Imported Disease Annotations - MGIObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Camkmt | Rat | hypotonia-cystinuria syndrome | | ISS | Camkmt (Mus musculus) | 13592920 | OMIM:606407 | MouseDO | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Imported Disease Annotations - MGIObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Camkmt | Rat | hypotonia-cystinuria syndrome | | ISS | Camkmt (Mus musculus) | 13592920 | OMIM:606407 | MouseDO | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| # | Reference Title | Reference Citation |
| 1. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
| 2. | ClinVar Automated Import and Annotation Pipeline | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
| 3. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| Camkmt (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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| CAMKMT (Homo sapiens - human) |
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| Camkmt (Mus musculus - house mouse) |
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| Camkmt (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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| CAMKMT (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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| CAMKMT (Canis lupus familiaris - dog) |
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| Camkmt (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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| CAMKMT (Sus scrofa - pig) |
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| CAMKMT (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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| Camkmt (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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Variants in Camkmt
2200 total Variants
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| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
| D6Rat214 |
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| RH136925 |
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| RH141573 |
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| UniSTS:237721 |
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alimentary part of gastrointestinal system
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appendage
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circulatory system
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ectoderm
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endocrine system
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endoderm
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exocrine system
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hemolymphoid system
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hepatobiliary system
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integumental system
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mesenchyme
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mesoderm
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musculoskeletal system
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nervous system
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renal system
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reproductive system
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respiratory system
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sensory system
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visual system
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16 | 13 | 79 | 211 | 91 | 90 | 59 | 140 | 59 | 6 | 448 | 260 | 20 | 191 | 105 | 113 | 31 | 33 | 33 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000048550 ⟹ ENSRNOP00000048187 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000151180 ⟹ ENSRNOP00000103105 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000151702 ⟹ ENSRNOP00000101859 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | NM_001134463 ⟹ NP_001127935 | ||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position: |
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||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | XM_039112121 ⟹ XP_038968049 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | XR_005505500 | ||||||||||||
| Type: | NON-CODING | ||||||||||||
| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | XR_010052077 | ||||||||
| Type: | NON-CODING | ||||||||
| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | XR_010052078 | ||||||||
| Type: | NON-CODING | ||||||||
| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | XR_010052079 | ||||||||
| Type: | NON-CODING | ||||||||
| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | XR_010052080 | ||||||||
| Type: | NON-CODING | ||||||||
| Position: |
|
| Protein RefSeqs | NP_001127935 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| XP_038968049 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| GenBank Protein | AAI59412 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| B0K012 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EDM02674 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000048187 | ||
| ENSRNOP00000048187.4 |
| RefSeq Acc Id: | NP_001127935 ⟸ NM_001134463 |
| - UniProtKB: | B0K012 (UniProtKB/Swiss-Prot), A6H9G9 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000048187 ⟸ ENSRNOT00000048550 |
| RefSeq Acc Id: | XP_038968049 ⟸ XM_039112121 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| - UniProtKB: | A6H9G9 (UniProtKB/TrEMBL) |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000103105 ⟸ ENSRNOT00000151180 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000101859 ⟸ ENSRNOT00000151702 |
| Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
| AF-B0K012-F1-model_v2 | AlphaFold | B0K012 | 1-323 | view protein structure |
| eQTL | View at Phenogen | |
| WGCNA | View at Phenogen | |
| Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
| RGD ID: | 13694383 | ||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_R4906 | ||||||||
| Type: | multiple initiation site | ||||||||
| Name: | AC111831_1 | ||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
| Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
| Position: |
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| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:1310453 | AgrOrtholog |
| BioCyc Gene | G2FUF-38663 | BioCyc |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000030629 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000048550 | ENTREZGENE |
| ENSRNOT00000048550.4 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Gene3D-CATH | 3.40.50.150 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| IMAGE_CLONE | IMAGE:8367183 | IMAGE-MGC_LOAD |
| InterPro | CaM-Lys-N-MeTrfase | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Methyltransf_16 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| SAM-dependent_MTases | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| KEGG Report | rno:299521 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| MGC_CLONE | MGC:188690 | IMAGE-MGC_LOAD |
| NCBI Gene | 299521 | ENTREZGENE |
| PANTHER | CALMODULIN-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PTHR13539 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Pfam | Methyltransf_16 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PhenoGen | Camkmt | PhenoGen |
| PROSITE | SAM_CLNMT | UniProtKB/Swiss-Prot |
| RatGTEx | ENSRNOG00000030629 | RatGTEx |
| Superfamily-SCOP | SSF53335 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| UniProt | A0A0H2UHY6_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
| A0ABK0LBC9_RAT | UniProtKB/TrEMBL | |
| A0ABK0LC95_RAT | UniProtKB/TrEMBL | |
| A6H9G9 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| B0K012 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2011-05-25 | Camkmt | calmodulin-lysine N-methyltransferase | RGD1310453 | similar to hypothetical protein FLJ23451 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2008-04-30 | RGD1310453 | similar to hypothetical protein FLJ23451 | RGD1310453_predicted | similar to hypothetical protein FLJ23451 (predicted) | 'predicted' is removed | 2292626 | APPROVED |
| 2005-01-20 | RGD1310453_predicted | similar to hypothetical protein FLJ23451 (predicted) | LOC299521_predicted | Symbol and Name status set to approved | 1331353 | APPROVED | |
| 2005-01-12 | LOC299521_predicted | similar to hypothetical protein FLJ23451 (predicted) | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |