Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Slc25a32 | Rat | Exercise Intolerance | | ISO | SLC25A32 (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Slc25a32 | Rat | Exercise Intolerance | | ISO | SLC25A32 (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
| # | Reference Title | Reference Citation |
| 1. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
| 2. | GOA pipeline | RGD automated data pipeline |
| 3. | ClinVar Automated Import and Annotation Pipeline | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
| 4. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| 5. | Comprehensive gene review and curation | RGD comprehensive gene curation |
| 6. | Trafficking of intracellular folates. | Stover PJ and Field MS, Adv Nutr. 2011 Jul;2(4):325-31. doi: 10.3945/¿an.111.000596. Epub 2011 Jun 28. |
| PMID:12477932 | PMID:15140890 | PMID:16165386 | PMID:18614015 | PMID:21956163 | PMID:29666258 |
| Slc25a32 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SLC25A32 (Homo sapiens - human) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Slc25a32 (Mus musculus - house mouse) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Slc25a32 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SLC25A32 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SLC25A32 (Canis lupus familiaris - dog) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Slc25a32 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SLC25A32 (Sus scrofa - pig) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SLC25A32 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Slc25a32 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Slc25a32 (Rattus rattus - black rat) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
.
Variants in Slc25a32
140 total Variants
|
| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
||||||||
| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
| D7Rat23 |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RH142696 |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| AW529678 |
|
|
alimentary part of gastrointestinal system
|
appendage
|
circulatory system
|
ectoderm
|
endocrine system
|
endoderm
|
exocrine system
|
hemolymphoid system
|
hepatobiliary system
|
integumental system
|
mesenchyme
|
mesoderm
|
musculoskeletal system
|
nervous system
|
renal system
|
reproductive system
|
respiratory system
|
sensory system
|
visual system
|
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16 | 12 | 67 | 164 | 91 | 90 | 59 | 92 | 59 | 6 | 356 | 192 | 11 | 143 | 81 | 92 | 31 | 17 | 17 |
| RefSeq Transcripts | NM_001173334 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| XM_006241603 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_063263561 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| GenBank Nucleotide | AC121173 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| BC166530 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| CH473950 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| JAXUCZ010000007 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000006029 ⟹ ENSRNOP00000006029 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
|
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000117696 ⟹ ENSRNOP00000076986 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000161119 ⟹ ENSRNOP00000104260 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | NM_001173334 ⟹ NP_001166805 | ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||
| Position: |
|
||||||||||||||||||||||||
| Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | XM_063263561 ⟹ XP_063119631 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
| Protein RefSeqs | NP_001166805 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| XP_063119631 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| GenBank Protein | AAI66530 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| EDM16353 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000006029 | ||
| ENSRNOP00000006029.5 | |||
| ENSRNOP00000076986.1 | |||
| ENSRNOP00000104260 | |||
| ENSRNOP00000104260.1 |
| RefSeq Acc Id: | NP_001166805 ⟸ NM_001173334 |
| - UniProtKB: | B2GV53 (UniProtKB/TrEMBL), F7EM79 (UniProtKB/TrEMBL), A0A8I5Y115 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000006029 ⟸ ENSRNOT00000006029 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000076986 ⟸ ENSRNOT00000117696 |
| RefSeq Acc Id: | XP_063119631 ⟸ XM_063263561 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| - UniProtKB: | A0A8I5Y115 (UniProtKB/TrEMBL) |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000104260 ⟸ ENSRNOT00000161119 |
| Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
| AF-B2GV53-F1-model_v2 | AlphaFold | B2GV53 | 1-316 | view protein structure |
| eQTL | View at Phenogen | |
| WGCNA | View at Phenogen | |
| Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
| RGD ID: | 13695306 | ||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_R5831 | ||||||||
| Type: | multiple initiation site | ||||||||
| Name: | Slc25a32_1 | ||||||||
| Description: | solute carrier family 25 member 32 | ||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
| Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
| Position: |
|
| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:1565789 | AgrOrtholog |
| BioCyc Gene | G2FUF-33576 | BioCyc |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000004403 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000006029 | ENTREZGENE |
| ENSRNOT00000006029.7 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000117696.2 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000161119 | ENTREZGENE | |
| ENSRNOT00000161119.1 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Gene3D-CATH | 1.50.40.10 | UniProtKB/TrEMBL |
| IMAGE_CLONE | IMAGE:7189614 | IMAGE-MGC_LOAD |
| InterPro | Mitochondrial_sb/sol_carrier | UniProtKB/TrEMBL |
| Mt_carrier_dom | UniProtKB/TrEMBL | |
| SLC25A32-like | UniProtKB/TrEMBL | |
| KEGG Report | rno:315023 | UniProtKB/TrEMBL |
| MGC_CLONE | MGC:188123 | IMAGE-MGC_LOAD |
| NCBI Gene | 315023 | ENTREZGENE |
| PANTHER | PTHR45683 | UniProtKB/TrEMBL |
| Pfam | Mito_carr | UniProtKB/TrEMBL |
| PhenoGen | Slc25a32 | PhenoGen |
| PROSITE | SOLCAR | UniProtKB/TrEMBL |
| RatGTEx | ENSRNOG00000004403 | RatGTEx |
| Superfamily-SCOP | Mitoch_carrier | UniProtKB/TrEMBL |
| UniProt | A0A8I5Y115 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| A0ABK0LQV6_RAT | UniProtKB/TrEMBL | |
| B2GV53 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| F7EM79 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2016-02-24 | Slc25a32 | solute carrier family 25 member 32 | Slc25a32 | solute carrier family 25 (mitochondrial folate carrier) , member 32 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2012-10-16 | Slc25a32 | solute carrier family 25 (mitochondrial folate carrier) , member 32 | Slc25a32 | solute carrier family 25, member 32 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2008-04-30 | Slc25a32 | solute carrier family 25, member 32 | Slc25a32_predicted | solute carrier family 25, member 32 (predicted) | 'predicted' is removed | 2292626 | APPROVED |
| 2006-03-30 | Slc25a32_predicted | solute carrier family 25, member 32 (predicted) | RGD1565789_predicted | similar to Mitochondrial folate transporter/carrier (predicted) | Symbol and Name updated | 1299863 | APPROVED |
| 2006-03-07 | RGD1565789_predicted | similar to Mitochondrial folate transporter/carrier (predicted) | LOC315023 | similar to Mitochondrial folate transporter/carrier | Symbol and Name status set to approved | 1299863 | APPROVED |
| 2006-02-09 | LOC315023 | similar to Mitochondrial folate transporter/carrier | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |