Gene-Chemical Interaction Annotations
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Comparative Map Data
Variants
miRNA Target Status (No longer updated)
Predicted Target Of
Summary Value | Count of predictions: | 79 | Count of miRNA genes: | 74 | Interacting mature miRNAs: | 76 | Transcripts: | ENSRNOT00000007754 | Prediction methods: | Microtar, Miranda, Rnahybrid | Result types: | miRGate_prediction | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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QTLs in Region (GRCr8)
| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
Markers in Region
| RH131698 |
|
Expression
RNA-SEQ Expression
|
alimentary part of gastrointestinal system
|
appendage
|
circulatory system
|
ectoderm
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endocrine system
|
endoderm
|
exocrine system
|
hemolymphoid system
|
hepatobiliary system
|
integumental system
|
mesenchyme
|
mesoderm
|
musculoskeletal system
|
nervous system
|
renal system
|
reproductive system
|
respiratory system
|
sensory system
|
visual system
|
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16 | 12 | 67 | 158 | 91 | 90 | 59 | 91 | 59 | 6 | 351 | 187 | 7 | 140 | 81 | 92 | 31 | 17 | 17 |
Sequence
Nucleotide Sequences
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000007754 ⟹ ENSRNOP00000007754 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | NM_001109293 ⟹ NP_001102763 | ||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position: |
|
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| Sequence: |
Protein Sequences
| Protein RefSeqs | NP_001102763 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| GenBank Protein | AAI58858 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| EDL95426 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000007754 | ||
| ENSRNOP00000007754.3 |
| RefSeq Acc Id: | NP_001102763 ⟸ NM_001109293 |
| - UniProtKB: | B0BNK2 (UniProtKB/TrEMBL), F7FLM3 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000007754 ⟸ ENSRNOT00000007754 |






















