Imported Disease Annotations - MGIObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Hsf2bp | Rat | primary ovarian insufficiency 19 | | ISS | Hsf2bp (Mus musculus) | 13592920 | OMIM:619245 | MouseDO | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Imported Disease Annotations - MGIObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Hsf2bp | Rat | primary ovarian insufficiency 19 | | ISS | Hsf2bp (Mus musculus) | 13592920 | OMIM:619245 | MouseDO | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| # | Reference Title | Reference Citation |
| 1. | GOA pipeline | RGD automated data pipeline |
| 2. | ClinVar Automated Import and Annotation Pipeline | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
| 3. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| Hsf2bp (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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| HSF2BP (Homo sapiens - human) |
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| Hsf2bp (Mus musculus - house mouse) |
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| Hsf2bp (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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| HSF2BP (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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| HSF2BP (Canis lupus familiaris - dog) |
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| Hsf2bp (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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| HSF2BP (Sus scrofa - pig) |
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| HSF2BP (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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| Hsf2bp (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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| Hsf2bp (Rattus rattus - black rat) |
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Variants in Hsf2bp
836 total Variants
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| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
| D20Rat31 |
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| D20Rat74 |
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alimentary part of gastrointestinal system
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appendage
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circulatory system
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ectoderm
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endocrine system
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endoderm
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exocrine system
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hemolymphoid system
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hepatobiliary system
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integumental system
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mesenchyme
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mesoderm
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musculoskeletal system
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nervous system
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renal system
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reproductive system
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respiratory system
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sensory system
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visual system
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16 | 12 | 64 | 152 | 91 | 90 | 59 | 59 | 59 | 6 | 314 | 156 | 11 | 131 | 75 | 92 | 31 | 15 | 15 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000001580 ⟹ ENSRNOP00000001580 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000079207 ⟹ ENSRNOP00000071827 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
|
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000149910 ⟹ ENSRNOP00000110974 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000155117 ⟹ ENSRNOP00000103748 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | NM_001127683 ⟹ NP_001121155 | ||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position: |
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| Sequence: |
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| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | XM_039099004 ⟹ XP_038954932 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | XM_063279457 ⟹ XP_063135527 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | NP_001121155 ⟸ NM_001127683 |
| - UniProtKB: | G3V646 (UniProtKB/TrEMBL), A6JK16 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000071827 ⟸ ENSRNOT00000079207 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000001580 ⟸ ENSRNOT00000001580 |
| RefSeq Acc Id: | XP_038954932 ⟸ XM_039099004 |
| - Peptide Label: | isoform X2 |
| - UniProtKB: | A0A0G2K1G2 (UniProtKB/TrEMBL) |
| RefSeq Acc Id: | XP_038954930 ⟸ XM_039099002 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| RefSeq Acc Id: | XP_063135527 ⟸ XM_063279457 |
| - Peptide Label: | isoform X3 |
| - UniProtKB: | B0BNC3 (UniProtKB/TrEMBL) |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000110974 ⟸ ENSRNOT00000149910 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000103748 ⟸ ENSRNOT00000155117 |
| Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
| AF-G3V646-F1-model_v2 | AlphaFold | G3V646 | 1-338 | view protein structure |
| eQTL | View at Phenogen | |
| WGCNA | View at Phenogen | |
| Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:1565879 | AgrOrtholog |
| BioCyc Gene | G2FUF-4289 | BioCyc |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000001193 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000001580.8 | UniProtKB/TrEMBL |
| ENSRNOT00000079207 | ENTREZGENE | |
| ENSRNOT00000079207.3 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000149910 | ENTREZGENE | |
| ENSRNOT00000149910.1 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000155117.1 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Gene3D-CATH | 1.25.10.10 | UniProtKB/TrEMBL |
| IMAGE_CLONE | IMAGE:7112979 | IMAGE-MGC_LOAD |
| InterPro | ARM-like | UniProtKB/TrEMBL |
| ARM-type_fold | UniProtKB/TrEMBL | |
| HSF2BP | UniProtKB/TrEMBL | |
| KEGG Report | rno:499413 | UniProtKB/TrEMBL |
| MGC_CLONE | MGC:188036 | IMAGE-MGC_LOAD |
| NCBI Gene | 499413 | ENTREZGENE |
| PANTHER | HEAT SHOCK FACTOR 2-BINDING PROTEIN | UniProtKB/TrEMBL |
| PTHR15434 | UniProtKB/TrEMBL | |
| PhenoGen | Hsf2bp | PhenoGen |
| RatGTEx | ENSRNOG00000001193 | RatGTEx |
| Superfamily-SCOP | ARM-type_fold | UniProtKB/TrEMBL |
| UniProt | A0A0G2K1G2 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| A0ABK0LG13_RAT | UniProtKB/TrEMBL | |
| A0ABK0M274_RAT | UniProtKB/TrEMBL | |
| A6JK16 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| B0BNC3 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| G3V646 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2008-03-07 | Hsf2bp | heat shock transcription factor 2 binding protein | RGD1565879_predicted | similar to heat shock transcription factor 2 binding protein (predicted) | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2006-03-07 | RGD1565879_predicted | similar to heat shock transcription factor 2 binding protein (predicted) | LOC499413 | similar to heat shock transcription factor 2 binding protein | Symbol and Name status set to approved | 1299863 | APPROVED |
| 2006-02-09 | LOC499413 | similar to heat shock transcription factor 2 binding protein | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |