Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_6.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 56,931 (bp)   Positions: 492
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 6.0  
.001
.104
.001
.012
1.0
.0
.567
.424
.403
.394
.185
.031
.017
--
--
.001
.012
.002
.008
.002
.001
.013
.003
.087
--
--
.015
.02
.0
.001
.006
.005
.001
.003
.0
.02
.0
.0
.045
.0
.0
.006
.001
.0
.073
--
.007
.001
.051
.036
.049
.009
.002
.001
.002
.011
.005
.061
.023
.0
.0
.01
.0
.022
.001
.003
.008
.016
.037
.0
.013
.548
.996
.002
.001
.029
.0
.0
.0
.006
.0
.0
.009
.0
.0
.001
.0
.0
.001
.003
.0
.007
.018
.346
.049
.002
.057
.051
.0
.001
.026
.233
.006
.039
.004
.222
.001
.0
.0
.004
.087
.009
.0
.0
.038
.006
.0
.004
.002
.007
.026
.014
.014
.01
.039
.003
.017
.014
.159
.14
.003
.002
.003
.182
.154
.124
.136
.008
.003
.032
.151
.008
.012
.004
.005
.004
.002
.013
.099
.094
.013
.022
.01
.012
.018
.565
.91
.963
.93
.734
.508
.352
.057
.02
.002
.006
.003
.003
--
--
.018
.063
.039
.003
.006
.017
.049
.065
.008
.002
.0
.002
.004
.02
.016
.05
.136
.408
.5
.006
.002
.004
.012
.001
.044
.0
.001
.024
.085
.001
.005
.0
.512
.998
.0
.0
.011
.002
.004
.577
.0
.034
.006
.002
.006
--
.0
.001
.0
.001
.005
.009
.01
.008
.005
.024
.038
.012
.143
.158
.08
.055
.037
.007
.002
.009
.01
.018
.012
.069
.052
.017
.156
.679
.361
.033
.001
.002
.008
.002
.006
.055
.035
.018
.001
.002
.004
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.007
.003
.0
1.0
.004
.0
.002
.002
.001
.009
.0
.002
.002
.0
.001
.006
.004
.009
.016
.002
.0
.004
.005
.01
.006
.084
.16
.065
.093
.011
.008
.011
.02
--
--
--
--
--
--
--
.031
.029
.037
.002
.001
.02
.002
.006
.026
.039
.0
.002
.001
.025
.008
.001
.001
.001
.007
.023
.034
.0
.0
.013
.008
.005
.001
.011
.064
.001
.064
.004
.002
.002
.003
.001
.001
.001
.003
.005
.042
.081
.102
.102
.095
.003
.0
.0
.257
.003
.0
1.0
.005
.137
.035
.029
.001
.001
.053
.027
.0
.022
.103
.05
.038
.004
.092
.005
.019
.021
.0
.0
.0
.002
.478
.009
.0
.001
.0
.0
.001
.001
.001
.053
.062
.002
.0
.026
.0
.003
.009
.002
.004
.029
.006
.064
.005
.001
.002
.019
.032
.003
.009
.001
.001
.007
.0
.0
.006
.018
.003
.001
.016
.001
.001
.02
.004
.033
.058
.111
.0
.001
.004
.02
.011
.61
.317
.292
.033
.038
.085
.006
.006
.008
.112
.001
.0
.002
.001
.089
.002
.003
.043
.011
.002
.254
.0
.003
.0
.0
.093
.0
.0
.002
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.164
.041
.019
.113
.001
.113
.066
.141
.0
.177
.014
.022
.002
.004
.134
.292
.002
.002
.005
.149
.008
.029
.007
.001
.003
.064
.069
.01
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
Aass
T
A
-
T
A
T
A
A
G
A
A
A
5
-
G
-
C
G
T
T
C
-
G
A
-
-
-
G
G
C
-
A
T
G
-
A
C
T
G
G
G
T
T
G
A
A
A
A
G
C
C
T
G
-
G
G
C
T
G
-
C
G
A
T
A
T
A
A
A
A
A
T
A
C
G
C
T
G
-
T
-
C
A
T
G
-
G
A
-
G
-
C
A
G
A
-
C
T
A
A
C
G
T
C
C
G
T
T
G
G
A
G
G
C
C
A
T
C
G
T
T
A
A
A
A
A
C
A
T
T
6
A
C
G
G
-
A
2
-
-
G
-
A
-
2
A
-
A
-
-
G
A
C
G
A
G
-
C
-
A
A
-
-
-
A
-
-
-
-
-
T
G
C
2
T
C
A
-
G
C
2
C
A
T
G
T
T
6
3
G
G
G
A
A
G
G
C
G
T
A
G
C
C
T
-
G
-
4
T
T
A
C
G
T
C
-
G
A
T
5
-
G
C
C
-
2
T
C
C
2
G
C
G
C
-
A
T
-
C
A
-
-
-
-
2
C
2
-
3
3
A
C
2
C
-
3
C
C
C
A
C
G
2
A
-
2
A
T
T
8
-
2
-
C
C
T
A
-
4
C
-
A
G
C
C
C
-
C
C
-
G
-
-
C
-
A
T
-
G
T
G
G
G
C
A
C
T
G
G
G
C
-
C
G
C
-
A
-
G
-
-
-
-
-
G
-
2
A
C
-
G
-
2
-
3
6
-
-
T
-
-
-
C
C
A
2
C
2
C
-
A
G
-
C
C
T
-
T
A
G
G
T
-
-
G
C
A
C
T
G
A
T
G
5
T
T
C
T
T
G
A
A
A
-
C
G
5
G
-
-
A
C
T
A
G
T
A
3
-
-
-
-
T
-
C
-
A
-
-
A
G
-
C
-
A
-
T
T
A
T
2
2
A
-
-
C
-
-
A
C
T
T
C
C
A
G
C
A
4
C
C
C
A
-
-
C
A
G
T
-
-
-
G
-
-
A
-
-
A
A
T
A
C
-
-
G
6
C
A
T
-
C
G
C
-
10
G
T
T
A
A
10
A
C
C
C
T
G
A
G
G
-
  50,152,291
  50,152,348
  50,152,365
  50,152,373
  50,152,569
  50,152,622
  50,152,932
  50,152,937
  50,152,940
  50,152,974
  50,152,980
  50,153,090
  50,153,205
  50,155,545
  50,155,561
  50,156,167
  50,157,891
  50,157,978
  50,158,141
  50,158,202
  50,158,356
  50,158,364
  50,158,400
  50,158,766
  50,158,956
  50,158,999
  50,159,365
  50,159,463
  50,159,478
  50,159,691
  50,159,719
  50,159,848
  50,159,852
  50,159,856
  50,160,115
  50,160,137
  50,160,340
  50,160,341
  50,160,512
  50,160,747
  50,161,016
  50,161,205
  50,161,225
  50,161,226
  50,161,310
  50,161,855
  50,162,102
  50,162,341
  50,162,373
  50,162,383
  50,162,449
  50,162,762
  50,163,056
  50,163,114
  50,163,222
  50,163,258
  50,163,335
  50,163,959
  50,163,987
  50,164,037
  50,164,057
  50,164,072
  50,164,121
  50,164,408
  50,164,462
  50,164,694
  50,164,884
  50,165,070
  50,165,143
  50,165,177
  50,165,334
  50,165,469
  50,165,675
  50,165,766
  50,165,808
  50,165,900
  50,165,921
  50,166,155
  50,166,208
  50,166,402
  50,166,412
  50,166,442
  50,166,671
  50,167,259
  50,167,260
  50,167,571
  50,167,650
  50,167,679
  50,167,971
  50,168,078
  50,168,252
  50,168,312
  50,168,737
  50,168,912
  50,169,085
  50,169,114
  50,169,160
  50,169,502
  50,169,706
  50,169,839
  50,169,996
  50,170,018
  50,170,186
  50,170,206
  50,170,866
  50,170,910
  50,171,011
  50,171,030
  50,171,429
  50,171,489
  50,171,624
  50,171,872
  50,171,992
  50,172,174
  50,172,253
  50,172,554
  50,172,575
  50,172,622
  50,172,623
  50,172,634
  50,172,683
  50,172,854
  50,172,865
  50,172,982
  50,173,294
  50,173,591
  50,173,735
  50,173,760
  50,173,835
  50,173,848
  50,173,996
  50,174,022
  50,174,023
  50,174,072
  50,174,084
  50,174,092
  50,174,098
  50,174,136
  50,174,140
  50,174,144
  50,174,199
  50,174,215
  50,174,244
  50,174,253
  50,174,255
  50,174,263
  50,174,294
  50,174,313
  50,174,331
  50,174,342
  50,174,373
  50,174,395
  50,174,407
  50,174,436
  50,174,438
  50,174,496
  50,174,509
  50,174,528
  50,174,539
  50,174,561
  50,174,565
  50,174,592
  50,174,611
  50,174,620
  50,174,625
  50,174,658
  50,174,715
  50,174,722
  50,174,735
  50,174,737
  50,176,532
  50,176,543
  50,176,552
  50,176,562
  50,176,566
  50,176,571
  50,176,576
  50,176,582
  50,176,597
  50,176,605
  50,176,617
  50,176,624
  50,176,627
  50,176,632
  50,176,639
  50,176,644
  50,176,646
  50,176,657
  50,176,674
  50,177,426
  50,177,524
  50,178,245
  50,178,687
  50,179,209
  50,179,366
  50,179,686
  50,179,852
  50,180,028
  50,180,065
  50,180,225
  50,180,633
  50,181,407
  50,181,500
  50,181,554
  50,181,792
  50,181,827
  50,182,173
  50,182,217
  50,182,513
  50,182,542
  50,182,579
  50,182,612
  50,182,638
  50,182,675
  50,182,884
  50,182,913
  50,182,988
  50,183,215
  50,183,371
  50,183,631
  50,183,645
  50,183,650
  50,183,653
  50,183,661
  50,183,667
  50,183,674
  50,183,684
  50,183,690
  50,183,697
  50,183,720
  50,183,722
  50,183,728
  50,183,730
  50,183,747
  50,183,753
  50,183,768
  50,183,769
  50,183,773
  50,183,777
  50,183,788
  50,183,809
  50,183,815
  50,183,824
  50,183,842
  50,183,859
  50,183,873
  50,183,888
  50,183,892
  50,183,901
  50,183,911
  50,183,921
  50,183,932
  50,183,943
  50,183,947
  50,183,951
  50,183,953
  50,183,979
  50,183,985
  50,183,998
  50,184,000
  50,184,004
  50,184,012
  50,184,016
  50,184,023
  50,184,033
  50,184,039
  50,184,288
  50,184,543
  50,184,848
  50,185,058
  50,185,241
  50,185,271
  50,185,308
  50,185,420
  50,185,522
  50,185,570
  50,185,575
  50,185,669
  50,185,705
  50,185,720
  50,185,814
  50,185,851
  50,185,854
  50,185,856
  50,185,880
  50,186,062
  50,186,188
  50,186,206
  50,186,232
  50,186,268
  50,186,271
  50,186,404
  50,186,433
  50,186,455
  50,186,468
  50,186,482
  50,186,568
  50,186,595
  50,186,600
  50,186,616
  50,186,620
  50,186,622
  50,186,639
  50,186,833
  50,186,835
  50,186,836
  50,187,193
  50,187,274
  50,187,302
  50,187,398
  50,187,658
  50,187,704
  50,187,707
  50,187,724
  50,187,732
  50,187,747
  50,187,777
  50,187,781
  50,187,787
  50,187,810
  50,187,832
  50,187,837
  50,187,866
  50,187,876
  50,187,882
  50,187,892
  50,187,896
  50,187,905
  50,187,908
  50,187,925
  50,187,936
  50,187,944
  50,187,961
  50,187,983
  50,187,987
  50,187,992
  50,188,000
  50,188,003
  50,188,008
  50,188,013
  50,188,015
  50,188,026
  50,188,046
  50,188,050
  50,188,053
  50,188,057
  50,188,066
  50,188,069
  50,188,077
  50,188,083
  50,188,095
  50,188,230
  50,188,258
  50,188,454
  50,188,526
  50,188,997
  50,189,637
  50,190,356
