Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 178,881 (bp)   Positions: 339
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.023
.031
.346
.558
.543
.657
.007
.009
.013
.004
.511
.504
.053
.004
.008
.002
.211
.014
.013
.004
.008
.004
.016
.007
.001
.004
.072
--
--
--
.318
.004
.041
.089
.045
.063
.351
.209
.362
.084
.081
.06
.043
.008
.061
.082
.078
.027
.045
.02
.031
.193
.041
.01
.975
.57
.99
.942
.939
.997
.931
.664
1
.999
.862
.797
.989
1
.996
.973
1
.966
.023
.848
.098
.819
.045
.9
.844
.118
.124
.453
.994
.998
.715
.005
.998
.968
.961
.994
.974
.123
.996
.879
.996
.989
.991
.691
.529
.33
.759
.079
.133
.95
.678
.056
.083
.088
.03
.024
.176
.099
.099
.039
.019
.105
.24
.228
.227
.188
.197
.366
.438
.514
.487
.313
.275
.307
.012
.006
.023
.131
.313
.28
.338
.508
.047
.04
.12
.96
.995
.993
.999
.988
.994
.995
.214
.012
.056
.021
.001
.001
.171
0
0
.001
.012
.019
.032
.004
.122
.004
.002
.077
.066
.139
.167
.137
.422
.005
.725
.198
.009
.015
.024
.834
.403
.306
.089
.208
.047
.028
.043
.035
.301
.086
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
.989
.842
.186
.017
.006
.003
.007
.013
--
.009
.004
.049
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.011
.079
.014
.009
.002
.13
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.14
.006
--
--
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.171
.093
.096
.144
.218
.006
.008
.011
.002
.02
.001
.001
.045
.004
.002
.045
.021
.005
.001
.111
.14
.026
.214
.004
.022
.003
.072
.041
.016
.02
.199
.202
.004
.001
.013
.004
.008
.036
.247
.065
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
G
G
A
G
G
A
G
C
C
A
C
G
G
A
T
G
A
C
C
A
G
G
G
C
C
G
C
T
T
A
G
G
G
T
T
A
A
A
T
G
C
C
T
A
C
A
C
C
G
G
C
A
G
C
A
G
G
C
G
G
G
T
C
G
T
C
A
A
C
T
C
C
G
C
G
G
C
A
A
A
G
T
G
A
C
C
A
G
G
A
G
G
G
T
T
C
G
A
G
C
G
G
T
A
G
C
G
T
T
C
A
T
A
T
A
A
C
C
T
A
C
T
A
G
T
G
A
A
A
C
C
C
T
C
T
T
T
G
G
G
C
T
C
C
T
A
C
C
C
T
C
A
A
C
G
T
A
T
A
A
C
C
A
G
T
A
A
G
A
T
G
G
C
C
A
T
C
T
C
C
C
G
A
C
T
G
A
A
G
C
G
G
C
A
A
A
G
T
G
G
A
A
T
T
C
G
G
G
A
A
A
T
G
G
T
T
T
G
G
C
C
T
C
A
G
G
C
C
C
G
G
G
A
G
C
C
C
G
T
A
A
T
C
T
G
T
G
A
G
A
G
G
C
A
T
C
A
C
A
G
T
C
G
C
T
A
C
A
C
T
G
A
C
C
T
G
A
T
G
G
T
G
A
G
G
C
C
T
G
C
C
C
A
T
C
A
G
C
T
T
T
C
T
G
T
C
C
T
C
G
T
A
C
T
A
C
G
G
T
G
T
T
A
C
T
T
G
C
A
A
G
T
A
C
T
G
A
G
  5,572,442
  5,572,444
  5,572,457
  5,572,476
  5,572,486
  5,572,496
  5,572,657
  5,572,720
  5,572,727
  5,572,740
  5,572,862
  5,572,863
  5,573,005
  5,576,796
  5,576,798
  5,576,833
  5,596,825
  5,596,888
  5,596,993
  5,597,044
  5,597,047
  5,597,051
  5,597,059
  5,597,096
  5,597,152
  5,597,154
  5,597,435
  5,597,519
  5,597,575
  5,597,589
  5,597,670
  5,597,720
  5,599,587
  5,599,604
  5,601,296
  5,601,297
  5,601,305
  5,601,309
  5,601,383
  5,601,818
  5,601,864
  5,601,867
  5,601,873
  5,601,892
  5,601,966
  5,604,539
  5,604,540
  5,604,640
  5,604,680
  5,604,722
  5,604,723
  5,604,851
  5,605,264
  5,605,410
  5,605,418
  5,605,426
  5,605,474
  5,605,702
  5,605,707
  5,605,716
  5,605,718
  5,605,725
  5,605,751
  5,605,783
  5,605,806
  5,605,817
  5,605,825
  5,605,829
  5,605,837
  5,605,858
  5,605,870
  5,605,874
  5,605,911
  5,605,959
  5,605,971
  5,605,998
  5,606,013
  5,606,157
  5,606,185
  5,606,252
  5,606,499
  5,606,525
  5,606,539
  5,606,555
  5,606,587
  5,606,596
  5,606,636
  5,606,651
  5,606,709
  5,606,715
  5,606,726
  5,606,740
  5,606,762
  5,606,772
  5,606,811
  5,606,857
  5,606,885
  5,606,930
  5,606,939
  5,606,960
  5,606,985
  5,607,070
  5,607,075
  5,607,098
  5,607,158
  5,607,196
  5,607,208
  5,607,214
  5,607,221
  5,607,228
  5,607,294
  5,607,326
  5,607,334
  5,607,376
  5,607,390
  5,607,405
  5,607,445
  5,607,470
  5,607,471
  5,607,477
  5,607,483
  5,607,491
  5,607,515
  5,607,542
  5,607,545
  5,607,553
  5,607,571
  5,607,578
  5,607,606
  5,607,608
  5,607,615
  5,607,634
  5,607,642
  5,607,647
  5,607,653
  5,607,656
  5,607,693
  5,607,694
  5,607,737
  5,607,754
  5,607,776
  5,607,791
  5,607,801
  5,607,804
  5,607,809
  5,607,811
  5,607,867
  5,607,916
  5,607,925
  5,607,986
  5,607,992
  5,608,100
  5,608,151
  5,608,212
  5,608,236
  5,608,245
  5,608,366
  5,608,415
  5,608,482
  5,608,536
  5,608,783
  5,608,822
  5,608,846
  5,609,227
  5,609,252
  5,609,258
  5,609,259
  5,609,272
  5,609,411
  5,609,735
  5,609,811
  5,609,927
  5,609,988
  5,610,005
  5,610,011
  5,610,086
  5,610,109
  5,610,134
  5,610,176
  5,610,187
  5,610,376
  5,610,402
  5,610,821
  5,616,496
  5,616,592
  5,616,621
  5,616,700
  5,616,829
  5,616,924
  5,616,937
  5,616,946
  5,616,950
  5,616,976
  5,616,982
  5,617,140
  5,618,459
  5,618,489
  5,618,579
  5,619,312
  5,619,346
  5,619,352
  5,619,428
  5,620,408
  5,620,607
  5,621,225
  5,621,480
  5,621,497
  5,621,549
  5,621,666
  5,621,777
  5,621,824
  5,621,828
  5,621,839
  5,621,879
  5,621,896
  5,621,903
  5,621,907
  5,621,914
  5,621,924
  5,623,757
  5,623,786
  5,624,693
  5,625,494
