Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Adamts15 | Rat | Distal Arthrogryposis Type 12 | | ISO | ADAMTS15 (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Adamts15 | Rat | Distal Arthrogryposis Type 12 | | ISO | ADAMTS15 (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| # | Reference Title | Reference Citation |
| 1. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
| 2. | ClinVar Automated Import and Annotation Pipeline | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
| 3. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| Adamts15 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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| ADAMTS15 (Homo sapiens - human) |
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| Adamts15 (Mus musculus - house mouse) |
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| Adamts15 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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| ADAMTS15 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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| ADAMTS15 (Canis lupus familiaris - dog) |
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| Adamts15 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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| ADAMTS15 (Sus scrofa - pig) |
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| ADAMTS15 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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| Adamts15 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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| Adamts15 (Rattus rattus - black rat) |
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Variants in Adamts15
160 total Variants
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| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
| RH135150 |
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alimentary part of gastrointestinal system
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appendage
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circulatory system
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ectoderm
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endocrine system
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endoderm
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exocrine system
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hemolymphoid system
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hepatobiliary system
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integumental system
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mesenchyme
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mesoderm
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musculoskeletal system
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nervous system
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renal system
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reproductive system
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respiratory system
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sensory system
|
visual system
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16 | 12 | 67 | 158 | 91 | 90 | 59 | 33 | 59 | 6 | 297 | 133 | 11 | 137 | 81 | 92 | 31 | 15 | 15 |
| RefSeq Transcripts | NM_001106810 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| XM_039081019 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_039081020 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_039081021 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_039081022 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| GenBank Nucleotide | CH474007 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| JAXUCZ010000008 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000013341 ⟹ ENSRNOP00000013341 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | NM_001106810 ⟹ NP_001100280 | ||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position: |
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| Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | XM_039081019 ⟹ XP_038936947 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | XM_039081020 ⟹ XP_038936948 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | XM_039081021 ⟹ XP_038936949 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | XM_039081022 ⟹ XP_038936950 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
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| Protein RefSeqs | NP_001100280 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| XP_038936947 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| XP_038936948 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| XP_038936949 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| XP_038936950 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| GenBank Protein | EDL83322 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000013341 | ||
| ENSRNOP00000013341.5 |
| RefSeq Acc Id: | NP_001100280 ⟸ NM_001106810 |
| - Peptide Label: | precursor |
| - UniProtKB: | D3ZXM1 (UniProtKB/TrEMBL), A6JYF3 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000013341 ⟸ ENSRNOT00000013341 |
| RefSeq Acc Id: | XP_038936949 ⟸ XM_039081021 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| RefSeq Acc Id: | XP_038936948 ⟸ XM_039081020 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| RefSeq Acc Id: | XP_038936947 ⟸ XM_039081019 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| RefSeq Acc Id: | XP_038936950 ⟸ XM_039081022 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
| AF-D3ZXM1-F1-model_v2 | AlphaFold | D3ZXM1 | 1-950 | view protein structure |
| eQTL | View at Phenogen | |
| WGCNA | View at Phenogen | |
| Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
| RGD ID: | 13695822 | ||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_R6347 | ||||||||
| Type: | single initiation site | ||||||||
| Name: | Adamts15_1 | ||||||||
| Description: | ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 15 | ||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
| Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
| Position: |
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| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:1309770 | AgrOrtholog |
| BioCyc Gene | G2FUF-31273 | BioCyc |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000009892 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000013341 | ENTREZGENE |
| ENSRNOT00000013341.7 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Gene3D-CATH | 2.20.100.10 | UniProtKB/TrEMBL |
| 2.60.120.830 | UniProtKB/TrEMBL | |
| 3.40.1620.60 | UniProtKB/TrEMBL | |
| 3.40.390.10 | UniProtKB/TrEMBL | |
| InterPro | ADAM_CR_2 | UniProtKB/TrEMBL |
| ADAM_Cys-rich | UniProtKB/TrEMBL | |
| ADAM_spacer1 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ADAMTS/ADAMTS-like | UniProtKB/TrEMBL | |
| ADAMTS_ADAMTS-like | UniProtKB/TrEMBL | |
| ADAMTS_CR_3 | UniProtKB/TrEMBL | |
| MetalloPept_cat_dom | UniProtKB/TrEMBL | |
| Pept_M12B_ADAM-TS8 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Peptidase_M12B | UniProtKB/TrEMBL | |
| Peptidase_M12B_N | UniProtKB/TrEMBL | |
| Thrombospondin_1_rpt | UniProtKB/TrEMBL | |
| TSP1_rpt_sf | UniProtKB/TrEMBL | |
| KEGG Report | rno:300474 | UniProtKB/TrEMBL |
| NCBI Gene | 300474 | ENTREZGENE |
| PANTHER | A DISINTEGRIN AND METALLOPROTEINASE WITH THROMBOSPONDIN MOTIFS 15 | UniProtKB/TrEMBL |
| ADAMTS A DISINTEGRIN AND METALLOPROTEASE WITH THROMBOSPONDIN MOTIFS PROTEASE | UniProtKB/TrEMBL | |
| Pfam | ADAM_CR_2 | UniProtKB/TrEMBL |
| ADAM_CR_3 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ADAM_spacer1 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Pep_M12B_propep | UniProtKB/TrEMBL | |
| Reprolysin | UniProtKB/TrEMBL | |
| TSP1_ADAMTS | UniProtKB/TrEMBL | |
| TSP_1 | UniProtKB/TrEMBL | |
| PhenoGen | Adamts15 | PhenoGen |
| PRINTS | ADAMTS8 | UniProtKB/TrEMBL |
| ADAMTSFAMILY | UniProtKB/TrEMBL | |
| PROSITE | ADAM_MEPRO | UniProtKB/TrEMBL |
| TSP1 | UniProtKB/TrEMBL | |
| RatGTEx | ENSRNOG00000009892 | RatGTEx |
| SMART | ACR | UniProtKB/TrEMBL |
| TSP1 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Superfamily-SCOP | Metalloproteases ('zincins'), catalytic domain | UniProtKB/TrEMBL |
| TSP1 | UniProtKB/TrEMBL | |
| UniProt | A6JYF3 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| D3ZXM1 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2008-09-18 | Adamts15 | ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 15 | Adamts15 | a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 15 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2008-04-30 | Adamts15 | a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 15 | Adamts15_predicted | a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 15 (predicted) | 'predicted' is removed | 2292626 | APPROVED |
| 2006-03-30 | Adamts15_predicted | a disintegrin-like and metallopeptidase (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 15 (predicted) | a disintegrin-like and metalloprotease (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 15 (predicted) | Name updated | 1299863 | APPROVED | |
| 2005-01-12 | Adamts15_predicted | a disintegrin-like and metalloprotease (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 15 (predicted) | Symbol and Name status set to approved | 70820 | APPROVED |