  50,190,643
  50,190,793
  50,191,028
  50,191,120
  50,191,173
  50,191,653
  50,192,008
  50,192,178
  50,192,668
  50,192,728
  50,192,778
  50,192,874
  50,192,932
  50,193,226
  50,193,233
  50,194,261
  50,194,432
  50,194,493
  50,194,862
  50,194,938
  50,194,953
  50,195,694
  50,195,708
  50,195,797
  50,195,809
  50,196,099
  50,196,342
  50,196,393
  50,196,473
  50,197,009
  50,197,022
  50,197,498
  50,197,601
  50,197,619
  50,197,729
  50,197,732
  50,198,036
  50,198,296
  50,198,317
  50,199,114
  50,199,128
  50,199,159
  50,199,165
  50,199,181
  50,199,230
  50,199,252
  50,199,317
  50,199,354
  50,199,371
  50,199,382
  50,199,390
  50,199,394
  50,199,396
  50,199,404
  50,199,407
  50,199,426
  50,199,428
  50,199,518
  50,199,521
  50,199,531
  50,199,543
  50,199,555
  50,199,579
  50,199,591
  50,199,608
  50,199,619
  50,199,629
  50,199,631
  50,199,635
  50,199,658
  50,199,674
  50,199,685
  50,199,689
  50,199,696
  50,199,697
  50,199,705
  50,199,707
  50,199,730
  50,199,927
  50,199,993
  50,200,457
  50,201,148
  50,201,289
  50,201,322
  50,201,334
  50,201,369
  50,201,385
  50,201,434
  50,201,476
  50,201,606
  50,201,651
  50,201,684
  50,201,703
  50,201,808
  50,201,819
  50,201,830
  50,201,862
  50,201,870
  50,201,884
  50,201,921
  50,201,940
  50,201,945
  50,201,971
  50,201,998
  50,202,002
  50,202,072
  50,202,083
  50,202,292
  50,202,568
  50,202,870
  50,203,062
  50,203,158
  50,203,163
  50,203,608
  50,203,767
  50,203,962
  50,204,335
  50,204,465
  50,204,625
  50,204,829
  50,205,038
  50,205,084
  50,205,547
  50,205,838
  50,206,192
  50,206,253
  50,206,315
  50,206,428
  50,206,547
  50,206,710
  50,206,784
  50,207,737
  50,207,971
  50,208,556
C
G
3
C
C
C
G
-
T
G
G
G
-
C
T
4
T
C
A
A
T
C
A
G
31
8
T
A
A
T
4
G
A
T
3
-
T
A
A
A
A
C
C
A
G
G
T
G
A
A
A
C
A
3
C
A
T
C
A
7
-
-
G
C
G
-
G
G
G
G
T
C
G
T
A
T
-
C
2
-
3
T
G
C
A
A
A
G
T
A
3
A
G
A
G
T
T
C
G
G
T
A
C
T
T
A
C
C
A
T
G
A
A
G
T
G
G
G
T
C
C
G
G
G
G
C
A
G
C
C
-
G
T
-
-
A
-
-
G
A
-
C
-
T
-
-
A
-
A
A
-
-
-
A
-
-
G
-
A
-
-
T
A
2
-
T
A
A
G
2
A
-
T
-
-
-
-
T
C
-
-
T
C
-
A
-
-
-
-
A
A
A
G
G
A
A
A
A
C
T
A
T
G
C
A
A
2
-
C
A
G
T
A
C
-
C
A
G
C
-
A
-
-
-
G
-
-
-
-
-
A
-
A
-
T
T
C
G
A
-
C
A
A
T
-
-
-
T
-
-
-
-
-
-
2
-
-
-
-
-
-
A
-
-
A
-
-
C
C
-
2
-
4
T
T
C
G
C
-
-
A
G
A
G
T
T
G
-
-
T
-
A
A
A
G
G
G
G
-
-
-
-
A
T
G
A
G
A
A
A
T
2
-
-
T
A
-
C
-
G
T
T
T
T
C
G
-
T
A
G
C
T
-
2
-
-
T
A
-
T
T
A
G
A
-
-
-
-
-
C
-
T
A
A
T
A
5
C
G
T
A
C
C
T
A
T
G
T
C
A
G
A
C
-
C
C
A
A
A
T
C
G
G
2
G
-
-
A
A
31
G
A
C
T
A
C
G
-
A
C
A
A
-
A
G
A
-
A
A
C
-
A
A
A
-
T
-
G
G
-
-
-
-
T
C
G
A
T
-
-
-
C
A
-
T
-
A
G
-
-
C/-
A
-
2
2
-
-
-
-
A
T
C
-
A
C
-
A
C
-
G
C
-
-
G
C
A
-
T
G
G
13
T
A
T
-/C
-
A
C
C
T
G
-
G
G
T
T
G
A
C
A
T
24