
  189,259,559
  189,259,570
  189,259,579
  189,259,580
  189,259,587
  189,259,627
  189,259,652
  189,259,678
  189,259,687
  189,259,690
  189,259,697
  189,259,705
  189,259,715
  189,259,761
  189,259,779
  189,259,786
  189,259,803
  189,259,804
  189,259,828
  189,259,833
  189,259,844
  189,259,852
  189,259,889
  189,259,995
  189,260,085
  189,260,090
  189,260,117
  189,260,128
  189,260,193
  189,260,241
  189,260,245
  189,260,274
  189,260,275
  189,260,342
  189,260,410
  189,260,475
  189,260,542
  189,260,647
  189,260,763
  189,260,776
  189,261,215
  189,261,480
  189,261,788
  189,261,887
  189,261,951
  189,262,026
  189,262,069
  189,262,126
  189,262,189
  189,262,203
  189,262,219
  189,262,270
  189,262,301
  189,262,458
  189,262,469
  189,262,846
  189,262,903
  189,263,002
  189,263,041
  189,263,045
  189,263,175
  189,263,208
  189,263,491
  189,263,953
  189,264,369
  189,264,379
  189,264,382
  189,264,398
  189,264,399
  189,264,766
  189,264,841
  189,265,013
  189,267,248
  189,267,316
  189,267,621
  189,267,644
  189,267,866
  189,267,920
  189,268,245
  189,268,406
  189,268,471
  189,268,567
  189,268,596
  189,268,598
  189,268,672
  189,268,827
  189,268,847
  189,268,908
  189,269,770
  189,269,827
  189,269,858
  189,269,920
  189,269,991
  189,270,248
  189,270,351
  189,270,374
  189,270,400
G
T
T
T
A
G
A
G
G
G
T
G
T
C
T
T
T
T
C
C
A
C
T
T
C
C
A
T
C
G
G
A
G
G
T
T
C
T
G
C
T
G
T
C
G
G
C
A
T
T
G
C
T
G
A
C
T
T
A
A
G
A
C
A
A
C
A
T
T
A
A
T
G
T
A
C
A
T
A
A
G
T
G
G
A
T
C
T
A
T
G
G
A
T
A
G
A
A
C
T
G
C
T
T
A
G
T
T
T
G
T
T
T
C
T
G
G
T
T
T
G
T
C
T
A
C
A
A
T
T
G
A
G
A
T
G
T
T
A
T
G
A
G
T
T
C
T
T
C
A
T
A
T
G
C
T
C
G
C
A
C
C
C
T
C
G
A
C
C
C
T
T
T
T
T
A
G
G
G
A
T
G
C
C
A
T
A
G
A
A
A
T
A
G
G
T
T
C
T
T
A
G
A
T
C
C
G
G
A
C
T
C
A
C
A
C
A
C
C
A
A
T
G
G
A
T
T
G
A
A
A
G
G
G
T
A
T
T
T
T
A
A
G
T
A
A
A
C
T
A
A
C
C
T
T
T
T
A
A
A
A
C
A
A
T
G
G
C
A
C
G
C
G
G
C
A
C
C
A
A
T
C
G
A
G
A
T
T
C
C
A
T
A
G
C
A
A
A
T
T
G
T
C
A
T
C
C
G
T
G
G
G
G
C
A
G
T
T
C
A
T
A
G
C
G
G
G
C
G
T
T
C
G
T
T
T
G
A
C
A
G
T
G
T
A
A
T
A
G
G
C
G
T
G
T
G
G
G
A
G
C
G
T
T
T
C
G
C
G
C
C
C
T
G
G
C
C
T
G
T
T
G
C
T
G
G
T
A
C
G
T
T
A
A
G
T
G
C
C
T
G
C
G
T
G
G
A
G
C
C
C
T
T
G
C
C
T
T
A
C
T
T
G
G
C
A
C
C
G
A
G
C
T
A
G
G
T
C
T
T
T
T
C
C
A
A
A
G
G
C
A
C
A
G
A
C
C
T
A
C
C
C
T
G
C
T
C
C
T
A
T
A
G
T
G
G
G
A
G
A
G
C
A
A
C
A
G
A
C
C
A
T
C
T
C
A
T
G
T
C
A
A
A
T
G
G
A
T
T
G
C
G
C
A
T
C
T
T
A
C
A
C
G
G
G
G
A
A
A
A
T
G
T
A
T
T
G
T
A
T
T
A
C
T
A
T
T
T
A
A
G
G
G
G
C
C
T
C
T
G
C
G
C
G
A
A
C
C
T
G
T
T
G
C
T
A
G
T
C
A
A
A
A
T
T
A
A
T
C
T
G
T
T
T
T
A
T
G
A
C
A