Imported Disease Annotations - MGIObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Cabyr | Rat | male infertility | | ISS | Cabyr (Mus musculus) | 13592920 | | MouseDO | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Imported Disease Annotations - MGIObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Cabyr | Rat | male infertility | | ISS | Cabyr (Mus musculus) | 13592920 | | MouseDO | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| # | Reference Title | Reference Citation |
| 1. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
| 2. | GOA pipeline | RGD automated data pipeline |
| 3. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| PMID:11820818 | PMID:12477932 | PMID:12801634 | PMID:15632090 | PMID:17855365 | PMID:18421703 | PMID:20731842 | PMID:21274509 | PMID:21630459 |
| Cabyr (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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| CABYR (Homo sapiens - human) |
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| Cabyr (Mus musculus - house mouse) |
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| Cabyr (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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| CABYR (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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| CABYR (Canis lupus familiaris - dog) |
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| Cabyr (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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| CABYR (Sus scrofa - pig) |
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| CABYR (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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| Cabyr (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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| Cabyr (Rattus rattus - black rat) |
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Variants in Cabyr
134 total Variants
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| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
| BE112861 |
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| RH139707 |
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alimentary part of gastrointestinal system
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appendage
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circulatory system
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ectoderm
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endocrine system
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endoderm
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exocrine system
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hemolymphoid system
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hepatobiliary system
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integumental system
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mesenchyme
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mesoderm
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musculoskeletal system
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nervous system
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renal system
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reproductive system
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respiratory system
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sensory system
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visual system
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 13 | 78 | 216 | 83 | 82 | 51 | 158 | 51 | 6 | 473 | 278 | 22 | 194 | 115 | 124 | 31 | 34 | 34 |
| RefSeq Transcripts | NM_001143893 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| XM_006254426 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_008771955 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_008771956 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_039097129 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_063277594 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_063277595 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XR_001842032 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XR_010059601 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XR_010059602 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| GenBank Nucleotide | BC160837 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| CH474065 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| JAXUCZ010000018 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000071392 ⟹ ENSRNOP00000065843 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
|
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000094472 ⟹ ENSRNOP00000079211 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | NM_001143893 ⟹ NP_001137365 | ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||
| Position: |
|
||||||||||||||||||||||||
| Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | XM_006254426 ⟹ XP_006254488 | ||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||
| Position: |
|
||||||||||||||||||||
| Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | XM_039097129 ⟹ XP_038953057 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | XM_063277594 ⟹ XP_063133664 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | XM_063277595 ⟹ XP_063133665 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | XR_001842032 | ||||||||||||||||
| Type: | NON-CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
|
||||||||||||||||
| Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | XR_010059601 | ||||||||
| Type: | NON-CODING | ||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | XR_010059602 | ||||||||
| Type: | NON-CODING | ||||||||
| Position: |
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| Protein RefSeqs | NP_001137365 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| XP_006254488 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| XP_038953057 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| XP_063133664 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| XP_063133665 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| GenBank Protein | EDL75014 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| EDL75015 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDL75016 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDL75017 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDL75018 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000065843 | ||
| ENSRNOP00000065843.1 | |||
| ENSRNOP00000079211 | |||
| ENSRNOP00000079211.1 |
| RefSeq Acc Id: | NP_001137365 ⟸ NM_001143893 |
| - UniProtKB: | M0R8P3 (UniProtKB/TrEMBL), A6KLS1 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | XP_006254488 ⟸ XM_006254426 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| - UniProtKB: | A6KLR9 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000065843 ⟸ ENSRNOT00000071392 |
| RefSeq Acc Id: | XP_038953057 ⟸ XM_039097129 |
| - Peptide Label: | isoform X3 |
| - UniProtKB: | A0A8I5ZMY5 (UniProtKB/TrEMBL), A6KLS0 (UniProtKB/TrEMBL) |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000079211 ⟸ ENSRNOT00000094472 |
| RefSeq Acc Id: | XP_063133664 ⟸ XM_063277594 |
| - Peptide Label: | isoform X2 |
| RefSeq Acc Id: | XP_063133665 ⟸ XM_063277595 |
| - Peptide Label: | isoform X4 |
| Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
| AF-M0R8P3-F1-model_v2 | AlphaFold | M0R8P3 | 1-400 | view protein structure |
| eQTL | View at Phenogen | |
| WGCNA | View at Phenogen | |
| Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
| RGD ID: | 13700641 | ||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_R11164 | ||||||||
| Type: | multiple initiation site | ||||||||
| Name: | Cabyr_1 | ||||||||
| Description: | calcium binding tyrosine phosphorylation regulated | ||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
| Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
| Position: |
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| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:1585413 | AgrOrtholog |
| BioCyc Gene | G2FUF-8353 | BioCyc |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000047436 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000071392 | ENTREZGENE |
| ENSRNOT00000071392.3 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000094472 | ENTREZGENE | |
| ENSRNOT00000094472.2 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Gene3D-CATH | cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit, dimerization-anchoring domain | UniProtKB/TrEMBL |
| InterPro | CABYR | UniProtKB/TrEMBL |
| cAMP_dep_PK_reg_su_I/II_a/b | UniProtKB/TrEMBL | |
| DD_CABYR_SP17 | UniProtKB/TrEMBL | |
| KEGG Report | rno:686189 | UniProtKB/TrEMBL |
| NCBI Gene | 686189 | ENTREZGENE |
| PANTHER | CALCIUM-BINDING TYROSINE PHOSPHORYLATION-REGULATED PROTEIN | UniProtKB/TrEMBL |
| PTHR15494 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Pfam | RIIa | UniProtKB/TrEMBL |
| PhenoGen | Cabyr | PhenoGen |
| RatGTEx | ENSRNOG00000047436 | RatGTEx |
| SMART | RIIa | UniProtKB/TrEMBL |
| Superfamily-SCOP | Dimerization-anchoring domain of cAMP-dependent PK regulatory subunit | UniProtKB/TrEMBL |
| UniProt | A0A8I5ZMY5 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| A6KLR9 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| A6KLS0 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| A6KLS1 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| M0R8P3 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2016-02-17 | Cabyr | calcium binding tyrosine phosphorylation regulated | Cabyr | calcium binding tyrosine-(Y)-phosphorylation regulated | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2010-12-08 | Cabyr | calcium binding tyrosine-(Y)-phosphorylation regulated | LOC686189 | similar to calcium-binding tyrosine-phosphorylation regulated protein isoform 2 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2006-11-19 | LOC686189 | similar to calcium-binding tyrosine-phosphorylation regulated protein isoform 2 | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |