Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Catip | Rat | spermatogenic failure 54 | | ISO | CATIP (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Catip | Rat | spermatogenic failure 54 | | ISO | CATIP (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| # | Reference Title | Reference Citation |
| 1. | C2orf62 and TTC17 are involved in actin organization and ciliogenesis in zebrafish and human. | Bontems F, etal., PLoS One. 2014 Jan 27;9(1):e86476. doi: 10.1371/journal.pone.0086476. eCollection 2014. |
| 2. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
| 3. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| Catip (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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| CATIP (Homo sapiens - human) |
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| Catip (Mus musculus - house mouse) |
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| Catip (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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| CATIP (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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| CATIP (Canis lupus familiaris - dog) |
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| Catip (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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| CATIP (Sus scrofa - pig) |
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| CATIP (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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| Catip (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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| Catip (Rattus rattus - black rat) |
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Variants in Catip
24 total Variants
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| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
| D9Arb3 |
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alimentary part of gastrointestinal system
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appendage
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circulatory system
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ectoderm
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endocrine system
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endoderm
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exocrine system
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hemolymphoid system
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hepatobiliary system
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integumental system
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mesenchyme
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mesoderm
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musculoskeletal system
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nervous system
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renal system
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reproductive system
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respiratory system
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sensory system
|
visual system
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16 | 12 | 66 | 160 | 91 | 90 | 59 | 61 | 59 | 6 | 321 | 160 | 11 | 138 | 78 | 92 | 31 | 12 | 12 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000057480 ⟹ ENSRNOP00000054290 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000071700 ⟹ ENSRNOP00000066656 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000077820 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000080528 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000082773 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000108303 ⟹ ENSRNOP00000083527 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | NM_001419706 ⟹ NP_001406635 | ||||||||||||
| RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | NM_001419707 ⟹ NP_001406636 | ||||||||||||
| RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | XM_017596825 ⟹ XP_017452314 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
|
||||||||||||||||
| Sequence: |
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| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | XM_039084641 ⟹ XP_038940569 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | XP_017452314 ⟸ XM_017596825 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| - UniProtKB: | A0A0H2UI37 (UniProtKB/TrEMBL), D4A843 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000054290 ⟸ ENSRNOT00000057480 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000066656 ⟸ ENSRNOT00000071700 |
| RefSeq Acc Id: | XP_038940567 ⟸ XM_039084639 |
| - Peptide Label: | isoform X2 |
| - UniProtKB: | D4A843 (UniProtKB/TrEMBL) |
| RefSeq Acc Id: | XP_038940569 ⟸ XM_039084641 |
| - Peptide Label: | isoform X3 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000083527 ⟸ ENSRNOT00000108303 |
| RefSeq Acc Id: | NP_001406635 ⟸ NM_001419706 |
| - Peptide Label: | isoform 1 |
| - UniProtKB: | D4A843 (UniProtKB/TrEMBL) |
| RefSeq Acc Id: | NP_001406636 ⟸ NM_001419707 |
| - Peptide Label: | isoform 2 |
| - UniProtKB: | A0A8I5ZX41 (UniProtKB/TrEMBL), D4A843 (UniProtKB/TrEMBL) |
| Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
| AF-M0RAU5-F1-model_v2 | AlphaFold | M0RAU5 | 1-489 | view protein structure |
| eQTL | View at Phenogen | |
| WGCNA | View at Phenogen | |
| Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
| RGD ID: | 13696782 | ||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_R7274 | ||||||||
| Type: | single initiation site | ||||||||
| Name: | Catip_1 | ||||||||
| Description: | ciliogenesis associated TTC17 interacting protein | ||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
| Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
| Position: |
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| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:1596071 | AgrOrtholog |
| BioCyc Gene | G2FUF-27138 | BioCyc |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000037835 | Ensembl, ENTREZGENE |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000071700 | ENTREZGENE |
| ENSRNOT00000108303 | ENTREZGENE | |
| InterPro | CATIP_N | UniProtKB/Swiss-Prot |
| NCBI Gene | 690437 | ENTREZGENE |
| PANTHER | CILIOGENESIS-ASSOCIATED TTC17-INTERACTING PROTEIN | UniProtKB/Swiss-Prot |
| RIIA DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 1 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Pfam | CATIP_N | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PhenoGen | Catip | PhenoGen |
| RatGTEx | ENSRNOG00000037835 | RatGTEx |
| UniProt | A0A0H2UI37 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| A0A8I5ZX41 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| CATIP_RAT | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| D4A843 | ENTREZGENE | |
| M0RAU5 | ENTREZGENE |
| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2015-02-25 | Catip | ciliogenesis associated TTC17 interacting protein | LOC690437 | hypothetical protein LOC690437 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2008-01-09 | LOC690437 | hypothetical protein LOC690437 | LOC679477 | hypothetical protein LOC679477 | Data merged from RGD:1588289 | 1643240 | APPROVED |
| 2006-11-20 | LOC690437 | hypothetical protein LOC690437 | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL | ||
| 2006-11-19 | LOC679477 | hypothetical protein LOC679477 | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |