chr start stop reference nuc variant nuc depth genic status zygosity variant ID 6 60104544 60104545 A AGG 6 GENIC homozygous 54432597 6 60104548 60104549 A AGGGGTAGGGT 4 GENIC homozygous 56214458 6 60104975 60104976 T C 32 GENIC homozygous 54432601 6 60105030 60105031 T C 25 GENIC homozygous 55037086 6 60105039 60105040 C T 28 GENIC homozygous 54432603 6 60105376 60105377 C T 29 GENIC homozygous 54432605 6 60105418 60105419 A G 39 GENIC homozygous 54432607 6 60105574 60105575 C G 41 GENIC homozygous 54432609 6 60105730 60105731 A G 41 GENIC homozygous 54432611 6 60106794 60106795 C T 21 GENIC homozygous 54432617 6 60107317 60107318 A G 37 GENIC possibly homozygous 54432621 6 60109391 60109392 G A 30 GENIC homozygous 55037087 6 60109868 60109869 T G 29 GENIC homozygous 54432638 6 60110479 60110480 G A 16 GENIC homozygous 55037088 6 60110530 60110531 C T 22 GENIC homozygous 55037089 6 60110584 60110585 T TAA 26 GENIC homozygous 54432642 6 60110594 60110595 C A 29 GENIC homozygous 54432644 6 60110680 60110681 T G 23 GENIC homozygous 54432646 6 60111139 60111140 A AGGT 23 GENIC homozygous 55037090 6 60111338 60111339 G A 34 GENIC homozygous 54432648 6 60111923 60111924 T C 35 GENIC homozygous 55037091 6 60112004 60112005 T C 35 GENIC homozygous 55037092 6 60112283 60112284 G A 46 GENIC homozygous 54432656 6 60113204 60113205 A G 33 GENIC homozygous 54432658 6 60113224 60113225 C T 35 GENIC homozygous 55037093 6 60113401 60113402 C G 41 GENIC homozygous 55037094 6 60107675 60107690 TATTTTATTTTATTT --------------- 20 GENIC homozygous 56449244 6 60113817 60113820 CTC --- 24 GENIC possibly homozygous 54837126 6 60113979 60113991 GTGTGTGTGTGT ------------ 11 GENIC homozygous 56214460 6 60114834 60114835 A AACACAC 17 GENIC homozygous 55710097 6 60115380 60115381 T - 17 GENIC homozygous 55037095 6 60115426 60115427 T C 19 GENIC homozygous 54432670 6 60115601 60115602 A G 26 GENIC homozygous 54432674 6 60116000 60116001 A G 18 GENIC homozygous 54432676 6 60116481 60116487 ACACAC ------ 5 GENIC homozygous 56214462 6 60116643 60116644 C CAAATCAAAG 22 GENIC homozygous 54432684 6 60117746 60117747 G - 19 GENIC homozygous 54432698 6 60118462 60118463 G A 28 GENIC homozygous 54432712 6 60119526 60119527 G A 26 GENIC homozygous 55037096 6 60119695 60119697 TT -- 21 GENIC homozygous 54432722 6 60122984 60122985 C T 34 GENIC homozygous 55037102 6 60121704 60121705 C CGT 12 GENIC homozygous 54432770 6 60119903 60119904 C T 18 GENIC homozygous 55037097 6 60120137 60120138 G A 17 GENIC homozygous 55037098 6 60121371 60121372 G A 37 GENIC possibly homozygous 55037099 6 60121501 60121503 GT -- 23 GENIC homozygous 55037100 6 60122032 60122033 C T 24 GENIC homozygous 55037101 6 60123375 60123376 C T 33 GENIC homozygous 55037103 6 60123530 60123531 G C 25 GENIC homozygous 54432790 6 60123704 60123705 A G 40 GENIC homozygous 54432794 6 60123966 60123967 A T 22 GENIC homozygous 55037104 6 60124117 60124120 TGG --- 21 GENIC homozygous 54432804 6 60124137 60124165 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA ---------------------------- 18 GENIC heterozygous 56214464 6 60124433 60124434 A - 22 GENIC possibly homozygous 55037105 6 60124652 60124653 G A 20 GENIC homozygous 54432808 6 60125107 60125108 A C 16 GENIC homozygous 54432812 6 60125316 60125317 A G 40 GENIC homozygous 54432814 6 60125333 60125334 T C 41 GENIC homozygous 55037106 6 60125549 60125552 AAG --- 13 GENIC homozygous 55037107 6 60125576 60125582 AAAAAC ------ 8 GENIC homozygous 54432820 6 60125626 60125632 GAGATC ------ 2 GENIC homozygous 56214466 6 60126191 60126223 CTCACACACACACACACACACACACACACACA -------------------------------- 18 GENIC homozygous 56214468 6 60126435 60126436 C G 45 GENIC homozygous 54432828 6 60126690 60126716 CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCC -------------------------- 7 GENIC possibly homozygous 56214470 6 60127141 60127143 AA -- 24 GENIC homozygous 55037108 6 60127370 60127371 G GA 18 GENIC homozygous 55037109 6 60127469 60127470 G A 34 GENIC homozygous 55037110 6 60127693 60127694 A G 33 GENIC homozygous 55037111 6 60127888 60127889 T G 35 GENIC homozygous 55037112 6 60127901 60127902 G A 36 GENIC homozygous 55037113 6 60128096 60128097 T TG 8 GENIC possibly homozygous 56214472 6 60128104 60128105 A G 13 GENIC possibly homozygous 55037116 6 60128924 60128925 A G 31 GENIC homozygous 54432838 6 60129047 60129048 C T 28 GENIC homozygous 55037119 6 60129507 60129508 C T 24 GENIC possibly homozygous 55037120 6 60129519 60129529 TGTGTGTGTG ---------- 18 GENIC possibly homozygous 56214474 6 60129702 60129704 GT -- 17 GENIC homozygous 55037123 6 60132034 60132035 C T 17 GENIC homozygous 55037124 6 60132833 60132834 A T 42 GENIC homozygous 54432842 6 60141386 60141387 A G 9 GENIC homozygous 55037126 6 60141503 60141504 T C 27 GENIC homozygous 55037127 6 60141687 60141688 T G 13 GENIC homozygous 55037128 6 60141889 60141893 ACAC ---- 10 GENIC heterozygous 54432854 6 60141891 60141893 AC -- 10 GENIC heterozygous 54432856 6 60141963 60141964 A G 25 GENIC homozygous 54432858 6 60142409 60142410 C T 26 GENIC homozygous 55037129 6 60142531 60142532 G T 19 GENIC homozygous 54432864 6 60142581 60142582 T G 18 GENIC homozygous 55412095 6 60142582 60142583 G A 18 GENIC homozygous 55412097 6 60142585 60142586 G T 19 GENIC homozygous 55412099 6 60142591 60142592 A T 19 GENIC homozygous 54837131 6 60142592 60142593 T C 19 GENIC homozygous 55412101 6 60143107 60143108 C T 33 GENIC homozygous 55037130 6 60143320 60143323 GGG --- 26 GENIC homozygous 55037131 6 60143642 60143643 G GT 27 GENIC homozygous 54432882 6 60143644 60143645 G T 27 GENIC homozygous 56106254 6 60144710 60144711 G GC 3 GENIC homozygous 54432908 6 60146191 60146192 T C 35 GENIC homozygous 54432932 6 60147644 60147645 A G 32 GENIC homozygous 54432944 6 60147687 60147688 T G 36 GENIC homozygous 55037132 6 60147927 60147928 G A 23 GENIC homozygous 55037133 6 60148017 60148019 TT -- 24 GENIC homozygous 54432946 6 60148091 60148092 A G 20 GENIC homozygous 54432950 6 60148142 60148143 T G 21 GENIC homozygous 54432952 6 60148220 60148221 C T 29 GENIC homozygous 55037134 6 60148530 60148638 AAGATTTTTGTTGCTCGGGGTTGGGGATTTAGCTCAGTGGTAGAGCGCTTGTCTAGGAAGCGCAAGGCCCTGGGTTCGGTCCCCAGCTCCAAAAAAAAGAAAAAAAAA ------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 22 GENIC homozygous 55412103 6 60148680 60148681 C A 17 GENIC homozygous 55037135 6 60148911 60148912 T C 33 GENIC homozygous 54432956 6 60148993 60148994 C T 27 GENIC homozygous 54432958 6 60149043 60149044 C T 26 GENIC homozygous 55037136 6 60149059 60149061 GA -- 26 GENIC homozygous 54432960 6 60149068 60149069 C T 26 GENIC homozygous 55037137 6 60149229 60149230 A G 31 GENIC homozygous 54432962 6 60149312 60149313 T C 41 GENIC homozygous 54432964 6 60149562 60149563 T G 21 GENIC homozygous 54432966 6 60149650 60149651 A AC 22 GENIC possibly homozygous 54432971 6 60149794 60149795 C T 22 GENIC homozygous 55037138 6 60151080 60151081 T C 28 GENIC homozygous 54432975 6 60151829 60151830 A T 35 GENIC homozygous 54432977 6 60151927 60151928 A G 24 GENIC homozygous 54432979 6 60153253 60153254 G A 30 GENIC homozygous 55037139 6 60153710 60153711 T TG 48 GENIC homozygous 54432983 6 60153895 60153896 G T 23 GENIC homozygous 55037140 6 60154184 60154185 T C 27 GENIC homozygous 54432987 6 60154318 60154319 A G 27 GENIC homozygous 55037141 6 60154625 60154626 C A 30 GENIC homozygous 54432989 6 60154632 60154633 C T 31 GENIC homozygous 54432991 6 60154669 60154670 T - 38 GENIC homozygous 54432993 6 60154696 60154703 GGCCCAG ------- 42 GENIC homozygous 55507254 6 60154702 60154703 G GTTTACT 41 GENIC homozygous 55507256 6 60155259 60155260 T A 25 GENIC homozygous 54432997 6 60155368 60155369 C T 28 GENIC homozygous 55037142 6 60156977 60156978 T C 19 GENIC homozygous 54433007 6 60155775 60155776 A G 35 GENIC homozygous 54432999 6 60156393 60156394 G A 34 GENIC homozygous 55037143 6 60156433 60156434 A T 38 GENIC homozygous 54433003 6 60156720 60156721 A G 25 GENIC homozygous 55037144 6 60156981 60156982 T C 21 GENIC homozygous 54433009 6 60157091 60157095 ACTG ---- 18 GENIC homozygous 56214476 6 60157113 60157127 TGTCTGTCTGTCTG -------------- 18 GENIC homozygous 56214478 6 60157142 60157143 A AT 12 GENIC homozygous 54433021 6 60157154 60157155 A G 18 GENIC homozygous 54433023 6 60157301 60157302 A T 24 GENIC possibly homozygous 54433027 6 60157728 60157734 GTTCAT ------ 33 GENIC homozygous 54433033 6 60157753 60157754 T TG 26 GENIC heterozygous 54433035 6 60157753 60157754 T TGGTGGTG 26 GENIC heterozygous 56214480 6 60157755 60157756 T TGGTG 36 GENIC heterozygous 54433039 6 60157773 60157774 T TGTGGTGGTG 32 GENIC heterozygous 56449247 6 60157777 60157778 T TGGTGGTG 33 GENIC heterozygous 55037148 6 60157786 60157787 G GTATGCA 36 GENIC heterozygous 55507262 6 60157942 60157943 A C 23 GENIC homozygous 54433047 6 60157989 60157993 ACGA ---- 21 GENIC homozygous 54433049 6 60158073 60158074 G GT 22 GENIC homozygous 54433051 6 60158074 60158075 G GTGA 19 GENIC homozygous 55037150 6 60158076 60158077 G A 22 GENIC homozygous 54433057 6 60158111 60158112 G A 29 GENIC homozygous 54433059 6 60158138 60158139 C T 33 GENIC homozygous 54433061 6 60158169 60158170 T C 28 GENIC homozygous 54433063 6 60158403 60158411 GTGTGTGT -------- 13 GENIC homozygous 54433065 6 60158966 60158967 A G 33 GENIC homozygous 54433069 6 60159012 60159014 AA -- 21 GENIC heterozygous 54433071 6 60159013 60159014 A - 21 GENIC heterozygous 54433073 6 60159466 60159467 G A 24 GENIC homozygous 54433077 6 60159957 60159959 CC -- 8 GENIC possibly homozygous 54433081 6 60160211 60160212 A G 32 GENIC homozygous 54433085 6 60160245 60160246 G A 38 GENIC homozygous 54433087 6 60160381 60160383 GC -- 19 GENIC homozygous 54433089 6 60160396 60160397 C T 27 GENIC homozygous 55155819 6 60161066 60161069 CTT --- 15 GENIC homozygous 54433095 6 60161408 60161409 T C 37 GENIC homozygous 54433097 6 60162042 60162043 G A 21 GENIC homozygous 54433101 6 60162902 60162903 G A 31 GENIC homozygous 55037153 6 60162939 60162940 A T 37 GENIC homozygous 54433103 6 60163148 60163155 TCTGGCG ------- 31 GENIC homozygous 55037154 6 60163176 60163177 T G 30 GENIC homozygous 54433111 6 60163609 60163610 A G 39 GENIC homozygous 54433117 6 60163829 60163830 A G 30 GENIC homozygous 54433119 6 60164180 60164181 C A 27 GENIC homozygous 54433125 6 60164340 60164341 C T 21 GENIC homozygous 54433127 6 60164357 60164358 A G 28 GENIC homozygous 54433129 6 60164405 60164406 C CTG 29 GENIC homozygous 54433131 6 60164703 60164704 A G 49 GENIC homozygous 54433133 6 60165116 60165119 TTT --- 18 GENIC homozygous 54433135 6 60165246 60165247 C CTAAAGTCCACTTAAGTCCATAACAGGGCTGTGATCCCT 11 GENIC homozygous 55507264 6 60165983 60165984 T C 27 GENIC homozygous 54433148 6 60166036 60166037 C T 23 GENIC homozygous 55037155 6 60166066 60166067 T G 28 GENIC homozygous 54433150 6 60166108 60166109 A G 27 GENIC homozygous 54433152 6 60166325 60166326 G A 23 GENIC homozygous 55037156 6 60166328 60166329 G A 25 GENIC homozygous 55037157 6 60166532 60166533 T C 40 GENIC homozygous 55037158 6 60167799 60167804 CACAT ----- 26 GENIC homozygous 55507266 6 60166586 60166587 C A 35 GENIC homozygous 54433154 6 60166754 60166758 ATGC ---- 7 GENIC homozygous 56214483 6 60167011 60167012 C T 32 GENIC homozygous 54433158 6 60167288 60167289 C CT 14 GENIC homozygous 55037159 6 60167806 60167807 C CTCTA 23 GENIC homozygous 55507268 6 60167808 60167809 A ACCC 23 GENIC homozygous 55412107 6 60167977 60167978 A G 37 GENIC homozygous 54433188 6 60168072 60168073 T TG 25 GENIC homozygous 54433192 6 60168245 60168246 C T 33 GENIC homozygous 55037160 6 60168937 60168938 C - 11 GENIC heterozygous 55155820 6 60169272 60169273 C CT 17 GENIC homozygous 54433205 6 60169691 60169692 A AT 30 GENIC homozygous 55037161 6 60169990 60169991 C CT 12 GENIC homozygous 55037162 6 60170004 60170005 A ATAAT 18 GENIC homozygous 54433206 6 60170293 60170294 T C 29 GENIC homozygous 54433207 6 60170428 60170429 C T 31 GENIC homozygous 55037163 6 60170502 60170506 CACA ---- 31 GENIC homozygous 55037164 6 60170631 60170645 AAACACACACACAT -------------- 10 GENIC homozygous 56214485 6 60170715 60170725 ACACACACAC ---------- 13 GENIC heterozygous 56141238 6 60171192 60171193 T A 33 GENIC homozygous 55037165 6 60171853 60171854 T C 27 GENIC homozygous 54433218 6 60171973 60171974 C T 17 GENIC homozygous 55037166 6 60172409 60172410 C T 35 GENIC homozygous 55037167 6 60172606 60172607 C T 35 GENIC homozygous 55037168 6 60173029 60173030 A G 28 GENIC homozygous 54433221 6 60173502 60173503 C T 29 GENIC homozygous 55037169 6 60174106 60174118 CTCTCTCTCTCT ------------ 4 GENIC homozygous 56197740 6 60174512 60174513 G A 28 GENIC homozygous 55037170 6 60174817 60174818 T C 27 GENIC homozygous 54433226 6 60175708 60175709 C T 21 GENIC homozygous 55037171 6 60175926 60175927 T A 21 GENIC homozygous 54433229 6 60176836 60176837 A G 23 GENIC homozygous 54433231 6 60180465 60180466 T A 26 GENIC homozygous 54433239 6 60180695 60180696 C CTTT 23 GENIC heterozygous 54433241 6 60180695 60180696 C CTT 23 GENIC heterozygous 54433243 6 60180848 60180849 T G 27 GENIC homozygous 54433249 6 60181083 60181084 T C 30 GENIC homozygous 54433251 6 60183192 60183194 TT -- 38 GENIC homozygous 54433257 6 60183195 60183196 T - 38 GENIC homozygous 54433259 6 60183492 60183493 C T 28 GENIC homozygous 54433261 6 60183813 60183814 A G 33 GENIC homozygous 54433263 6 60184013 60184014 A G 31 GENIC homozygous 54433265 6 60184255 60184256 C A 36 GENIC homozygous 55037172 6 60186143 60186144 C T 40 GENIC homozygous 55037173 6 60186566 60186567 T C 41 GENIC homozygous 55037174 6 60186720 60186721 G A 36 GENIC homozygous 54433273 6 60186824 60186825 G C 27 GENIC homozygous 54433275 6 60187011 60187014 TCA --- 30 GENIC homozygous 54433279 6 60187015 60187016 G GAC 29 GENIC homozygous 54433281 6 60187016 60187017 T A 29 GENIC homozygous 55412109 6 60187329 60187353 CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT ------------------------ 16 GENIC homozygous 55412111 6 60187375 60187376 C T 16 GENIC homozygous 54433287 6 60187404 60187408 ACAC ---- 19 GENIC heterozygous 54433289 6 60187406 60187408 AC -- 19 GENIC heterozygous 54433291 6 60187694 60187695 G A 38 GENIC homozygous 55155821 6 60188396 60188397 A - 45 GENIC homozygous 55155822 6 60190558 60190559 A G 42 GENIC homozygous 54433318 6 60193119 60193120 G GTTTTT 16 GENIC homozygous 55507282 6 60191176 60191177 A C 15 GENIC homozygous 54433320 6 60191452 60191453 G C 13 GENIC homozygous 55155823 6 60192808 60192809 T C 27 GENIC heterozygous 54433348 6 60193029 60193030 G A 28 GENIC homozygous 55155824 6 60177006 60177008 TG -- 13 GENIC heterozygous 55606249 6 60194427 60194428 A T 24 GENIC homozygous 54433352 6 60194602 60194604 CC -- 29 GENIC homozygous 54433354 6 60194606 60194607 T TG 30 GENIC homozygous 54433356 6 60194786 60194787 T C 32 GENIC homozygous 54433358 6 60195422 60195423 G - 37 GENIC homozygous 54433362 6 60195790 60195791 A ATGTG 15 GENIC heterozygous 55507284 6 60195790 60195791 A ATG 15 GENIC heterozygous 55606251 6 60195791 60195807 TGTGTGTGTGTGTGTG ---------------- 15 GENIC possibly homozygous 56449250 6 60196480 60196481 C T 40 GENIC homozygous 55155825 6 60197060 60197061 G A 37 GENIC homozygous 55155826 6 60197529 60197530 A AAG 18 GENIC homozygous 55155827 6 60197941 60197942 A G 27 GENIC homozygous 54433374 6 60198695 60198696 T TAAA 28 GENIC homozygous 54433379 6 60200505 60200506 G A 25 GENIC homozygous 55155828 6 60200940 60200941 A G 33 GENIC homozygous 54433389 6 60201265 60201266 G A 22 GENIC homozygous 55155829 6 60203029 60203031 TG -- 36 GENIC heterozygous 55822639 6 60203998 60203999 T - 19 GENIC possibly homozygous 54886207 6 60204269 60204270 A G 42 GENIC homozygous 54433395 6 60205124 60205125 C CT 30 GENIC homozygous 54433401 6 60205158 60205159 G GTT 18 GENIC homozygous 55155830 6 60205382 60205383 A AT 31 GENIC homozygous 55155831 6 60206317 60206318 C T 45 GENIC homozygous 55155832 6 60206734 60206735 T G 40 GENIC homozygous 54433405 6 60207205 60207206 G A 23 GENIC homozygous 54433407 6 60207937 60207940 GGG --- 13 GENIC homozygous 54433411 6 60208067 60208068 C T 18 GENIC homozygous 55155833 6 60208605 60208606 T C 35 GENIC homozygous 55155834 6 60209689 60209690 C T 44 GENIC possibly homozygous 55155835 6 60210519 60210520 G C 19 GENIC homozygous 55155836