  5,626,226
  5,626,419
  5,626,698
  5,626,811
  5,627,433
  5,628,459
  5,628,834
  5,628,866
  5,629,098
  5,630,063
  5,630,648
  5,631,060
  5,632,241
  5,632,276
  5,632,384
  5,633,796
  5,633,847
  5,633,849
  5,634,145
  5,634,204
  5,634,395
  5,634,396
  5,634,456
  5,647,336
  5,647,354
  5,647,419
  5,647,515
  5,647,563
  5,647,608
  5,649,450
  5,649,490
  5,649,760
  5,649,798
  5,650,549
  5,675,705
  5,675,754
  5,675,758
  5,675,765
  5,675,769
  5,675,786
  5,675,812
  5,675,816
  5,675,835
  5,675,870
  5,675,919
  5,675,928
  5,675,967
  5,675,969
  5,675,994
  5,675,996
  5,676,015
  5,676,017
  5,701,379
  5,701,391
  5,701,392
  5,701,401
  5,701,415
  5,701,535
  5,701,549
  5,701,558
  5,701,581
  5,701,627
  5,701,680
  5,701,684
  5,701,747
  5,701,752
  5,701,760
  5,701,808
  5,701,990
  5,701,996
  5,702,006
  5,702,035
  5,702,057
  5,702,254
  5,702,260
  5,702,295
  5,702,321
  5,702,382
  5,702,555
  5,702,561
  5,702,568
  5,702,582
  5,702,600
  5,702,602
  5,702,637
  5,702,707
  5,702,904
  5,702,944
  5,702,963
  5,703,237
  5,703,287
  5,703,319
  5,703,446
  5,703,447
  5,703,594
  5,703,662
  5,703,696
  5,703,720
  5,703,810
  5,703,828
  5,703,889
  5,703,913
  5,703,932
  5,703,955
  5,703,958
  5,704,014
  5,732,948
  5,744,088
  5,744,334
  5,744,376
  5,745,469
  5,745,491
  5,746,007
  5,746,025
  5,746,042
  5,746,735
C/G
C/G
A
G/A
A/G
T/G
T/A
A/G
T/C
A
G/A
G/C
A/G
A
G
C
T
T
A
T/C
G/A
C/G
A/G
T/G
G
G
A
T
C
C
G/A
T/G
A
A
C
C
G
G
T
C
A/G
T/C
T/C
G/T
T/A
T/C
G
T/C
T/C
T/G
A/G
T/C
C
A
T/C
T
T/G
T
T
T
A
A/G
C/T
T/C
A
C
G
G
G
T/C
C/T
T/C
T/C
C/G
T/C
A/G
A/G
G
T
G
G
A/G
A/T
A/G
C/A
A/C
T/C
G
A/G
A/G
G
T/G
A/G
T/G
C
C
G/C
A/G
T/A
A/G
T/C
T/G
A
C/T
G/A
A/G
T/C
A/G
C
C/T
G/C
G/A
C/T
G/A
A/T
G/A
G/A
T/C
G/C
C/T
T/A
T/C
A/T
T/A
A/G
C/T
A/G
T/A
T/A
G
T/C
T/C
A/C
A/T
T/C
A/T
C/T
G/T
A/G
T/G
C/G
T/C
C/T
G/C
A/C
C
T/A
T/C
T/C
A/C
A/T
T
C
C
G
A/G
C
C
G
G
G
T
T
G
C
C
G
T
C
T
C
A/G
C
G
T
C/A
C/T
A
A
G
T
A
C
G
A
C
T
G
T/A
C/G
T/C
A/G
A/G
A/C
C
G
G
T/G
C
C
T
G
G
C
A
A
A
C
A
G
G/A
C/A
C/T
A/G
A/G
A/T
A/T
G/T
T/G
A
G
T
C
T/C
C
A/G
A/G
T
T
T/C
A/G
A/G
C
T
T
T/C
T/C
T/C
T
C
G
G/A
G
A/C
G/T
T/G
A
A/G
G/A
A/G
G
T
A
G
C
G
T
G/A
T/C
G/A
A/G
C
T/C
A/G
T/C
C/T
G/A
T/C
C/A
A/C
A/T
C/G
G/A
T/C
T/C
G/T
C/G
T/A
A
T/G
T/G
G/T
A/G
G/A
A/G
A/G
A/C
A/C
A/T
C/G
A/C
T/C
T/C
T/A
G/T
G/C
C/A
T/G
A/C
A/T
G/T
C/T
G/C
C/T
A/G
C/T
T/C
T/C
C/T
T
A/G
C
G
T/C
C/T
G/A
T/C
A/G
A/G
C/T
A/G
C/T
G/T
G/A
T/C
G
G/T
A/G
A/C
G/A
T
C
C
T
T
C
T
G
A