Gene-Chemical Interaction Annotations
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Variants
miRNA Target Status (No longer updated)
Predicted Target Of
Summary Value | Count of predictions: | 95 | Count of miRNA genes: | 68 | Interacting mature miRNAs: | 74 | Transcripts: | ENSRNOT00000056450 | Prediction methods: | Microtar, Miranda, Rnahybrid, Targetscan | Result types: | miRGate_prediction | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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QTLs in Region (GRCr8)
| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
Markers in Region
| RH143470 |
|
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| RH139578 |
|
Expression
RNA-SEQ Expression
|
alimentary part of gastrointestinal system
|
appendage
|
circulatory system
|
ectoderm
|
endocrine system
|
endoderm
|
exocrine system
|
hemolymphoid system
|
hepatobiliary system
|
integumental system
|
mesenchyme
|
mesoderm
|
musculoskeletal system
|
nervous system
|
renal system
|
reproductive system
|
respiratory system
|
sensory system
|
visual system
|
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16 | 11 | 36 | 128 | 45 | 46 | 17 | 90 | 17 | 6 | 241 | 155 | 11 | 105 | 45 | 58 | 29 | 16 | 16 |
Sequence
Nucleotide Sequences
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000056450 ⟹ ENSRNOP00000053288 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000108588 ⟹ ENSRNOP00000087166 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000109172 ⟹ ENSRNOP00000089504 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000121644 ⟹ ENSRNOP00000100854 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000138057 ⟹ ENSRNOP00000105728 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | NM_001399655 ⟹ NP_001386584 | ||||||||||||
| RefSeq Status: | INFERRED | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
Protein Sequences
| Protein RefSeqs | NP_001386584 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000087166.1 | ||
| ENSRNOP00000089504.1 | |||
| ENSRNOP00000100854.1 | |||
| ENSRNOP00000105728 | |||
| ENSRNOP00000105728.1 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000053288 ⟸ ENSRNOT00000056450 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000087166 ⟸ ENSRNOT00000108588 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000089504 ⟸ ENSRNOT00000109172 |
| RefSeq Acc Id: | NP_001386584 ⟸ NM_001399655 |
| - UniProtKB: | A0A8I6AAG2 (UniProtKB/TrEMBL) |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000105728 ⟸ ENSRNOT00000138057 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000100854 ⟸ ENSRNOT00000121644 |






















