Imported Disease Annotations - CTDObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Prx | Rat | motor peripheral neuropathy | | ISO | PRX (Homo sapiens) | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Imported Disease Annotations - CTDObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Prx | Rat | motor peripheral neuropathy | | ISO | PRX (Homo sapiens) | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| # | Reference Title | Reference Citation |
| 1. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
| 2. | Periaxin, a novel protein of myelinating Schwann cells with a possible role in axonal ensheathment. | Gillespie CS, etal., Neuron 1994 Mar;12(3):497-508. |
| 3. | Rat ISS GO annotations from GOA human gene data--August 2006 | GOA data from the GO Consortium |
| 4. | Sensory neuron proteins interact with the intracellular domains of sodium channel NaV1.8. | Malik-Hall M, etal., Brain Res Mol Brain Res. 2003 Feb 20;110(2):298-304. |
| 5. | Rat ISS GO annotations from MGI mouse gene data--August 2006 | MGD data from the GO Consortium |
| 6. | Electronic Transfer of LocusLink and RefSeq Data | NCBI rat LocusLink and RefSeq merged data July 26, 2002 |
| 7. | OMIM Disease Annotation Pipeline | OMIM Disease Annotation Pipeline |
| 8. | Regulation of the myelin gene periaxin provides evidence for Krox-20-independent myelin-related signalling in Schwann cells. | Parkinson DB, etal., Mol Cell Neurosci 2003 May;23(1):13-27. |
| 9. | ClinVar Automated Import and Annotation Pipeline | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
| 10. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| PMID:9488714 | PMID:10839370 | PMID:11430802 | PMID:15282162 | PMID:21940993 | PMID:24633211 | PMID:26467811 | PMID:31931020 |
| Prx (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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| PRX (Homo sapiens - human) |
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| Prx (Mus musculus - house mouse) |
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| Prx (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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| PRX (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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| PRX (Canis lupus familiaris - dog) |
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| Prx (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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| PRX (Sus scrofa - pig) |
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| PRX (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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| Prx (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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| Prx (Rattus rattus - black rat) |
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Variants in Prx
139 total Variants
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| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
| G67961 |
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alimentary part of gastrointestinal system
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appendage
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circulatory system
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ectoderm
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endocrine system
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endoderm
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exocrine system
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hemolymphoid system
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hepatobiliary system
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integumental system
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mesenchyme
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mesoderm
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musculoskeletal system
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nervous system
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renal system
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reproductive system
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respiratory system
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sensory system
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visual system
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16 | 12 | 67 | 154 | 91 | 90 | 59 | 78 | 59 | 6 | 341 | 178 | 11 | 133 | 80 | 92 | 31 | 12 | 12 |
| RefSeq Transcripts | NM_023976 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| XM_017589763 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_017589764 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_039091780 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_063274955 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| GenBank Nucleotide | AC118914 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| CH473979 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| JAXUCZ010000001 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| Z29649 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000024771 ⟹ ENSRNOP00000024771 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000103350 ⟹ ENSRNOP00000089560 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000146700 ⟹ ENSRNOP00000110948 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | NM_023976 ⟹ NP_076466 | ||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position: |
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| Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | XM_039091780 ⟹ XP_038947708 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | XM_063274955 ⟹ XP_063131025 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
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| Protein RefSeqs | NP_076466 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| XP_038947708 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| XP_063131025 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| GenBank Protein | CAA82757 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| EDM07952 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000110948 | ||
| GenBank Protein | Q63425 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| RefSeq Acc Id: | NP_076466 ⟸ NM_023976 |
| - UniProtKB: | Q63425 (UniProtKB/Swiss-Prot), A0A8I6GHF6 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000024771 ⟸ ENSRNOT00000024771 |
| RefSeq Acc Id: | XP_038947708 ⟸ XM_039091780 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| - UniProtKB: | G3V8D2 (UniProtKB/TrEMBL), A6J9D2 (UniProtKB/TrEMBL), A0A8I6GHF6 (UniProtKB/TrEMBL) |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000089560 ⟸ ENSRNOT00000103350 |
| RefSeq Acc Id: | XP_063131025 ⟸ XM_063274955 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| - UniProtKB: | A0A8I6GHF6 (UniProtKB/TrEMBL), A6J9D2 (UniProtKB/TrEMBL), G3V8D2 (UniProtKB/TrEMBL) |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000110948 ⟸ ENSRNOT00000146700 |
| Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
| AF-Q63425-F1-model_v2 | AlphaFold | Q63425 | 1-1383 | view protein structure |
| eQTL | View at Phenogen | |
| WGCNA | View at Phenogen | |
| Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
| RGD ID: | 13689853 | ||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_R378 | ||||||||
| Type: | single initiation site | ||||||||
| Name: | Prx_1 | ||||||||
| Description: | periaxin | ||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
| Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
| Position: |
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| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:619960 | AgrOrtholog |
| BioCyc Gene | G2FUF-60307 | BioCyc |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000018369 | Ensembl, ENTREZGENE |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000146700 | ENTREZGENE |
| Gene3D-CATH | 2.30.42.10 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| InterPro | Myelin_sheath_structural | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDZ | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| PDZ_sf | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| KEGG Report | rno:78960 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| NCBI Gene | 78960 | ENTREZGENE |
| PANTHER | PERIAXIN | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PERIAXIN/AHNAK | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Pfam | PDZ | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PhenoGen | Prx | PhenoGen |
| PROSITE | PDZ | UniProtKB/Swiss-Prot |
| RatGTEx | ENSRNOG00000018369 | RatGTEx |
| SMART | PDZ | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Superfamily-SCOP | SSF50156 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| UniProt | A0A8I6GHF6 | ENTREZGENE |
| A0ABK0M1T8_RAT | UniProtKB/TrEMBL | |
| A6J9D2 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| G3V8D2 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| PRAX_RAT | UniProtKB/Swiss-Prot, ENTREZGENE |
| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2005-01-20 | Prx | periaxin | Symbol and Name status set to approved | 1299863 | APPROVED | ||
| 2002-08-07 | Prx | periaxin | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |
| Note Type | Note | Reference |
|---|---|---|
| gene_cellular_localization | colocalizes with myelin-associated glycoprotein to the cytoplasm-filled periaxonal region of the myelin sheath | 729479 |