Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 189,220 (bp)   Positions: 303
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.0
.0
.0
.005
.001
.006
.023
.015
.01
.037
.0
.001
.001
.193
.0
.109
.003
.007
.734
.0
.029
.902
.845
.03
.006
.003
.251
.24
.13
.034
.011
.002
.087
.007
.0
.0
.0
.001
.025
.0
.037
.0
.134
.0
.948
.001
.0
.003
.011
.011
.022
.004
.003
.264
.034
.0
.007
.084
.0
.024
.121
.003
.003
.002
.014
.007
.003
.0
.992
.022
.0
1.0
.033
.007
.0
.006
.001
.001
.003
.156
.0
.0
.001
.686
.014
.028
.004
.0
.0
.002
.004
.019
.016
.001
.061
.002
.0
.002
.001
.0
.001
.0
.012
.005
--
.001
--
.023
.007
.032
.026
.012
.001
.036
.027
.032
.001
.0
.007
--
.224
.0
.001
.0
.0
.001
.007
.662
.0
.0
.373
.209
.004
.005
.005
.001
.012
.001
.0
.037
.001
.002
.0
.188
.004
.001
.025
.34
.0
.0
.0
.001
.0
.026
.999
.003
.0
.001
.025
.008
.255
.002
.971
.357
.826
.208
.248
.034
.052
.191
.201
.089
.001
--
.0
.001
.015
.009
.045
.116
.0
.002
--
.007
.007
.0
.017
.005
.013
.003
.032
.0
.002
.001
.003
.003
.0
.001
.0
.0
.003
.002
.0
.012
.0
.0
.006
.0
.0
.016
.0
.002
.243
.637
.12
.11
.107
.003
--
.0
.0
.014
.0
.002
.014
.004
.0
.0
.0
.0
.784
.004
.007
.001
.003
.0
.001
.0
.001
.624
.002
.001
.005
.0
.002
.0
.002
.0
.153
.111
.0
.0
.0
.0
.155
.006
.079
.044
.083
.01
.008
.001
.001
.011
.001
.0
.0
.002
.004
.009
.002
.023
.002
.055
.002
.068
.273
.001
.464
.001
.002
.002
.0
.015
.0
.018
.975
.068
.091
.007
.001
.002
.029
.007
.001
.004
.001
.0
.0
.006
.003
.003
.023
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
Ablim1
A
T
G
G
T
G
T
T
C
T
A
C
C
A
T
T
A
G
T
T
T
G
A
A
C
T
T
G
C
T
C
A
A
C
A
C
A
T
C
T
T
C
A
C
C
G
A
T
T
T
T
G
G
C
C
G
A
C
C
C
C
T
A
C
C
G
A
C
T
T
A
T
T
A
G
A
T
A
C
G
A
G
G
C
G
G
A
C
T
C
C
A
G
T
T
G
A
A
C
G
C
G
C
G
A
G
C
C
G
G
T
A
G
G
G
T
A
A
A
G
A
A
T
T
C
A
A
C
T
T
A
C
T
A
A
A
G
T
G
C
A
G
C
G
T
T
C
A
T
T
A
A
T
A
G
C
C
T
T
A
A
T
A
G
G
G
G
G
G
G
A
G
A
C
T
T
C
C
C
A
C
T
C
G
A
T
A
A
A
G
C
A
G
A
C
T
C
A
C
T
C
C
C
C
T
T
C
G
T
G
G
T
C
A
A
G
T
T
C
C
T
C
C
C
T
A
C
A
C
A
T
T
G
G
C
A
C
T
C
A
G
A
C
A
C
G
G
T
C
A
A
C
A
C
C
G
C
T
G
A
A
G
C
A
C
C
C
C
C
C
T
T
G
C
T
A
C
C
A
G
T
C
T
A
G
T
A
C
T
T
G
G
C
C
A
G
A
T
T
G
C
C
C
  277,857,980
  277,859,165
  277,861,542
  277,861,644
  277,862,550
  277,862,651
  277,863,348
  277,863,463
  277,863,893
  277,864,198
  277,865,011
  277,866,052
  277,866,110
  277,866,338
  277,866,531
  277,866,586
  277,867,760
  277,868,213
  277,868,297
  277,868,532
  277,868,748
  277,868,967
  277,869,105
  277,869,317
  277,870,859
  277,871,550
  277,871,713
  277,871,714
  277,871,758
  277,874,285
  277,874,481
  277,875,773
  277,875,887
  277,876,450
  277,876,637
  277,876,867
  277,876,871
  277,877,120
  277,877,751
  277,877,786
  277,877,816
  277,877,925
  277,878,039
  277,878,421
  277,879,132
  277,879,792
  277,881,533
  277,882,560
  277,883,150
  277,883,442
  277,883,465
  277,885,388
  277,885,540
  277,886,200
  277,886,756
  277,886,932
  277,887,158
  277,888,114
  277,890,557
  277,891,002
  277,891,280
  277,892,088
  277,892,312
  277,893,324
  277,893,464
  277,893,929
  277,893,959
  277,894,098
  277,894,414
  277,895,198
  277,895,623
  277,896,196
  277,896,887
  277,897,199
  277,897,864
  277,900,011
  277,900,347
  277,900,570
  277,901,696
  277,903,074
  277,903,619
  277,904,179
  277,904,508
  277,907,159
  277,909,107
  277,911,946
  277,912,057
  277,912,766
  277,913,025
  277,918,644
  277,919,082
  277,919,799
  277,920,548
  277,921,129
  277,921,368
  277,921,585
  277,921,902
  277,924,479
  277,928,817
  277,928,932
  277,930,158
  277,930,832
  277,931,205
  277,931,371
  277,931,776
  277,932,241
  277,932,439
  277,932,555
  277,932,607
  277,932,696
  277,932,948
  277,933,051
  277,933,082
  277,933,111
  277,933,698
  277,933,699
  277,934,868
  277,935,036
  277,935,655
  277,935,989
  277,936,229
  277,936,371
  277,936,922
  277,937,488
  277,937,917
  277,938,044
  277,938,055
  277,939,129
  277,939,733
  277,939,824
  277,940,602
  277,941,760
  277,942,272
  277,942,350
  277,942,376
  277,943,131
  277,943,695
  277,944,261
  277,944,577
  277,944,661
  277,945,656
  277,945,808
  277,946,692
  277,946,807
  277,946,828
  277,947,281
  277,947,303
  277,947,479
  277,948,115
  277,950,905
  277,950,990
  277,951,780
  277,951,951
  277,953,295
  277,953,735
  277,954,072
  277,954,248
  277,954,369
  277,954,887
  277,954,922
  277,955,046
  277,955,178
  277,955,941
  277,956,612
  277,956,643
  277,956,657
  277,956,684
  277,956,790
  277,956,791
  277,956,814
  277,959,276
  277,959,682
  277,967,178
  277,972,450
  277,983,738
  277,990,840
  277,991,446
  277,991,876
  277,992,112
  277,992,155
  277,992,965
  277,994,273
  277,994,711
  277,997,166
  278,001,979
  278,002,184
  278,003,426
  278,003,754
  278,003,766
  278,003,936
  278,004,080
  278,004,229
  278,004,594
  278,004,718
  278,005,961
  278,006,010
  278,006,102
  278,006,106
  278,006,144
  278,006,267
  278,006,534
  278,006,629
  278,006,667
  278,006,945
  278,007,072
  278,007,569
  278,008,099
  278,008,261
  278,008,348
  278,008,439
  278,008,530
  278,008,602
  278,008,772
  278,008,839
  278,008,907
  278,008,937
  278,008,938
  278,009,316
  278,009,941
  278,010,369
  278,011,037
  278,012,054
  278,012,892
  278,012,928
  278,013,012
  278,013,068
  278,013,273
  278,013,358
  278,013,583
  278,014,205
  278,014,921
  278,015,802
  278,016,031
  278,016,035
  278,016,183
  278,016,549
  278,016,743
  278,017,291
  278,018,442
  278,019,046
  278,019,510
  278,019,622
  278,019,978
  278,020,045
  278,020,706
  278,021,773
  278,023,878
  278,024,058
  278,024,204
  278,024,365
  278,024,492
  278,024,529
  278,024,569
  278,024,704
  278,024,813
  278,024,825
  278,025,282
  278,025,303
  278,025,434
  278,025,472
  278,025,563
  278,025,621
  278,025,723
  278,026,028
  278,026,212
  278,026,493
  278,026,621
  278,026,744
  278,026,814
  278,026,835
  278,027,044
  278,027,362
  278,027,600
  278,027,630
  278,027,658
  278,028,559
  278,028,632
  278,029,501
  278,029,663
  278,031,009
  278,031,077
  278,031,148
  278,031,281
  278,032,210
  278,032,934
  278,033,059
  278,033,817
  278,034,692
  278,034,710
  278,034,820
  278,035,015
  278,035,856
  278,035,915
  278,037,238
  278,039,623
  278,039,857
  278,040,143
  278,040,160
  278,040,952
  278,040,975
  278,041,056
  278,041,149
  278,041,764
G
C
A
A
C
T
C
C
T
C
G
T
T
C
T/C
C
G
A
C
A
C
C
C
G
G
C
C
A
T
A
T
G
G
T
G
T
G
C
T
C
C
T
A/G
T
A
A
C
A
G
C
A
A
A
A
T
A
T
T
T
T
T
G
G
G
T
A
C
G
T/G
C
C
C
C
G
T
A/G
A
G
C/T
G/T
T
A
T
T
A
A
A/G
A
C
T
T
A/G
A
T/C
C
A
G
G
T
G/A
T
C
T
A
G
A
C/T
T
G/A
G/A
C
G
A
A
T
C
G
G
G
A
G
G
C
C
T
G
G
T
C
A
A/G
T
A
G
T
G
A
C
A
C/T
G
C
T
A
C
C
T
G
C
C
G
G
C
G
A
T
T
C
C
G
G
C
G
T
A
T
A
T
C
C
G
T
A/G
T
C
C
T
G
A
G
A
C
G
A
G
C
G
G
C
A
C/T
G
A
G
T
C
T
G
T
C
T
T
T
T
C
C
T
T
C
A
A
A
T
A/G
C
A
T/G
C
T
T
C
A
A
G
C
G
G
G
T
G
C
C
A
A
T
T
A
C
A
T
C
T
T
C
G
A
A
C
G
G
T
T
G
G
G
A
T
C
T
G
G
A
A
G
G
A
T
G
T
T
C
C
A
T
A
G
C/T
T
G
C
A
A
C
T
A
G
G
A
C
C
A
T
T
T
G
A
G
C
C
A
T
T
T