Imported Disease Annotations - CTDObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Cox7c | Rat | obesity | | ISO | COX7C (Homo sapiens) | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:20882379 | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
Imported Disease Annotations - CTDObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Cox7c | Rat | obesity | | ISO | COX7C (Homo sapiens) | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:20882379 | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
| # | Reference Title | Reference Citation |
| 1. | Reduced Mitochondrial Activity is Early and Steady in the Entorhinal Cortex but it is Mainly Unmodified in the Frontal Cortex in Alzheimer's Disease. | Armand-Ugon M, etal., Curr Alzheimer Res. 2017;14(12):1327-1334. doi: 10.2174/1567205014666170505095921. |
| 2. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
| 3. | KEGG Annotation Import Pipeline | Pipeline to import KEGG annotations from KEGG into RGD |
| 4. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| PMID:7601105 | PMID:8889548 | PMID:12477932 | PMID:12865426 | PMID:14651853 | PMID:15489334 | PMID:18614015 | PMID:20833797 | PMID:30030519 | PMID:31536960 | PMID:34800366 |
| Cox7c (Rattus norvegicus - Norway rat) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| COX7C (Homo sapiens - human) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cox7c (Mus musculus - house mouse) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| LOC102008533 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| LOC100979972 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| LOC102155410 (Canis lupus familiaris - dog) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| LOC101961000 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| COX7C (Sus scrofa - pig) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| LOC103231597 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| LOC101713193 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| LOC116897316 (Rattus rattus - black rat) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
.
Variants in Cox7c
7 total Variants
|
| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
||||||||
| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
|
alimentary part of gastrointestinal system
|
appendage
|
circulatory system
|
ectoderm
|
endocrine system
|
endoderm
|
exocrine system
|
hemolymphoid system
|
hepatobiliary system
|
integumental system
|
mesenchyme
|
mesoderm
|
musculoskeletal system
|
nervous system
|
renal system
|
reproductive system
|
respiratory system
|
sensory system
|
visual system
|
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16 | 12 | 67 | 165 | 91 | 90 | 59 | 92 | 59 | 6 | 356 | 192 | 11 | 144 | 81 | 92 | 31 | 17 | 17 |
| RefSeq Transcripts | NM_001134705 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| GenBank Nucleotide | BC166894 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| BI289576 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BQ779631 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| CH473955 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ217721 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ217795 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ219964 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ221226 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ223619 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ224715 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| JAXUCZ010000002 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000051895 ⟹ ENSRNOP00000049222 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | NM_001134705 ⟹ NP_001128177 | ||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position: |
|
||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence: |
| Protein RefSeqs | NP_001128177 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| GenBank Protein | AAI66894 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| EDM09981 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000049222 | ||
| ENSRNOP00000049222.2 | |||
| GenBank Protein | P80432 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| RefSeq Acc Id: | NP_001128177 ⟸ NM_001134705 |
| - UniProtKB: | B2RYT3 (UniProtKB/Swiss-Prot), P80432 (UniProtKB/Swiss-Prot) |
| - Sequence: |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000049222 ⟸ ENSRNOT00000051895 |
| Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
| AF-P80432-F1-model_v2 | AlphaFold | P80432 | 1-63 | view protein structure |
| eQTL | View at Phenogen | |
| WGCNA | View at Phenogen | |
| Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
| RGD ID: | 13691050 | ||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_R1575 | ||||||||
| Type: | multiple initiation site | ||||||||
| Name: | Cox7c_1 | ||||||||
| Description: | cytochrome c oxidase subunit 7C | ||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
| Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
| Position: |
|
| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:2300145 | AgrOrtholog |
| BioCyc Gene | G2FUF-54920 | BioCyc |
| BioCyc Pathway | PWY-3781 [aerobic respiration I (cytochrome c)] | BioCyc |
| PWY-7279 [aerobic respiration II (cytochrome c) (yeast)] | BioCyc | |
| BioCyc Pathway Image | PWY-3781 | BioCyc |
| PWY-7279 | BioCyc | |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000030237 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000051895 | ENTREZGENE |
| ENSRNOT00000051895.3 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Gene3D-CATH | 4.10.49.10 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| InterPro | COX7C/Cox8 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| COX7C/Cox8_sf | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| KEGG Report | rno:100188937 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| NCBI Gene | 100188937 | ENTREZGENE |
| PANTHER | CYTOCHROME C OXIDASE SUBUNIT 7C, MITOCHONDRIAL | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PTHR13313 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Pfam | COX7C | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PhenoGen | Cox7c | PhenoGen |
| RatGTEx | ENSRNOG00000030237 | RatGTEx |
| Superfamily-SCOP | SSF81427 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| UniProt | B2RYT3 | ENTREZGENE |
| COX7C_RAT | UniProtKB/Swiss-Prot, ENTREZGENE | |
| UniProt Secondary | B2RYT3 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2016-02-17 | Cox7c | cytochrome c oxidase subunit 7C | Cox7c | cytochrome c oxidase, subunit VIIc | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2008-09-06 | Cox7c | cytochrome c oxidase, subunit VIIc | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |