Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Ndufa12 | Rat | nuclear type mitochondrial complex I deficiency 23 | | ISO | NDUFA12 (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Ndufa12 | Rat | nuclear type mitochondrial complex I deficiency 23 | | ISO | NDUFA12 (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| # | Reference Title | Reference Citation |
| 1. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
| 2. | Rat ISS GO annotations from MGI mouse gene data--August 2006 | MGD data from the GO Consortium |
| 3. | OMIM Disease Annotation Pipeline | OMIM Disease Annotation Pipeline |
| 4. | KEGG Annotation Import Pipeline | Pipeline to import KEGG annotations from KEGG into RGD |
| 5. | ClinVar Automated Import and Annotation Pipeline | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
| 6. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| PMID:8889548 | PMID:12060780 | PMID:12611891 | PMID:12857734 | PMID:14651853 | PMID:18614015 | PMID:21700703 | PMID:24746669 | PMID:27626371 | PMID:28844695 |
| Ndufa12 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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| NDUFA12 (Homo sapiens - human) |
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| Ndufa12 (Mus musculus - house mouse) |
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| Ndufa12 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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| NDUFA12 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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| NDUFA12 (Canis lupus familiaris - dog) |
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| Ndufa12 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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| NDUFA12 (Sus scrofa - pig) |
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| NDUFA12 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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| Ndufa12 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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| Ndufa12 (Rattus rattus - black rat) |
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Variants in Ndufa12
176 total Variants
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| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
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alimentary part of gastrointestinal system
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appendage
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circulatory system
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ectoderm
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endocrine system
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endoderm
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exocrine system
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hemolymphoid system
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hepatobiliary system
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integumental system
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mesenchyme
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mesoderm
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musculoskeletal system
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nervous system
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renal system
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reproductive system
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respiratory system
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sensory system
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visual system
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16 | 12 | 67 | 165 | 91 | 90 | 59 | 92 | 59 | 6 | 356 | 192 | 11 | 144 | 81 | 92 | 31 | 17 | 17 |
| RefSeq Transcripts | NM_001106781 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| GenBank Nucleotide | BF555697 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| BG671355 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BQ205274 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| CH473960 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ212338 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ217295 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ224477 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| JAXUCZ010000007 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000010117 ⟹ ENSRNOP00000010117 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000085978 ⟹ ENSRNOP00000070804 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000089442 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | NM_001106781 ⟹ NP_001100251 | ||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position: |
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| Sequence: |
| Protein RefSeqs | NP_001100251 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| GenBank Protein | EDM16885 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| EDM16886 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDM16887 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDM16888 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000010117 | ||
| ENSRNOP00000010117.7 |
| RefSeq Acc Id: | NP_001100251 ⟸ NM_001106781 |
| - UniProtKB: | F1LXA0 (UniProtKB/TrEMBL), A6IG10 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000010117 ⟸ ENSRNOT00000010117 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000070804 ⟸ ENSRNOT00000085978 |
| Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
| AF-F1LXA0-F1-model_v2 | AlphaFold | F1LXA0 | 1-145 | view protein structure |
| eQTL | View at Phenogen | |
| WGCNA | View at Phenogen | |
| Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
| RGD ID: | 13695155 | ||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_R5679 | ||||||||
| Type: | multiple initiation site | ||||||||
| Name: | Ndufa12_1 | ||||||||
| Description: | NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A12 | ||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
| Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
| Position: |
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| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:1311462 | AgrOrtholog |
| BioCyc Gene | G2FUF-34371 | BioCyc |
| BioCyc Pathway | PWY-3781 [aerobic respiration I (cytochrome c)] | BioCyc |
| BioCyc Pathway Image | PWY-3781 | BioCyc |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000007407 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| ENSRNOG00000053643 | Ensembl | |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000010117 | ENTREZGENE |
| ENSRNOT00000010117.7 | UniProtKB/TrEMBL | |
| InterPro | NADH_UbQ_OxRdtase_17.2kDa_su | UniProtKB/TrEMBL |
| KEGG Report | rno:299739 | UniProtKB/TrEMBL |
| NCBI Gene | 299739 | ENTREZGENE |
| PANTHER | Complex1_17_2kD | UniProtKB/TrEMBL |
| NADH DEHYDROGENASE [UBIQUINONE] 1 ALPHA SUBCOMPLEX SUBUNIT 12 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Pfam | NDUFA12 | UniProtKB/TrEMBL |
| PhenoGen | Ndufa12 | PhenoGen |
| RatGTEx | ENSRNOG00000007407 | RatGTEx |
| ENSRNOG00000053643 | RatGTEx | |
| UniProt | A6IG10 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| F1LXA0 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2021-03-09 | Ndufa12 | NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A12 | LOC100910710 | NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12-like | Data merged from RGD:6496868 | 737654 | PROVISIONAL |
| 2015-11-30 | Ndufa12 | NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A12 | Ndufa12 | NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 12 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2012-07-05 | LOC100910710 | NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12-like | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL | ||
| 2008-04-30 | Ndufa12 | NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 12 | Ndufa12_predicted | NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 12 (predicted) | 'predicted' is removed | 2292626 | APPROVED |
| 2006-03-30 | Ndufa12_predicted | NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 12 (predicted) | RGD1311462_predicted | similar to RIKEN cDNA 2410011G03 (predicted) | Symbol and Name updated | 1299863 | APPROVED |
| 2005-01-20 | RGD1311462_predicted | similar to RIKEN cDNA 2410011G03 (predicted) | LOC299739_predicted | Symbol and Name status set to approved | 1331353 | APPROVED | |
| 2005-01-12 | LOC299739_predicted | similar to RIKEN cDNA 2410011G03 (predicted) | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |